Table S2. S. thermophilus CRISPR spacer sequence analysis.

Koko: px
Aloita esitys sivulta:

Download "Table S2. S. thermophilus CRISPR spacer sequence analysis."

Transkriptio

1 Table S2. S. thermophilus CRISPR analysis. 001_1_01 TGTTTGACAGCAAATCAAGATTCGAATTGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_02 AATGACGAGGAGCTATTGGCACAACTTACA _1_03 CGATTTGACAATCTGCTGACCACTGTTATC _1_04 ACACTTGGCAGGCTTATTACTCAACAGCGA _1_05 CTGTTCCTTGTTCTTTTGTTGTATCTTTTC _1_06 TTCATTCTTCCGTTTTTGTTTGCGAATCCT _1_07 GCTGGCGAGGAAACGAACAAGGCCTCAACA _1_08 CATAGAGTGGAAAACTAGAAACAGATTCAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_09 ATAATGCCGTTGAATTACACGGCAAGGTCA _1_10 GAGCGAGCTCGAAATAATCTTAATTACAAG 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_11 GTTCGCTAGCGTCATGTGGTAACGTATTTA _1_12 GGCGTCCCAATCCTGATTAATACTTACTCG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_13 AACACAGCAAGACAAGAGGATGATGCTATG _1_14 CGACACAAGAACGTATGCAAGAGTTCAAG 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_15 ACAATTCTTCATCCGGTAACTGCTCAAGTG _1_16 AATTAAGGGCATAGAAAGGGAGACAACATG _1_17 CGATATTTAAAATCATTTTCATAACTTCAT _1_18 GCAGTATCAGCAAGCAAGCTGTTAGTTACT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_19 ATAAACTATGAAATTTTATAATTTTTAAGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_20 AATAATTTATGGTATAGCTTAATATCATTG _1_21 TGCATCGAGCACGTTCGAGTTTACCGTTTC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_22 TCTATATCGAGGTCAACTAACAATTATGCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_23 AATCGTTCAAATTCTGTTTTAGGTACATTT _1_24 AATCAATACGACAAGAGTTAAAATGGTCTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage lysogeny mo _1_25 GCTTAGCTGTCCAATCCACGAACGTGGATG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_26 CAACCAACGGTAACAGCTACTTTTTACAGT _1_27 ATAACTGAAGGATAGGAGCTTGTAAAGTCT _1_28 TAATGCTACATCTCAAAGGATGATCCCAGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_29 AAGTAGTTGATGACCTCTACAATGGTTTAT 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_30 ACCTAGAAGCATTTGAGCGTATATTGATTG _1_31 AATTTTGCCCCTTCTTTGCCCCTTGACTAG _1_32 ACCATTAGCAATCATTTGTGCCCATTGAGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _2_01 GCTTTCTAGCTCGCTATAATTACCCATTCCTAGAAA _2_02 TCAAAATATGTTATTACCTTGTATTTCATAATTCAATTAA _2_03 CCACTTGCTGTGTACATCCTACCAGTTCCGCCTATGATG 39 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _3_01 AAATTCTAAACGCTAAAGAGGAAGAGGACA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_02 TACTGCTGTATTAGCTTGGTTGTTGGTTTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _3_03 TTCCTCTTGTAAACATTTTATTAATAATGT 30 AF Swinepox virus isolate , complete genome _3_04 TATCCCAGAGAATGGAAGAACAATTATAGA _3_05 TATGAATTGTCAAATTAACGGTTGCGCTAA _3_06 CGATGGAAATGATGGCTTGCCAGGTAAGGA _3_07 AATGGGAAAGTAGCTATATATGATCCAGAG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _3_08 GAAGGCACAAGAAAGTCAAATGCGTAGCGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _3_09 AATTTTAACAGATATAGTGTAATCGGTATT _3_10 CTATTACTATACTTCCGAAGAGATTGCAGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_01 TTACGTTTGAAAAGAATATCAAATCAATGA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CTCAGTCGTTACTGGTGAACCAGTTTCAAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 TCCAAGTTATTTGAGGAGTTATTAAGACAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 ATTGTCTATTACGACAACATGGAAGATGAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CTTCAAATGTACTGCAAGGCTGCAAAAGTA _1_01 AGTTTCTTTGTCAGACTCTAACACAGCCGC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GCCCTTCTAATTGGATTACCTTCCGAGGTG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 TTATATCGAAGAACGACTGAAAGAGCTTGA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 TGAAGTATTAGGTCTCTCAAAAGATGATATT 31 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 AGTTGATTGCGTAATCAACCATCTCCATAA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 AAATCAACGTACATCCCGATATAGGCACGA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 GACATATCGACGTATCGTGATTATCCCATT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GCAACACTCAAACGTTGCAAACGCAAGCTT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 CTCAGTCGTTACTGGTGAACCAGTTATCAAT 31 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 TTTCATCGTCAATTTCCATGTTATAAATCT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GAAGTATTAGGTCTCTCAACAGATGATATT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 ATTGGCATGATTTCAATTTTAATTGGGAT 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 TACCGAAACGACTGGTTTGAAAAATTCAAG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 AAGCAAGTTGATATATTTCTCTTTCTTTAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CGTTTTCAGTCATTGGTGGTTTGTCAGCG 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 TTACTAGAGCGTGTCGTTAACCACTTTAAA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 TTCGTTAAAGTCACCTCGTGCTAGCGTTGC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_03 ATAACGGTAGCAAATATAAACCTGTTACTG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_04 GAAGTAGCCATACAAGAAGATGGATCAGCA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GATGTCACTGAGTGTCTAAGCATTGCGTAC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 TGAATAAGCAGTTCTTGACGACCAACCGAC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CAACACATTCAACAGATTAATGAAGAATAC _1_02 TCCACTCACGTACAAATAGTGAGTGTACTC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage J1 putative ly _1_01 ACATATCGACGTATCGTGATTATCCCATT 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 ATGCCATTCTTTAAAGAGGCTTTACTCGTT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 GTTGGCGGACTACTCCTTCGAGGGGTTGAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GAAGCACCTCTTGCGTTGATAAAAGTATT 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CAATTAACACAGCAATTAACACAGTATAT 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 AAATCAGTTTTTTGTTCAGAAACTTGTTCT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_01 TGCTCGACTTGTTAAAAAAACTACTGAAGA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_02 TAGAGGTAATGACGGCTTACCGGGTAAAGA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_01 TACGCCAGAAGAACTAGCGAAGAACATAGT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 GATAGCAATAGCTTTCTTGACCTAAAAGAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_02 GAGGTCTGTAATTTCATTCCCTCGTAATCT 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_03 AAAGGTTTCTCTAAACACATGCGGAATAT _1_04 GTCATAGTACCAAGCACAAATAACGTTAGT _1_05 GTGTATTTAGTAATGGTGATTTTTTAAATT _1_06 CATTCATTTTTTATATATCAATAAAACTTT 30 AJ Buchnera aphidicola plasmid pbpp1, leuc gene, leud ge _1_07 GGGGATTCTTATTTCACTGTAGTTACGATG _1_08 CAAAAATTGATGTCACAATTAATAAAGGTG _1_09 CTATTTCTGACAATGGTTGAAATTGTGTTC _1_10 CTTTTTTTAAATTAATTTATCGTAAGCAA 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_11 AACAAACTTATGAGAACGGTTGAACGGCTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_12 AGCCCGCTTATTGCTTCAGTTGGTTTATAT _1_13 TGGAGCAACAAGAATGATTAACTCTAATGC 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_14 TTTGATGGATATCATTGATAAACTATACGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_15 TAACGAAAGCAATACCAATCGTGCTAAAGC _1_16 TATTCCTATGGTCGATATTCGAACAGTCAA 30 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2, complete _1_17 CAGGGGACAAGGACTTTGACCCAACAGAAG 30 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _1_18 AGAAACACCTAATGGTCTCTTAGAACCCGA 30 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _1_19 AAGAAGTTAAAGACAACTTTGTTAAAGACT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_20 GAAAAAGCATCCATGATAGTGCTTAGACCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_21 CGGAATGGTATAAAGAATACAAAGAAAACG 30 AE Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482, complete genom _1_22 CCAAGTATCACGCAAAGAAATCAACGAGA _1_23 TTGACCTGTTTATCCTTGTTAACTAGAATAG _1_24 AGAGCACTAGCATACTGTTTAGTCCGAACG _1_25 AGGCAAGGTATTTGATCCAACAGAAGCCAA _1_26 CATGATTTACAACCACGCGCTAGACCAAG 29 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _1_29 TAATAGTTTACCAAATCGTCCTTGTTCCAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl BLAST hit with other ( below 40,1)

