Projektitiimisi toivottaa sinut tervetulleeksi!

Projektitiimisi toivottaa sinut tervetulleeksi! Hyvä tutkija University of California San Francisco on valinnut LabCorp Clinical Trialsin suorittamaan DNA:n ekstraktion tutkimussuunnitelmassa POINT NCT00991029. Olemme iloisia tästä valinnasta ja valmiita tarjoamaan sinulle ja tiimillesi tarvittavaa tietoa ja ohjeita menestyksellisen yhteistyön saavuttamiseksi. Alla ovat tähän tutkimukseen määrättyjen LabCorpin tiimien jäsenten nimet ja ilmaisnumerot. Kehotamme sinua ottamaan meihin yhteyttä niin usein kuin tarpeellista, jotta voimme vastata kaikkiin kysymyksiin ja huolenaiheisiin. Olemme valmiita antamaan tarvittavaa tukea ja apua tässä tutkimuksessa. Tutkimuskeskuksesi tukitiimi on ensimmäinen tiedonvälityskanava useimpia tutkimukseen liittyviä asioita varten. LabCorpin Clinical Trials -osasto on avoinna klo 8.00 18.00 (CET) maanantaista perjantaihin. Aukioloaikojen ulkopuolella ja viikonloppuisin ja juhlapäivinä puhelinnumerot on yhdistetty puhelinvastauspalveluun. Soittoihin vastataan seuraavana normaalina työpäivänä. Kaikkien tämän tutkimuksen kliiniseen osaan liittyvien henkilöiden tulisi käydä läpi kaikki asianmukaiset ohjeet ja menettelytapojen selitykset ennen näytteiden keräämistä tai lähettämistä. Jos teillä on kysymyksiä tai huolenaiheita, ottakaa yhteyttä seuraavassa mainittuihin tiimin jäseniin. Toivotamme sinulle ja tiimillesi menestystä tutkimuksessa ja olemme valmiita vastaanottamaan näytteitä. Ystävällisin terveisin Tina Cuylen, Projektipäällikkö Tutkimuskeskuksen tukitiimi Puh: +32-15-342-164 Faksi: +32-15-342-136 Sähköposti: MonitoringEurope@labcorp.com Projektipäällikkö Tina Cuylen Puh: +32-15-342-214 Sähköposti: cuylent@labcorp.com Avustavat projektipäälliköt Puh: +32-15-342-190/208/212 Sähköposti: APMBelgium@labcorp.com Muut numerot LabCorp Yleinen puhelinnumero: +32-15-342-111 LabCorp Yleinen faksi: +32-15-342-147

Ilmaisnumerot: Australia 1800808020 Itävalta 0800 293184 Belgia 0800 93 828 Bulgaria 800 861 4502 Kroatia 800 8614509 Tšekin tasavalta 800 900 388 tai 800142640 Tanska 80 24 08 53 Viro 800 044113 Suomi 0800 98773 Ranska 0800 053 254 Saksa 0800 2000 127 Kreikka 00800 44149368 Unkari 06800 14094 Irlanti 1800 925012 Israel 180 9242029 Italia 800 253133 Latvia 8000 0439 Liettua 800 861 4502 Luxemburg 80029454 Alankomaat 0800-0231785 Uusi-Seelanti 0508 500123 Norja 800 30 135 Puola 00800 4411336 Portugali 800 20 43 50 Romania 800894427 Venäjä 7 495 5809450 Slovenia 0800 80030 Slovakia 0800 004613 tai 0800 004427 Etelä-Afrikka 0800 99 1159 Espanja 0 900210314 Ruotsi 0200 110262 Sveitsi 0800 80 1754 Turkki 00800448820610 Ukraina 800 861 4502 Yhdistynyt kuningaskunta 0800 169 4076 HUOMAUTUS: Jos maallesi ei ole ilmaisnumeroa, soita LabCorpin yleiseen numeroon tai ota yhteyttä tutkimuskeskuksen tukitiimiin.

LABORATORION KÄSIKIRJA VAIN EU:n tutkimuskeskukset University of California San Francisco POINT NCT00991029 Toimeksiantaja: University of California San Francisco 675 Nelson Rising Lane, Room 402A San Francisco, CA 94158 USA Keskuslaboratorio: LabCorp Clinical Trials Intercity Business Park Generaal De Wittelaan L11 A2 2800 Mechelen, Belgia LabCorp Clinical Trials Center for Esoteric Testing 1447 York Court Burlington, NC 27215 USA LabCorp Clinical Trials LabCorp CMBP 1904 Alexander Drive RTP, NC 27709 USA LabCorp Biorepository 724 Chipola Street Kannapolis, NC 28083 USA

