Tallentajan opas. Julki Pirjo Heikkilä

Transkriptio

1 Tallentajan opas Julki 2017 Pirjo Heikkilä

2 Pirjo Heikkilä Julkin pääkäyttäjä Tays Tutkimus- ja innovaatiopalvelut, Tiedekeskus Raila Melin Tietopalveluneuvoja Tampereen yliopiston kirjasto ARVO Tärkeät linkit tallennukseen: Palveluntuottaja on Istekki: Oy (

3 1/21 Sisällysluettelo 1. Julki-rekisteristä Yleistä tallennuksesta Perusperiaatteet Tyyppiluokitus Tieteenalaluokitus epub-muodot eivät tallennuskelpoisia Hyvä tietää: pitkä otsikko ja puuttuvat sivunumerot Kirjoittajan yhteyksistä Kirjoittajan henkilökortti päivitetään tarpeen mukaan Kirjoittajalla yhteys yhteistyösopimuksen kautta Kirjoittajan yhteys terveydenhuollon yksikköön Monen kirjoittajan julkaisu Monen terveydenhuollon yksikön julkaisu eli yhteisjulkaisu Monen yhteyden kirjoittaja ja hänen tunnistamisensa Kirjoittajan tunnistaminen useaan terveydenhuollon yksikköön Julkaisun luokituksesta Kansainväliset yhteisjulkaisut Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa Julkaisun avoin saatavuus Julkaisun rinnakkaistallentaminen Rinnakkaistallennuksen verkko-osoite Lisää tallennuksesta Study groupit ja konsortiot Open access julkaisu ja sen tallentaminen Kirjan, selvityksen ja kirjan luvun tallentaminen Patentin tallentaminen Toisesta järjestelmästä Julkiin tuodun julkaisun kirjaaminen Bibliografisista mittareista JUFO-pisteet EVO:jen tilalle H-indeksin hakeminen Web of Science - ja Scopus-tietokannoista Valtion tutkimusrahoituksen (VTR) kirjaaminen Lähteet Liitteet... 20

4 2/21 1. Julki-rekisteristä Julkaisurekisteri Julki on Itä-Suomen yliopistossa kehitetty tietojärjestelmä, jonka avulla kerätään ja käsitellään yliopistosairaalassa, yliopistosairaalan erityisvastuualueella sekä yhteistyössä Tampereen yliopiston kanssa syntyneiden julkaisujen tietoja. Rekisterin tärkein tehtävä on tuottaa julkaisuluetteloita valtion sosiaali- ja terveysministeriön kilpailutettavan tutkimusrahoituksen myöntämisen tueksi. Opetus- ja kulttuuriministeriö hyödyntää julkaisutietoja Suomen tiedettä koskevissa selvityksissä ja arvioinneissa. Itä-Suomen yliopiston tietotekniikkakeskus on toimittanut ohjelman kattavan kuvauksen tietokantarakenteineen. Rekisterin nykyinen palveluntuottaja Istekki Oy on PSHP:n osittain omistama. Julkin ohjelmakuvaus ja käyttäjän opas on luettavissa osoitteessa: PSHP:n Julki-tallentajan opas toimii perusoppaana aloittelevalle tallentajalle ja erityistapausten tallennuksen muistin tukena sekä tietolähteenä kokeneelle tallentajalle. Oppaan luvut on kirjoitettu omiksi kokonaisuuksikseen, joita selkeästi merkityt liitteet tukevat. Oppaan verkkopainosta päivitetään vuosittain ja tarpeen mukaan. 2. Yleistä tallennuksesta 2.1 Perusperiaatteet Vain julkaistut julkaisut ovat tallennuskelpoisia. Julkaisu on julkaistu silloin, kun sillä on vuositieto, numero ja sivunumerot. Jotkut lehdet ja kirjat ilmestyvät vain verkossa, mutta yleisimmin niillä on kuitenkin myös painettu versio, jonka tiedot tallennetaan. Tallennus tapahtuu julkaisukopiosta, kun sellainen on saatavissa. Mikäli kyseessä on vain verkossa ilmestyvä lehti tai kirja, tallennus tehdään internettulosteesta, jossa näkyy tulostuspäivä sekä kaikki saatavissa olevat bibliografiset tiedot. Julkiin tallennetaan kaikki ne julkaisut ja artikkelit, jotka ovat ilmestyneet terveystieteellisten alojen lehdissä, sarjoissa, selvityksissä ja kirjoissa. Terveystieteen alojen väitös- ja oppikirjat sekä oppikirjojen luvut tallennetaan myös. JUFO- arvon ei tarvitse olla julkaisukanavalla tallennushetkellä, koska se voi saada arvon myöhemmin. Tallentaja, joka saa ensimmäisenä julkaisun, tallentaa sen ja tunnistaa kaikki tekijät julkaisussa olevan tiedon mukaan. Tallennetun julkaisun kopio lähetetään Tampereen yliopiston ARVO-kirjastoon bibliografisten tietojen tarkistusta varten (liitteet 1 ja 2). Epäselvissä tapauksissa julkaisu lähetetään pääkäyttäjälle Tiedekeskukseen. Huomattavaa on, että vuosittain kaikki edellisenä vuonna ilmestynet julkaisut on oltava tallennettuina ja tarkistettuina kuluvan vuoden helmikuun loppuun mennessä. 2.2 Tyyppiluokitus Tyypiltään tietokantaan tallennetaan julkaisut, jotka ovat alkuperäis- ja katsausartikkeleita, ammatillisia artikkeleita, tieteellisten lehtien pääkirjoituksia tai kirjeitä, artikkeli- ja monografiaväitöskirjoja tai oppikirjoja ja oppikirjojen lukuja, muita kirjoja tai selvityksiä.

