BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA. Biokemian linja Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan linja Elintarvikekemian linja

BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA Biokemian linja Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan linja Elintarvikekemian linja Koulutusohjelman tavoitteet Biokemia tutkii elämän perustan muodostavien molekyylien rakennetta ja toimintaa. Sanat perintöaines, geenit, geenien toiminnan säätely, geenitekniikat, geenien kloonaus ja geneettinen muokkaus sekä proteiinit ja entsyymit ovat biokemian avainsanoja. Ne kuvaavat erinomaisesti biokemian opetusta ja tutkimusta ja sitä, mistä biokemiassa oikeastaan on kysymys. Keskeisellä sijalla biokemiallisessa tutkimuksessa ovat soluissa tapahtuvat kemialliset reaktiot ja niiden säätely sekä solun molekyylitason rakenne. Viime vuosina tapahtunut biokemian ja sen eräiden osaalueiden, kuten molekyylibiologian, rakenne-biologian ja bioinformatiikan nopea kehittyminen ovat entisestään lisänneet biokemiallisen tiedon merkitystä elävän luonnon tutkimisessa, suojelussa ja hyödyntämisessä. Biokemia perehdyttää opiskelijat elämälle keskeisten molekyylien rakenteeseen ja toimintaan sekä erillisten biokemiallisten tapahtumien merkitykseen yksittäisille soluille ja kokonaisille organismeille. Perustietojen lisäksi opiskelijalle pyritään opettamaan biokemian keskeiset käytännön työmenetelmät sekä valmiudet käyttää opittua sekä tieteellisessä perustutkimuksessa sekä soveltavassa tutkimus- ja kehitystyössä. Elintarvikekemia tutkii biologisten materiaalien ja elintarvikkeiden kemiallista koostumusta, rakennetta ja ominaisuuksia sekä elintarvikkeissa tapahtuvia kemiallisia ja biokemiallisia muutoksia. Elintarvikekemia sijoittuu täten myös ravitsemustieteen lähialueelle sekä nojautuu läheisesti muihin luonnontieteisiin, erityisesti kemiaan ja biokemiaan. Elintarvikekemia on soveltava tieteenala, jonka laajan perustutkimuksen tuloksia sovelletaan käytännönläheisten ongelmien ratkaisemiseen. Elintarvikekemistin koulutuksen tavoitteena on antaa laaja-alainen näkemys elintarvikekemian kentästä sekä taata valmiudet toteuttaa elintarvikekemistin työsarkaa niin tutkimustyön, tuotekehityksen, valvonnan kuin hallinnonkin piirissä. Erityinen paino opetuksessa ja opiskelussa on elintarvikekemialliseen tutkimukseen perehtymisessä ja tämän tiedon soveltamisessa elintarvikealaa kehitettäessä. Biotekniikka. Laitoksen biotekniikan tutkimus suuntautuu molekulaariseen biotekniikkaan ja in vitro diagnostiikkaan. Tutkimuskohteina ovat laajasti ihmisen terveyteen ja sairauteen sekä elintarvikkeisiin ja ympäristöön vaikuttavat tekijät ja menetelmät. Biotekniikka on tieteiden välinen nopeasti kasvava ala, jossa sekä luonnontieteellinen perustutkimus että käytännönläheinen soveltava tutkimus ovat edustettuina. Opetuksen tarkoituksena on perehdyttää opiskelijat menetelmiin, joilla arvioidaan ihmisten ja eläinten terveydentilan astetta ja laatua, elintarvikkeiden turvallisuutta ja haitta-ainejäämiä sekä ympäristön tilaa. Tavoitteena on, että opiskelijat tutustuvat erityisesti molekulaariseen biotekniikkaan ja in vitro -diagnostiikkaan sekä biotekniikkaa soveltaviin ja hyödyntäviin prosesseihin. Sijoittuminen eri ammattialoille Koulutusohjelmasta valmistuneet luonnontieteiden kandidaatit voivat ilman eri hakemusta siirtyä suorittamaan oman koulutusohjelman maisterin tutkintoa tai sitten he voivat pyrkiä muihin korkeakouluihin joko kotimaassa tai ulkomailla. Filosofian maisterit sijoittuvat hyvin monenlaisiin tehtäviin. Yleisimmin työpaikka löytyy tutkimuksen, opetuksen, laadunvalvonnan, tuotekehityksen, informaatiopalvelun, ympäristönsuojelun, markkinoinnin sekä hallinnon parista. 1

Yhteenveto opintojen rakenteesta LUONNONTIETEIDEN KANDIDAATIN TUTKINTO Opinnot Biokemian koulutusohjelma FILOSOFIAN MAISTERIN TUTKINTO Biokemian linja Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan linja Elintarvikekemian linja Perusopinnot 25 Aineopinnot 65-67* pakolliset Kemia 32 Kieli- ja viestintäopinnot 8 Toinen sivuai- 25 nekokonaisuus Valinnaiset pääaineen 0-23 20-39 5-24 opinnot Syventävät pääaineen 97 81 96 opinnot Muut valinnaiset 23-25* 0-23 0-19 0-19 opinnot Yhteensä 180 120 120 120 *) Riippuen siitä, valitseeko opiskelija biokemian, elintarvikekemian vai biotekniikan opintojaksoja. Mikäli opiskelija valitsee elintarvikekemian opintoja, tulee hänen suorittaa myös tilastotiedettä 6 op. LuK = Luonnontieteiden kandidaatin tutkinto, FM = Filosofian maisterin tutkinto LuK-tutkielma ja seminaari 6 op, pro gradu tutkielma ja seminaari 20 op. 2

LUONNONTIETEIDEN KANDIDAATIN TUTKINTO BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMASSA (LUK) 180 op Linjavalintaa ei suoriteta, vaan suoritettava tutkinto on luonnontieteiden kandidaatin tutkinto, joka voi opiskelijan valinnoista riippuen painottua joko biokemiaan, elintarvikekemiaan tai molekulaariseen biotekniikkaan ja in vitro diagnostiikaan. LUONNONTIETEIDEN KANDIDAATIN TUTKINTO 180 op KEMIA, perus BIOKEMIAN ALAN PERUSOPINNOT 25 op 25 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I 6 Perusopinnot Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II 6 KIELI- JA Kemian perusteet Biokemian perustyömenet, tentti 2 VIESTINTÄ- Orgaaninen Biokemian perusharjoitustyöt 2 OPINNOT 8 kemia Mitä biotekniikka on? 4 Fysikaalinen Elintarvikekemian perusteet 3 tieteellinen kemia Laatujärjestelmät 2 viestintä Työturvallisuus ja 1 työt BIOKEMIAN ALAN AINEOPINNOT 27 äidinkieli 3 KEMIA, aineop 7 Aineopinnot Analyyttinen kemia Epäorg kemia Fysikaalinen kemia Orgaaninen kemia Spektroskopia TOINEN SIVUAINE 25 Tilastotiede Tietojenkäsittely Biologia Matematiikka Fysiikka Bioinformatiikka Lääketiet tdk opin Ympäristötiede Astrobiologia Biokemian harjoitustyöt 13 Mikrobiologian perusteet 4 ruotsi 2 Mikrobiologian harjoitustyöt 3 In vitro diagnostiikka 3 englanti 2 Geenieknologian menetelmät 2 Ravitsemuksen biokemia 2 Elintarvikeanalytiikka 1 LINJAKOHTAISET AINEOPINNOT BIOKEMIA 38 Geenien ilmeneminen 4 Geenien säätely 4 Molekyylibiologian harjoitukset 5 Entsyymi- ja proteiinikemian luennot 6 Immunologian perusteet 4 LuK-tutkielma ja seminaari 6 Lopputentti 9 BIOTEKNIIKKA 39 Biotekniikan harjoitustyöt 15 Molekylibiologian harjoitustyöt 5 Geenien ilmeneminen 4 Molekulaarinen biotekniikka 5 LuK-tutkielma ja seminaari 6 Lopputentti 4 ELINTARV.KEMIA 40 Elintarvikekemian harjoitustyöt 8 Kasviperäiset elintarvikkeet 5 Eläinperäiset elintarvikkeet 5 Kaasukrom ja ylikriit 4 Nestekromatografia 2 Aistittavan laadun tutkimus 6 LuK-tutkielma ja seminaari 6 Lopputentti 4 VALINNAISET OPINNOT 25 VALINNAISET OPINNOT 24 VALINNAISET OPINNOT 23 Biotekniikka, Biokemia, Biokemia, Elintarvikekemia, Elintarvikekemia, Biotekniikka, Kemia, Muut Kemia, Muut Kemia, Muut 3