SISÄLLYSLUETTELO Yhteenveto muutoksista Toimintasuunnitelma Yleinen johdanto Kuriiritiedot Oikea näytteenottopakkaus Laboratorion lähetelomake Näytteen otto ja valmistelu Näytteiden pakkaus kuljetusta varten Tulosraportti University of California San Francisco POINT NCT00991029 tutkimusta koskevat ohjeet ja menettelytavat Luku 1: Kuriiritiedot Luku 2: Mittausten aikataulu Luku 3: Testipyyntöjen esimerkkejä Luku 4: Näytteenotto ja valmistelu Luku 5: Näytteiden pakkaus ja kuljetus Luku 6: Raportointi ja suoritusaika Lisäasiakirjat Liite 1: Yleiset vapaapäivät Liite 2: Viitealueet Liite 3: Laboratorion akkreditointi Liite 4: CV, Lääketieteellinen johtaja Liite 5: Lomakkeet POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 2 / 23 101993 Finnish

YHTEENVETO MUUTOKSISTA Muutoksen kuvaus Osa Lisäyspäivämäärä Versio Ensimmäinen julkaisu Ei sovellu 12 joulu 2013 1.0 Päivitetyt APM-puhelinnumerot Tervetuloa 12 huhti 2016 2.0 Päivitetty versio ja päiväys Alatunniste 12 huhti 2016 2.0 Päivitetyt pyynnöt 5-numeroisella luvulla Luku 3 12 huhti 2016 2.0 2013-2015 lomat poistettu Liite 1 12 huhti 2016 Ei sovellu Kaikki Mechelenin, RTP1904:n ja Burlingtonin sertifikaatit päivitetty Kaikki Mechlelenin, RTP1904:n ja Burlingtonin CV:t päivitetty Liite 3 Liite 4 12 huhti 2016 Ei sovellu 12 huhti 2016 Ei sovellu POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 3 / 23 101993 Finnish

TOIMINTASUUNNITELMA Kuriiritiedot Valitse oikea näytepakkaus Täytä laboratorion lähetelomake Kerää ja valmistele näytteet Pakkaa kuljetusta varten Tulosraportti POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 4 / 23 101993 Finnish

Näytteiden tutkimuspaikasta laboratorioon kuljetusta varten on valittu mahdollisesti yksi tai useampia kuriireita. Jos saat lisätietoja kuriirin ohjeiden mukana, käy ne läpi ja säilytä luvussa 1. Järjestä näytteiden noutaminen valitun kuriirin kanssa Viimeisin tilausaika: Tämä aika on kuriiriyhtiön antama ja on myöhäisin mahdollinen aika sen päivän näytteiden noutamisen järjestämiseksi. Varmistaaksesi näytteiden oikea-aikaisen noudon ja keskuslaboratorioon toimituksen, on erittäin tärkeää kutsua kuriiriyhtiö ennen tätä "viimeisintä tilausaikaa": Kehotamme kuitenkin kaikkia tutkimuskeskuksia antamaan kuriiriyhtiölle ennakkotiedot päivää ennen näytteen keräystä. Tilausnumero: Kun olet ajoittanut näytteiden noudon, sinulle annetaan tilaus- tai noutonumero. Kirjaa tämä numero pyyntösi vahvistuksena. Viimeisin noutoaika: Tämä on päivän viimeinen mahdollinen ajankohta, jolloin kuriiri voi noutaa näytteet tutkimuskeskuksestasi ja toimittaa ne määrätyssä ajassa keskuslaboratorioon. Tämä aika perustuu tarjottuun rutiinipalveluun. Noutoon liittyviä ongelmia: Jos sinulla on ongelmia näytteiden noutamisen suhteen (esim. kuriiri ei saavu), ota heti yhteyttä LabCorpiin. Sinun on annettava meille tilausnumero ja lentorahtikirjan numero, jotta voimme selvittää asian kuriiriyhtiön kanssa. Älä odota seuraavaan päivään, ennen kuin tiedotat asiasta LabCorpille, koska tämä voi viivästyttää näytteiden käsittelyä ja heikentää näytteiden eheyttä. Kuivajää Jos näytteiden kuljetukseen tarvitaan kuivajäätä, katso sen tilaustietoja luvusta 1. Juhlapäivät Tarkista maasi paikalliset juhlapäivät ennen näytteiden lähettämistä, koska tulli- ja kuriiripalvelut saattavat olla niinä päivinä, niitä edellisinä tai niiden jälkeisinä päivinä kiinni. Tarkista myös ennen lähetystä sen maan kansalliset juhlapäivät, johon näytteet lähetetään. LabCorpin laitokset ovat kiinni sunnuntaisin ja tiettyinä juhlapäivinä (katso liite 1). YLEINEN JOHDANTO KURIIRITIEDOT On suositeltavaa välttää lähetyksiä juuri ennen päivämääriä, jotka on lueteltu liitteessä 1. Varmistaaksesi oikea-aikaisen toimituksen ajoita lähetyksesi vähintään 3 päivää ennen juhlapäivää. KATSO ERITYISIÄ TUTKIMUKSEESI LIITTYVIÄ KURIIRITIETOJA LUVUSTA 1. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 5 / 23 101993 Finnish