2 033_3_01 AACACTTGGTCCATTACTCAGTCCTCAGAG _3_02 AGATACGTCAGTTGTGTTTAGTCTTGCTAC 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _3_03 ATTCGGTGTACCTGAATATACTAGTCGTGA _3_04 AAACCGTTCGACAATTACAAGAGTGCGGAA _3_05 TATTAAAGGTCCAGAAGGCCTTTCAACTGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_06 TATCTCTGAAGGTAAAGCTGAAGGAAATAA _3_07 CAACCCAGACATGAATGTCACTAGATATGT _3_08 ACGGTCTGTATCGAAAAAGACCACTTGGCT 30 AJ Streptococcus thermophilus repa gene for putative sma _3_09 CATGGTAACTTTGAAATCTCACGCAGAATAG _3_10 GAACTTTCAGCTTATAACAACGCATTAGAAC _3_11 ATTGACCTATTCAATGTATGGGTCACGTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_12 TCTTAAAAATTGAATATTAACGAAGTACAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage SFi18 lysin, _3_13 TAACAAGCTGTACGACTTGTACTATCAGGC _3_14 GGGTGCTGATATGTCTACCTCTGGTGGAGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_01 AGATACTCGCTCATATCATCCAACGTGGT 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_02 ATGTTATTAAAGAGCGTTCTAAGTTATCAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_03 ATCAGATAAAAAAGGTGGATATGTGTACCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_04 GGCAATATTACCCGTTTGGATGATGATATT _1_05 GTGGTCTTCTATTCGTAAGATAGCACTAGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_06 ATTAGATGCTATTATCACCGATGTCAAAAT _1_07 CAAAAACGCTTTGGGTGACTACCTAATGGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_08 ATTTTTGACATTGACTGTTAAGAATGTTGAG 31 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2, complete _1_09 CGATATCAGTAGTGATGATTTGCCGTTTTA 30 CP Psychrobacter cryohalolentis K5, complete genome _1_10 CACATTACGTTACTCATGGGGCGACAAACA _1_11 CAAGAATTGGGCATAACAGACATGACCCA 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_12 CTGCTGCTGTTCGACCGCAGAACGTTATCAA 31 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_13 CATTCAATGCAACCCGTGGATGGTCTGACA _1_14 ATTAAAATGTCGAAAATAGCCCAAATTGCC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_15 TTACAAAGACAAAGAAAACAAAACAACCAA 30 CP Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 c _1_16 TGGAAACTAAGAAATGCAATAGAGTGGAAG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_17 AAATCTCGTAGTTAGTACAGTAGGTTTCAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_18 TCATAGCGGATTCGAACCGCTATAAGCCC 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_22 AATTGGAACGTGTCAAACGAACAAAGGTCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_01 CAGCACTAGCCGCAAGCCCTTGTATATTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_02 TAGAAATCAAGGAACTTGGATGAAAAGTAA _1_03 ATATGAAAGGGAAATGATATGAAGAATGAA _1_04 TTTTGGGATACAACACGCAGTCGTTGACTTG _1_05 GTTTGAGATGCCAATGTTTTTCAATCCTTG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_06 GTATCAAAAGACGCATTCATGAAGCGAGCT _1_07 AAAAACAATTGAAATTCATAATCAGCGCTT _1_08 GCTTTTAACGTTTTAAGAGAATACCCTCT 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_09 GTGACGCTGCAATGACTTGCCATAGTAATT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_10 ATACTGGTATATAGTAATTCATACTTCATC _1_11 TTGGTTTCATATTTACTCCTTTGTGTTTTG _1_12 CTGATTTGGTCTTGTTCTTTTGTCCCTTTT _1_13 GCAGCAGTTGAGAACTTTAGCGTCCAGTGG _1_14 TGCTACTATGAAGGACGCTGTTGATACTTT _1_15 TCTTCTTTAATCTTTTTTAACGTCAACGTT _1_16 GTATCCATTAATATAGTAGCATTTCTATCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_17 AGTAGAGAGACCAGCACACTACTGTACTAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_18 CTTCGCACGAAAGTTTATTAGACAACTCGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_19 TGATAGAGCTAGAATTGTCTTTTTTACCGA _1_25 ATTCATTAATATCTGCAAGGATGTCTTGTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_26 GAGAAAGTAGCCCATTCGGCCCATTCGGGG _3_01 CTGACGTTCTAGTTCAGCAGCATCAGCGAT 30 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 1, complete _3_02 TTCAGTTTGGCTTTTTATTTTAAAAAACAT 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _3_03 GAAAATCGCTAAAGAAGCAGTTAAGAAGTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _3_04 TGTGGCGCTGTCCTATGACCGTACTGGTCT _3_05 GTTGACAGTTAAATATAGCTTTACAGGAAA _3_06 GTCTTCTAATACAGAAACACGTTGTTGACT _3_07 CCCATGACATCAAGATGATATCCCCTGTCA _3_08 AATGAAGAAGCCAATTCAAGCGCAAGGGTC _3_11 AGTGTTTTTCTGAACACCGTTCACAGTCAG _3_12 TTATATTTTTTTAAGGCGGTCAGTTTGGTC _1_01 ACTTACAGAGGATATCAACTCTAGCTTTAG _1_02 AAAATAGCACCACTAACTGTGAACGGCGTG _1_03 CTAGCCTTAAAATCACTGCGACCGCAGTA _1_04 GTGAAGTAGAGCATATGAAGTCCTCATCTT _1_05 ATCATGGCAAGAGCATTGCTTATGGCTGAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_06 GAAGCACCTCTTGCGTTGATAAAAGTATTG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_07 ATCATCGAGAACAAGCTTGATAAAATCATC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_08 ATGGTTCTAATATCGGTACTTACTTTATCG _1_09 CACACATTCAACAGATTAATGAAGAATACA _1_10 CATTGGTAAACGTGAACGCTTCACAAATG _1_11 AACGAATTTAAAGATTTTGATGAAAGTCTA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_12 ATACTGGTGCTCAATTAGCCTCAAACGGCA _1_13 CTGAGTGGCTTGTATTGGATGATGTGGGCA _1_14 TCATTTATCAGGAAAATTTCCCTCAACGT _1_16 GAGCGCCCTCTATTACTTAACATAAACGGT _1_17 CAGATAGCTGTTAAGTCGCCTGGCTGATAA _1_01 TGACTTAGCGAATTTAATCGCTAAGATATC 30 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _1_02 CTTCACCTCAAATCTTAGAGCTGGACTAAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_03 ATGTCTGAAAAATAACCGACCATCATTACT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_04 GAAGCTCATCATGTTAAGGCTAAAACCTAT _1_05 TAGTCTAAATAGATTTCTTGCACCATTGTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1.1 host s _1_06 ATTCGTGAAAAAATATCGTGAAATAGGCAA 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_07 TCTAGGCTCATCTAAAGATAAATCAGTAGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage J1 putative ly _1_08 TAAAAACATGGGGCGGCGGTAATAGTGTAAG _1_09 ACAACCAGCAAAGAGAGCGCCGACAACATT _1_10 TATAACACAGGTTTAGAGGATGTTATACTT _1_11 CTAGAAGCTCAAGCGGTAAAAGTTGATGGCG _1_12 CTTTGAGGGCAAGCCCTCGCCGTTCCATTT _1_13 AACTACCAAGCAAATCAGCAATCAATAAGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_14 CTATAAGTGACAATCAGCGTAGGGAATACG _1_15 ATCAGTGCGGTATATTTACCCTAGACGCTA _1_16 AACAGTTACTATTAATCACGATTCCAACGG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_01 GGTGAAAAAGGTTCACTGTACGAGTACTTA _3_02 TCAATGAGTGGTATCCAAGACGAAAACTTA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _3_03 CCTTGTCGTGGCTCTCCATACGCCCATATA 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _3_04 TGTTTGGGAAACCGCAGTAGCCATGATTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_05 ACAGAGTACAATATTGTCCTCATTGGAGACAC _3_06 TAACGGTGAGCCAATCAAAAAATACTTCAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _3_07 TTATATAAAATCGTGCTACGGGCGTTTTAT 30 X65856 S.thermophilus gene for replication protein (Rep A) _3_08 CTCATATTCGTTAGTTGCTTTTGTCATAAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _3_09 AGAACTTTATCAAGATAAAACTACTTTAAA 30 CR Legionella pneumophila str. Paris complete genome _3_10 ATAGTATTAATTTCATTGAAAAATAATTGT 30 AP Onion yellows phytoplasma OY-M DNA, complete geno _1_01 ATGATGATGAAGTATCGTCATCTACTAAC _1_01 ACCAAGTAGCATTTGAGCAAAGATAGATTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_01 TAGATCTCATGAGTGGCGACAGTGAGCTT 29 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 TACCATCTTGGGATAGGTACTGGTCATGCC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_01 CTATCATGTTTTTTATGTATCAAAACTCGT 30 CP Shewanella frigidimarina NCIMB 400, complete genome _1_01 GATTTTTAGCGTAGGTACCTTCGCTACCTT BLAST hit with other ( below 40,1)

3 044_1_01 CAATAGTTACCCGAGTACCATCTTCAATCA _3_01 CCTTATCGCAACACTTCCAGAGGGATCGGTA _3_01 TGCAATTTCCATTAGTTCTTGACGCCCTTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_01 TTTATACTTTATCTTTTTAAAGAATGTATT _3_01 GACCACAAGAGTACTTATAAAGGCAATCAT _3_02 CGGTTTATACCGTAAGCGACAACTTGGTTA 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _3_03 TCTGACGGTTAGATATGATTTTACTGGTAA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_01 CCTAAAATCATTTTCAACGAGTTGCGATAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1.1 host s _1_02 AATAAATTGCTATGATACAGCGTACCGATA 30 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2, complete _1_01 AACATCTTTCCACATCTACAACAAGGAATT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage J1 putative ly _1_02 CTTCGAATAGACCACATTAGGTCAGTATTT _1_01 CGTGGCAGCGTGGTCGGGTTTAATAGCCCG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 AAGCCCAAGTCAGAGCATCCGTCCAAGCC 29 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_03 ATTGGGTTTCGGTAAGAACTAAACATACCA _1_04 CACAAAATAATTCGGTAGTTTTTACTAACT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT2 host sp _1_05 TTTGACCGTTTATTTAGACGTGCTAAAGT 29 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2, complete _1_06 AATATCTACAGGTCACTACAAAGCTACGCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_01 CATATCACCCTCATATTCATGTTTTGATGA 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _3_05 TGATGGACGAGACGGTATTCCAGGAAAACC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_06 ATTGGAAAAAGGCGTTTTTACTAATGAGTA _3_07 ATACTTACGATGGCGAAGATTACAACTATAG _3_10 TATTGAAACGAGCGTGCCTTTTAAGCCATC _3_12 TGAATCTTCTAACTTTAACTCAGTTGTTAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _3_13 AATAATAAAAGTGATACAAGCTCAAGGCAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_01 TTAGATCTCATGAGTGGCGACAGTGAGCTT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_01 GCATTCATGGTTTGTTGGTATTTAACGTAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage MD2 putative _1_01 GCTACTGAAAGCTACGAGGTTGGTAATCCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage MD2 putative _1_02 GTAGTTAGAGCGCTTGAAGCTAACGGTATA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_01 TATTTTATCAGTCATCATGGCGTCATAGCC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_01 TGCTCTCTATGCGATTGGACGTCTGTCTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_02 AAGAAAGATAAGAAAAAAGTAACACTACTT _1_01 TAGTAAAAGATTCTGGGTTGATTGTCTCGT 30 AM Lactococcus lactis subsp. cremoris MG1363, complete g _1_02 TTCTTTTGGTTCATCCAAATGACACACCCT 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _1_03 TCACATCCTAGCGATAATCTGTTTGCTTC _1_04 ATAGCTTCATTGCGCTTTTTAATTTGACCT _1_05 AACAACAAAGCAAATACAACAGTAACAACC _1_06 CTAAACTACGTTTGAAGGTCTCAACTCCGT 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_07 GAGGTTGAATAGTGAGTGCACCATGTTTGT _1_01 AAAATTTGTTGATGGCATGTTTAGTGCTGC 30 DQ Turnip ringspot virus RNA1 polymerase gene, partial cd _1_02 ATGGAAGTGTAGAAAGTACAGCACGGAACT 30 AF Streptococcus thermophilus plasmid per36, complete p _1_03 ACAGTAAGATACACGTAGTTGATGAATTG 29 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_04 AAGACATATCTTTTTAACATCATGAAGACG 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_05 TAAAACTTACTGCAGACAGTGTTAATTATC 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _1_09 TGATAGAGAATGGTCGTTAAATGGTGTAAT _1_10 GAACAAGTAGAAGGAGGAGTGGAAGAGTCGG _1_11 ACGAGTGGGCTATCAGTCACGGACTGGATA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_15 GGCCGCATCGGAAAATGGGCTTGTTATCGG _1_16 TCAGAAAGCGGTTGCTGTGCCTGTGCTGG 29 CP Solibacter usitatus Ellin6076, complete genome _1_17 AGACCATCCGTTCTTTGTGTTTAGAGCCAT _1_18 CTTGAATCTGCTTGACTGATAATGTGCTAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_19 CGAACATTGCAGAACTGGGGAAATGGGTAC _1_20 TAAGAAACCTGTCGGAGAAGCTAAAAGCTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage MD2 putative _1_21 CTCACTAGTCCATTAGTGCGGTTAGGGAA 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_22 TGGTACTACACCTCAAACGGTGAGTGCATG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_23 GCAACAATGGTTATAATTATCCCACACAGG _1_24 GCATACGCTGTTACAAACACACCCCACCC _1_01 GACGTTCAATGAAATATTCTTATCAGACAT 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _1_02 TCTGACGATAAAGAGAATATCTCAAAGGGT 30 AF Streptococcus thermophilus plasmid per35, complete p _1_03 GGGTGCGATGGATTCAATGACAAAGAGCAC _1_09 TCAGTTTCAAATGCTCCACCACCGATATTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_10 GTTCGGGTTCAGGTGGTTTTATACTCAACT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage lysogeny mo _1_11 AACATGCATCAGTTTGGATACGAGGTCAAG _3_01 GGAATTCACATTTATGCCACGGGGTGGTAG _3_02 CTAAGGTTTGATGATGTCGTACAGTTCTAC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _3_03 TATACGCAACTTCCATATCTACAAAAGTCG _3_04 ATCTGGTTCAATGCATACTGATATGGTTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_05 ATTTGCACCCTTTAACATCCATGATGTAAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_06 AAGTAATGCTAAGAAGTTAGCCGATTATTT 30 CP Lactobacillus reuteri F275, complete genome _3_07 ATGGGATTGGTTCGATTAGTGAAAGCTCAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _3_08 GATTGCTTGGGCAATTTGCCAGTTTGGTTT _3_09 TAATACAGTTACATTGTCTTCATATGGTCG _3_10 TACCTCCCTGGCAACTTGCCCTAAATAGTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _3_11 CCAAGGGATTCAAGGACCACAAGGCCCTCA 30 AE Bacillus cereus ATCC 10987, complete genome _3_12 CTCAATGGTTGAGGATTATCTTGAAAGTAA _3_13 CATCACTGACATGGGCGATGGCGGCTACTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_14 CGGGCTTAACATTCCACACAATATCCAAGA _3_15 AATCTGACACAGCTAACCACATGAGCGACA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _3_16 CGGACAGCGATAAATACACTCTATACAGAGA 31 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_01 AAGACCGCTGTACTGGTTGGTATTCGTACC _1_02 CAACCAAGCGAACACAGCAGTAGCACCGCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_13 CTTAGCCTTGAAATGGCACGTAGTGAACTTA _3_15 TAAATAATAAAGTTTTCTACCAAGATAATT _3_16 CACACTTGCACAAGTATGTTTCAATCTTAT _1_01 ATCCGCATGGCAGAACATCTAGCTATGATG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_02 CAATTTAGGAACAATTAAATTTATTGTACT 30 CP Streptococcus thermophilus LMD-9 plasmid 2, complete _1_03 GGATTGCCAAAAAAGTTGTTGTAACTCGCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_04 ATAAATTTTTAAAAATGACAACGTCGACTG _1_05 TTTGAAAGCATTTTACTAACTGCTTGCGGT _1_06 GTGTCGCTGGAGCTTTCAATTTAATGACTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_07 CTGCATCTGGCTTCAATAGTGCCAATATGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_08 TACCCATTGCAATTATTTCTTCACCTTTGT _1_09 TGAAATAGCTTGCTACCCTTACGAATACA 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_10 AAGTTGATCGTATCTATTTAGAATATCGCA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_11 ATTCACTTTGACAGATACTAATGCTACATC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_12 CAAGCAGTGTAAAGGTGGTTTAAATGTTAA _1_13 CCATGGGTGCTAAAGGTGATGACTACCGCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_14 AAATGAACAGACAAGAAGCAACAGAAATTG 30 AJ Streptococcus thermophilus repa gene for replication pr _2_02 TCAAAATATGTTATTACTTTGTATTTCATAATTCAATTAA 40 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _2_03 CTAGGTCATGATATTTATTATCTGCCGAATGATTTGATA 39 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_01 TCTCTTTCCATCGGTACTGGTATATCTCAT 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 ATTGGTAGCCAAGTAAATATCACCATTGAT _1_03 TTCTTCAAATTCACCGACTGCAAAATTACA _1_04 GCTTCCTAAGTGCATGAAAATCGCAAACGG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_05 TATACCTGTCTATGTAAGGGAATTTAACTC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_06 GGTGTAGGTGCTGTTGGTAAGTTGTTTAAT _1_07 GTGAAACAGGTTATCAAAAAACGTATATTG _1_08 TTATTCTTGGAATTATTACAGACCCTACTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_09 GCTTTCATTATATCACTTACTCATAAATCT _1_10 TAATCACCCCTTTTTCTAGCTCTTGATTGA _1_12 CATAGTATAGCCGTCTTCTTTGATTGATTG _3_01 TTCTGGATGTCTGTACCAAGGTTCTGGTTC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage lysogeny mo _3_02 TGGGGGACGGTGAAGATGGTCCTCAAGGTAC 31 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl BLAST hit with other ( below 40,1)