5 3/21 Myönnetyt patentit tallennetaan. Niiden ohessa syntyneet lääke- ja terveystieteen alan tuotteet, menetelmät tai laitteet tullevat mukaan tallennettaviin tuotteisiin. Kts.kohta 5.4. Julkaisua tallentaessa kannattaa ensin miettiä julkaisun muoto ja sitten luonne. Julkaisumuotoja ovat esimerkiksi lehtiartikkelit (painetut tai sähköiset) kirjat (painetut tai sähköiset) kirjat osat (painetut ja sähköiset) muut Luonteeltaan julkaisu voi olla tieteellisen alkuperäistutkimuksen raportointia, laaja-alaista yhteenvetoa tai kommentointia kirjoitettu nimenomaan oppikirjaksi ammatillinen tai yleistajuinen teksti Julkaisutyypit on luetultu liitteessä Tieteenalaluokitus OKM:n tieteenalaluokituksessa on Lääke- ja terveystieteen alueella 16 tieteenalaluokkaa. Tätä luokittelua käytetään myös Julkissa (liite 4). 2.5 epub-muodot eivät tallennuskelpoisia Ohjelmaan ei tallenneta in print muodossa, submitted for publication -muodossa tai internetissä ennen varsinaista julkaisua nähtävillä olevia tekstejä eli epub-julkaisuja Matern Child Nutr Oct 7. doi: /mcn [Epub ahead of print] 2.6 Hyvä tietää: pitkä otsikko ja puuttuvat sivunumerot Jos Julkin otsikkokenttään on tallennettava otsikko, joka ei mahdu kokonaan ko. kenttään, otsikkoa kopioidaan niin pitkälti, kun se mahtuu ja loppuun kirjoitetaan etc.

6 4/21 Puuttuvat sivunumerot Esimerkki: Julki-tallennus Pubmedissä: Biomed res Int. 2014; 2014: Is Roux-Y binding pancreaticojejunal anastomosis feasible for patients undergoing left pancreatectomy? Results from a prospective randomized trial. Julkaisussa: Hindawi Publishing Corporation BioMed Research International Volume 2014, Article ID , 6 pages dx.doi.org/ /2014/508714

7 5/21 3. Kirjoittajan yhteyksistä 3.1 Kirjoittajan henkilökortti päivitetään tarpeen mukaan Tallentaja vastaa oman alueensa henkilökorteista. Ne on päivitettävä tarpeen mukaan. Tallennettaessa on huomioitava, että julkaisun tekijän tiedot vastaavat niitä tietoja, jotka hänellä oli julkaisua kirjoittaessaan. Henkilö voi myös julkaista jonkun muun kuin oman yksikkönsä nimissä tai useammankin yksikön nimissä, jolloin julkaisu tunnistetaan aina julkaisussa olevan tiedon mukaan. Julkaisu voidaan näin ollen tunnistaa eri yksiköille ilman, että henkilökorttia muutetaan. Tunnistaminen tapahtuu tällöin lisäämällä toinen yksikkö Laitokset -välilehdellä. Kts kohta Kirjoittajalla yhteys yhteistyösopimuksen kautta Osa tutkijoista voi työskennellä terveydenhuollon yksikössä ns. konsultaatiosopimuksella. Tutkijalla ei ole varsinaista virkaa tai tointa terveydenhuollon yksikössä, mutta hän tekee tiivistä tutkimusyhteistyötä ko. yksikön kanssa. 3.3 Kirjoittajan yhteys terveydenhuollon yksikköön Julkaisussa on oltava selkeä yhteys yliopistosairaalaan tai muuhun valtion tutkimusrahoitukseen oikeutettuun terveydenhuollon yksikköön. Yhteyden on oltava todennettavissa julkaisun kirjoittajien affiliaatioista. Erityistapauksissa riittävänä yhteytenä pidetään sitä, että terveydenhuollon yksikkö on myötävaikuttanut julkaisun syntyyn ja että julkaisu kuuluu johonkin yliopistotasoisen tutkimuksen painoalueeseen>. Myös VTR:n saaminen, terveydenhuollon yksikön resurssien tai potilaiden käyttö julkaisuun johtavissa tutkimuksissa antavat oikeuden affiliaation kirjaamiseen ko. yksikköön. Tutkimuksen tehneen tutkijan ei välttämättä tarvitse olla palvelussuhteessa tutkimusaineiston luovuttaneeseen terveydenhuollon yksikköön, vaan voi ollatyösuhteessa ainoastaan esimerkiksi Tampereen yliopistoon. Monikeskus- ja konsortiotutkimusjulkaisuissa noudatetaan samaa affiliaatioyhteysperiaatetta kuin muissakin julkaisuissa. Tekijän/kirjoittajan yhteyden tallentaminen etenee seuraavasti: tarkistetaan, onko julkaisu jo tallennettu jos ei tallennettu, haetaan Pubmedistä (liite 7: Julkaisutietokantoja) ja tallennetaan kopioi-liitä -toiminnolla jos julkaisu on jo tallennettu, tarkastetaan, että kaikki julkaisussa olevat kirjoittajat on tunnistettu oikein; epäselvät julkaisut lähetetään pääkäyttäjälle jos kirjoittajalla ei ole henkilökortissa yhteyttä terveydenhuollon yksikköön, mutta yhteys on julkaisussa, terveydenhuollon yksikkötieto on lisättävä erikseen tunnistusvaiheessa. Henkilökortti tarkistetaan, ja terveydenhuollon yksikkötieto lisätään tarvittaessa. lopuksi julkaisu lähetetään ARVO-kirjastoon bibliografisten tietojen tarkistusta varten. Kts liite 2.