YLEINEN JOHDANTO OIKEA NÄYTTEENOTTO- PAKKAUS Sinulle on toimitettu näytteenottopakkauksia ja joitakin tukkutarvikkeita. Kussakin pakkauksessa on vaaditut materiaalit näytteiden ottamista, valmistelemista ja LabCorpin kliinisten tutkimusten osastolle palauttamista varten. Lähetelomake ja viivakoodilla varustetut materiaalit, jotka ovat kunkin pakkauslaatikon sisällä, ovat valmiiksi painettuja ja sisältävät saman viivakoodinumeron. Älä vaihda pakkausten sisältöjä keskenään. Kaikki etiketit on täytettävä ennen näytteiden lähettämistä. VARMISTA, ETTÄ OLET VALINNUT OIKEAN NÄYTTEENOTTOPAKKAUKSEN: Tarkista TUTKIMUKSEN TUTKIMUSSUUNNITELMA Tarkista PAKKAUSTYYPPI Tarkista VIIMEINEN KÄYTTÖPÄIVÄMÄÄRÄ Jos käynnille on valittu väärä näytteenottopakkaus, näytteitä voi puuttua tai tarpeettomia näytteitä voidaan ottaa. Tulokset myös kirjataan ja raportoidaan väärälle käynnille. Kyseisten näytteiden vahvistaminen voi viivästyttää tulosten raportointia. Jos pakkaukset ovat pian vanhenemassa Tilaa uusia pakkauksia liitteessä 5 annetulla tilauslomakkeella. Vanhenneet pakkaukset on hävitettävä paikallisten säädösten mukaisesti. Jos näytteenotto ei onnistunut Jos jotakin on rikkoutunut tai mennyt hukkaan, korvaa se tukkutarvikkeella. Kussakin näytteenottopakkauksessa on lisää viivakoodattuja etikettejä. Kiinnitä yksi ylimääräisistä viivakoodatuista etiketeistä niin, että se voidaan skannata helposti (esim. putken pituussuunnassa). Varmista, että "Lot Expiration" -viivakoodia (Erän viimeinen käyttöpäivämäärä) ei peitetä. Täytä vaaditut etiketin tiedot ja myös vaaditun testin nimi. Tarvikkeiden tilaaminen Tilaa lisää tarvikkeita kopioimalla tutkimuskohtainen tilauslomake, joka sisältyy liitteeseen 5. Täytä tarvikkeiden tilauslomake ja faksaa tai lähetä sähköpostissa lomakkeen ylälaidassa olevaan numeroon ja osoitteeseen. Tarvikkeita tilattaessa varaa vähintään 5 7 arkipäivää tarvikkeiden kokoamiseen ja toimittamiseen POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 6 / 23 101993 Finnish

KATSO ESIMERKKEJÄ TUTKIMUKSEEN LIITTYVISTÄ LÄHETELOMAKKEISTA LUVUSTA 3. Laboratorion lähetelomake sisältyy näytteenottopakkaukseen DNA:n ekstraktiota/plasman säilytystä varten lähetetyillä näytteillä täytyy olla mukana lähetelomake. Lähetelomakkeessa olevan viivakoodinumeron täytyy olla sama kuin esipainetussa etiketissä oleva viivakoodinumero. Lähetelomakkeessa olevien potilas- ja näytteenottotietojen täytyy olla samat kuin etiketissä olevat potilastiedot. Potilastiedot on kirjoitettava selvästi ja täydellisesti. YLEINEN JOHDANTO LABORATORION LÄHETELOMAKE LABORATORIO Kaikki pyydetyt potilas- ja näytteenottotiedot täytyy antaa kullekin käynnille, jotta varmistetaan oikea näytteiden käsittely laboratoriossa. HUOMAUTUS: Jos yllä olevissa menettelyissä on ristiriitaisuuksia tai havaitaan eroja potilaan demografisissa tiedoissa, laitostasi pyydetään vahvistamaan tiedot. Tämä voi viivästyttää tulosraportteja. Esipainettu tutkimussuunnit elman ja tutkijan nimi ja tutkimuskeskuks en numero TOIMEKSIANTAJAN NIMI TUTKIMUSSUUNNITELMAN TUNNUS ETUNIMI SUKUNIMI TUTKIMUSKE SKUKSEN NUMERO TILI Ainutkertainen viivakoodinumero, joka yhdistää kaikki pakkauksen tarvikkeet Lisäohjeet Potilaan osa Demografiset tiedot Käyntikohtaiset testitiedot LIITÄ YKSI KOPIO KUSTAKIN LÄHETELOMAKKEESTA (POTILASTA KOHDEN) KUHUNKIN LÄHETYKSEEN SÄILYTÄ YKSI KOPIO KUSTAKIN LÄHETELOMAKKEESTA OMASSA ARKISTOSSASI POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 7 / 23 101993 Finnish