4 064_3_03 TGGTTTATATAGAAAACGGCAACTTGGATA 30 AJ Streptococcus thermophilus partial repa gene, ORF1 to _3_04 CTTGACTGACAATGAAGACAACTATAGAGTA _3_05 AAGTAATTTTGATAATTGCAATAATTACAT _3_06 AGTCCTATTGGGTTTAATTATTTTGATAA _3_07 CAAAGCAGGAGGCGTTTGAGACCAATTTGT _3_08 AGCTAGTGCCTGAGCCTTGCCAATAAGGGA _3_09 GCTACGACCTTCATTTTCTTGTAAATATGA _3_10 TAGAGGTAATGATGGTATTGCAGGTAAGGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_11 TTTGGGTGTGGTAACTCCTGACGCACGAAT _3_12 TATGGAAGGTCGCGGAATGCAACCGCTTGA _3_13 ATTTTAAGGGGATTAATCCCCTTTTTTAGT _1_01 AACCCGCGTGGTTATGGGCTTGAGGAGTGT _1_02 ATATTAATAGCGATTCTATGCTACAACGTG _1_03 TCATCTTCTAAGTAAATACCACTGTCAGGG _1_06 TTTTCGCAAAGTAAGCGAAGCTCTACGTG _2_02 GGTCATGATATTTATTGTCTGCTGAATGATTTGATA 36 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _2_03 CTTCTTCTTCTATGTAATAATCTTTCATTTTCAAG _2_04 GTGACCCTGTTTTAGCATTAACAACGATATGTCCCAC _2_05 TCTTGGTGGTGAGATTTGTCGAATTTCCAAAGACCT _2_06 ACCCCTACTGGTTTGTAGGTTATTTCCATAATCACCA _3_01 ATAGATACTGTAAGGTCGGCTAATGGCTCA _3_02 CACTAAAATCAACGATGTTTTAAGGCAAGG _3_03 AAGTTTTTAAGTATCCATCTTCGTCGAACA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _3_04 TTGATATTTACCTTTTGAGTAGGTATCTTG _3_05 CTAGGTCATACATATAAAGCAAACTATTGT 30 CP Streptococcus thermophilus CNRZ1066, complete geno _3_06 TATGGCATATAATCAGAAATACCATTACAC 30 DQ Clostridium botulinum neurotoxin type E gene, partial cd _3_07 GTTGAAGTATTTCGTTGTAACAATGACAAGT _3_08 ATGAGGTGAAAATAAAGAGCTTGTGTATCT _3_09 ACACATGTCTCTTCTTTCAACCAATATCGG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _3_10 TGCTCTAAAATCGTTCTACGAGCGTTTTAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_11 GGCTAGGAAGTACAAGTAACTATAAGAAAT 30 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _3_12 AGCCTTTAGCCATAGTTTTTACATGACCGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _3_13 CTGAAGCAGTAGAGAACTCTACTTGGAACT _3_14 CATTTGATGGGAATTTAAGTCAGCTTGGTT 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _3_15 TTGAGAGTAGATGACACGATTCAATTCTAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _3_16 CCTTAATGCCAATGGTATTTTGAAGATTAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _3_17 AATTACAAAAGTCGAGTTGGCTGAAAAAAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_01 AAGAAGCGGTTAAATGCTTCAACTGAATAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 AATTGCTAAACATCTAAAAGACTTAACGGG _1_03 GATGAAGATTTGACTGATGATAAAGAGAAA 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_04 GACATCAGAAAGCAGTTTATAAATATTTTA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_05 TTTGAATTTAACAACCTTGATTTTGATATC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_06 TGATACGGTCAAAGTTTTTCCACTAATAGCG _1_07 ATGGTTTTCATTTCCTGAACCCCTAAGAGG 30 CP Marinobacter aquaeolei VT8, complete genome _1_08 AAGTTATTGAAAAACGCCAACATGATGAGT _1_09 ATATAAGTCCTCCTATTAATATCCACAATA 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_10 TTGCCTCAAGAGATCCTGCTTGTTGCCAAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_14 TCCCATAGTTTTAATGAGTCGGTTAACTTA _1_15 GTGTACTAAAAGTGTGCTAAGTTCATAAGG _1_16 ATATAGTGATTGTATCCAGCTGCGGCGTAG _1_17 AAAAGCAAATCGCGAGTATAAAGGATATA _1_18 TTGTCATAATAATTAAATCCAATAGGACTT 30 AY Staphylococcus phage Twort, complete genome _1_19 TTATGATTGAATGACATGGTTGTATAAGTA _1_20 GAAAATTTCTGTTGTGTTCTTAATATTAGC _1_21 TTTCTTTAGGAATACCAGGGAGTTCAGCTT 30 DQ Streptococcus thermophilus plasmid p2991 chaperone ( _1_22 TGGCAGAGATTACACAGCAACGGAAACAGC 30 AM Streptococcus pneumoniae pspnp1 plasmid _1_23 GGGTATCATTGTATCTAGTGATGGACCTGA _1_24 ATTTGAAAAATGCACAACAGCGTTTGATAG _1_01 AGAACGTATTCCAAAACCTCTTTACGATTA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage kappa3 puta _1_02 TTAACTGTTATCAAAATGATAAGATAGTCT _1_03 CGTTGATGTTTATTCAAGTAAAATAATTAA 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_04 TCCTTTCACGGGTAGCACACTAACATACAC _1_05 GTTGGCAATGCAAACAACCTTTATGAACCG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_06 TTTATTTCCTTGCGATAACGTTCCACCTTT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_07 AGATTATAAGGAACACAACCAACTATATAG _1_08 ACGACATCAAGCTGATTGTCTTCTACATAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_09 TTTGGAATACTGAATGTTTTACTGAAAATC _1_10 ACACCACTATCTTTTCCTCCTGAAAATGAA _1_11 GTAATTCCACGAAATTATCAACCTTATGCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_12 TTGGAGGATTGCCCCATATTCCCAAGAGT _1_13 GAGAGGCGTTAAATATAGAAATGCAAGATT 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_14 TTTTAACGTCATCAGTCCACCGCCTTAAAT _1_15 CACCTCTTTCGATGGAAAGGTATCCTTCTA 30 CP Shewanella baltica OS185, complete genome _1_16 GACCAAAGTTTGATTATAGAGCTATACACC 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_17 ACCATCATTCTTACCATTACAACTGTAATG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_18 ATACGAATTCGGTTCGCACAATTACAATTC _1_19 TATCAACGCAATCATTACAACAACTTCAAACA _1_20 ATCTACGTGTCAATACATATCACAAAACAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_21 ATTTTTAGAAATTTCTGATATAATAATGA 29 CP Clostridium botulinum F str. Langeland, complete genom _1_22 TTGTTGGAACAAGGACGACTTGGTAAACTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_23 CATATTAAGCTGACTGGGCCTAATGCTTTT 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_24 TTCATAGCATACCGTAGTTGTAAAATCTAT 30 AY Streptococcus thermophilus plasmid pnd103, complete _1_25 AACATTTAGGGAATGAAATTGATAAGACTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_26 AACATGAGAAACTGTAGAAAACAAGCAATA _1_27 TGGTGAAGATGGCAGTCATAAATGGCACATT _1_28 AAGGGTTGAAAAATGTTGGTATATCAAACG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_29 TTCTGGTAGTGGATTTAGTCAAACAGATGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_30 TCCATAGAGCGTCTTAAACAAAGAATAGTC 30 CP Streptococcus thermophilus LMD-9, complete genome _1_43 CATATATATATATATATTTATTTTAAATAT 30 AJ Streptococcus thermophilus repa gene for replication pr _1_01 ATCAGGGACGTTTTCCCTAATCCAGCCTTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_01 TCTATATATATATATTTATTTATATATATA 30 D90263 Human papillomavirus type 21 E6 gene, complete cds _1_02 TAATCATTCTTACATAAAATCTTAACTTCC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_01 TGGCAAGAAGTGTAAGAGATGCAATGGATA 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_02 TTTATTATCATTATTCTTCTTCCCAAGCGT _1_03 TTTTATAGAATTTGGTGGTGAACTTTTTCA _1_04 AATGGGTCACAGATTGCCATAATAAGGAGG _1_05 CCGAGGTCACTTTAGAACCCACAAAATAAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_06 ATGAGAGAACACAGTATAGACCCTGATACA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_07 CAGTATTAATGAGGTTTGGGTGGTCATTCC _1_09 ACCTCATACATGGGGAAAACTTGTAAGTA _1_10 TATTTCACGAATTTCTACACTTTTCAACCT _1_11 CTGAAACCTTGTTTTGAAGCGCTTGGAAGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_12 GTCAATTGATACTGCAATCTCTTTAACATT _1_13 ACTTCAATATGGTCAACATCTTGATCACCGA _1_14 TAATATGTCGCTCTACTGATTCCAAAACGG _1_15 ATGAATTACATTCATGATTTTATCGAGTTT _1_16 CGTGCCATTGTTTCGGTCGGACGTGGGCA _1_01 TAAACTCGACAAAAGCACTACATGAATATT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 ATTTTTTAAGGAAAGGAGGAAAATAATATA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_03 CGTTCAAAACAGCGAAAACTTAACCCTAAC _1_04 CATTAAGTCGCTTGAGGCAGACATTGAAGC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_05 CCAAACTCAAATTGTCTATAATAATAACCG BLAST hit with other ( below 40,1)