8 6/ Monen kirjoittajan julkaisu Julkaisuissa voi olla on kirjoittajina useita tutkijoita. Jos kirjoittajia on 1 5, kaikki kirjataan Julki-tietokantaan. Jos tekijöitä on enemmän kuin viisi, kirjoitetaan ensimmäiset kolme ja sitten "et al" (pienillä kirjaimilla, ilman lainausmerkkejä tai pisteitä). Jos Taysin tai sen erityisvastuualueen tekijät eivät ole kolmen ensimmäisen joukossa, heidän nimensä kirjataan "et al" merkinnän jälkeen ja heidät tunnistetaan. Liite 5: Monen kirjoittajan julkaisu 3.5 Monen terveydenhuollon yksikön julkaisu eli yhteisjulkaisu Jos julkaisussa on usean terveydenhuollon yksikön kirjoittajia mainittuna, heidät tunnistetaan omiin yksiköihinsä. Tallennettu julkaisu lähetetään kirjastoon bibliografisten tietojen tarkistamista varten. Liite 6: Yhteisjulkaisut 3.6 Monen yhteyden kirjoittaja ja hänen tunnistamisensa Pääsääntöisesti julkaisun kirjoittajan katsotaan käyttäneen vain yhden terveydenhuollon yksikön resursseja julkaisun tekemiseen (tutkimusaineiston kokoaminen, analysointi, koostaminen, kirjoitustyö jne). Useita yksiköitä voidaan hyväksyä esimerkiksi silloin, jos kirjoittaja on aloittanut tutkimustyön yhdessä terveydenhuollon yksikössä ja jatkanut sen loppuun toisessa. Kirjoittaja tunnistetaan tällöin kahteen tai useaan terveydenhuollon yksikköön julkaisussa olevien affiliaatiomerkintöjen mukaisesti tai kohdassa 3.3 kirjatun erityistapauksen kriteerien täyttyessa. 3.7 Kirjoittajan tunnistaminen useaan terveydenhuollon yksikköön Celiac Disease Specific TG2-Targeted Autoantibodies Inhibit Angiogenesis Ex Vivo and In Vivo in Mice by Interfering with Endothelial Cell Dynamics Katri Kaukisen affiliaatiomerkintä: School of Medicine, University of Tampere and Department of Gastroenterology and Alimentary Tract Surgery, Tampere University Hospital, Tampere, and Department of Medicine, Seinäjoki Central Hospital, Seinäjoki, Finland

9 Tallennus: 7/21

10 1. gastroentelologian vastuualue poistetaan 2. tilalle haetaan Seinäjoen keskussairaala 3. tallennetaan muutos 8/21

11 9/21 Artikkeli näkyy molempien terveydenhuollon yksiköiden luetteloissa: SEKS01 Seinäjoen keskussairaala 2013 Kalliokoski S, Sulic AM, Korponay-Szabó IR, et al, Martucciello S, Mäki M, Kaukinen K, Lindfors K, Caja S. Celiac Disease-Specific TG2-Targeted Autoantibodies Inhibit Angiogenesis Ex Vivo and In Vivo in Mice by Interfering with Endothelial Cell Dynamics. PLoS ONE 2013:8(6):e GAST Gastroenterologian vastuualue 2013 Kalliokoski S, Sulic AM, Korponay-Szabó IR, et al, Martucciello S, Mäki M, Kaukinen K, Lindfors K, Caja S. Celiac Disease-Specific TG2-Targeted Autoantibodies Inhibit Angiogenesis Ex Vivo and In Vivo in Mice by Interfering with Endothelial Cell Dynamics. PLoS ONE 2013:8(6):e65887.

12 10/21 4. Julkaisun luokituksesta 4.1 Kansainväliset yhteisjulkaisut Kansainvälinen yhteisjulkaisu on julkaisu, jossa vähintään yhden artikkelin tekijän terveydenhuollon yksikön osoite on muualle kuin Suomeen. Kansainvälisten yhteisjulkaisujen lukumäärää vertaisarvioiduissa julkaisusarjoissa käytetään PSHP:n tieteellisen toiminnan yhtenä vuosittaisena mittarina tiedejulkaisuviittausmäärien rinnalla. Kts kuva kohdassa Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa Opetus- ja kulttuuriministeriön määritelmä yhteisjulkaisusta yrityksen kanssa ei tätä opaspäivitystä kirjoitettaessa ollut vielä ilmestynyt. Kuva kansainvälisen yhteisjulkaisun ja yhteisjulkaisun yrityksen kanssa merkitsemisestä Julkiin. 4.3 Julkaisun avoin saatavuus Kentät ja niiden määrittelyt tulevat Julkin käyttöliittymään maaliskuussa Julkaisun rinnakkaistallentaminen Kentät ja niiden määrittelyt tulevat Julkin käyttöliittymään maaliskuussa Rinnakkaistallennuksen verkko-osoite Kentät ja niiden määrittelyt tulevat Julkin käyttöliittymään maaliskuussa Lisää tallennuksesta 5.1. Study groupit ja konsortiot Monikeskustutkimuksilla (study group) tarkoitetaan suuria tutkimuskokonaisuuksia, jotka toteutetaan useassa terveydenhuollon yksikössä. Ko. tutkimusten kautta syntyvissä julkaisuissa eri ryhmien tutkijat/kirjoittajat ovat aktiivisia tutkimuksen eri vaiheissa eivätkä osallistu varsinaiseen kirjoitustyöhön. Study groupin tai konsortion nimi voi olla laajassa tiedeartikkelissa kirjoittajaluettelon sisällä tai sen tilalla. Tällöin kirjoittajiksi hyväksytään jokainen ko. ryhmän jäsen, jonka affiliaatio on Tays-ervaan tai joka täyttää kohdan 3.3 erityistapauksen kriteerit.