YLEINEN JOHDANTO LABORATORION LÄHETELOMAKE TÄYTÄ KAIKKI LÄHETELOMAKKEESSA PYYDETYT DEMOGRAFISET TIEDOT 1. Käytä kansainvälistä päivämäärää: (ts. 15-LOK-2011) Käytä seuraavia lyhennyksiä (KKK) kuukausiin: TAM (tammikuu) HEL (helmikuu) MAA (maaliskuu) HUH (huhtikuu) TOU (toukokuu) KES (kesäkuu) HEI (heinäkuu) ELO (elokuu) SYY (syyskuu) LOK (lokakuu) MAR (marraskuu) JOU (joulukuu) 2. Käytä 24 tunnin aikaa: (ts. 14.30) 3. JOS SOVELLETTAVISSA: - Muista merkitä oikea käynti. 4. Älä kirjoita mitään tietoja osaan "Vain LabCorpin käyttöön". HUOMAUTUS: Älä tilaa mitään muita testejä kuin mitä lähetelomakkeessa on osoitettu. LabCorp Clinical Trials ei voi suorittaa tutkimussuunnitelman ulkopuolista testiä ilman toimeksiantajan kirjallista suostumusta. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 8 / 23 101993 Finnish

YLEINEN JOHDANTO NÄYTTEENOTTO JA VALMISTELU Kaikkien näytteiden on saavuttava vastaavan lähetelomakkeen kanssa näytepussissa. Kaikki näytteet on tunnistettava vastaavilla viivakoodi- ja potilasetiketeillä. Näytevaatimukset on määritettävä huolellisesti. On erittäin tärkeää, että tämän käsikirjan ja testipyynnön lomakkeen ohjeita noudatetaan tarkasti. Näytevaatimusten esimerkkejä voivat olla mm: o Näytetyyppi (esim. seerumi, plasma, kokoveri, virtsa, kudos) o Putki/säiliötyyppi (esim. punakorkkinen putki (ei säilytysainetta), natriumhepariini, formaliini) o Lämpötila (esim. huoneenlämpö, jääkaappi, pakastettu) o Näytteen määrä (esim. vaadittu vähimmäismäärä, täydellinen määrä-ei pieniä näytteitä) POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 9 / 23 101993 Finnish

YLEINEN JOHDANTO NÄYTTEIDEN PAKKAAMINEN JA KULJETUS HUOMAUTUS: Lähetykset ovat paikallisten, kansallisten ja kansainvälisten lakien ja säännösten alaisia. Lähetyksiä valmistelevat henkilöt ovat vastuussa siitä, että kaikkia soveltuvia vaatimuksia, lakeja ja sertifiointeja noudatetaan. Kuljetuslaatikot, jotka LabCorp tai kuriiri toimittaa keskukseesi, ovat IATA:n määräysten mukaisia. Tässä käsikirjassa olevat tekniset tiedot eivät täytä säännöstenmukaisia koulutus- tai sertifiointivaatimuksia. Kaikki sertifiointia koskevat kysymykset vaarallisten aineiden valmistelusta, käsittelystä tai lähetyksestä tulee esittää asianmukaisille viranomaisille tai valvontaviranomaisille. Saat luettelon IATA:n (Kansainvälisen ilmakuljetusliiton) hyväksymistä koulutuspaikoista ottamalla yhteyden paikalliseen toimistoon (tiedot osoitteessa www.iata.org/about/offices) tai IATA:n pääpaikasta Montrealissa, Kanadassa (+ 1 514 874 0202). POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 10 / 23 101993 Finnish

YLEINEN JOHDANTO TULOSRAPORTTI Kaikki tutkimukseen liittyvät tiedot välitetään toimeksiantajan tarkkojen ohjeiden mukaisesti. Puuttuvat demografiset tiedot tai ristiriitaisuudet voivat viivästyttää tiedonsiirtoa. KATSO TUTKIMUSKOHTAISTA TULOSTEN RAPORTOINTIA LUVUSTA 6. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 11 / 23 101993 Finnish

University of California San Francisco POINT NCT00991029 Tutkimuskohtaiset ohjeet VAIN EU-tutkimuskeskukset POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 12 / 23 101993 Finnish

LUKU 1 KURIIRITIEDOT Näytteiden kuljetukseen valittu kuriiri: (Tässä ruudussa annetaan tutkimuskeskukseen liittyvän kuriirin etiketti) Verkkosivuston osoite: Voit seurata lähetystäsi seuraavalla verkkosivustolla: www.tnt.com / www.dhl.com antamalla lentorahtikirjan numeron. MUISTUTUS: Näytteet voidaan lähettää LabCorp Clinical Trialsille vain MAANANTAISTA TORSTAIHIN POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 13 / 23 101993 Finnish

LUKU 1 Tilaa kuivajäätä Kuivajäätä voidaan tilata LabCorpille lähetyksiä varten. Tämä voidaan tehdä faksaamalla kuivajään tilauslomake, joka on tämän käsikirjan takaosassa (katso osa "Lomakkeet"). Täytä vaaditut tiedot kenttiin, jos niitä ei ole esipainettu, ja faksaa lomakkeessa olevaan numeroon. Kuivajää on toimitettava 1 PÄIVÄ ENNEN näytteiden lähetystä. Tilaa kuivajäätä vain tiistain ja keskiviikon toimitusta varten. HUOMAUTUS: Kuriiri toimittaa pakastettujen lähetysten kuljetuslaatikot kuivajään toimituksen kanssa. Nämä kuljetuslaatikot sisältävät kuivajäätä, joka vaaditaan pakastettujen näytteiden lähetykseen. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 14 / 23 101993 Finnish