5 075_1_06 TATCTCTATTTCAGGTGGTTTAAAACATTC 30 AF Lactococcus lactis plasmid pcis3, complete sequence _1_07 AAACGAAGATGGAAGCGTTGATGTTTATTC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_08 GATTGCATTTGCCAGTATTTCTTTTGATTA _1_09 TGAAGACAACGGAAACAATCAACCTATTA _1_10 ACTTCTTTTTTAATGTCATCTAAGACAATA 30 X64346 Saimiriine herpesvirus 2 complete genome _1_11 GCCAATGATGTTCAATTCGTTAATGGAATT _1_12 TCAACATGGGATATTTCGTTGGTCAGGATG _1_13 TATGGCTCTCTTGTTGGAATAAAGATGATT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_14 ATAACATAGCAGTCTATTTCTTTGCTGATG _1_15 GTTACCACGCGCCCTACTGTATTAGTGGAG 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_16 TACATACCCAAGGTTGTAAGTCGTTAAATT _1_17 TGTAAGTAGTCAATATTCACTTCTGATAAC _1_18 TTAGCGGTGATTGGAATAGAATAAGCGAAT _1_19 CTTCTACAGCAGTTTAAGACACATTATCAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_20 CGTATCGAAAACGGCGATAATCCAACAGT _1_21 CAATACCTTTTTTTAATTCATCTTGATAAGT 31 CP Francisella tularensis subsp. novicida U112, complete g _1_22 TTAAGAACAATATCATCAATACGACTTTCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_23 CATCTATCAAATTCAAATTCGGATAAACTA 30 CP Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11, complete gen _1_24 TCCTTGCCATCTGCACTGTAAGCCCAAGCA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_05 GACTTATCTTGGAAGGTAGTGAAGGCACTT _1_07 TAGTACGCATAATCAATTCATCAAGCTTGA _1_08 GTAGTGACCCAAAATTCTATGACCTTGAAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_09 AGATTGTGGTGCTTACGGAAAATTCCTTGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_16 CCATACTCTCTATCAGTTCATTTAATTCTTC _1_17 TGAGAGTGTCTGATGGATTTATTGGTAACC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_01 GAGCTACCAGCTACCCCGTATGTCAGAGAG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 CGTTCCTTTTTTCAAGGTAATCTTTGAAAG _1_03 AAGTCCGTAAGCACCAGTTCCAATCGTCAT _1_04 TTGAATACCAATGCCAGCTTCTTTTAAGGC _1_05 AACCTCATACATGGGGAAAATTGGTAAGTA _1_06 TAACTTCATTAGTGTAGTTGTAATTAGCAT _1_07 TTAGCTACCCAAATATCTTCTGTTTTCCAA _1_08 GAGTTTTCAATATTGGCACAGGAGACAATT _1_09 TGATACTATTTTAGTCAGATATGAAATATC _1_10 TCATCAATGTTTAAAGCCCAACAATACATGA _1_11 TAGATTTAATCAGTAATGAGTTAGGCATAA _1_12 AGGAAAATAGCATGAGCGTACAACAATCTA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_13 TGTCTATCACGCTTCCTAAGTGCATGAAAA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_14 ATGTCACCAATCACTAAAGAACCTACGCTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi11, compl _1_15 AACATCTTCCTCTCCGATTGCAAATAGTGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_16 CATATTTGGTGCCCGTTCGATAAAGAGTA _1_17 CATTAAATCGCTTGAAGCAGACATTGAAGC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_26 AATGGGTCACAGATTGCCATAATAAGGAG _2_02 TTTGAATAGTCTTTGAATCGCATTTGAACCATATA _2_03 AGGTTTTTTGCCATAGATTTTCCAAGACCTTCCCAACT _1_01 CTTTCTAAGTTGAATTAAATTCAAGTTTTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage lysogeny mo _1_02 TCGCTACTATGGTTAACGATGAGGAACTCT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_03 AGCAACTTTAAAACTAAAAGAGCTACTTGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi19, compl _1_04 AAAACCCTACACAGTGTGTGAGATGTGTCA _1_01 AAAAGCCTATGTTTGCCCACTTTGTGGAAG 30 AJ Streptococcus thermophilus repa gene for replication pr _1_02 TGTCACTTTCTCTTTCTGGGTTGTGCCAAT _1_03 CATACTTTTCCATCTGTTTGTTGTTTGAAAA _1_04 TGAGAGTGTCTGATGGATTTATTGGCAGCC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_05 GGGGTTATTTTCCATTTTACCGTCTATCTA _1_06 TATCACGCCCATTTTCATTTCGCCATCTGT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_07 AACATTTTAATATAATTTCTAAATCTATTG 30 CP Clostridium botulinum F str. Langeland, complete genom _1_08 TACAAAATTCCTTCAAACGCTATTTATTGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_09 AGAGTTTGAAAATTATTTTTCAGTTTCTA _1_10 TTCCTCATCTTTCTCCGCTTTTGCTAGCTT 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_11 TTGAGCGTTCTAGTGTGTGGCTTGTAATGAA 31 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1, comple _1_12 TGAAAGAAATACAATACAACGATAATGACC _1_13 CTAGTTTTAAGAGATAGCTCTCTAAGTAGG _1_14 AAATTCGACATAAGCACTACAGTTATATT 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_15 CTATTTTCGAGAGAACGTCAGTCATTTTAA _1_16 GTGCTAACTATATCAGTCGCATCAATAACA _1_01 AAACTCGACAAAAGCACTACATGAATATT 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 TAATTCTTTCAGGTATGAAACTAGAAACAC _1_03 AAATCAATTACAACCCAAAAATGTGGGTTC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl _1_04 CATTATCTAAATCGAACCATGCAAAAAGTT _1_06 TATTTTCCTTCCTTTTCGTCTAGTGGTTTG 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_07 TACCTGTGTCTGTGATGTTGACTTCGTCAC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_08 TATCTTTATGCTTAGAATTCAAGAATATAT _1_09 GAATGGTTCGAAAGGACCTTTTAAACCTGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT4 host sp _1_10 TTGAATACCGACACCCGCTTCTTTTAAGGC _1_11 TTGCGAGATGAACGACATGGAGGTTATTAG _1_12 CATTCGGCTTCGCTCATGGGTGTTAAGGGT _1_13 TGGATAGACTCTGACATACATATAGAAT _1_14 TGTCAAATAACCCGTTGCTACTCATGAGCA _1_15 CAGGAATCTCATTGAACCAACTTCAAGGC 29 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage DT1.1 host s _1_01 TTCTGTAGCCACTCCGTGGATGCCTTCAGC 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage MD2 putative _1_02 TTCTTTAGTTCGGACACCCTCAACACCTAT _1_03 GCTTTGATTGGACGGAAAATGGTATCCCTG _1_06 TTAGACCAGATGGACAGATATTCTTCATCG 30 U88974 Streptococcus thermophilus temperate bacteriophage O _1_07 TCATCAGAGCAACAATCACGGGAAAGACCT 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_08 ACACTCACCTTATTCCTGTAGTTCAAAACA _1_09 TACCTTAACATTTTCGATATTTTTCAAATT 30 CP Thermosipho melanesiensis BI429, complete genome _1_10 TTTGACTGCTTTTTTATCTGAATTGTAATT _1_11 CAGTAACCTAAAGCTCTATCAAGCCTATTT 30 S67974 RepS=replication protein [Streptococcus thermophilus=p _1_12 CGTCAAGCTGACAGACCTTGACAACAAATC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_13 AGGCATAAATAACATTGATAACCCTAACA 29 AY Streptococcus thermophilus plasmid psmq308, comple _1_14 GCCAACGAGGTCAAATATGTCAACGGCATT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_15 GAAATAGGAACTTCAAAGGTAATTTCTTTA _1_17 ATTTAGAGCAAGGAAAGCAGTACATCATTA _1_18 CTGTAATCATTTTTAAATCAGGATTATCAA _1_19 TTAAATGTATCCTAGTATTTTTGTACTATA _1_20 CCATCAGCCAACTGTATCGGCTACTTTCTA _1_21 ATGCTCTTGGCGACTATCTCATGGAGCGTG _1_22 AGGAAAAAACCCAAACAACCCAAAATGTTA _1_26 TCTAATTCTGTCACCACGACTATATCGCCA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_01 TTATTTGATAGGAATGTCAGTAATTTTTGA 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_02 AACATTTCAGCGCTTACTTATCAATCTAAT _1_03 TGGCAGCAGTGAATTCGATGCCGAGCAAT _1_04 CCAAGGAATACCAGGTCCTAAAGGTGCCGA _1_05 CTAAATGAACTACAACAACAGCTTGATGA _1_25 GTATTAGTAGGCATACGATTATGGAAGTA 29 DQ Streptococcus thermophilus plasmid psmq-316, comple _1_01 TTTTAATTGATCTAGACACCCTATGAAATA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_02 ACAGAGGAGAGAAACCATGGCTATTTTAGA 30 AJ Streptococcus thermophilus res gene, ORF2 and ORF _1_01 AATCAAAAATTGACAAACTAAAAGCAGCAC 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_02 CTCTATATAGGATACCGTTTTTAGTACCAA _1_03 TTACTGATACTGTGGCTATGACTAAAGCAT 30 AF Streptococcus thermophilus bacteriophage 7201, compl _1_04 GCTAACTTCTCATAGTGTCTTATAACATCA 30 AY Streptococcus thermophilus bacteriophage 2972, compl _1_05 TCCCCATATAAAATAGCGAACTTACTGCGC BLAST hit with other ( below 40,1)