13 Study group -julkaisun tallennus: 11/21

14 12/ Open access julkaisu ja sen tallentaminen Open Access tarkoittaa tieteen avointa saatavuutta. Avoimeen saatavuuteen liittyy sekä tutkimusjulkaisujen että tutkimusten taustalla olevien tutkimusaineistojen avoin saatavuus. Open Access -julkaiseminen tarkoittaa vapaata oikeutta lukea, kopioida, tulostaa ja linkittää tieteellisiä julkaisuja kokotekstimuodossa. Tieteellinen julkaisu on avoimesti saatavilla, kun sekä tiedeyhteisö että suuri yleisö voi lukea sitä ilmaiseksi Internetistä. 5.3 Kirjan, selvityksen ja kirjan luvun tallentaminen Väitöskirjoja on kahta julkaisutyyppiä artikkeli- ja monografiaväitöskirja. Ensimmäinen on ns."nippuväitöskirja", joka perustuu jo tieteellisissä lehdissä julkaistuihin tai julkaistaviksi hyväksyttyihin artikkeleihin (tavallisesti viiteen). Artikkeliväitöskirjan alussa on yhteenveto erillisartikkeleista. Monografia on väitöskirja, joka on kokonaan aiemmin julkaisematon yhtenäinen kokonaisuus, erillisteos. Artikkeliväitöskirjan (VKA) ja monografiaväitöskirjan (VKM) tallennus: Väitöskirjan nimiölehdellä on kirjattuna tiedot julkaisusarjasta: Acta Universitatis Tamperensis 1850 ISBN (nid.) ISSN-L ISSN

15 13/21 Lisätietoa tunnuksista: ISBN (= International Standard Book Number) koostuu viidestä osasta: Etuliite, maatunnus tai kieliryhmän tunnus, kustantajatunnus, julkaisutunnus ja tarkistusmerkki. ISSN-L tunnus kokoaa julkaisun eri julkaisumuotojen (esim. painetun ja verkkoversion) tunnukset yhteen. ISSN (= International Standard Serial Number) on jatkuvasti ilmestyvän tekstijulkaisun kansainvälinen tunnus.

16 14/21 Toimitettu oppikirja (TOPK): Kuten kirjoitettu oppikirja, mutta toimitettu eikä samojen tekijöiden kokonaan kirjoittama. Tallennukset perustiedot: Tallennuksen bibliografiset tiedot:

17 15/21 Luku oppikirjassa (LOPK): Luku oppilaitos- ja opetuskäyttöön suunnatussa kirjassa. Tallennukset perustiedot: Tallennuksen bibliografiset tiedot:

18 16/21 Toimitettu selvitys tms. (TSELV): Toimitettu, joskus tilattu, yleisselvitys, usein vapaasti saatavilla. Kustantaja on yleensä julkinen organisaatio. Esimerkissä Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen selvitys: Tallennukset perustiedot: Tallennuksen bibliografiset tiedot:

19 17/21 Luku selvityksessä tms. (LSELV): Luku yleisselvityksessä, usein vapaasti saatavilla, kustantaja yleensä julkinen organisaatio. Tallennukset perustiedot: Tallennuksen bibliografiset tiedot:

20 18/ Patentin tallentaminen Patenttijulkaisusta (Patent Specification) kopioidaan keksinnön nimi julkaisun nimeksi. Keksijä tai keksijät tallennetaan julkaisun tekijöiksi. Julki lisää automaattisesti sanan keksijä, keksijät, inventor tai inventors tekijäluettelon loppuun patentin kielestä riippuen. Hakija/omistaja: Tähän kirjoitetaan patenttijulkaisusta hakijayrityksen tai -yhteisön nimi. Keksijät voivat myös itse olla hakijoita, esim. PSHP:n tutkijat. Huom. Patentti tallennetaan Julkiin vasta, kun se on hyväksytty. Tällöin hakija on jo myös patentin omistaja. Patenttihakemuksia ei tallenneta. Maa, jossa myönnetty: Maan nimi kirjoitetaan sen omalla kielellä tai englanniksi siten kuin se esiintyy patenttijulkaisussa. Julki lisää automaattisesti sanan patentti, patent maan nimen jälkeen. Patentin numero: Patenttijulkaisusta. Myöntämispäivämäärä: Patenttijulkaisusta 5.5 Toisesta järjestelmästä Julkiin tuodun julkaisun kirjaaminen Importointi eli toisesta järjestelmästä tuominen helpottaa tallennustyötä siten, että Julkiin tarjolle tulleissa julkaisuissa ovat täytettyinä valmiiksi kentät: julkaisun nimi kirjoittajat julkaisuvuosi bibliografiset tiedot Importoitussa julkaisussa näkyy tallennettaessa ja tulosteissa tieto siitä, milloin importointi on tehty: Tallentajan tehtäväksi jää kirjoittajien tunnistaminen tieteenalaluokan, kansainvälisen yhteisjulkaisuluokan (ruksi tai ei ruksia) merkitseminen ja kansainvälisyysluokan valitseminen (KV tai KANS) lisättäviä tietoja tulee maaliskuussa 2017 lisää Paperitulosteet tarvitaan edelleen, yleensä etusivu riittää, jos siitä on mahdollista tarkistaa bibliografiset tiedot ja kirjoittajien affiliaatiot. Tarvittavan tulosteen saa esille helposti, kun kopioi Julkissa tarjolla olevan julkaisun otsikon PubMedin hakukenttään.