LUKU 1 Lentorahtikirja Tutkimuskeskukseesi on toimitettu esipainettuja lentorahtikirjoja. Allekirjoita ja päivää lentorahtikirja ja lisää se lähetettävään pakkaukseen. Kun kuljettaja on täyttänyt asianmukaiset osat, ota yksi kopio arkistoosi. Esimerkki DHL:n lentorahtikirjasta (3-sivuinen NCR-paperi) 1. kopio laita muovitaskuun 2. kopio kuriirille 3. kopio tutkimuskeskukselle Esimerkki TNT-lentorahtikirjasta Allekirjoita ja päivää Tämä osa kuuluu pakettiin laita muovitaskuun Päivämäärä _ Tämä osa kuriirille Allekirjoita ja päivää _ Tämä osa tutkimuskeskuksen arkistoon Huomautus: Jos näytteiden noutamisessa on ongelmia, ota heti yhteyttä LabCorpin tutkimuskeskuksen tukiryhmään. Ole valmis antamaan tilaus- ja lentorahtikirjanumerot. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 15 / 23 101993 Finnish

LUKU 2 MITTAUSTEN AIKATAULU Käyntinimi/käyntinumero Käyntien väli Käyntityyppi Näyteputki/työ putki Testipaneeli/nimi Näytetyyppi Keräysputki (tulee takaisin) Näytteet, jotka voidaan jakaa eriin Lähtötason DNA + Plasma A Plasma- säilytys Plasma EDTA de 10 ml 6 x 2 ml:n kryoputki P DNA-ekstraktio- Buffy coat 10 ml kryoputki Kyllä** P *Tutkimuspaikassa sentrifugoinnin jälkeen plasma siirretään 6 x 2 ml:n kryoputkiin ja jäädytetään tutkimuspaikassa. Jäljellä olevat punasolut ja buffy coat siirretään 10 ml:n EDTA-putkesta 10 ml:n kryoputkeen ja jäädytetään. Lähetetään 2 ml:n kryoputkien kanssa. **Näytteet voidaan jakaa eriin tutkimuspaikassa ja lähettää 3 kuukauden välein vain, jos näytteet säilytetään pakastimessa -70 C:n lämpötilassa tai sitä kylmemmässä. Jos tutkimuspaikassa ei ole -70 C:n pakastimia, näytteet on säilytettävä lämpötiloissa -20 C, -30 C tai - 40 C ja lähetettävä 4 päivän kuluessa näytteenotosta LabCorpille, Mecheleniin, Belgiaan). Huomautus: Näytteiden TÄYTYY olla pakastettuna 24 tuntia ennen lähetystä! Huomautuksia: A: Aikataulutettu/P: Pakastettu **** Näytteet voidaan jakaa eriin tutkimuspaikassa ja lähettää 3 kuukauden välein vain, jos näytteet säilytetään pakastimessa -70 C:n lämpötilassa tai sitä kylmemmässä. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 16 / 23 101993 Finnish

LUKU 3 TESTIPYYNNÖN ESIMERKKI ESIMERKKI POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 17 / 23 101993 Finnish

LUKU 4 NÄYTTEIDEN OTTO JA VALMISTELU Yleisiä muistutuksia Koko näytteiden keräyksen ja käsittelyn aikana on noudatettava oikeita yleisiä varotoimia. Näytteiden keräyksen ja käsittelyn aikana on käytettävä näytteenottokäsineitä, silmien suojaimia ja laboratoriotakkia. Erityistä varovaisuutta on noudatettava suoneen pistettäessä. Vahvista, että biomarkkereiden tutkimukseen on saatu tietoinen suostumus. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 18 / 23 101993 Finnish

LUKU 4 NÄYTTEIDEN OTTO JA VALMISTELU Sentrifugointi Suhteellisen keskipakoisvoiman (g) muuttaminen RPM:ksi (kierrosnopeus kierroksina minuutissa) Huomautus: Jos tarvitset lisäapua, soita LabCorpin tutkimuskeskuksen tukitiimille. Säde (cm) G-voima RPM Säde (cm) G-voima RPM 10 1200 3280 10 1500 3660 12 1200 2990 12 1500 3340 14 1200 2770 14 1500 3090 16 1200 2590 16 1500 2890 18 1200 2440 18 1500 2730 20 1200 2310 20 1500 2590 22 1200 2200 22 1500 2470 24 1200 2110 24 1500 2360 26 1200 2030 26 1500 2270 28 1200 1950 28 1500 2190 30 1200 1890 30 1500 2110 POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti 2016 Sivu 19 / 23 101993 Finnish