Lampiran 1 Komposisi media pertumbuhan yang digunakan A. Media nutrien agar (NA) - Agar 1.5% - Nutrient broth 0.8%

Lampiran 1 Komposisi media pertumbuhan yang digunakan A. Media nutrien agar (NA) - Agar 1.5% - Nutrient broth 0.8% LAMPIRAN 8 9 Lampiran 1 Komposisi media pertumbuhan yang digunakan A. Media nutrien agar (NA) - Agar 1.5% - Nutrient broth 0.8% B. Media King s B agar - Agar 1.5% - Pepton 2% - K 2 HPO 4 0.15% - MgSO 4.4H

Lisätiedot

Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua

Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua Johdanto kliinisesti merkittäviin bakteereihin Miksi kliininen bakteriologia on tärkeää? Bakteerien luokittelusta Bakteeri-infektiot Patogeeni Tartunnanlähde Ennaltaehkäisy Bakteriologista diagnostiikkaa

Lisätiedot

Plasmid Name: pmm290. Aliases: none known. Length: bp. Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson. Last updated: 17 August 2009

Plasmid Name: pmm290. Aliases: none known. Length: bp. Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson. Last updated: 17 August 2009 Plasmid Name: pmm290 Aliases: none known Length: 11707 bp Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson Last updated: 17 August 2009 Description and application: This is a mammalian expression vector for

Lisätiedot

Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii

Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of

Lisätiedot

Supporting Information for

Supporting Information for Supporting Information for Analysis of Sogatella furcifera proteome that interact with P10 protein of Southern rice black-streaked dwarf virus Win Than*, Faliang Qin*, Wenwen Liu, Xifeng Wang ** State

Lisätiedot

Hevosista eristettyjen bakteerien herkkyys mikrobilääkkeille

Hevosista eristettyjen bakteerien herkkyys mikrobilääkkeille Hevosista eristettyjen bakteerien herkkyys mikrobilääkkeille Lääkepäivä 22.5.2013 ELK Merita Määttä Kuva: Merita Määttä Keskeiset asiat Suomessa hevosilla yleisimmin esiintyvät bakteerit Hevosilla esiintyvien

Lisätiedot

tgg agg Supplementary Figure S1.

tgg agg Supplementary Figure S1. ttaggatattcggtgaggtgatatgtctctgtttggaaatgtctccgccattaactcaag tggaaagtgtatagtaatgaatctttcaagcacacagatcacttcaaaagactgtttcaa catcacctcaggacaaaaagatgtactctcatttggatgctgtgatgccatgggtcacag attgcaattcccaagtgcccgttcttttacaccaaaatcaaagaagaatatctccccttt

Lisätiedot

Oct. 21, h2p://

Oct. 21, h2p:// Oct. 21, 2009 67 13 38 118 912 1041 971 2924 4 75 59 138 2 11 45 58 10 76 38 124 6 24 24 54 1001 1242 1179 3422 h2p://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/stabc/gpstat.html 1995 1997 1998 2002 2003 Mycoplasma

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO. 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 100 mg tabletti

VALMISTEYHTEENVETO. 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 100 mg tabletti VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 100 mg tabletti 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT Yksi tabletti sisältää doksisykliiniä 100 mg. Apuaineet: Täydellinen apuaineluettelo, ks. kohta

Lisätiedot

Functional Genomics & Proteomics

Functional Genomics & Proteomics Functional Genomics & Proteomics Genome Sequences TCACAATTTAGACATCTAGTCTTCCACTTAAGCATATTTAGATTGTTTCCAGTTTTCAGCTTTTATGACTAAATCTTCTAAAATTGTTTTTCCCTAAATGTATATTTTAATTTGTCTCAGGAGTAGAATTTCTGAGTCATAAAGCGGT CATATGTATAAATTTTAGGTGCCTCATAGCTCTTCAAATAGTCATCCCATTTTATACATCCAGGCAATATATGAGAGTTCTTGGTGCTCCACATCTTAGCTAGGATTTGATGTCAACCAGTCTCTTTAATTTAGATATTCTAGTACAT

Lisätiedot

Vähärauma, Teknologiakeskus Pripoli, A-siipi, 3. kerros. Suorat puhelinnumerot: Toimisto 02-621 3342

Vähärauma, Teknologiakeskus Pripoli, A-siipi, 3. kerros. Suorat puhelinnumerot: Toimisto 02-621 3342 1 YHTEYSTIEDOT: AVOINNA: ma - pe klo 8.00-15.30 KÄYNTIOSOITE: POSTIOSOITE: INTERNETOSOITE: SÄHKÖPOSTIOSOITE: Vähärauma, Teknologiakeskus Pripoli, A-siipi, 3. kerros Tiedepuisto 4, 28600 PORI www.pori.fi/porilab

Lisätiedot

gi 161984995 gb CP000896.1 Acholeplasma laidlawii PG-8A, complete genome ATTTGATTTTTTGCTTAATTTTTATGTAATTACTTCCCCACAATTTTTGCCCACATATTGTGGATAAAT TTCCACATTTTATTCACAATGTTGATAAGTTGTGTAAGTCGACTTGTTGGCTTTATAAAGCAAATGACA

Lisätiedot

Katastrofivalmiusyhteistyö. Neuvottelukokous mikrobiologisten laboratorioiden edustajille, Labquality, /JU

Katastrofivalmiusyhteistyö. Neuvottelukokous mikrobiologisten laboratorioiden edustajille, Labquality, /JU Katastrofivalmiusyhteistyö Neuvottelukokous mikrobiologisten laboratorioiden edustajille, Labquality, 4.11.2005/JU Katastrofit voivat uhata yhteiskunnan ja terveydenhuollon infrastruktuuria tai johtaa

Lisätiedot

Valmiustaitoja biokemisteille

Valmiustaitoja biokemisteille Valmiustaitoja biokemisteille - Power Point -ohjelman käyttö - seminaariesitelmän laatiminen ja esittäminen Tuomo Glumoff 1. Power Point -ohjelman käyttö - teksti - kuvat - tausta - valmiit pohjat * löytyy

Lisätiedot

Menestyminen ulkoisessa laadunarvioinnissa Miten meillä ja muualla? Eveliina Tarkka HUSLAB Bakteriologia Labqualitypäivät

Menestyminen ulkoisessa laadunarvioinnissa Miten meillä ja muualla? Eveliina Tarkka HUSLAB Bakteriologia Labqualitypäivät Menestyminen ulkoisessa laadunarvioinnissa Miten meillä ja muualla? Eveliina Tarkka HUSLAB Bakteriologia Labqualitypäivät 5.2.2009 Suomi muu maailma Vertailu UK Neqasin laadunarviointitulosten perusteella

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA T022/A16/2014 Liite 1 / Appendix 1 Sivu / Page 1(7) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA VALIO LTD, R&D, CHEMISTRY AND MICROBIOLOGY Tunnus

Lisätiedot

Supporting information

Supporting information Supporting information Figure S1. Carotenoid biosynthesis pathway in papaya fruit which is adopted from Blas et al. (2010) (reference 4) and Nisar et al. (2015) (reference 5). Carotenoids are synthesized

Lisätiedot

Esimerkki bioturvallisuuspuutteista. CDC:n tapahtumat 2014

Esimerkki bioturvallisuuspuutteista. CDC:n tapahtumat 2014 Suomen bioturvaverkoston koulutuspäivä Viikki, Helsinki, 9.10.2014 Esimerkki bioturvallisuuspuutteista laboratoriossa: CDC:n tapahtumat 2014 Kolme tapausta Yhdysvalloissa tuli ilmi kesällä 2014 kolme

Lisätiedot

Mikrobibiotekniikka. Vesa Joutsjoki. Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus MTT Biotekniikka ja elintarviketutkimus. 05.06.2007 Vesa Joutsjoki

Mikrobibiotekniikka. Vesa Joutsjoki. Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus MTT Biotekniikka ja elintarviketutkimus. 05.06.2007 Vesa Joutsjoki Mikrobibiotekniikka Vesa Joutsjoki Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus MTT Biotekniikka ja elintarviketutkimus Mikrobibiotekniikka MTT:llä 1) Genomiset menetelmät hyötymikrobien valinnassa ja haittamikrobien

Lisätiedot

Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver. PT 1

Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver. PT   1 Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver PT www.acolor.net 1 Outline: Part I: Why (Background) Part II: Some concrete work we have done Part III: Prospects to further

Lisätiedot

VIILIN VARAHAPATTEEN KEHITTÄMINEN

VIILIN VARAHAPATTEEN KEHITTÄMINEN ISSN 0355-1180 HELSINGIN YLIOPISTO Elintarvike- ja ympäristötieteiden laitos EKT-sarja 1495 VIILIN VARAHAPATTEEN KEHITTÄMINEN Anne Väistö Helsinki 2010 Tiedekunta/Osasto Fakultet/Sektion Faculty Maatalous-metsätieteellinen

Lisätiedot

Nestemäinen kylmädesinfiointiaine lähinnä elintarviketeollisuuteen. Tuote perustuu peroksidiyhdisteiden synergistiseen vaikutukseen.