21 19/21 6. Bibliografisista mittareista 6.1 JUFO-pisteet EVO:jen tilalle Tutkijoiden tieteellistä julkaisutoimintaa on helppo mitata määrällisesti. Laadun ja vaikuttavuuden mittaaminen vaatii monipuolisten bibliometristen indikaattoreiden kehittämistä ja hyödyntämistä. Käytössä olevia bibliometrisiä indikaattoreita ovat esimerkiksi Impact Factor -luku, Hirsch-indeksi, SJR (Scientic Journal Ranking), SNIP (Sourse normalized impact per paper), Terkko-factori ja JUFO (Julkaisufoorumiluokitus). Julkaisufoorumiluokitus toimii indikaattorina tieteellisten julkaisukanavien laadun arvioinnissa. Julkaisufoorumissa on kolme tasoluokkaa. Luokkiin 2 ja 3 kuuluvat korkeatasoisimmat ja vaikuttavimmat kansainväliset julkaisukanavat. Luokkaan 1 kuuluu valtaosa tieteellisistä kansainvälisistä ja kansallisista julkaisukanavista, joilla on toimituskunta ja vertaisarviointikäytäntö. Julkaisut, jotka eivät täytä tason 1 kriteereitä, jäävät tasolle 0. Lisätietoa sivulla: H-indeksin hakeminen Web of Science - ja Scopus-tietokannoista Hirsch- eli h-indeksi on vuonna 2005 käyttöönotettu bibliometrinen mittari, jolla voi mitata ja vertailla tutkijoiden vaikuttavuutta. Jos tutkijan julkaisut laitetaan viittausmäärien mukaiseen järjestykseen eniten siteerattu artikkeli ensimmäiseksi, h- indeksi on tutkijan sen julkaisun järjestysnumero, jonka kohdalla siteerausmäärä on mahdollisimman lähellä järjestysnumeroa. Mitä suurempi h-indeksi on, sitä enemmän tutkijalla on paljon viittauksia saaneita julkaisuja. H-indeksissä korostuu tutkijan koko uran merkitys. H-indeksin voi hakea sekä ISI:n Web of Science että Scopus -tietokannoista. Kts. liite 7: 7. Valtion tutkimusrahoituksen (VTR) kirjaaminen Väitöskirjan tekijän affiliaatio on kirjattuna kirjan nimiölehden yläreunaan ja artikkelin kirjoittajan pääsääntöisesti heti otsikon alle. Jos affiliaatio viittaa vain yliopistoon tai muuhun tutkimuslaitokseen, on tarkistettava tekijän maininta tutkimuksen rahoituksesta esim. Kiitokset kohdasta. Valtion tutkimusrahoituksen (VTR) ollessa kyseessä kirjataan artikkelin/julkaisun Kiitokset kohtaan:

22 20/21 Suomenkielisen artikkelin/julkaisun ollessa kyseessä kirjataan artikkelin/julkaisun Kiitokset-kohtaan: Tämä tutkimus on rahoitettu (osittain) Tampereen yliopistollisen sairaalan erityisvastuualueen kilpailutettavalla valtion tutkimusrahoituksella, hankenumero. Englanninkielisen artikkelin/julkaisun ollessa kyseessä kirjataan Acknowledgements-kohtaan. This study was financially supported (partly) by the Competitive State Research Financing of the Expert Responsibility area of Tampere University Hospital, Grant number xxxx. Esimerkki This study was financially supported by the Competitive State Reasearch Financing of the Expert Responsibility area of Tampere University Hospital, 9T Lähteet Julkaisurekisteri Julki, käyttäjän opas on osoitteessa Tampereen yliopistokirjaston sairaalaportaali on osoitteessa Dokumentit "Kansallisesti yhtenäiset periaatteet tieteellisten julkaisujen käsittelyyn valtion tutkimusrahoitukseen oikeutetuissa terveydenhuollon toimintayksiköissä ja Liitteet Liite 1: Liite 2: Liite 3: Liite 4: Liite 5: Liite 6: Liite 7: Kirjoittajan tunnistaminen -kaavio Tallentajat ja TaY:n ARVO-kirjaston yhteystiedot Julkiin tallennettavien julkaisujen tyypit Tieteenalaluokitus Monen kirjoittajan julkaisu Yhteisjulkaisu Julkaisutietokantoja

23 21/21 Muistiinpanoille tilaa:

24 Kirjoittajan tunnistaminen LIITE 1 Julkaisu tallennettavana Kirjoittajalla A affiliaatio Tays-ervan terveydenhuollon yksikköön julkaisu Kirjoittajalla B yhteys Tays-ervan terveydenhuollon yksikköön esimerkiksi potilasaineistojen tai muiden resurssien kautta julkaisu Julkaisu tallennetaan ja sekä kirjoittaja A että B tunnistetaan. julkaisu Julkaisu lähetetään ARVO-kirjastoon (kts. kiite 2).

25 LIITE 2 Pirkanmaan sairaanhoitopiirin tiedejulkaisujen tallentajat ja Tampereen yliopiston ARVO-kirjaston yhteystiedot: Tallentajat: Bibliografiset tarkastukset Raila Melin Puhelin: ) ARVO-kirjasto Lääkärinkatu Tampereen yliopisto sähköposti: etunimi.sukunimi@staff.uta.fi

26 LIITE 3 Julkaisurekisteri Julkiin tallennettavien julkaisujen tyypit Lehtiartikkelit: Julkaisutyyppi Englanninkielinen selite ARTIK Alkuperäisartikkeli Original scientific article KATS Katsausartikkeli tieteellisessä Review, minireview lehdessä PÄÄK Pääkirjoitus tieteellisessä Editorial in scientific journal lehdessä KIRJE Kirje, tms. tieteellisessä lehdessä Letter/comment/tech. note/book review AMM Ammatillinen artikkeli Professional article YLEIS Yleistajuinen artikkeli General purpose/popularized article Konferenssijulkaisut: KONF Opinnäytetyöt: Artikkeli konferenssijulkaisussa Paper in proceefings, extended abstract VKA Artikkeliväitöskirja Doctoral dissertation (articles) VKM Monografiaväitöskirja Doctoral dissertation (monograph) Erillisteokset (kirjoitetut kirjat ja selvitykset) KIRJA Kirjoitettu tieteellinen kirja Authored scientific monograph OPK Kirjoitettu oppikirja Authored prescribed textbook AKIR Kirjoitettu ammatillinen kirja Authored prosession-oriented monograph SELV Kirjoitettu selvitys tms. Authored working paper, report, etc. Kokoomateokset (toimitetut kirjat ja selvitykset): TOIM Toimitettu tieteellinen kirja Edited scientific monoraph TOPK Toimitettu oppikirja Edited prescribed textbook