OPINTOJEN RAKENNE PERUSOPINNOT 25 op 12,5 ov Perusopinnot antavat opiskelijalle tiedot solun sisältämistä yhdisteistä (biomolekyyleistä), niiden kemiallisesta rakenteesta ja reaktioista sekä solun synteettisistä, hajottavista ja energiaa tuottavista reaktioteistä. Lisäksi perusopinnoissa tutustutaan biokemian perustyömenetelmiin, biotekniikan ja elintarvikekemian perusteisiin sekä laatujärjestelmiin. BKEM1001 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I 6 op 3 ov BKEM1002 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I 6 op 3 ov BKEM3767 Biokemian perustyömenetelmät, tentti 1 ov BKEM3768 Biokemian perustyömenetelmät, harjoitustyöt 1 ov FOOD1013 Elintarvikekemian perusteet 3 op 1,5 ov BTEK4100 Mitä biotekniikka on 4 op 2 ov FOOD3752 Laatujärjestelmät 1 ov KOULUTUSOHJELMAN YHTEISET AINEOPINNOT 27 op 15 ov Aineopinnot antavat opiskelijoille tiedot mikrobeista, mikrobien ja ravitsemuksen biokemiasta sekä in vitro diagnostiikasta. Opiskelija perehtyy myös erilaisiin analyysimenetelmiin ja laboratoriotekniikoihin sekä oppii itsenäisesti eristämään ja analysoimaan elämän kannalta tärkeitä yhdisteitä biologisesta materiaalista. BKEM3758 Biokemian harjoitustyöt 13 op 7 ov BKEM1007 Geeniteknologian menetelmät 1 ov BKEM3521 Mikrobiologian perusteet 4 op 2 ov BKEM1008 Mikrobiologian harjoitustyöt 3 op 1,5 ov BTEK1030 In vitro diagnostics 3 op 1,5 ov FOOD1014 Ravitsemuksen biokemia 1 ov FOOD1015 Elintarvikeanalytiikka 1 op 0,5 ov Opiskelija suorittaa valintansa mukaan joko 38 op biokemian, 40 op elintarvikekemian tai 39 op biotekniikan aineopintoja, joihin sisältyy LuK-tutkielma ja lopputentti. BIOKEMIAN AINEOPINNOT 38 op 20 ov Biokemian linjakohtaiset aineopinnot antavat opiskelijalle tiedot genomeista, geeneistä, geenien ilmenemisestä ja säätelystä, entsyymien ja proteiinien rakenteista ja toiminnasta sekä elimistön immunojärjestelmistä molekyylitasolla. Opiskelija perehtyy erilaisiin geenitekniikan ja molekyylibiologian menetelmiin. BKEM3759 Geenien ilmeneminen 4 op 2 ov BKEM3760 Geenien säätely 4 op 2 ov BKEM1010 Molekyylibiologian harjoitustyöt 5 op 3 ov BKEM8904 Entsyymi- ja proteiinikemian luennot 6 op 3 ov BKEM3748 Immunologian perusteet 4 op 2 ov BKEM3597 LuK-tutkielma ja seminaari 6 op 3 ov BKEM3111 Lopputentti 9 op 5 ov BIOTEKNIIKAN AINEOPINNOT 39 op 21 ov 4

Biotekniikan aineopinnot antavat perustiedot solujen ja biomolekyylien mahdollisuuksista erilaisiin teknologisiin sovellutuksiin. BTEK4023 Biotekniikan harjoitustyöt 15 op 8 ov BKEM1010 Molekyylibiologian harjoitustyöt 5 op 3 ov BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka 5 op 3 ov BKEM3759 Geenien ilmeneminen 4 op 2 ov BTEK4026 LuK-tutkielma ja seminaari 6 op 3 ov BTEK4024 Lopputentti 4 op 2 ov ELINTARVIKEKEMIAN AINEOPINNOT 40 op 22 ov Elintarvikekemian aineopinnot antavat opiskelijalle perustiedot raaka-aineiden koostumuksesta sekä jalostamisesta elintarvikevalmisteiksi, laatuun vaikuttavista kemiallisista ja fysikaalisista muutoksista sekä säilyvyydestä. Harjoitustöiden yhteydessä opiskelija perehtyy elintarvikeanalytiikassa käytettäviin menetelmiin ja laitteisiin. FOOD3750 Elintarvikekemian harjoitustyöt 8 op 5 ov FOOD3803 Kasviperäiset elintarvikkeet 5 op 3 ov FOOD3804 Eläinperäiset elintarvikkeet 5 op 3 ov FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia 4 op 2 ov FOOD3586 Nestekromatografia 1 ov FOOD3630 Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät 6 op 3 ov FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari 6 op 3 ov FOOD3511 Lopputentti 4 op 2 ov (Valinnaiset opinnot: FOOD3515 Näytteen esikäsittely, 1 ov, ja FOOD3672 elintarviketeknologian perusteet 3 op, 2 ov) Sivuaineiden opinnot SIVUAINEET 57-60 op Sivuaineiksi voidaan lukea joko kaksi pientä (25 op) tai yksi laaja (60 op) sivuainekokonaisuus. Biokemian koulutusohjelman pakollinen sivuaine on kemia ja sen vähimmäislaajuus on 3 (kemian perusopintokokonaisuuus 25 op ja vähintään 7 op kemian aineopintoja, katso kemian koulutusohjelma). Toisen sivuainekokonaisuuden (25 op) voi valita esim. biologian, fysiikan, tietotekniikan, tilastotieteen ja matematiikan koulutusohjelmien tai ympäristötieteen, astrobiologian ja bioinformatiikan opetustarjonnasta. Jos valitsee kemiasta 60 op:n kokonaisuuden, ei tarvitse valita toista sivuainekokonaisuutta. Mikäli opiskelija valitsee elintarvikekemiaan suuntautuneita opintojaksoja, tulee hänen suorittaa pakollisena 6 op tilastotiedettä, esimerkiksi A0 Tilastotieteen johdantokurssi tai EKOL2401 Biostatistiikka. VALINNAISET OPINNOT 23-25 op Valinnaisiksi opinnoiksi opiskelija voi valita pää- tai sivuaineiden opintoja sekä muita opintoja. Valinnaisiksi opinnoiksi kelpaa lähes kaikki se, mikä jollakin tavoin laajentaa ja rikastuttaa pääaineen opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Perus- ja aineopintotasoisia opintojaksoja voi ottaa esim. biokemian, kemian, biologian, terveyden biotieteiden, fysiikan, tietojenkäsittelytieteiden, tilastotieteen sekä matematiikan koulutusohjelmien tai ympäristötieteen, astrobiologian, 5

bioinformatiikan (ks. TKO bioinformatiikan linja) sekä lääketieteen opetustarjonnasta. Valinnaisia opintoja voi ottaa myös Åbo Akademin kurssitarjonnasta sekä valtakunnallisesta että kansainvälisestä kurssitarjonnasta. Valinnaisiksi opinnoiksi voi ottaa myös kieli- ja viestintäopintoja sekä kaupallisen alan opintoja. Valinnaiset opinnot voi pyrkiä keskittämään vain yhteen tai kahteen tieteenalaan tai sitten ottaa opintojaksoja useilta eri tieteenaloilta. Kieli- ja viestintäopinnot 8 op 4 ov BKEM1009 Tieteellinen viestintä Äidinkielen opinnot Kirjallinen viestintä Kirjallisen työn laatimiseen liittyvä opetus Toisen kotimaisen kielen opinnot Ruotsin kieli/matemaattis-luonnont. Vieraan kielen opinnot Englanti, tekstin ymmärtäminen tai sopimuksen mukaan joku muu kieli 1 op 0,5 ov 1 ov 1 op 0,5 ov 1 ov 1 ov 6