Nestemäinen kylmädesinfiointiaine lähinnä elintarviketeollisuuteen. Tuote perustuu peroksidiyhdisteiden synergistiseen vaikutukseen. P3-oxysan ZS Nestemäinen kylmädesinfiointiaine lähinnä elintarviketeollisuuteen. Tuote perustuu peroksidiyhdisteiden synergistiseen vaikutukseen. KUVAUS Tehoaa laajakirjoisesti mikrobeihin Toimii kylmissä

Lisätiedot

Eukaryotic Comparative Genomics

Eukaryotic Comparative Genomics Eukaryotic Comparative Genomics Detecting Conserved Sequences Charles Darwin Motoo Kimura Evolution of Neutral DNA A A T C TA AT T G CT G T GA T T C A GA G T A G CA G T GA AT A GT C T T T GA T GT T G T

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA T022/M18/2017 Liite 1 / Appendix 1 Sivu / Page 1(7) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA VALIO LTD, R&D, CHEMISTRY AND MICROBIOLOGY Tunnus

Lisätiedot

4rrr. PYSwvYoesrÄ. 0809-cPR-1115. Tarvasjoen Teräsovi Oy Junnaronkatu 16 24100 Salo SE RTI FI KAATTI TUOTTEE N SUORITUSTASON EN 12101-2:2003

4rrr. PYSwvYoesrÄ. 0809-cPR-1115. Tarvasjoen Teräsovi Oy Junnaronkatu 16 24100 Salo SE RTI FI KAATTI TUOTTEE N SUORITUSTASON EN 12101-2:2003 4rrr VTT XPRT SRVCS Y llmeu ls r 0809 VTT XPRT SRVCS Y P 1001.02044\TT S RT KAATT TUTT SURTUSTAS PYSwvYesrÄ 0809PR1115 urpn prlmenn j neuvsn seuksen : 305/201 1 (rkennusueseus el CPR), jk n nneu mlskuun

Lisätiedot

Bakteerien taudinaiheuttamismekanismeista. ja faagiterapiasta

Bakteerien taudinaiheuttamismekanismeista. ja faagiterapiasta Bakteerien taudinaiheuttamismekanismeista ja faagiterapiasta Mikael Skurnik, FT Bakteriologian professori 09-19126464 tai 050-336 0981 mikael.skurnik@helsinki.fi Taustatietoja Tutkimustyö: halu ymmärtää

Lisätiedot

Pvm Kello Sarja Kotijoukkue Vierasjoukkue Pelipaikka Kenttä Paikkakunta Vastuujoukkue

Pvm Kello Sarja Kotijoukkue Vierasjoukkue Pelipaikka Kenttä Paikkakunta Vastuujoukkue M4D-24 PS, otteluohjelma 2015-2016 03.10.2015 10:00 M4D-24 PS Jäjä LIME Kempelehalli Kempele Kempele Jäjä 03.10.2015 11:00 M4D-24 PS Total FBC PartyBoys Kempelehalli Kempele Kempele Jäjä 03.10.2015 12:00

Lisätiedot

State of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology

State of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology Functional Genomics Research Stream State of the Union... Research Meeting: February 16, 2010 Functional Genomics & Research Report III Concepts Genomics Molecular Biology Computational Biology Genome

Lisätiedot

Määräys STUK SY/1/ (34)

Määräys STUK SY/1/ (34) Määräys SY/1/2018 4 (34) LIITE 1 Taulukko 1. Vapaarajat ja vapauttamisrajat, joita voidaan soveltaa kiinteiden materiaalien vapauttamiseen määrästä riippumatta. Osa1. Keinotekoiset radionuklidit Radionuklidi

Lisätiedot

Virusriskin vähentäminen elintarviketuotannossa

Virusriskin vähentäminen elintarviketuotannossa Virusriskin vähentäminen elintarviketuotannossa Satu Salo, VTT Expert Services Oy Marjaana Rättö, Irina Tsitko ja Hanna Miettinen, VTT 2 Viruskontaminaation riskinhallintakeinojen kehittäminen ja arvioiminen

Lisätiedot

Miten tulkitsen mikrobiologisia laboratoriovastauksia?

Miten tulkitsen mikrobiologisia laboratoriovastauksia? Miten tulkitsen mikrobiologisia laboratoriovastauksia? 08.11.2017 Sisätautimeeting Kerttu Saha, sairaalamikrobiologi Seinäjoen keskussairaala, Kliininen mikrobiologia Mikrobiologiset tutkimukset - Etsitään

Lisätiedot

IDOFORM CLASSIC. - Maitohappobakteereja sisältävä ravintolisätuotesarja koko perheelle. PLUS Fire Spesielt Utvalgte Melkesyrestammer

IDOFORM CLASSIC. - Maitohappobakteereja sisältävä ravintolisätuotesarja koko perheelle. PLUS Fire Spesielt Utvalgte Melkesyrestammer IDOFORM - Maitohappobakteereja sisältävä ravintolisätuotesarja koko perheelle CLASSIC PLUS Fire Spesielt Utvalgte Melkesyrestammer KAPSLER 50 MAITOHAPPOBAKTEERI ASIANTUNTIJA IDOFORM Maitohappobakteeriasiantuntija

Lisätiedot

Pvm Kello Sarja Kotijoukkue Vierasjoukkue Pelipaikka Kenttä Paikkakunta Vastuujoukkue

Pvm Kello Sarja Kotijoukkue Vierasjoukkue Pelipaikka Kenttä Paikkakunta Vastuujoukkue M4D-24 PS, otteluohjelma kausi 2015-2016 03.10.2015 10:00 M4D-24 PS JÄJÄ LIME Kempelehalli Kempele Kempele JÄJÄ 03.10.2015 11:00 M4D-24 PS TOTAL FBC PARTYBOYS Kempelehalli Kempele Kempele JÄJÄ 03.10.2015

Lisätiedot

1.1 MIKROBIT ELINTARVIKKEISTA

1.1 MIKROBIT ELINTARVIKKEISTA Kainuun elintarvike- ja ympäristölaboratorio 1. ELINTARVIKKEET Hinta alv 0 % Hinta alv. 24 % 1.1 MIKROBIT ELINTARVIKKEISTA Bacillus cereus 16,58 20,56 Campylobacter spp. 38,53 47,78 Clostridium perfringens

Lisätiedot

TUTKIMUSMAKSUT 1. ELINTARVIKKEET KAINUUN MAAKUNTA -KUNTAYHTYMÄ

TUTKIMUSMAKSUT 1. ELINTARVIKKEET KAINUUN MAAKUNTA -KUNTAYHTYMÄ 1. ELINTARVIKKEET KAINUUN MAAKUNTA -KUNTAYHTYMÄ KAINUUN ELINTARVIKE- JA YMPÄRISTÖLABORATORIO TUTKIMUSMAKSUT 1.1 MIKROBIT ELINTARVIKKEISTA Bacillus cereus 17,00 Campylobacter spp. 39,50 Clostridium perfringens

Lisätiedot

Labquality Kudos- ja märkänäytteiden bakteeriviljely 2006-2010

Labquality Kudos- ja märkänäytteiden bakteeriviljely 2006-2010 Labquality Kudos- ja märkänäytteiden bakteeriviljely 2006-2010 Markku Koskela OYS/Mikrobiologian laboratorio 5-vuotisseurantajakson kertymä 20 bakteeriviljelykierrosta 80 potilasnäytettä 40 Pu-BaktVi2;

Lisätiedot

Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriosta

Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriosta Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriosta Kysely vertailututkimustuloksista 2015 Tuula Pirhonen Tutkimus ja laboratorio osasto Kyselylomake 2015 Paranneltu excel, joka tehtiin Eviran laboratoriorekisterissä

Lisätiedot

THL:n laboratoriopohjainen seuranta ja kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat,

THL:n laboratoriopohjainen seuranta ja kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat, THL:n laboratoriopohjainen seuranta ja kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat, 1.1.2015 Bakteeri Lähetysperuste Tyypitys THL:ssa ja vastauskäytäntö Minne lähetetään Metisilliiniresistentti Staphylococcus

Lisätiedot

Lukujärjestys vko 41 5.10. - 9.10.2015

Lukujärjestys vko 41 5.10. - 9.10.2015 1 (5) AmmattitaitoinenSihteeri 7.10.2015 8:00 7.10.2015 3:00 MaL Mikro 2 AvustajanaArjessa 5.10.2015 8:00 5.10.2015 3:00 Ulkop. kouluttaja / AvustajanaArjessa 6.10.2015 8:00 6.10.2015 3:00 Ulkop. kouluttaja

Lisätiedot

Gram-värjäykset. Olli Meurman

Gram-värjäykset. Olli Meurman Gram-värjäykset Olli Meurman 5.2.2010 Gram-värjäys Gram-positiivinen Kiinnitys (kuumennus/alkoholi) Gram-negatiivinen Kristalliviolettivärjäys Kiinnitys jodilla Värinpoisto alkoholilla Safraniinivärjäys

Lisätiedot

CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology. Xiaohui S. Xie University of California, Irvine

CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology. Xiaohui S. Xie University of California, Irvine CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology Xiaohui S. Xie University of California, Irvine Today s Goals Course information Challenges in computational biology Introduction to molecular

Lisätiedot

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely1 1/2009. Kuvat ja teksti: Markku Koskela, ylilääkäri OYS, mikrobiologian laboratorio Oulu

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely1 1/2009. Kuvat ja teksti: Markku Koskela, ylilääkäri OYS, mikrobiologian laboratorio Oulu Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely1 1/2009 Kuvat ja teksti: Markku Koskela, ylilääkäri OYS, mikrobiologian laboratorio Oulu Näyte 1 / 2009 Poskionteloerite. 72-vuotiaan miehen sinuiitti.

Lisätiedot

Supporting Information Table S1 Core regions of 18 identified promoters in C. acetobutylicum

Supporting Information Table S1 Core regions of 18 identified promoters in C. acetobutylicum Supporting Information Table S1 Core regions of 18 identified promoters in C. acetobutylicum Gene Core regions of the promoters Reference 35 region 10 region thl TATA TTGATA AAAATAATAATAGTGGG TATAAT TAA

Lisätiedot

Tilannekatsaus probiootteihin

Tilannekatsaus probiootteihin Tilannekatsaus probiootteihin 29.11.2016 Maria Saarela VTT Technical Research Centre of Finland Ltd. 2 Probioottien historiaa Ilja Metschikoff v. 1907 elävät maitohappobakteerit teoria: mädättävien bakteerien

Lisätiedot

Garlic yellow mosaic-associated virus

Garlic yellow mosaic-associated virus Garlic yellow mosaic-associated virus TGB3 Replicase TGB1 CP 8,209 nt TGB2 LOCUS Garlic 8209 bp RNA linear 23-MAR-2018 DEFINITION yellow mosaic-associated virus. ACCESSION Garlic VERSION KEYWORDS. SOURCE

Lisätiedot

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012 Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012 Kuvat ja teksti: Markku Koskela Mikrobiologian ylilääkäri OYS, Oulu Huom! Käyttäkää yläpalkin suurennusmahdollisuutta 100-400% pesäkekasvun

Lisätiedot

Campylobacter jejunin antibioottiresistenssi Suomessa

Campylobacter jejunin antibioottiresistenssi Suomessa Campylobacter jejunin antibioottiresistenssi Suomessa Satu Olkkola, ELL Elintarvikehygienian ja Ympäristöterveyden osasto, Eläinlääketieteellinen tiedekunta, Helsingin Yliopisto Yleistä * Yleensä ei tarvita

Lisätiedot

LVI-numero Hitsattu teräsputki P235 TR1 / EN ;Suojamaalattu / Korro E

LVI-numero Hitsattu teräsputki P235 TR1 / EN ;Suojamaalattu / Korro E Hitsattu putki PUTKI P235TR1 PUN 21,3X2,0 0404058 punainen;hitsauskerroin V=1,0;Todistukset EN10204:2004/3.1;Toimituspituus 6 m; TM42 PUTKI P235TR1 PUN 26,9X2,3 0404094 punainen;hitsauskerroin V=1,0;Todistukset

Lisätiedot

Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6.

Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6. Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6. A. Promoter Sequences Gal4 binding sites are highlighted in the color referenced in Figure 1A when possible. Site 1: red,

Lisätiedot

Virus-mediated gene delivery for human gene therapy KURT NURMI

Virus-mediated gene delivery for human gene therapy KURT NURMI Virus-mediated gene delivery for human gene therapy KURT NURMI 23.10.2017 Sisältö Lyhyesti geeniterapiasta, yleisimmistä virusvektoreista ja niiden ominaispiirteistä Kliininen käyttö ja ongelmat Johdanto

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO. 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 150 mg tabletti

VALMISTEYHTEENVETO. 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 150 mg tabletti VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 150 mg tabletti 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT Yksi tabletti sisältää doksisykliiniä 150 mg. Apuaineet: Täydellinen apuaineluettelo, ks. kohta

Lisätiedot

PUTKIKAKSOISNIPPA MUSTA

PUTKIKAKSOISNIPPA MUSTA Takorauta Tuote LVI-numero Pikakoodi 0753007 RU33 KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS KESKIRASKAS DN 65 KESKIRASKAS 0 KESKIRASKAS 0 KESKIRASKAS SK/UK SK/UK

Lisätiedot

Enseigner l'évolution

Enseigner l'évolution AATTTTCGTATCTGTTGGAGTTAGATAAGCCTACGCTTGATGGACCGTTGGGTGGCTTTCTAAGTGAGCTCGTGCCATCACAATTAATATAAGGAATTGTAGATGTTTCTTTCGTTATAGGTATTTCAAAAT TTATAAGAACCTACGCCCTCGTCTTTCTCCATTGGAACAGTTGCCGTTTTCGCAGTTCTTTTTGGTTCAGTCCTCATATCATGTGATTCCCCTGGCTCTCCTGATCTTTTTATACTTACTTTGAAATCGTCA

Lisätiedot

Hollolan Hinnasto: NSM Kartio Kartio 23. Kartio

Hollolan Hinnasto: NSM Kartio Kartio 23. Kartio YKSIVAIHEISET HARJATTOMAT GENERAATTORIT - 2 NAPAISET - 000 RPM - 0Hz ES0 A EA ES0 B EB ES0 D ED ES0 E EE ES0 F EF, 2,2 92,- 2,- 29,- IM B B/B 2 0 J609a 9 ----2A ----2A ----2A ----2A -#-2A 22, 2,/ -#-26

Lisätiedot

KESKIJÄNNITEVERKON SUOJAUS JA OHJAUS. Ville Tiesmäki 9.10.2012

KESKIJÄNNITEVERKON SUOJAUS JA OHJAUS. Ville Tiesmäki 9.10.2012 KESKIJÄNNITEVERKON SUOJAUS JA OHJAUS Ville Tiesmäki 9.10.2012 Siemensin suojauksen tuoteportfolio Generation Transmission Distribution Industry 7UM6, 7VE6 7UT6, 7SA6, 7SD5, 7SS52, 7VK6, 6MD6 7SJ6, 6MD6,

Lisätiedot

Utaretulehdusta aiheuttavien mikrobien eristäminen ja tunnistaminen

Utaretulehdusta aiheuttavien mikrobien eristäminen ja tunnistaminen Sivu/sivut 1 / 6 1 Menetelmä T. Honkanen-Buzalski and E. Seuna: Isolation and identification of pathogens from milk. Teoksessa The bovine udder and mastitis, 1995, 121-141. Muunnos. 2 Poikkeamat viitemenetelmästä

Lisätiedot

Strain or plasmid Description a Reference or source b. 168 trpc2 Laboratory. 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC

Strain or plasmid Description a Reference or source b. 168 trpc2 Laboratory. 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC TABLE S1 Bacterial strains and plasmids Strain or plasmid Description a Reference or source b B. subtilis 168 trpc2 Laboratory stock 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC BM1010 trpc2 htpx::pgs1582; Em r BM1302 trpc2

Lisätiedot

VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki

VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Biologian DNA koodi ja sen selvittäminen Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Kuinka solut kehittyivät? Kolmenlaisia soluja

Lisätiedot

Luomuhunajien antimikrobisista vaikutuksista

Luomuhunajien antimikrobisista vaikutuksista Luomuhunajien antimikrobisista vaikutuksista Ruralia-instituutti Carina Tikkanen-Kaukanen FT, dosentti, tutkimusjohtaja Ruralia-instituutti /Dosentti Carina Tikkanen- Kaukanen / Luomuhunajien antimikrobisista

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA T022/A19/2018 Liite 1 / Appendix 1 Sivu / Page 1(5) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA VALIO LTD, R&D, CHEMISTRY AND MICROBIOLOGY Tunnus

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI

VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI SYNULOX vet 40 mg/10 mg tabletti, koiralle ja kissalle SYNULOX vet 200 mg/50 mg tabletti, koiralle ja kissalle SYNULOX vet 400 mg/100 mg tabletti, koiralle 2. LAADULLINEN

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO. Harkinnan mukaan tulee antaa virallista ohjausta asianmukaiseen mikrobilääkkeiden käyttöön.

VALMISTEYHTEENVETO. Harkinnan mukaan tulee antaa virallista ohjausta asianmukaiseen mikrobilääkkeiden käyttöön. VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Doxitin 100 mg tabletti 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT Yksi tabletti sisältää doksisykliiniä 100 mg. Apuaineet: Täydellinen apuaineluettelo, ks. kohta

Lisätiedot

Tekijä Pitkä matematiikka On osoitettava, että jana DE sivun AB kanssa yhdensuuntainen ja sen pituus on 4 5

Tekijä Pitkä matematiikka On osoitettava, että jana DE sivun AB kanssa yhdensuuntainen ja sen pituus on 4 5 Tekijä Pitkä matematiikka 6..06 8 On osoitettava, että jana DE sivun AB kanssa yhdensuuntainen ja sen pituus on 5 sivun AB pituudesta. Pitää siis osoittaa, että DE = AB. 5 Muodostetaan vektori DE. DE =

Lisätiedot

Ilmalämpöpumput. KUPARIPUTKI KIEPPI ARMACELL 1/4X3/8 L25M ERISTETTY LVI-numero PIKA VR06

Ilmalämpöpumput. KUPARIPUTKI KIEPPI ARMACELL 1/4X3/8 L25M ERISTETTY LVI-numero PIKA VR06 Ilmalämpöpumput KUPARIPUTKI KIEPPI ARMACELL 1/4X3/8 L25M ERISTETTY 1582309 VR06 SEINÄLIITOS ARMACELL SPLIT SD-CA 80X60 3258501 GG64 LIITOSKAPPALE ARMACELL SPLIT SD-CC 80X60 3258503 SW22 SUOJAKOTELO ARMACELL

Lisätiedot

Säteilyturvakeskuksen määräys turvallisuusluvasta ja valvonnasta vapauttamisesta

Säteilyturvakeskuksen määräys turvallisuusluvasta ja valvonnasta vapauttamisesta 1 (33) LUONNOS 2 -MÄÄRÄYS STUK SY/1/2017 Säteilyturvakeskuksen määräys turvallisuusluvasta ja valvonnasta vapauttamisesta Säteilyturvakeskuksen päätöksen mukaisesti määrätään säteilylain ( / ) 49 :n 3

Lisätiedot

Pellettien pienpolton haasteet TUOTEPÄÄLLIKKÖ HEIKKI ORAVAINEN VTT EXPERT SERVICES OY

Pellettien pienpolton haasteet TUOTEPÄÄLLIKKÖ HEIKKI ORAVAINEN VTT EXPERT SERVICES OY Pellettien pienpolton haasteet TUOTEPÄÄLLIKKÖ HEIKKI ORAVAINEN VTT EXPERT SERVICES OY Esityksen sisältö Ekopellettien ja puupellettien vertailua polttotekniikan kannalta Koetuloksia ekopellettien poltosta

Lisätiedot

OUTOKUMPU OY KAIRAUSNAYTTEISTA - 1. Kalibrointi Kanavarajojen asetuksen jälkeen mitattiin 40 kpl ns.

OUTOKUMPU OY KAIRAUSNAYTTEISTA - 1. Kalibrointi Kanavarajojen asetuksen jälkeen mitattiin 40 kpl ns. Q * Q>~/X - 4514 02 0 K MALMNETSNTA X-MET -ANALYSAATSORN TESTAUS NOLYBDEENN ANALYSOMSESSSA ATTOJARVEN KARAUSNAYTTESTA - Työn tarkoituksena on ollut tutkia X-Metin soveltuvuutta geologisten näytteiden analysointiin

Lisätiedot

Proteiinihydrolysaatit ja peptidit terveyden edistäjinä

Proteiinihydrolysaatit ja peptidit terveyden edistäjinä Proteiinihydrolysaatit ja peptidit terveyden edistäjinä Anne Pihlanto MTT Biotekniikka ja elintarviketutkimus Tutkimustieto avaa maitoproteiinien merkitystä ruuassamme Meijeritieteellinen seura 5.11.2014

Lisätiedot

TEOLOGIAN YLIOPPILAIDEN TIEDEKUNTAYHDISTYKSEN JULKAISU VUODESTA 1853 4/2012

TEOLOGIAN YLIOPPILAIDEN TIEDEKUNTAYHDISTYKSEN JULKAISU VUODESTA 1853 4/2012 TEOLOGIAN YLIOPPILAIDEN TIEDEKUNTAYHDISTYKSEN JULKAISU VUODESTA 1853 4/2012 P 4 V 5 P 6 L 7 A H g 10 K 12 N ö ( ) 15 T,, 16 A3 - N 20 Dg! 18 R 21 E 19 K: K R 22 R 23 L - Hd R, Sf L, I V A V K - Sf L K

Lisätiedot

Yliherkkyys vaikuttavalle aineelle tai kohdassa 6.1 mainituille apuaineille.

Yliherkkyys vaikuttavalle aineelle tai kohdassa 6.1 mainituille apuaineille. VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Fusidic Acid Orifarm 20 mg/g, emulsiovoide 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT Yksi gramma emulsiovoidetta sisältää fusidiinihappoa hemihydraattina, joka vastaa

Lisätiedot

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio

Lisätiedot

Python Libraries 1 / 14

Python Libraries 1 / 14 Python Libraries 1 / 14 Gzip, CSV https://docs.python.org/3/library/gzip.html https://docs.python.org/3/library/csv.html https://daler.github.io/pybedtools/ - PyBed tools http://biopython.org/wiki/gff_parsing

Lisätiedot

Uutta pikadiagnostiikkaan

Uutta pikadiagnostiikkaan Uutta pikadiagnostiikkaan Joanna Peltola Sairaalamikrobiologi NordLab Rovaniemi Käsitteitä Perinteiset mikrobiologiset menetelmät Viljely Biokemiallinen tunnistus Kiekkoherkkyysmääritys Pikatestit Immunografiset

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO. Tabletti. Vaaleanpunainen, pyöreä tabletti, toisella puolella jakouurre, toisella puolella painettu numero 500.