LUKU 4 NÄYTTEIDEN OTTO JA VALMISTELU TESTI KÄYNTI NÄYTTEENO TTOPUTKET OHJEET / STABIILIUS PALAUTETTAVAT PUTKET KULJETUSLÄ MPÖTILA KULJETUS tiheys/kuriiri/paikka Plasman säilytys DNA:nekstr aktiobuffy coat Lähtötason DNA + plasma 10 ml:n EDTAputki - Täytä kokonaan EDTA-putki, korkin väri lila. -Käännä putkea heti näytteenoton jälkeen varovasti ylösalaisin vähintään 6 8 kertaa hyytymisen estämiseksi. -Täytä tarran tiedot: SubjID (potilaan tunnus) ja Random# (satunnaistamisnro) -Täytä laboratorion lähetelomake. -Erota plasma soluista sentrifugoimalla voimalla 1000 x g 15 minuutin ajan. -Sentrifugi jääkaappilämpötilassa on suositeltava. Sentrifugoi 30 60 minuutin kuluessa näytteenotosta. -Käytä näytteenottopakkauksessa olevaa pipettiä, siirrä 0,7 ml plasmaa lilakorkkisesta EDTA-putkesta kuhunkin kuuteen alikvoottiin kryoputkeen. -Varo sekoittamasta verisolujen ja plasman välistä buffy coat -kerrosta. (HUOMAUTUS: Buffy coat on kriittisen tärkeä DNA:n ekstraktioon ja jos buffy coat - kerrosta ei ole, DNA:ta tai minimaalista DNA:ta ei eroteta). * -Sulje plasman alikvoottien kryoputkien korkit. -Täytä alikvoottien putkien tarrojen tiedot: SubjID (tutkittavan tunnus) ja Random# (satunnaistamisnro) -Käyttäen uutta pipettiä siirrä jäljellä olevat punasolut ja buffy coat lilakorkkisesta EDTA-putkesta 10 ml:n kryoputkeen. -Varmista, että kaikki putket ja säiliöt ovat tiukasti kiinni, jotta ne eivät vuoda kuljetuksen aikana. -Aseta kaikki putket Aqui Pak -pakkaukseen (6 putken teline imukykyisessä materiaalissa), sijoita näytepussin suurimpaan osaan ja sulje. Aseta täytetyn lähetelomakkeen kopio näytepussin ulkotaskuun. (Säilytä yksi kopio omassa arkistossasi.) SIJOITA NÄYTEPUSSI HETI PAKASTIMEEN. Pakastimessa säilytyksen aikana näyteputkien tulee olla niiden muovipusseissa pystyasennossa. HUOMAUTUS: Sekä 10 ml:n kryoputki, joka sisältää buffy coat -kerroksen, että erotettu plasma, lähetetään yhdessä kuivajäähän pakattuna. 6 x 2 ml:n kryoputket 10 ml:n kryoputki (sisältää punasolut ja buffy coat - kerroksen) PAKASTETTU Lähetä näytteet kuivajäähän pakattuna 4 päivän kuluessa näytteenotosta, jos jäljellä olevat solut ja plasma ovat pakastettuna pakastimessa, jonka lämpötila on -20 C, -30 C tai -40 C. Näytteiden TÄYTYY olla pakastettuna 24 tuntia ennen lähetystä! Näytteet voidaan säilyttää -70 C:n pakastimessa korkeintaan kolme kuukautta ennen kuivajäähän pakattuna lähettämistä VAIN maanantaista torstaihin Via DHL/TNT Vastaanottaja LabCorp Mechelen, Belgia * Jos vahingossa vedät buffy coat -kerrosta yhteen näistä pipeteistä, tee siitä huomautus laboratorion lähetelomakkeeseen. Tämä voi vaikuttaa biomarkkeritasojen tarkkuuteen. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 20 / 23 101993 Finnish

LUKU 5 NÄYTTEIDEN PAKKAAMINEN KULJETUSTA VARTEN Tutkimuskohtaisia HUOMIOITAVIA SEIKKOJA: Kaikki näytteet on tunnistettava vastaavilla viivakoodi- ja potilastarroilla. Kaikki putket ja säiliöt on suljettava tiukasti, jotta ne eivät vuoda kuljetuksen aikana. Useiden potilaiden näytteet voidaan lähettää yhdessä säiliössä mutta ne on jätettävä yksilöllisiin näytepusseihin, vastaavien lähetelomakkeiden kanssa. Tarkista paikalliset ja kansalliset juhlapäivät (katso liite 1). Siinä tapauksessa, että näytteitä ei voida lähettää näytteenottopäivänä (tai jos määräajan ulkopuolella): - Tutkimuskeskuksissa, joissa EI ole -70 C:n pakastinta, kaikki näytteet on säilytettävä lämpötiloissa -20 C, -30 C tai -40 C ja ne on lähetettävä 4 päivän kuluessa näytteenottopäivästä. Huomautus: Näytteiden TÄYTYY olla pakastettuna 24 tuntia ennen kuljetusta! - Tutkimuskeskuksissa, joissa on -70 C:n pakastin, näytteitä voidaan säilyttää korkeintaan 3 kuukautta ennen niiden lähettämistä LabCorpille kuivajäähän pakattuna. Täytä kaikki kuljetusasiakirjat tarkkaan - Kuljetusasiakirjat toimitetaan esipainettuina tutkimuskeskuksen ja LabCorpin tiedoilla. (Katso luku 1 Kuriiripalvelut) - Allekirjoita ja päivää ne asianmukaisesti - Säilytä yksi kopio arkistossasi POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 21 / 23 101993 Finnish