6 op Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I LUONNONTIETEIDEN KANDIDAATIN TUTKINTO 180 op 1. vuosi 2. vuosi 3. vuosi Syksy Kevät Syksy Kevät Syksy Kevät 6 op 13 op Biomolekyylit Geeniteknologian Biokemia Äidinkieli kir- ja aineenvaihdunta mene- harjoitustyöt jallinen vies- II telmät tintä 1 op Äidinkieli Kirjallisen työn laatiminen 4 op Mitä biotekniikka on? 3 op Elintarvikekemian perusteet Biokemian perustyöment. tentti Biokemian perustyöm harj Mikrobiologian perust. 4 op Harjoitustyöt 3 op 3 op In vitro diagnostics 4 op Geenien ilmeneminen, bk, btk 4 op Geenien säätely, bk 5 op Molekyylibiologian harjoitustyöt, bk,btk Nestekromatografia, etk Englanti 5 op Kasviperäiset elintarvikkeet etk 5 op Eläinperäiset elintarvikkeet etk 4 op Kaasukromatografia ja ylikriittinen krom, etk 6 op Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät etk Ruotsi 1 op Elintarvikeanalytiikka Ravitsemuksen biokemia 4 op Immunologian perusteet, bk 5 op Molekulaarinen biotekniikka, btk Valinnaiset opinnot bk 25, etk 23, btk 24 Kemian perusopinnot 25 op 1 op Tieteellinen viestintä 15 op Biotekniikan harjoitustyöt, btk Laatujärjestelmät Sivuaineopinnot 25 op Kemian aineopinnot 7 op 6 op Entsyymi- ja prot luennot bk Loppukuul.: Bk 9 op, etk 4 op, btk 4 op 6 op LuK-tutkielma ja semin. 6 op 8 op Elintarvikekemian harjoitustyöt, etk Mikäli jakson nimen perässä on bk, btk tai etk, niin silloin ko. jakso ei ole kaikille pakollinen, vaan ainoastaan niille, jotka painottavat opintonsa joko biokemiaan (bk), elintarvikekemiaan (etk) tai molekulaarisen biotekniikkaan ja in vitro diagnostiikkaan (btk). 7

FILOSOFIAN MAISTERIN TUTKINTO (FM) 120 op Edellytyksenä LuK-tutkinto tai vastaavat tiedot. Opiskelija voi valita pääaineekseen joko biokemian, elintarvikekemian tai molekulaarisen biotekniikan ja in vitro diagnostiikan, jolloin suoritettava tutkinto on vastaavasti joko FM biokemiassa, FM elintarvikekemiassa tai FM biotekniikassa. OPINTOJEN RAKENNE BIOKEMIAN LINJA Opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikoiskursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen. Opiskelijat saavat perusvalmiudet toimia biokemian asiantuntijatehtävissä sekä sellaiset tiedot ja taidot, jotka mahdollistavat yhteistyön biokemian lähialojen asiantuntijoiden kanssa. Biokemian syventävät opinnot antavat myös perustiedot ja -taidot biokemian alan tutkimustyöhön. Pakolliset syventävät opinnot 97 op 52 ov BKEM1011 Eukaryoottigeenien toiminta ja molekulaarinen solubiologia 8 op 4 ov BKEM3753 Bioinformatiikkaa biokemisteille 3 op 2 ov (sisältää BKEM3770 ja BKEM3771) BKEM1012 Bionanotiede 4 op 2 ov BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt 5 op 3 ov BKEM1013 Molekulaarisen solubiologian harjoitustyöt 6 op 3 ov BKEM1014 Työskentely biokemian tutkimusryhmässä I 8 op 4 ov BKEM1015 Työskentely biokemian tutkimusryhmässä II 8 op 4 ov BKEM3742 Erikoistyö 35 op 20 ov BKEM1016 Pro gradu tutkielma ja seminaari 20 op 10 ov Valinnaiset opinnot 23 op 11 ov BKEM1017 Erikoisteos 2-1 1-6 ov BKEM1018 Erikoisteos osa 1 BKEM1019 Erikoisteos osa 2 BKEM9510 Immunologian harjoitustyöt 1 ov BKEM3547 Immunologian menetelmät 1 ov BKEM3102 Opetusharjoittelu maksimissaan 8 op 4 ov BKEM3123 Ympäristö- ja soveltavan mikrobiologian perusteet 1 ov BKEM3540 Työharjoittelu 4 op 2 ov BKEM1020 Frontiers of Science 1 ov Valinnaisiksi opinnoiksi opiskelija voi valita pää- tai sivuaineiden opintoja sekä muita opintoja. Valinnaisiksi opinnoiksi kelpaa lähes kaikki se, mikä jollakin tavoin laajentaa ja rikastuttaa biokemian opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opintojaksoja voi ottaa esimerkiksi biokemian, kemian, biologian, terveyden biotieteiden, fysiikan, tietojenkäsittelytieteiden, tilastotieen sekä matematiikan koulutusohjelmien tai bioinformatiikan (ks. TKO bioinformatiikan linja), ympäristötieteen, lääketieteen ja kaupallisen alan opetustarjonnasta. Valinnaisia opintoja voi otaa myös Åbo Akademin kurssitarjonnasta sekä valtakunnallisesta että kansainvälisestä biokemian alan 8

kurssitarjonnasta. Suositeltavia Åbo Akademin biokemian kursseja ovat mm. Applied bioinformatics 8 op (4 ov), Molecular modelling 4 op (2 ov) ja Structure-based drug design 4 op (2 ov). Valinnaiset opinnot voi pyrkiä keskittämään vain yhteen tai kahteen tieteenalaan tai sitten ottaa opintojaksoja useilta eri tieteenaloilta. Yllä esimerkkejä valinnaisiksi opinnoiksi sopivista biokemian opintojaksoista. MOLEKULAARISEN BIOTEKNIIKAN JA IN VITRO DIAGNOSTIIKAN LINJA Opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikoiskursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opiskelijoille annetaan perustiedot ja -taidot biotekniikan alan tutkimustyöhön, sekä asiantuntijatehtävissä toimimiseen. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen. Pakolliset syventävät opinnot 81 op 43 ov BTEK4025 Syventävien opintojen harjoitustyöt 1 6 ov BTEK1032 Proteiinien puhdistus ja analytiikka 3 op 1,5 ov BTEK1033 Fermentaatio- ja downstreamtekniikka 3 op 1,5 ov BTEK4027 Erikoistyö 35 op 20 ov BTEK1031 Pro gradu tutkielma ja seminaari 20 op 10 ov BTEK4046 Loppukuulustelu 8 op 4 ov BTEK4047 Loppukuulustelu osa 1 BTEK4048 Loppukuulustelu osa 2 Valinnaiset pääaineen opinnot 20-39op 18 ov BTEK3111 Recombinant DNA Technologies 4 op 2 ov BTEK3108 Biotechnical Diagnostics 4 op 2 ov BTEK1025 Trends in Clinical Chemistry 4 op 2 ov BTEK3110 Possibilities of Diagnostics 4 op 2 ov BTEK1024 Syventävien opintojen harjoitustyöt 6 op 3 ov BTEK3135 Molekyylibiologian harjoitustyöt, jatko-osa biotekniikan opiskelijoille 4 op 2 ov BTEK1034 Biotechnology in health and disease 1 ov BTEK3107 Biotechnical Applications of Nucleic Acids 4 op 2 ov BTEK4021 Opetusharjoittelu 8 op 4 ov BTEK1017 Työharjoittelu 4 op 2 ov BTEK1035 Molecular- and nanobiotechnology 4 op 2 ov BTEK4020 Työskentely tutkimusprojekteissa 4 op 2 ov BTEK4049 Journal Club 1 op 1 ov BTEK3573 Kirjatentti (erikoisteos) 4 op 2 ov Muut valinnaiset opinnot 0-19 op Valinnaisiksi opinnoiksi opiskelija voi valita pää- tai sivuaineiden opintoja sekä muita opintoja. Valinnaisiksi opinnoiksi kelpaa lähes kaikki se, mikä jollakin tavoin laajentaa ja rikastuttaa biotekniikan opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opintojaksoja voi ottaa esimerkiksi biokemian, kemian, biologian, terveyden biotieteiden, fysiikan, tietojenkäsittelytieteiden, tilastotieen sekä matematiikan koulutusohjelmien tai bioinformatiikan (ks. TKO bioinformatiikan linja) lääketieteen ja kaupallisen alan opetustarjonnasta. Valinnaisia opintoja voi otaa myös Åbo Akademin kurssitarjonnasta sekä valtakunnallisesta että kansainvälisestä biokemian alan kurssitarjonnasta. 9