27 LIITE 3 TAKIR Toimitettu ammatillinen kirja Edited profession-oriented monograph TSELV Toimitettu selvitys tms. Edited working paper, report, etc. Kokoomateosten osat (kirjojen ja selvitysten luvut) LUKU Luku tieteellisessä kirjassa tai Chapter in monograph/series sarjassa LOPK Luku oppikirjassa Chapter in prescribed textbook LAKIR Luku ammatillisessa kirjassa Chapter in professionoriented monograph LSELV Luku selvityksessä tms. Chapter in working paper etc. Muut: PAT Tieteellinen patentti Scientific patent KEKS Keksintöilmoitus Invention report AV ELEKT Audiovisuaalinen tuote (sisäiseen käyttöön) Elektroninen tuote (sisäiseen käyttöön) Audiovisual product Electronic product Alkuperäisartikkeli (ARTIK): Uutta tietoa tai tulkintaa sisältävä tieteelliseen tutkimukseen perustuva artikkeli. Tieteellisen tutkimuksen luonne on riippuvainen tieteenalasta: esimerkiksi lääketiede ja luonnontieteet tekevät usein empiirisiä kokeita numeroilla mitattavilla menetelmillä. Tieteellisen alkuperäisartikkelin ei tarvitse olla empiiristä tutkimusta, vaan se voi olla myös teoreettista tai käsitteellistä kehittelyä tai tulkintaa. Olennaista on, että alkuperäisartikkeli julkistaa uutta tieteellistä tietoa eikä siis ole vain katsaus olemassa olevaan kirjallisuuteen. Useimmiten tieteelliset alkuperäisartikkelit julkaistaan kansainvälisessä lehdessä, jolla on niin sanottu referee-käytäntö eli asiantuntijat arvioivat käsikirjoitukset nimettöminä ennen julkaisupäätöstä. Näin tehdään myös kotimaisissa arvostetuissa lehdissä, esimerkiksi Duodecimissä. Kotimaisissa arvostetuissa lehdissä on usein sekä alkuperäisartikkeleita että ammattikäytäntöön liittyviä artikkeleita, kansainvälisissä tieteellisissä lehdissä taas alkuperäisartikkelien ohella pääkirjoituksia, kirjeitä ja ammattikäytäntöön liittyviä artikkeleita. Luokitus määritellään siis artikkelikohtaisesti eikä lehtikohtaisesti. Tähän luokkaan kuuluvat myös tapausselostukset (case reports, short communications).

28 LIITE 3 Katsausartikkeli tieteellisessä lehdessä (KATS): Katsaus- eli review-artikkeli, jossa tehdään laaja-alainen yhteenveto olemassa olevasta tiedosta kyseisellä la tutkimusalueella. Yhteenveto perustuu usein suureen määrään olemassa olevaa kirjallisuutta aiheesta. Katsausartikkelit julkaistaan yleensä katsauslehdissä (Annual Review of... tai Advances in... tai Yearbook of... tai Current Opinion in... ja niin edelleen) tai muissa tieteellisissä aikakauslehdissä tai sarjajulkaisuissa alkuperäisartikkelien joukossa. Katsaus ei siis sisällä kokeellisten tai kliinisten tutkimusten tai kyselyjen ja haastattelujen tai teoreettisten pohdintojen tuottamaa uutta tietoa tai tulkintaa, vaan katsauksen olemassa olevaan tilanteeseen. Artikkelin katsausluonne ei välttämättä käy ilmi sen nimestä. Tähän luokkaan kuuluu myös minireview. Pääkirjoitus tieteellisessä lehdessä (PÄÄK): Editorial, ledare. Tähän luokkaan tulevat vain sellaisten lehtien pääkirjoitukset, jotka julkaisevat tieteellisiä alkuperäisartikkeleita. Kirje tai muu sellainen tieteellisessä lehdessä (KIRJE): Letter to the Editor, Comment, Technical Note, Book Review. Tieteellisen lehden yleisönosastoon lähetetty kirje, usein mielipiteen ilmaisu tai kommentti. Näissä voi olla myös jokunen kirjallisuusviite lopussa. Tähän luokkaan tulevat myös kirja-arvostelut. Artikkelin nimestä ei asia käy välttämättä ilmi, mutta lehdissä on usein omat osastot tämän tyypin julkaisuille. Ammatillinen artikkeli (AMM): Ei välttämättä tieteellinen, vaan ammattikäytäntöön liittyvä ja tietylle ammattikunnalle tarkoitettu. Nämä julkaistaan usein ammattikäytäntöön liittyvissä lehdissä, jotka eivät valitse artikkeleitaan tieteellisin perustein, esim. TEHY-lehti. Lehdissä julkaistut hoitosuositukset tulevat myös tähän luokkaan, esim. Duodecimin Käypä hoito - suositukset. Yleistajuinen artikkeli (YLEIS): Yleistajuistettu, popularisoitu, maallikolle, potilaille tai suurelle yleisölle tarkoitettu artikkeli esimerkiksi sanoma- tai aikakauslehdessä. Artikkeli konferenssijulkaisussa (KONF): Vertaisarvioitu artikkeli, joka on julkaistu painetussa tai muuten julkisesti saatavilla olevassa konferenssijulkaisussa. Tieteellisessä kongressissa tms. pidetty esitelmä kokonaisuudessaan, ei pelkästään abstrakti. Artikkeliväitöskirja (VKA): "Nippuväitöskirja", joka perustuu jo tieteellisissä lehdissä julkaistuihin tai julkaistaviksi hyväksyttyihin artikkeleihin. Uutta on tavallisesti vain yhteenveto. Erillisartikkelit tallennetaan kukin erikseen oman tyyppinsä mukaisesti. Monografiaväitöskirja (VKM): Väitöskirja, joka on kokonaan aiemmin julkaisematon yhtenäinen kokonaisuus, erillisteos.