LUKU 5 NÄYTTEIDEN PAKKAAMINEN Tartunnanvaaraton PAKASTETTU kuljetus VAIN maanantaista torstaihin Lähetä näytteet kuivajäähän pakattuna 4 päivän kuluessa verinäytteenotosta, jos jäljellä olevat solut ja plasma ovat jäädytettynä pakastimessa, jonka lämpötila on -20 C, -30 C tai -40 C. Huomautus: Näytteiden TÄYTYY olla pakastettuna 24 tuntia ennen lähetystä! Näytteet voidaan säilyttää -70 C:n pakastimessa korkeintaan kolme kuukautta ennen kuivajäähän pakattuna lähettämistä. KULJETUSLAATIKKO Pakastetut näytteet: 1. Kääri näytteet imukykyiseen kääreeseen. 2. Aseta käärityt näytteet näytepussin suurimpaan osaan ja sulje pussi. (Älä koskaan aseta kuivajäätä näytepussiin!) 3. Aseta täytetyn lähetelomakkeen kopio näytepussin ulkotaskuun. (Säilytä yksi kopio omassa arkistossasi.) 4. Lisää yksi kerros kuivajäätä pakastekuljetuslaatikon styroksiosan pohjalle. 5. Aseta näytteet sisältävä näytepussi kuivajään päälle. 6. Peitä näytepussi kuivajäällä kunnes laatikko on 3/4 kokonaan täynnä. (Älä täytä liian täyteen, koska laatikon päältä painaminen voi rikkoa kryoputket.) 7. Aseta styroksikansi kiinni ja sinetöi kuljetuslaatikko. 8. Täytä DHL/TNT-lentorahtikirja. (Säilytä yksi kopio omassa arkistossasi.) 9. Aseta DHL/TNT-lentorahtikirja rahtikirjan taskuun, kiinnitä tasku pakastekuljetuslaatikon ulkopuolelle ja anna laatikko kuriirin kuljettajalle. HUOMAUTUS: Useiden potilaiden näytteet voidaan lähettää yhdessä säiliössä mutta ne on pakattava yksilöllisiin näytepusseihin, vastaavien lähetelomakkeiden kanssa. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 22 / 23 101993 Finnish

LUKU 6 RAPORTOINTI JA LÄPIMENOAIKA LabCorp ei suorita mitään testausta. Erotetun DNA:n näytteet ja pakastetut plasman alikvootit lähetään Mayo-klinikalle analysoitavaksi. Otettaessa yhteyttä LabCorpiin on AINA pidettävä lähetelomakkeen numero käsillä, koska tämä on LabCorpille ensisijainen tunniste. POINT NCT00991029 Versio 2.0 12 huhti2016 Sivu 23 / 23 101993 Finnish

LIITE 1 Yleiset vapaapäivät Belgiassa 2016 2017 2018 uudenvuodenpäivä* perjantai, 1. tammikuuta sunnuntai, 1. tammikuuta maanantai, 1. tammikuuta toinen pääsiäispäivä maanantai, 28. maaliskuuta maanantai, 17. huhtikuuta maanantai, 2. huhtikuuta vapunpäivä sunnuntai, 1. toukokuuta maanantai, 1. toukokuuta tiistai, 1. toukokuuta helatorstai torstai, 5. toukokuuta torstai, 25. toukokuuta torstai, 10. toukokuuta 2. helluntaipäivä maanantai, 16. toukokuuta maanantai, 5. kesäkuuta maanantai, 21. toukokuuta Belgian kansallispäivä torstai, 21. heinäkuuta perjantai, 21. heinäkuuta lauantai, 21. heinäkuuta Marian taivaaseenastumisen päivä maanantai, 15. elokuuta tiistai, 15. elokuuta keskiviikko, 15. elokuuta pyhäinpäivä iistai, 1. marraskuuta keskiviikko, 1. marraskuuta torstai, 1. marraskuuta aselevon vuosipäivä perjantai, 11. marraskuuta lauantai, 11. marraskuuta sunnuntai, 11. marraskuuta joulupäivä* sunnuntai, 25. joulukuuta maanantai, 25. joulukuuta tiistai, 25. joulukuuta * LabCorp suljettu

LIITE 2 Viitealueet Ei sovellu

LIITE 3 Laboratorion akkreditointi Burlington DNA testing Division (Burlington DNAtutkimusosasto) Sivu 1 / 2

LIITE 3 Sivu 2 / 2

LABORATORION AKKREDITOINTI Mechelen LIITE 3 Voimassaoleva laboratorion akkreditointi toimitetaan ensimmäisen toimituksen mukana. Katso verkkoakkreditointitiedot osoitteesta: http://www.covance.com/customers/investigators/investigator-tools-and-resources/accreditationsand-certifications.html Sivu 1 / 3