ELINTARVIKEKEMIAN LINJA Syventäviin opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikoiskursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen sekä loppukuulusteluihin. Opiskelijat saavat perusvalmiudet asiantuntijatehtäviin, joita tuotantoelämä elintarvikekemistiltä edellyttää sekä sellaiset tiedot ja taidot, jotka mahdollistavat yhteistyön elintarvikekemian lähialojen erikoistuntijoiden kanssa. Lisäksi opiskelijat saavat myös perustiedot ja -taidot elintarvikekemian alan tutkimustyöhön. Pakolliset syventävät opinnot 96 op 52 ov FOOD8904 Hiilihydraatit 1 ov FOOD8905 Proteiinit 1 ov FOOD3826 Aromit 1 ov FOOD1019 Lipidit I 4 op 2 ov FOOD3824 Elintarvikekemian syventävät harj.työt 8 op 4 ov FOOD8822 Elintarvikkeiden lisäaineet 4 op 2 ov FOOD3683 Elintarvikkeiden laadunohjaus 1 ov FOOD3684 Elintarvikkeiden tuotetutkimus 1 ov FOOD3633 Elintarvikemikrobiologia ja hygienia 5 op 3 ov FOOD3504 Elintarvikelainsäädäntö 3 op 2 ov FOOD3816 Erikoistyö 35 op 20 ov FOOD1016 Pro gradu -tutkielma ja seminaari 20 op 10 ov FOOD3607 Loppukuulustelu, yleisteos, Fennema, osa 1 1 ov FOOD3617 Loppukuulustelu, yleisteos, Fennema, osa 2 1 ov FOOD3618 Loppukuulustelu, erikoisteos 3 op 2 ov Valinnaiset pääaineen opinnot 5-24 op FOOD3823 Luonnon värit 3 op 2 ov (FOOD3570 Natural Colours) FOOD8814 Massaspektrometrian sovellutuksia elintarvikekemiassa 1 ov (FOOD3569 Mass Spectrometry on Food Analysis) FOOD8824 Ylikriittiset uuttoteknologiat 1 ov (FOOD3568 Supercritical Fluid Technologies) FOOD1017 Kuljetus ja pakkausteknologia 3 op 1,5 ov FOOD3530 Atomispektrometria 2-3 op 2 ov FOOD8815 Opetusharjoittelu 2-7 op 1-4 ov FOOD3516 Elintarvikkeiden kivennäisaineet 1 ov FOOD8903 Työharjoittelu 4 op 2 ov FOOD3566 Lipidit II: Lipidit ja niiden funktiot 4 op 2 ov (FOOD3567) Lipids II: Lipids and their Functions) FOOD1018 Ravitsemuksen biokemian syventävä kurssi 1 op 0,5 ov Muut valinnaiset opinnot 0-19 op Valinnaisiksi opinnoiksi opiskelija voi valita pää- tai sivuaineiden opintoja sekä muita opintoja. Valinnaisiksi opinnoiksi kelpaa lähes kaikki se, mikä jollakin tavoin laajentaa ja rikastuttaa elintarvikekemian opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opintojaksoja voi ottaa esimerkiksi biokemian, kemian, biologian, terveyden biotieteiden, fysiikan, tietojenkäsittelytieteiden, tilastotieen sekä matematiikan koulutusohjelmien tai bioinformatiikan (ks. TKO bioinformatiikan linja) lääketieteen ja kaupallisen 10

alan opetustarjonnasta. Valinnaisia opintoja voi otaa myös Åbo Akademin kurssitarjonasta sekä valtakunnallisesta että kansainvälisestä biokemian alan kurssitarjonnasta. FILOSOFIAN MAISTERIN TUTKINTO BIOKEMIASSA, ELINTARVIKEKEMIASSA JA BIOTEKNIIKASSA 120 op 1. vuosi 2. vuosi Syksy Kevät Syksy Kevät 5 op Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt, bk 8 op Eukaryoottigeenien toiminta ja molekulaarinen solubiologia, bk 3 op Proteiinien puhd ja analytiikka btk 3 op Fermentaatio- ja downstreamtekniikka btk 3 op Elintarvikelainsäädäntö, etk/ 4 op Elintarvikkeiden lisäaineet etk 6 op Molekulaarisen solubiologian harjoitustyöt bk 8 op Elintarvikekemian harjoitustyöt Aromit etk 3 op Bioinformatiikkaa biokemisteille bk 8 op Työskentely tutkimusryhmässä I bk 4 op Bionanotiede bk 8 op Työskentely tutkimusryhmässä II bk 1 Biotekniikan harjoitustyö, btk Elintarvikkeiden tuotetutkimus etk/ Elintarvikkeiden laadunohjaus, etk 5 op Elintarvikemikrobiologia ja hygienia etk 4 op Lipidit I, etk Hiilihydraatit etk/ Proteiinit etk Erikoistyö Loppukuulustelu 3 op Elintarvikelainsää däntö, etk/ 4 op Elintarvikkeiden lisäaineet etk Pääaineen valinnaiset opinnot bk 0-23, etk 5-24, btk 20-39 Muut valinnaiset opinnot bk 0-23, etk 0-19, btk 0-19 35 op Erikoistyö Loppukuulustelu btk 8 op, etk 7 op Elintarvikkeiden tuotetutkimus etk/ Elintarvikkeiden laadunohjaus, etk Hiilihydraatit etk/ 2op Proteiinit etk 20 op Pro gradu ja seminaari 11

OPINTOJEN SUORITTAMINEN Opetukseen osallistuminen Luonnontieteiden kandidaatin ja filosofian maisterin tutkinnon suorittamiseksi biokemian koulutusohjelmassa opiskelijan on 1) osallistuttava koulutusohjelman opintojaksoihin kuuluvaan opetukseen 2) osoitettava saavuttaneensa koulutusohjelmaan kuuluvissa opinnoissa vaaditut tiedot, taidot ja valmiudet sekä 3) suoritettava kirjallinen kypsyysnäyte sekä opinnäytetyö sekä LuK-tutkinnossa että FMtutkinnossa. Opintojakson suorittamista varten järjestetään kuulusteluja, jotka suoritetaan määrättyinä tenttipäivinä tai erikseen sovittuina aikoina. Virallisista tenttiajoista ilmoitetaan opinto-oppaassa sekä laitoksen ilmoitustaululla. Useimpia kurssia voi tenttiä jokaisena virallisena tenttipäivänä, mutta joihinkin kuulusteluihin voi osallistua vain tiettyinä tenttipäivinä. Näistä tenttikohtaisista rajoituksista ilmoitetaan myös laitoksen ilmoitustaululla. Kuulustelu järjestetään kuitenkin vähintään kolme kertaa yhden vuoden aikana luentosarjan tai kurssin päättymisestä. Kuulusteluihin ilmoittaudutaan kirjallisesti tarkoitusta varten laadittua lomaketta käytäen. Lomake palautetaan täytettynä tenttiinilmoittautumislaatikkoihin, joista toinen on Arcanumin 2. kerroksen ilmoitustaulun vieressä ja toinen BioCityn ilmoitustaulun vieressä. Kuulusteluun ilmoittaudutaan viimeistään kuulustelua edeltävänä maanantaina klo 16.00 mennessä. Kuhunkin kuulusteluun voi ilmoittautua enintään kolme kertaa. Mikäli opiskelija ei vielä tällöin ole läpäissyt ko. tenttiä, opiskelijan tulee ottaa yhteyttä kuulustelijaan. Kuulustelussa vaaditaan aina viimeksi kokonaan luennoidun kirjan tai kurssin asiat. Opiskelu ulkomailla Laajentaakseen ja monipuolistaakseen opintojaan opiskelija voi suorittaa osan tutkinnostaan myös ulkomailla osallistumalla laitoksen, tiedekunnan tai yliopiston tarjoamiin opiskelijavaihto-ohjelmiin. Laitoksen kaikki kolme linjaa hyväksyvät ulkomailla suoritetut opinnot soveltuvin osin. SOKRATES/ERASMUS ohjelman yhteistyöyliopistot ovat Italiassa, Englannissa, Espanjassa, Portugalissa, Ranskassa ja Saksassa. NORDPLUS ohjelma tarjoaa opiskelupaikkoja Skandinavian maissa ja varsinkin Ruotsissa. Suositus on, että opiskelija lähtee ulkomaille aikaisintaan kolmannen opiskeluvuoden jälkeen. Laitoksen yhteyshenkilöt ovat professori Timo Lövgren (Nordplus) ja professori Rainer Huopalahti (Sokrates/Erasmus). Opiskelu ulkomailla on todellinen vaihtoehto. Opintojen arvostelu Ks. opinto-oppaan johdanto-osa. Linjavalinnat Valinta biokemian koulutusohjelman eri linjoille tapahtuu maisteriopintojen alussa. Opiskelija, ilmoittaa linjavalintansa syyskuun alkuun mennessä laitoksen ilmoitustauluilla olevaan listaan. Opiskelija voi valita joko biokemian, molekulaarisen biotekniikan ja in vitro diagnostiikan tai elintarvikekemian linjan. LuK-vaiheessa suoritetut ainevalinnat edesauttavat opiskelijaa pääsemään haluamalleen linjalle. Tarvittaessa suoritetaan karsintaa. 12