29 LIITE 3 Kirjoitettu kirja (KIRJA): Monografia, erillisteos, jonka on kokonaan kirjoittanut (ei toimittanut) sama tekijä tai tekijäryhmä. Kirjalla on yksi tai useampi tekijä, jotka/jotka on/ovat vastuussa koko kirjasta. Sillä on ISBNnumero ja kustantaja. Kirjoitettu oppikirja (OPK): Oppilaitos- ja opetuskäyttöön kirjoitettu erillisteos. Kirjoista ei välttämättä käy ilmi, mikä on alun perin tarkoitettu oppikirjaksi, mutta joskus sellainen kirjoitetaan varta varten. Tähän luokkaan kuuluminen ei siis riipu siitä, onko kirja hyväksytty jossakin tutkintovaatimuksiin vai ei. Kirjoitettu ammatillinen kirja (AKIR): Ammattiyhteisölle kirjoitettu kirja, käytännön työhön soveltava ja sitä tukeva erillisteos. Kirjoitettu selvitys tms. (SELV): Muut kuin tieteelliset kirjat; yleistajuinen kirja, working paper, occasional paper, esi-, väli- tai loppuraportti, erillisinä julkaistut hoitosuositukset, muu selvitys, kaunokirjallinen teos, jne. Se on tilattu yleisselvitys, usein vapaasti saatavilla. Kustantaja on yleensä julkinen organisaatio. Selvitys saattaa perustua esimerkiksi jo olemassa oleviin tilastolukuihin tai muihin tietoihin ilman uutta tieteellistä pohdintaa. Toimitettu tieteellinen kirja (TOIM): Tieteellinen kirja, jota sama henkilö tai ryhmä ei ole kirjoittanut kokonaan, vaan on koonnut sen useimmiten monelta kirjoittajalta ja tehnyt toimitustyön. Toimitettu oppikirja (TOPK): Kuten kirjoitettu oppikirja, mutta toimitettu eikä samojen tekijöiden kokonaan kirjoittama. Toimitettu ammatillinen kirja (TAKIR): Toimitettu ammatillinen käsi- tai opaskirja. Toimitettu selvitys tms. (TSELV): Toimitettu, joskus tilattu, yleisselvitys, usein vapaasti saatavilla. Kustantaja on yleensä julkinen organisaatio. Luku tieteellisessä kirjassa/kirjasarjassa (LUKU): Tekijä tai tekijäryhmä on kirjoittanut luvun (jakson, artikkelin) jonkun toisen toimittamaan tieteelliseen kirjaan. Sama henkilö tai ryhmä voi sekä toimittaa koko kirjan että kirjoittaa siihen yhden tai useamman luvun. Koostuu pääosin julkaisemattomasta materiaalista. Kirjan toimituskunta tai vastaava on vertaisarvioinut artikkelin. Kirjalla on ISBN-numero. Kirjan on julkaissut tieteellinen julkaisija. Luku oppikirjassa (LOPK): Luku oppilaitos- ja opetuskäyttöön suunnatussa kirjassa.

30 LIITE 3 Luku ammatillisessa kirjassa (LAKIR): Luku ammattiyhteisölle kirjoitetussa kirjassa, käytännön työhön sovellettavaa tietoa. Luku selvityksessä tms. (LSELV): Luku yleisselvityksessä, usein vapaasti saatavilla, kustantaja yleensä julkinen organisaatio. Tieteellinen patentti (PAT): Patentti on yhteiskunnan keksijälle myöntämä yksinoikeus keksinnön ammattimaiseen hyödyntämiseen. Patentista on oltava tiedossa sen keksijä(t), omistaja(t) ja myöntämispäivämäärä. Audiovisuaalinen tuote (AV): Filmi, elokuva, radio- tai TV-ohjelma. Elektroninen tuote (ELEKT): Elektroninen tuote on eri asia kuin julkaisu elektronisessa muodossa. Elektroninen tuote on esimerkiksi tietokoneohjelma tai multimediatuote. Huom! Pro gradu töitä ei tallenneta Julkiin

31 LIITE 4 Julkin uusi tieteenalaluokitus vuodesta Lääke- ja terveystieteet (OKM:n luokituksesta) Luokan Luokan nimi Luokan sisältö koodi 311,1 Biolääketieteet Anatomia ja morfologia, ihmisen genetiikka. immunologia, fysiologia, sytologia, patologia 311,2 Neurotieteet 312,1 Sisätaudit Andrologia, sydän ja verenkiertojärjestelmä, ääreisverenkierron sairaudet, hematologia, hengityselimet, iho- ja sukupuolitautioppi, allergiat, reumatologia, endokrinologia ja aineenvaihdunta, gastroenterologia ja hepatologia, urologia ja nefrologia, geriatria ja gerontologia, yleislääketiede ja sisätautioppi 312,2 Syöpätaudit Onkologia 312,3 Naisten- ja lastentaudit Synnytysoppi ja gynekologia, lastentautioppi 312,4 Neurologia ja psykiatria Kliininen neurologia, psykiatria 312,5 Korva-, nenä- ja kurkkutaudit, silmätaudit 312,6 Kirurgia, anestesiologia, tehohoito, radiologia Kirurgia, akuutti- ja ensihoito, anestesiologia, ortopedia, radiologia, isotooppilääketiede ja lääketieteellinen kuvantaminen, elinsiirrot 313 Hammaslääketieteet Suukirurgia ja -lääketiede 314,1 Terveystiede Sairaanhoito, ravitsemustiede, ruokavalio-oppi, infektiotaudit, epidemiologia, päihdyttävien aineiden väärinkäyttö, lääketieteen etiikka 314,2 Kansanterveystiede, Kansanterveys ja ympäristöterveys, työterveys ympäristö ja työterveys 315 Liikuntatiede 316 Hoitotiede Terveydenhuolto-oppi ja palvelut (myös sairaalahallinto ja terveydenhuollon rahoitus), terveyspolitiikka ja -palvelut 317 Farmasia Toksikologia, lääkeainekemia, farmakologia 318 Lääketieteen bioteknologia 319 Oikeuslääketiede ja muut lääketieteet Terveyden biotieteet; solujen, kudosten ja elinten manipulointiin liittyvät teknologiat; DNA:n ja proteiinien toiminnan tunnistaminen, vaikutukset hyvinvointiin/sairastavuuteen; biomateriaalit, lääketieteen biotekniikkaan liittyvä etiikka