Laboratorion akkreditointi Mechelen LIITE 3 Katso lisätietoja akkreditoinnista ja nykyisestä akkreditoitujen testien luettelosta seuraavasta web-sivustosta: www.belac.be. Sivu 2 / 3

LIITE 3 Sivu 3 / 3

LIITE 3 Laboratorion akkreditointi RTP 1904 Sivu 1 / 2

LIITE 3 Sivu 2 / 2

LIITE 4 CV lääketieteellinen johtaja Burlington Sivu 1 / 15

LIITE 4 Sivu 2 / 15

LIITE 4 Sivu 3 / 15

LIITE 4 Sivu 4 / 15

LIITE 4 Sivu 5 / 15

LIITE 4 Sivu 6 / 15

LIITE 4 Sivu 7 / 15

LIITE 4 Sivu 8 / 15

LIITE 4 Sivu 9 / 15

LIITE 4 Sivu 10 / 15

LIITE 4 Sivu 11 / 15

LIITE 4 Sivu 12 / 15

LIITE 4 Sivu 13 / 15

LIITE 4 Paternity Porum: Beyond Biology, Bay Arca Out Reach Conference for Child Suppon, San Francisco, CA June 7-9, 201 1 DNA Paternity Testing,Indiana Child Suppon Conference, Indianapolis, IN June 15-17, 2011 Understanding DNA Results for the Courts, WICSBC 28' 11 Annual Training Conference, Austin, TX October 30 November 3, 2011. Legal Issues with Paternity Testing, 20 1 2 Child Support Enforcemen t Conference, Indiana Department of Child Services, Merrillville, INJune 13-1520 12. Relations hip Testing Calculations: Standard Trio, Duo, RMNE and PE. AABB Audioconference. September 19, 2013. htlp://w\\w.aahb.org/evc nto;/audiocon ference:i/pagcs/tle'crip1ion,.a,rd0919 New Frontiers in Patemity Establishment. 10th Annual Child Support Conference, Rethinking Child Support: Who Moved Our Mission? Warwick, Rl May 22, 2014. DNA Testing, 38'h Annual Child Support Enforcement Conference, Florence, IN June 4-6, 2014. Complex. Relationship Statistics Workshop.Kelly Beatty. George Frech. Donna Housley. George C. Maha. 25TH I nternational Symposium on Human Identification, Phoenix, AZ. October 29, 20 14. Sivu 14 / 15

LIITE 4 Sivu 15 / 15

LIITE 4 CV lääketieteellinen johtaja Sivu 1 / 3

LIITE 4 Sivu 2 / 3

LIITE 4 Sivu 3 / 3

LIITE 4 CV lääketieteellinen johtaja RTP Sivu 1 / 1

Lomakkeet LIITE 5 Tarvikkeiden tilauslomake Tilaa tarvikkeita käyttämällä LabCorpin esipainettuja, tutkimuskohtaisia tilauslomakkeita. Täytä tarvikkeiden tilauslomake ja faksaa tai lähetä sähköpostissa lomakkeen ylälaidassa olevaan numeroon ja osoitteeseen. Salli vähintään 5 7 arkipäivää tilattujen tarvikkeiden kokoamiseen ja toimittamiseen. Kuivajään tilauslomake Täytä vaaditut tiedot kenttiin, jos niitä ei ole esipainettu, ja faksaa lomakkeessa olevaan numeroon. Kuivajää on toimitettava 1 PÄIVÄ ENNEN näytteiden lähetystä.

TARVIKKEIDEN TILAUSLOMAKE University of California San Francisco Tutkimussuunnitelma: POINT NCT00991029 Tutkimuskeskuksen numero: faksilla: +32 15 342 147 sähköpostilla: AdminOps@labcorp.com Tutkija: GCP / LSN: 101993 1. Pakkaukset MÄÄRÄ PAKKAUSTYYPPI Lähtötason DNA + plasma 2. Asiakirjat MÄÄRÄ KUVAUS CTX-KOODI Tarvikkeiden tilauslomake Kuivajään tilauslomake SUPFO DYOF 3. Lisätarvike MÄÄRÄ KUVAUS CTX-KOODI 10 ml:n EDTA-putki EDT10 2 ml:n kryoputki CRYO2 10 ml:n simport kryoputki 10CRY TUTKIMUSKESKUKSEN TÄYTETTÄVÄ OSA Tilauksen tekijä: Tilauspäivämäärä: Puhelinnumero: Päivämäärä jolloin tarvikkeet tarvitaan*: *SALLI VÄHINTÄÄN 5 7 ARKIPÄIVÄÄ TARVIKKEIDEN TOIMITUKSEEN EU VAIN LABORATORION KÄYTTÖÖN Vastaanottopäivämäärä: Tilauksen käsittelijä: Syöttöpäivämäärä SWO-numero (vain CTX): Odotettu toimituspäivä: Malli CT-GLOB-TEMP-FCD-2 versio: 6 Infokorttinro: CT-GLOB-PM-FCD-13 versio: 1 Sivu 1 / 1