Opintojaksojen vastuuhenkilöt Luentokurssi: luennoitsija tai opintojaksosta vastaava opettaja Harjoitustyöt: yliassistentti tai harjoitustöistä vastaava opettaja LuK-tutkielma ja seminaari: ao. linjan professori Erikoistyö: Työn vastuullinen ohjaaja Posteri ja erikoistyöseminaari: Erikoistyötapahtumasta vastaava opettaja Pro gradu tutkielma: ao. linjan professori Sivuainekokonaisuus: kanslia vie kokonaisuuden rekisteriin Pääaineen kokonaisuus: kanslia vie kokonaisuuden rekisteriin Opettajatutorit: Biokemian lehtori sekä koulutusohjelman yliassistentit: Jarmo Käpylä (biokemia), Urpo Lamminmäki (biotekniikka) ja elintarvikekemia (avoinna). OHJEITA OPISKELUA VARTEN Biokemian koulutusohjelman opiskelijat Ennen 1.8.2005 opintonsa aloittaneilla on oikeus suorittaa opintojaan vanhojen vaatimusten mukaan 31.7.2008 asti. Opiskelun suunnitteluun ja suorittamiseen liittyviä ohjeita antavat koulutusohjelman opettajatutorit sekä biokemian, elintarvikekemian ja biotekniikan opettajat. Sivuaineoikeuden saaminen biokemian koulutusohjelmasta Ei kuulustelua. Sivuaineoikeus on hakemuksetta niillä opiskelijoilla, joiden oman koulutusohjelman tutkintovaatimuksiin sisältyy pakollisia biokemian, elintarvikekemian tai biotekniikan opintoja. Vaihtoehtoisia opintoja suorittavat opiskelijat voivat osallistua niihin opintojaksoihin, joiden osanottajamäärä ei ole rajoitettu (lähinnä luennot). Harjoitustyökursseille etusija on biokemian koulutusohjelman opiskelijoilla sekä pakollisia sivuaineopintoja suorittavilla toisten koulutusohjelmien opiskelijoilla. Karsintaa suoritetaan, mikäli halukkaiden lukumäärä ylittää käytettävissä olevat resurssit. Lopullinen varmuus pääsystä harjoitustyökurssille selviää vasta kaikkia opiskelijoita koskevan ennakkoilmoittautumisen jälkeen. Ilmoittautuminen suoritetaan biokemian koulutusohjelman ilmoitustauluilla oleviin listoihin hyvissä ajoin ennen kurssien alkamista. Mikäli opintojaksojen suorittamiselle on asetettu ennakkoehtoja, kuten sisäänpääsykoe tai aiemmat opintojaksot, vaaditaan ne myös kaikilta sivuaineopiskelijoilta. OPINTOJAKSOJEN TAVOITTEET JA SISÄLTÖ PERUSOPINNOT BKEM1001 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I (6 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I luentosarja perehdyttää opiskelijat keskeisten biomolekyylien, kuten hiilihydraattien, lipidien, proteiinien ja nukleiinihappojen rakenteisiin, toiminnallisiin ominaisuuksiin ja biokemialliseen merkitykseen, biologisten membraanien toimintaan ja signaalinvälitykseen. Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 4. painos, kappaleet 1-10. Suoritustavat: Luentoihin ja oppikirjaan perustuva tentti. Jarmo Niemi. BKEM1002 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II (6 op, 3 ov) 13

Tavoitteet ja sisältö: Luentosarjan toinen osa keskittyy aineenvaihduntaan, erityisesti energian tuottoon, sekä keskeisiin anabolisiin ja katabolisiin reaktioteihin. Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 4. painos, kappaleet 11-23. Suoritustavat: Luentoihin ja oppikirjaan perustuva tentti. Jarmo Niemi. Esitiedot: Kurssilla tarvitaan jakson Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I tiedot. BTEK4100 Mitä biotekniikka on? ( 4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksossa selvitetään mitä biotekniikka on käsittelemällä mm. biotekniikan mahdollisuuksia ja saavutuksia lääketieteessä, maanviljelyksessä ja ympäristötutkimuksessa. Lisäksi selvitetään geenitekniikan merkitystä uuden biotekniikan kehityksessä. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. M. Vehniäinen Kirjallisuus: Luentomoniste ja Schmid.R.D.: Pocket Guide to Biotechnology and Genetic Engineering. BKEM3767 Biokemian perustyömenetelmät, tentti (, 1 ov) BKEM3768 Biokemian perustyömenetelmät, harjoitustyöt (, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tarkoitus on perehdyttää opiskelija biokemiallisten perusmenetelmien teoreettiseen taustaan sekä niissä käytettävien laitteistojen toimintaan. Käsiteltäviä asioita ovat mm. fotometria, kromatografia, elektroforeesi ja radioisotooppitekniikat. Suoritustavat: Experimental Biochemistry-kirjan sivut 1-83 ja 105-109 tenttiminen siten, että kirja voi olla mukana tentissä. Tentti on suoritettava elokuun, syyskuun tai lokakuun tenttipäivinä. Hyväksytty tenttisuoritus on edellytyksenä harjoitustöihin osallistumiselle. Harjoitustyöt suoritetaan pareittain kurssimaisesti marras - joulukuun aikana. Työselostukset tehdään pareittain välittömästi kunkin harjoitustyön jälkeen. Työselostusten tulee olla hyväksytty ennen harjoitustöiden aloittamista. Esa-Matti Lilius. Kirjallisuus: Switzer, R., Garrity, L.: Experimental Biochemistry, 3. Painos. Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä kemian perusharjoitustyöt on oltava täysin suoritettuja ennen kuin voi osallistua perustyömenetelmät kurssille FOOD1013 Elintarvikekemian perusteet (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle yleiskuva elintarvikekemian eri osaalueista ja niiden liittymisistä muihin tieteisiin. Kurssi antaa perustiedot elintarviketieteen suomenja englanninkielisestä sanastosta. Opintojaksolla perehdytään elintarvikkeiden ja niiden raakaaineiden tärkeimpien yhdisteryhmien kemialliseen koostumukseen ja tarkastellaan näiden vaikutusta elintarvikkeiden ominaisuuksiin. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Heikki Kallio Kirjallisuus: Luentomoniste. Luentojen lähdekirjallisuutena voi käyttää aineopintojen loppukuulustelukirjoja: Coultate, T.P., 2002 Food The Chemistry of its Components, 4 th ed. FOOD3752 Laatujärjestelmät (, 1 ov) tai (4 op, 2 ov ) Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tarkoituksena on antaa perustiedot eri laatujärjestelmistä sekä laadunhallinnan menetelmistä. Kurssilla perehdytään mm. viranomaisvaatimuksiin koskien laatujärjestelmiä, mittaukseen ja testaustoimintaan liittyvään laadunvarmistukseen. 4 op:n kurssi antaa valmiuksia esimerkiksi testauksen mittausepävarmuuden arviointiin, validointiin, riskienhallintaan ja auditointien suorittamiseen. Suoritustavat: Luennot, harjoitustyöt, tentti, luennoille osallistuminen suotavaa Opintojakson vastuuhenkilönä on dosentti Linnéa Linko, laadunvarmistusyksikön johtaja. Kirjallisuus: Luentomonisteet. KOULUTUSOHJELMAKOHTAISET AINEOPINNOT BKEM3758 Biokemian harjoitustyöt (13 op, 7 ov) 14

Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle käytännön peruskoulutus biokemiallisessa laboratoriotyöskentelyssä ja ensikosketus biologisen materiaalin tutkimiseen biokemiallisin menetelmin. Harjoitustyöt sisältävät kokeellisia töitä eri biomolekyyleistä kuten entsyymeistä, lipideistä ja nukleiinihapoista. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä osallistuminen työt ulos -kuulusteluun. Biokemian assistentit. Kirjallisuus: Harjoitustyömonisteet Esitiedot: Biokemian perustyömenetelmät oltava täysin suoritettu. BKEM1007 Geeniteknologian menetelmät (, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla tutustutaan geenien siirtoon ja karakterisointiin liittyviin perusmenetelmiin. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Opintojakson suorittaminen on edellytys molekyylibiologian harjoitustöihin pääsemiselle. Jarmo Käpylä. BKEM3521 Mikrobiologian perusteet (4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakso tutustuttaa opiskelijat mikrobiologian perusteisiin kuten mikroskopointiin ja solumorfologiaan, prokaryoottisolujen rakenteeseen, mikrobien kasvuun ja ravintovaatimuksiin, mikrobien torjuntaan kemiallisin ja fysikaalisin menetelmin, energiaaineenvaihduntaan, viruksiin mikrobien luokitteluun, tärkeimpiin mikrobiryhmiin sekä lääketieteellisen ja teollisen mikrobiologian perusteisiin. Kirjallisuus: Prescott, Harley, Klein: Microbiology, 6. tai 5.painos, valituin osin kappaleet 1-3, 5-7,9, 16, 17, 19-25, 34-36, 41,42. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Jarmo Niemi. BKEM1008 Mikrobiologian harjoitustyöt (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakson tavoitteena on antaa opiskelijoille perusvalmiudet mikrobiologiseen laboratoriotyöskentelyyn. Harjoitustöissä perehdytään mm. aseptiseen työskentelyyn, siirrostusmenetelmiin, puhdasviljelmien valmistamiseen, erilaisiin ravintoalustoihin, mikroskopointiin, mikrobien värjäysmenetelmiin, mikrobien tunnistamiseen ja antibioottiherkkyyden määrittämiseen. Suoritustavat: Osallistuminen aamupalavereihin, harjoitustöihin ja töiden raportointiin. Jarmo Niemi. Kirjallisuus: Harjoitustyömoniste ja töiden yhteydessä jaettava lisämateriaali. Esitiedot: Harjoitustöihin tarvitaan kurssin Mikrobiologian perusteet tiedot. BTEK1030 In vitro- Diagnostics (3 op, 1,5 ov) Aims and contents: The course provides an overview of in vitro diagnostics including definitions of basic concepts, a historical exposé of the development of human laboratory diagnostics and clinical chemistry with focus on the major technical and clinical driving forces. The present state-ofart technologies and the some dominating trends in routine IVD testing are presented. Special emphasis is attached to basic chemical and biochemical technologies applied to sensitive bioaffinity applications such as immunoassays and nucleic acid testing. A limited number of major application areas is described more closely. For possible update information check the website http://www.sci.utu.fi/biokemia/luennot.html 2-3 weeks before the course start. Mode of teaching: The course consists of lectures in the form of data projector sessions. Kim Pettersson. Mode of assessment: Mandatory attendance of the course and written examination (3 ects). The lecture material is provided as printouts of PowerPoint presentation FOOD1014 Ravitsemuksen biokemia (, 1,5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehtyä ihmisen ravitsemuksen biokemiaan. Opintojaksossa keskitytään erityisesti hiilihydraattien, lipidien ja proteiinien ruuansulatukseen, imeytymiseen, kuljetukseen ja varastointiin. Luennoilla ja oheismateriaalien avulla selvitetään 15

ravintoaineiden tehtäviä ja merkitystä ihmisen biokemiallisissa reaktioissa ja fysiologiassa. Oppijaksossa on englanninkielisiä osioita. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, kirjallisiin harjoituksiin ja päättökuulusteluun. Yliassistentti. Kirjallisuus: Luennoilla jaettava materiaali (http://www.wm.utu.fi), Aro et al., 2000: Ravitsemustiede (Duodecim) Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I-II, elintarvikekemian perusteet FOOD1015 Elintarvikeanalytiikka (1 op, 0.5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle yleiskuva keskeisistä elintarvikeanalyysien kemiallisista ja fysikaalisista perusteista, näytteenotosta ja menetelmien validoinnista sekä valituilla esimerkeillä analyysien suorittamisesta. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Luentomoniste (myös http://wm.utu.fi). Luentojen lähdekirjallisuutena voi käyttää Luktutkielman elintarvikekemian loppukuulustelukirjaa: James C.S. 1995. Analytical Chemistry of Foods. ss 1-67. BIOKEMIAN AINEOPINNOT BKEM3759 Geenien ilmeneminen (4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tutustutaan mm. pro- ja eukaryoottien perintöaineisiin, geeneihin, geeniperheisiin ja niiden evoluutioon, geneettiseen koodiin, proteiinisynteesikoneistoon ja translaation tapahtumiin molekyylitasolla sekä proteiinien kuljetusmekanismeihin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, itseopiskelua ja kirjallinen kuulustelu. Tentin voi suorittaa myös kahdessa osassa. Reijo Lahti. Kirjallisuus: Lewin, B. (2004): Genes VIII-kirja/kappaleet 1-8 sekä luennoilla jaettava informaatio ja muu oheismateriaali. Osa 1/ kappaleet 1 4 (, 1 ov) ja osa 2/ kappaleet 5 8 (, 1 ov). Esitiedot: Edellyttää perustietoja varsinkin proteiineista ja nukleiinihapoista sekä niiden rakennekomponenteista. Siksi osallistujan oletetaan suorittaneen opintojaksot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä Geeniteknologian menetelmät. BKEM3760 Geenien säätely (4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla tutustutaan mm. RNA- ja DNA-synteesikoneistoihin, transkription ja replikaation tapahtumiin, operonikäsitteeseen, geenien toiminnan säätelymekanismeihin, DNA vaurioiden korjausmekanismeihin ja hyppiviin geeneihin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, itseopiskelua ja kirjallinen kuulustelu. Tentin voi suorittaa myös kahdessa osassa. Reijo Lahti. Kirjallisuus: Lewin, B (2004): Genes VIII/kappaleet 9-17 sekä luennoilla jaettava informaatio ja muu oheismateriaali. Osa 1/ kappaleet 9 12 (, 1 ov) ja osa 2/ kappaleet 13 17 (, 1 ov). Esitiedot: Edellyttää perustietoja varsinkin proteiineista ja nukleiinihapoista sekä niiden rakennekomponenteista. Siksi osallistujan oletetaan suorittaneen opintojaksot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä Geeniteknologian menetelmät. Lisäksi osallistujien oletetaan kuunnelleen luentosarjan Geenien ilmeneminen. BKEM3748 Immunologian perusteet (4 op, 2 ov) Sisältö: Opintojakso kuvaa immuunijärjestelmän sekä sellulaaristen että liukoisten tekijöiden rakennetta, toimintaa ja säätelyä eli miten vieras rakenne erotetaan isännän omista rakenteista, ja miten vierasta rakennetta kohtaan syntyy puolustusvaste. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Esa-Matti Lilius. Esitiedot: Kemian ja biokemian perusteet tunnettava. BKEM8904 Entsyymi- ja proteiinikemian luennot (6 op, 3 ov) 16

Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään entsyymien katalyysin ja proteiinien rakennekemian perusteisiin sekä käydään läpi yleisimmät proteiinien ja entsyymien tutkimusmenetelmät. Lisäksi käydään läpi yleisempien entsyymikineettisten yhtälöiden johtaminen. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, demonstraatioihin ja päättökuulusteluun. Jarmo Käpylä. Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä biokemian perusharjoitustyöt. BKEM1010 Molekyylibiologian harjoitustyöt (5 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään molekyylibiologian menetelmiin. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja keskusteluihin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Biokemian assistentit. Esitiedot: Biokemian harjoitustyöt ja Geeniteknologian menetelmät luennot täysin suoritettu. Lisäksi osallistujien oletetaan kuunnelleen luentosarjan Geenien ilmeneminen. BKEM3597, BTEK4026, FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari (6 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opiskelijan tulee perehtyä joko biokemian, elintarvikekemian tai molekukaarisen biotekniikan ja in vitro diagnostiikan erityiskysymykseen osoitetun kirjallisuuden avulla. Hänen tulee laatia aiheesta tieteellinen, n. 15 sivun mittainen LuK-tutkielma sekä pitää noin 30 min pituinen esitelmä. Tavoitteena on perehdyttää opiskelija kirjallisen tiedon julkistamiseen sekä harjaannuttaa hänen suullista esitystaitoaan, havaintovälineiden käyttämistään sekä keskustelutaitoaan. Suoritustavat: Annetusta aiheesta kirjoitetaan LuK-tutkielma, joka jätetään aiheen antajalle viimeistään viikkoa ennen seminaarin pitämistä. Tutkielman kieliasun tarkastaa äidinkielen opettaja. Itse pitämänsä seminaarin lisäksi opiskelijan tulee osallistua muiden pitämiin seminaareihin yhden lukukauden ajan. Pakollinen osallistumine 2/3 seminaareista. Tutkielmasta kirjoitetaan kypsyysnäyte, jonka tarkastaa professori. Tutkielman hyväksyy ao. linjan professori. Merkinnän saa seminaarin päätyttyä keväällä. Kirjallisuus: Biokemian oppikirjat, kokooma-artikkelit ja osittain myös alkuperäisjulkaisut. Esitiedot: Kirjallinen viestintä ja tieteellinen viestintä BKEM3111 Aineopintojen lopputentti (9 op, 5 ov) Suoritustapa: Opiskelija tenttii kirjasta Nelson, D.L. & Cox, M.M. (2000): Lehninger Principles of Biochemistry (3. painos) kappaleet 12-29 tai vastaavat kappaleet 4. painoksesta. Tentin voi suorittaa yhdessä, kahdessa tai kolmessa osassa [osa 1/kapplaeet 12 18 (3 op, 1.5 ov), osa 2/ kappaleet 19 23 (3 op, 1.5 ov) ja osa 3/ kappaleet 24 29 (3 op, 1.5 ov)]. Reijo Lahti. MOLEKULAARINEN BIOTEKNIIKKA JA IN VITRO DIAGNOSTIIKKA AINEOPINNOT BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka (5 op, 3 ov) Kurssi järjestetään siten, että opiskelijat pitävät kurssin aikana 4-6 Journal Club -tyyppistä esitelmää suomeksi Glick & Pasternak Molecular Biotechnology 2 nd ed. -kirjan pohjalta ja siihen liittyvistä valituista julkaisuista. Kahden tunnin jakson aikana esiintyy neljä opiskelijaa. Esitysten jälkeen käydään keskustelu aiheeseen liittyvistä kysymyksistä, esiintymistavoista ja - menetelmistä. Jokaisella tunnilla on läsnäolopakko. Ei kuulustelua. Urpo Lamminmäki. BTEK4023 Harjoitustyöt (15 op, 8 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat käytännön tasolla osaan aiheista, joita on käsitelty Molekulaarinen biotekniikka luennoilla. Kurssi sisältää viisi erillistä työkokonaisuutta, jotka käsittelevät mm. eläinsoluviljelytekniikoita, bioluminesenssia, nukleiinihappohybridisaatiota sekä immunomääritysmenetelmiä. Suoritustavat: Osallistuminen pareittain tai pienryhmissä tehtäviin harjoitustöihin, show and tell tilaisuuksiin sekä hyväksyttävät työselostukset. Assistentti. Esitiedot: Ennakkoilmoittautuminen biotekniikan assistentille loppukeväällä. Opintojakso tulee suorittaa opintojen ohjeellisena ajankohtana (3. opiskeluvuoden syksy), muulloin suoritetaan karsintaa. BTEK4024 Lopputentti (4 op, 2 ov) 17

Suoritustapa: Opiskelija tenttii professorin kanssa sovitun kirjan, joka voi olla esim. Glick, Pasternak: Molecular Biotechnology. Urpo Lamminmäki BTEK4026 LuK- tutkielma, ja seminaari (6 op, 3 ov) Katso biokemian linjan ao kohta. ELINTARVIKEKEMIAN AINEOPINNOT FOOD3803 Kasviperäiset elintarvikkeet (5 op, 3 ov) FOOD3804 Eläinperäiset elintarvikkeet (5 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksojen tarkoituksena on antaa perustiedot elintarvikeryhmien koostumuksesta, ominaisuuksista ja elintarvikkeissa tapahtuvista kemiallisista reaktioista. Opintojaksolla käsitellään elintarvikkeiden eri aineosien suhdetta rakenteeseen sekä kemiallisiin ja fysikaalisiin muutoksiin. Lisäksi tarkastellaan ko. elintarvikeryhmien kulutuslukuja ja niiden mahdollisia vaikutuksia ravitsemukseen. Kurssilla käsitellään myös kalan biokemiaa. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, tehdasvierailuihin ja päättökuulusteluun. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Belizt & Grosch, 1999: Food Chemistry, 2 nd ed., kappaleet 10-12, 14-18, 21, 22. Alais, C. & Linden, G. 1991. Food Biochemistry, Part II: Biochemistry of the Principal Foods, ss. 119-218. Esitiedot: Elintarvikekemian perusteet, elintarvikeanalytiikka ja biomolekyylit ja aineenvaihdunta I- II. FOOD3750 Elintarvikekemian harjoitustyöt (8 op, 5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden tarkoituksena on perehdyttää opiskelija tavanomaisiin elintarvikeanalytiikassa käytettäviin menetelmiin ja laitteisiin. Harjoitustyöt sisältävät kvalitatiivisia ja kvantitatiivisia määrityksiä eri elintarvikeryhmistä. Suoritustavat: Osallistuminen yksin ja ryhmässä tehtäviin laboratoriotöihin, työselostuksien laatiminen sekä töihin liittyvien kotitehtävien suorittaminen. Arvosana muodostuu oppimistehtävistä, harjoitustöistä, työpäiväkirjasta ja työselostuksista. Kts. http://www.sci.utu.fi/biokemia/etk_harjoitustyot/etk_harjoitustyot_index.htm Eila Järvenpää Esitiedot: Ennen töiden aloittamista on laatujärjestelmät, biokemian perusharjoitustyöt ja mikrobiologian aineopintokurssit oltava suoritettuina ja kasvi- ja eläinperäisten elintarvikkeiden luentojen kuuntelu aloitettu. Lisäksi on suotavaa, että seuraavat opintojaksot olisi suoritettu ennen töihin tuloa: kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia sekä nestekromatografia. FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia (4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla opitaan käyttämään kapillaarikromatografiatekniikkaa elintarvikkeiden ja muun biologista alkuperää olevan materiaalin haihtuvien (GLC) ja haihtumattomien (SFC) aineosien tunnistamiseen ja määrälliseen analysointiin. Erityisesti tutustutaan menetelmien käyttöalueisiin ja rajoituksiin. Kurssiin kuuluvien harjoitustöiden avulla opetellaan analyysien tekninen suoritus vaiheittain sekä yleisimpien suoritusvirheiden eliminointi. Harjoitustyöosan sisäänotto rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen ja päättökuulustelu. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Kallio, H. Kapillaarikaasukromatografian perusteista ja sovellutuksista (luentomoniste), Riekkola ja Hyötyläinen 2002: Kolonnikromatografia ja kapillaarielektromigraatiotekniikat. Esitiedot: Kemian perusopinnot ja biokemian harjoitustyöt tai vastaavat tiedot. FOOD3586 Nestekromatografia (, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla käsitellään modernin nestekromatografian (HPLC) laitteistoa, työskentelytekniikkaa sekä HPLC-analytiikassa esiintyviä yleisimpia käytännön ongelmia. 18

Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja harjoitustöihin sekä työselostusten laatiminen ja päättökuulustelun suorittaminen. Harjoitustöiden osanottajamäärä on rajoitettu, etusija on linjan opiskelijoilla. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi ennen elintarvikekemian harjoitustöitä siten, että esim. kaikki kemian opinnot ja biokemian perusharjoitustyöt tai vastaavat tiedot on suoritettu. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Moniste sekä Riekkola ja Hyötyläinen 2002 (2. painos): Kolonnikromatografia ja kapillaarielektromigraatiotekniikat. FOOD3630 Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät (6 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on antaa perustiedot elintarvikkeiden aistittavien ominaisuuksien - ulkonäön, rakenteen, hajun ja maun analysoinnista. Kurssin pääpaino on erilaisten analyyttisten menetelmien, kuten erotustestien ja kuvailevien menetelmien esittelyllä. Lisäksi kurssilla käsitellään ihmisten aistimekanismeja. Opiskelijoille pyritään antamaan perusvalmiudet arviointiryhmien kokoamiseen ja harjaannuttamiseen sekä asianmukaisten laboratoriotilojen suunnitteluun. Kuluttaja- ja mieltymystestien hyväksikäyttöä käsitellään suppeasti. Kurssin oleellisena osana ovat harjoitustyöt, joissa opiskelijat toimivat arviointiryhmänä ja perehtyvät näin käytännössä eri arviointimenetelmien hyväksikäyttöön. Harjoitustyökurssin sisäänotto on rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä päättökuulustelu. Mari Hakala. Opintojakso toetutetaan joka toinen vuosi. Kirjallisuus: Lawless, H.T. & Heymann, H, 1998 Sensory Evaluation of Food Principles and Practices, Chapman & Hall, Tuorila, H. & Hellemann, U. (toim.), 1993 Elintarvikkeet aistien puntarissa, Yliopistopaino Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet -opintojaksot sekä perustason tilastotieteen kurssi suositellaan suoritettavaksi ennen kurssille osallistumista. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi LuK-opintojen loppuvaiheeseen siten, ettei muita työkursseja ole samanaikaisesti suoritettavana. FOOD3672 Elintarviketeknologian perusteet (3 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Katso Turun AMK bioalojen opinto-opas, opintojakson nimi on säilöntämenetelmät http://www.turkuamk.fi/bioalat/opintokuvaukset.html Suoritustavat: Osallistumalla Turun Ammattikorkeakoulun elintarviketekniikan antamiin luentoihin, demonstraatioihin ja päättökuulusteluun. TY:n vastuuhenkilö Rainer Huopalahti. Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet suoritettu. FOOD3515 Näytteen esikäsittely (, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla käsitellään yleisiä neste- ja kaasukromatografiassa käytettäviä näytteen esikäsittelymenetelmiä kuten SFE, SPE, headspace, lämpödesorptio, osmoosi, suodatus, ym. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja demonstraatioihin sekä päättökuulustelu. Rainer Huopalahti. FOOD3511 Loppukuulustelu (4 op, 2 ov) Tentittävät kirjat: Coultate, T.P. 2002. Food The Chemistry of its Components 4th ed., James, C.S., 1995. Analytical Chemisty of Foods, ss. 1-67. FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari (6 op, 3 ov) Katso biokemian linjan ao. kohta. KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT BKEM1009 Tieteellinen viestintä (1 op, 0.5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla kerrotaan millaisia menetelmiä käytetään, kun julkaistaan tutkimustuloksia ja -katsauksia sekä opetetaan lukemaan tieteellisiä julkaisuja ja hyödyntämään niiden sisältöjä. Erityistä huomiota kiinnitetään kirjallisuuden hakuun ja hakukoneiden käyttöön. Tavoitteena on johdattaa opiskelijat laatimaan tieteellinen katsausartikkeli, joka vaaditaan jo LuKtutkinnossa. Jyrki Heino. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille (läsnäolopakko). 19

MAISTERIN TUTKINNON OPINNOT BIOKEMIAN LINJA Syventävät opinnot BKEM1011 Eukaryoottigeenien toiminta ja molekulaarinen solubiologia (8 op, 4 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelijat eukaryoottien, geenien, kromosomien ja kromatiinin rakenteeseen ja säätelyyn. Lisäksi tutustutaan mm. tumallisten solujen signaalinvälitysmekanismeihin, solusyklin ja kasvun säätelyyn sekä onkogeeneihin. Kurssi luennoidaan seuraavan kerran syksyllä 2006. Suoritustavat: Luennot, itseopiskelu ja tentti, joka voidaan suorittaa kahdessa osassa (2 ov + 2 ov). Luennot ja tentti. Jyrki Heino. Kirjallisuus: Lewin: Genes VIII (kappaleet 18 31). BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt (5 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään proteiinien tuottosysteemeihin sekä tavallisimpiin proteiinien puhdistusmenetelmiin. Lisäksi tutustutaan entsyymikinetiikkaan sekä tietokoneiden käyttöön entsyymikinetiikassa. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja laskuharjoituksiin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Biokemian assistentit. Esitiedot: Biokemian perusharjoitustyöt täysin suoritettu. BKEM3770 Bioinformatiikkaa biokemisteille, luennot (1 op, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa yleiskuva bioinformatiikan eri osa-alueista ja näiden käytöstä tutkimuksessa. Kurssi koostuu vierailevien asiantuntijoiden pitämistä luennoista ja on kaikille avoin. Kurssi on pakollinen biokemian linjan opiskelijoille, joille se on suunniteltu suoritettavaksi "Bioinformatiikkaa biokemisteille" -harjoitustöiden (BKEM3771) yhteydessä. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja loppukuulusteluun. Pekka Rappu. BKEM3771 Bioinformatiikkaa biokemisteille, harjoitustyöt (, 1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden tavoitteena on antaa valmiudet bioinformatiikan työkalujen käyttämiseen tutkimuksessa. Harjoitustyöt sisältävät sekä lähiopetuksena että etäopetuksena tehtäviä tietokoneharjoituksia. Kurssin voi suorittaa vain biokemian linjan opiskelijat. Kurssi suositellaan suoritettavaksi "Bioinformatiikkaa biokemisteille" -luentojen (BKEM3770) yhteydessä. Suoritustavat: Osallistuminen tietokoneharjoituksiin ja kurssin etätehtävien hyväksytty suorittaminen. Pekka Rappu. Esitiedot. Molekyylibiologian harjoitustyöt (BKEM3585) suoritettu. BKEM1012 Bionanotiede (4 op, 2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla perehdytään nanotieteen ja teknologian perusajatuksiin ja kehitysnäkymiin. Syvemmin käydään läpi solun rakentumista biologisista nanokoneista, nanopartikkelien biokemiaa, bionanon soveltamismahdollisuuksia esim. lääketieteessä, diagnostiikassa ja biomateriaaleissa sekä uusien kuvantamismenetelmien (esim. AFM) käyttöä biokemiassa ja nanotieteissä. Useita luennoitsijoita. Jyrki Heino. Suoritustavat: Luennot, luennoilla jaettava materiaali ja tentti. BKEM 1013 Molekulaarisen solubiologian harjoitustyöt (6op, 3ov) Tavoitteet ja sisältö: Nisäkäsproteiinin kohdennettu mutageneesi, ilmentäminen ja tuotto bakteerissa, rekombinanttiproteiinin toiminnan testaus eri menetelmillä. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Jarmo Käpylä. 20