32 LIITE 5 Monen kirjoittajan julkaisut ESIMERKKI 1: J Clin Invest July 1; 118(7): Variations in the G6PC2/ABCB11 genomic region are associated with fasting glucose levels Wei-Min Chen, 1,2 Michael R. Erdos, 3 Anne U. Jackson, 4 Richa Saxena, 5 Serena Sanna, 4,6 Kristi D. Silver, 7 Nicholas J. Timpson, 8 Torben Hansen, 9 Marco Orrù, 6 Maria Grazia Piras, 6 Lori L. Bonnycastle, 3 Cristen J. Willer, 4 Valeriya Lyssenko, 10 Haiqing Shen, 7 Johanna Kuusisto, 11 Shah Ebrahim, 12 Natascia Sestu, 13 William L. Duren, 4 Maria Cristina Spada, 6 Heather M. Stringham, 4 Laura J. Scott, 4 Nazario Olla, 6 Amy J. Swift, 3 Samer Najjar, 13 Braxton D. Mitchell, 7 Debbie A. Lawlor, 8 George Davey Smith, 8 Yoav Ben-Shlomo, 14 Gitte Andersen, 9 Knut Borch-Johnsen, 9,15,16 Torben Jørgensen, 15 Jouko Saramies, 17 Timo T. Valle, 18 Thomas A. Buchanan, 19,20 Alan R. Shuldiner, 7 Edward Lakatta, 13 Richard N. Bergman, 20 Manuela Uda, 6 Jaakko Tuomilehto, 18,21 Oluf Pedersen, 9,16 Antonio Cao, 6 Leif Groop, 10 Karen L. Mohlke, 22 Markku Laakso, 11 David Schlessinger, 13 Francis S. Collins, 3 David Altshuler, 5 Gonçalo R. Abecasis, 4 Michael Boehnke, 4 Angelo Scuteri, 23,24 and Richard M. Watanabe 20,25 Luettelon alku ja loppu poistettu esimerkistä. 18 Diabetes Unit, Department of Health Promotion and Chronic Disease Prevention, National Public Health Institute, and Department of Public Health, University of Helsinki, Helsinki, Finland. 19 Department of Medicine, Division of Endocrinology, and 20 Department of Physiology and Biophysics, Keck School of Medicine, University of Southern California, Los Angeles, California, USA. 21 South Ostrobothnia Central Hospital, Seinäjoki, Finland.

33 LIITE 5 Tallennus: Tuomilehto J tunnistetaan Seinäjoen keskussairaalaan. Ei-tulosteta -ruksia ei välttämättä tarvitse laittaa, koska julkaisuluetteloita ei enää paineta PSHP:n vuosikertomuksen osana ESIMERKKI 2 Diabetologia May;51(5): Serum α- and γ-tocopherol concentrations and risk of advanced beta cell autoimmunity in children with HLA-conferred susceptibility to type 1 diabetes mellitus L. Uusitalo 1, 2, J. Nevalainen 1, 2, S. Niinistö 3, G. Alfthan 4, J. Sundvall 4, T. Korhonen 2, M. G. Kenward 5, H. Oja 1, R. Veijola 6, O. Simell 7, 8, J. Ilonen 9, 10, M. Knip 8, 11, 12 1, 2, 13 and S. M. Virtanen Luettelon alku poistettu esimerkistä 2 11 Department of Pediatrics, Tampere University Hospital, Tampere, Finland 12 Tampere University Hospital Research Unit, Tampere, Finland

34 LIITE 5

35 LIITE 6 Terveydenhuollon yksiköiden yhteisjulkaisu Suomen lääkärilehti 15-16/2009 vsk 64

36 LIITE 6 Kirjoittajien tunnistaminen eri terveydenhuollon yksiköihin (kohdat 1-4) Kirjoittajien tunnistaminen eri terveydenhuollon yksiköihin (kohdat 5-7)

37 Julkaisun kaikkien tunnistettujen kirjoittajien terveydenhuollon yksikkötiedot näkyvissä. LIITE 6

38 LIITE 7 Julkaisujen etsimistä ja tallennusta helpottavia tietokantoja Tampereen yliopiston kirjaston sivulla Keskeiset lääketieteen tietokannat (TaY)> Tärkeitä tietokantoja Julkaisujen perushaku Kotimaiset e-artikkelit Ulkomaiset e-lehtiartikkelit PubMed haku (ulkomaiset) Medic (kotimaiset) Andor kirjastokokoelma > kotimaiset lehdet Andor-tietokanta E-kirjat Andor kirjastokokoelma > Tutkijan ja/tai terv.huollon yksikön julkaisujen haku Hirsch-indeksin haku Tietoa JUFO-luokituksesta Julkin julkaisut näkyvät Julkaisujen Impact Factor arvojen hakeminen Scopus, Web of Science, Scopus, Web of Science Julkaisufoorumi Juuli Impact factors (JCR)

39