VALMISTEYHTEENVETO. Tabletti. Vaaleanpunainen, pyöreä tabletti, toisella puolella jakouurre, toisella puolella painettu numero 500. VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI Amoxiclav vet 400 mg/100 mg tabletti koirille 2. LAADULLINEN JA MÄÄRÄLLINEN KOOSTUMUS Vaikuttavat aineet: Amoksisilliini (amoksisilliinitrihydraattina) Klavulaanihappo

Lisätiedot

Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa

Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa 27.01.2005 1 (6) Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa Kun kunnallinen viranomainen saa tiedon epäillystä elintarvike- tai talousvesiepidemiasta, kunnan ruokamyrkytysten

Lisätiedot

LOPPUTENTTI

LOPPUTENTTI Mikrobiologian ja immunologian kurssi 2012-2013 LOPPUTENTTI 22.2.2013 Tehtävä 1. Vastaa lyhyesti alla oleviin kysymyksiin. 1. Luettele vasta-aineiden tehtäviä (4kpl) immuunipuolustuksessa. (2p) 2. HLA

Lisätiedot

Veriviljelypositiiviset infektiot TAYS:ssa Reetta Huttunen, ayl, infektiolääkäri, TAYS, Infektioyksikkö

Veriviljelypositiiviset infektiot TAYS:ssa Reetta Huttunen, ayl, infektiolääkäri, TAYS, Infektioyksikkö Veriviljelypositiiviset infektiot TAYS:ssa 1.10.2013 Reetta Huttunen, ayl, infektiolääkäri, TAYS, Infektioyksikkö Miksi? SIRO-tulosten analysointi sairaalainfektioiden seurantaa varten Tutkimusintressi

Lisätiedot

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, OES

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, OES 1 Novalab Oy, Kemian ja mikrobiologian osastot Lepolantie 9 03600 KARKKILA Puh. 09 2252860 EVIRAN REKISTERISSÄ OLEVAT MENETELMÄT elintarvikkeet Aerobiset mikro-organismit akkr ISO 4833-1:2013 Myös rohdosvalmisteet

Lisätiedot

VERTAILULABORATORIOTOIMINTA Evira 3484/liite 2/versio 8

VERTAILULABORATORIOTOIMINTA Evira 3484/liite 2/versio 8 Liite 2. Kiekkoherkkyysmenetelmän SIR-tulkintarajat 1,2,3 Sivu 1 VERTAILULABORATORIOTOIMINTA Evira 3484/liite 2/versio 8 MIKROBILÄÄKEHERKKYYDEN TESTAAMINEN AMINOGLYKOSIDIT Gentamisiini Koira Enterobacteriacae,

Lisätiedot

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio Jyväskylän ympäristölaboratorio Eeronkatu 10 40720 JYVÄSKYLÄ Puh. 014 626650 EVIRAN REKISTERISSÄ OLEVAT MENETELMÄT asumisterveystutkimukset Mikrobit (homeet, hiivat, bakteerit ja aktinobakteerit) akkr

Lisätiedot

Bioinformatics. Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding. Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute

Bioinformatics. Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding. Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute Bioinformatics Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute Course Syllabus Jan 7 Jan 14 Jan 21 Jan 28 Feb 4 Feb 11 Feb 18

Lisätiedot

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio CELL 411-- replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi

Lisätiedot

SUODATIN- PATRUUNAT MASINO-HYDROSTO KEY OY

SUODATIN- PATRUUNAT MASINO-HYDROSTO KEY OY 1 SUODATIN- PATRUUNAT 2006 10 MASINO- KEY OY 2 Masino-Hydrosto key Oy toimittaa suodatusjärjestelmiä, suodattimia ja patruunoita hydrauli- ja kiertovoitelujärjestelmiin, kompressoreihin, ilmalle, vedelle

Lisätiedot

Laboratoriopalveluiden saatavuus, riittävyys ja käyttö elintarvikkeiden viranomais- ja omavalvonnassa

Laboratoriopalveluiden saatavuus, riittävyys ja käyttö elintarvikkeiden viranomais- ja omavalvonnassa Laboratoriopalveluiden saatavuus, riittävyys ja käyttö elintarvikkeiden viranomais- ja omavalvonnassa Eviran laboratorioselvitys 2014 Taija Rissanen Evira Selvityksen tavoite kuvata laboratoriokentän ja

Lisätiedot

Käymälästä peltoon. Eeva-Liisa Viskari Yliopettaja Degree Programme in Energy and Environmental Engineering

Käymälästä peltoon. Eeva-Liisa Viskari Yliopettaja Degree Programme in Energy and Environmental Engineering Käymälästä peltoon Eeva-Liisa Viskari Yliopettaja Degree Programme in Energy and Environmental Engineering Hieman historiaa 1800-luvulla ja vielä 1900-luvun peltoviljely perustui lannoittamiseen karjanlannalla.

Lisätiedot

Pienjännitekojeet Kontaktorit, Lämpöreleet, Lisävarusteet

Pienjännitekojeet Kontaktorit, Lämpöreleet, Lisävarusteet Pienjännitekojeet Kontaktorit, Lämpöreleet, Lisävarusteet Tekninen esite A1FI 04_06 1SCC100002C1801 2 Pienjännitekojeet Tekninen esite Kontaktorit Lämpöreleet Lisävarusteet Pienjännitekojeet 3 4 Pienjännitekojeet

Lisätiedot

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014 Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014 Kuvat ja teksti: Markku Koskela Mikrobiologian ylilääkäri Nordlab Oulu Huom! Käyttäkää yläpalkin suurennusmahdollisuutta 100-400% pesäkekasvun

Lisätiedot

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) DNA RNA 7.12.2017 Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Osaamistavoitteet Lärandemål Luennon jälkeen ymmärrät pääperiaatteet

Lisätiedot

evira-3484-liite-2-sir-tulkintarajat.xlsx kiekossa S I R AMINOGLYKOSIDIT Enterobacteriacae, Pseudomonas aeruginosa 10 mg

evira-3484-liite-2-sir-tulkintarajat.xlsx kiekossa S I R AMINOGLYKOSIDIT Enterobacteriacae, Pseudomonas aeruginosa 10 mg Sivu 1 Evira 3484/liite2/2019 VERTAILULABORATORIOTOIMINTA MIKROBILÄÄKEHERKKYYDEN TESTAAMINEN Liite 2. Kiekkoherkkyysmenetelmän SIR-tulkintarajat 1,2,3 Mikrobilääkkeen määrä Estovyöhykkeen halkaisija (mm)

Lisätiedot

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, ICP- OES

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, ICP- OES 1 SYNLAB Analytics & Services Finland Oy Lepolantie 9 03600 KARKKILA Puh. 09 2252860 EVIRAN REKISTERISSÄ OLEVAT MENETELMÄT elintarvikkeet Aerobiset mikro-organismit akkr ISO 4833-1:2013 Myös rohdosvalmisteet

Lisätiedot

Valtioneuvoston asetus

Valtioneuvoston asetus Valtioneuvoston asetus tartuntataudeista Valtioneuvoston päätöksen mukaisesti säädetään tartuntatautilain (1227/2016) nojalla: 1 luku Tartuntatautien luokittelu 1 Yleisvaaralliset tartuntataudit Yleisvaarallisia

Lisätiedot

VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI. Amoxiclav vet 40 mg/10 mg tabletti kissalle ja koiralle 2. LAADULLINEN JA MÄÄRÄLLINEN KOOSTUMUS

VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI. Amoxiclav vet 40 mg/10 mg tabletti kissalle ja koiralle 2. LAADULLINEN JA MÄÄRÄLLINEN KOOSTUMUS VALMISTEYHTEENVETO 1. ELÄINLÄÄKKEEN NIMI Amoxiclav vet 40 mg/10 mg tabletti kissalle ja koiralle 2. LAADULLINEN JA MÄÄRÄLLINEN KOOSTUMUS Vaikuttavat aineet: Amoksisilliini (amoksisilliinitrihydraattina)

Lisätiedot

Kalastustuotteiden omavalvonta

Kalastustuotteiden omavalvonta Kalastustuotteiden omavalvonta ETL Lars-Olof Lindroth Larscon Oy 1 Aluksi Luento on vuorovaikutteinen Kysykää jos joku asia kaivelee mieltä Toivon aktiivista osallistumista ja tavoitteellista keskustelua

Lisätiedot

Utaretulehdusten PCR diagnostiikka - miten tuloksia tulkitaan?

Utaretulehdusten PCR diagnostiikka - miten tuloksia tulkitaan? Utaretulehdusten PCR diagnostiikka - miten tuloksia tulkitaan? Heidi Hiitiö 1*, Rauna Riva 2, Tiina Autio 2, Tarja Pohjanvirta 2, Jani Holopainen 3, Satu Pyörälä 1, Sinikka Pelkonen 2 1 Department of production

Lisätiedot

Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL Juha Partanen

Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL Juha Partanen Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL 19.11.2016 Juha Partanen Geenisakset 2 2 N A T U R E V O L 5 2 2 4 J U N E 2 0 1 5 Sisältö Geenimuokkaus: historiallinen perspektiivi Geenisakset

Lisätiedot

Jakotukit / tarvikkeet

Jakotukit / tarvikkeet Jakotukit / tarvikkeet Tuote LVI-numero Pikakoodi VIRTAUSMITTARI UPONOR SMART S 2022148 BT40 JAKOTUKKIIN PALUUVENTTIILI UPONOR SMART S JAKOTUKKIIN JAKOTUKKI DANFOSS FBH-F RST 2+2 LATTIALÄMMITYS 2+2 VIRTAUKSEN

Lisätiedot

Yhdessä parempaan koulupäivään! Vuorovaikutus, yhteistyö, oppimisen tuki

Yhdessä parempaan koulupäivään! Vuorovaikutus, yhteistyö, oppimisen tuki Yd rm l! Vr, yyö, m l j d K l ld j rll m j l l l r ll r Pr r m l j j j l d T ll. j l j j j jll d l K ö. lö, lll j. O j m l m j yö y. P l l. l j l j l m j, l ö y O y PPl, l MM, yydy l j r- yll l j ll j

Lisätiedot

Hunajan terveysvaikutuksista. Helsingin yliopisto, Ruralia-instituutti ja Luomuinstituutti Carina Tikkanen-Kaukanen FT, dosentti, tutkimusjohtaja

Hunajan terveysvaikutuksista. Helsingin yliopisto, Ruralia-instituutti ja Luomuinstituutti Carina Tikkanen-Kaukanen FT, dosentti, tutkimusjohtaja Hunajan terveysvaikutuksista Helsingin yliopisto, Ruralia-instituutti ja Luomuinstituutti Carina Tikkanen-Kaukanen FT, dosentti, tutkimusjohtaja BerryFoods A. Tuotekehitysosio Pilot-mallituote:marja-hunajmehu,

Lisätiedot

Genetic engineering of a temperature phage-based delivery system for CRISPR/Cas9

Genetic engineering of a temperature phage-based delivery system for CRISPR/Cas9 Genetic engineering of a temperature phage-based delivery system for CRISPR/Cas9 antimicrobials against Staphylococcus aureus Bo Youn Moon 1,2$, Joo Youn Park 1$, Juw Won Park 3, Justin A. Thornton 4,

Lisätiedot

Laajakirjoisia beetalaktamaaseja tuottavat bakteerit ja MRSA - Uudet ilmoitettavat eläintaudit

Laajakirjoisia beetalaktamaaseja tuottavat bakteerit ja MRSA - Uudet ilmoitettavat eläintaudit Laajakirjoisia beetalaktamaaseja tuottavat bakteerit ja MRSA - Uudet ilmoitettavat eläintaudit Erikoistutkija Suvi Nykäsenoja Jaostopäällikkö Antibioottijaosto Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö

Lisätiedot