Kemia ja biokemia. Opintojaksot Opetustiedot WebOodissa

Transkriptio

1 Kemia ja biokemia PL 27 (Latokartanonkaari 11), Helsingin yliopisto, puh. (09) , fax (09) Opettajat Tenkanen, Maija, prof., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 112, puh. (09) Makarow, Marja, prof., (työstävapautus asti) Virta, Marko, professori, tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 119, puh. (09) Mäkinen, Kristiina, yliopistonlehtori, dos., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 110, puh. (09) Ekholm, Päivi, yliopistonlehtori, dos., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 117, puh. (09) Lankinen, Pauliina, yliopistonlehtori, opintoneuvonta (biotekniikka), tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 113, puh. (09) Rasilo, Maija-Liisa, lehtori, dos., opintoneuvonta (biokemia) tavattavissa sl ja kl to huone 119, puh. (09) Tuomainen, Päivi, yliopistonlehtori, dos., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 116, puh. (09) Valo, Jaana, yliopisto-opettaja, opintoneuvonta (kemia), tavattavissa sl ma ja kl sopimuksen mukaan, huone 120, puh. (09) Virkki, Liisa, yliopistonlehtori, dos., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 111, puh. (09) Viikari, Liisa, prof., tavattavissa sopimuksen mukaan, huone 109, puh. (09) Sähköpostiosoitteet ovat muotoa etunimi.sukunimi(at)helsinki.fi Opintokokonaisuudet Kemian perusopinnot, 25 op Tunniste: YKEM010 Yleinen ja epäorgaaninen kemia, 4 op ja YKEM020 Orgaanisen kemian perusteet, 4 op tai entinen YKEM100 Kemian luennot, 8 op YKEM101 Kemian työt, 5 op 12 op seuraavista tai vastaavista kursseista: YKEM110 Fysikaalisen kemian luennot, 6 op YKEM111 Fysikaalisen kemian työt, 3 op YKEM200 Soveltava orgaaninen kemia, 6 op YKEM210 Spektrometrian luentokurssi, 3 op YKEM220 Kromatografian luentokurssi, 3 op YKEM310 Bioepäorgaaninen kemia, 3 op Biokemian ja molekyylibiologian perusopinnot, 25 op Tunniste: BKEM100 Biokemia I, 5 op BKEM101 Biokemia I harjoitustyöt, 5 op 15 op seuraavista tai vastaavista kursseista: BKEM200 Biokemia II, 5 op BKEM201 Biokemia II harjoitustyöt, 5 op BKEM300 Molekulaarinen solubiologia, 5 op BIOT200 Geenitekniikan perusteet, 2 op BIOT201 Geenitekniikan harjoitustyöt, 3-5 op Opintojaksot Opetustiedot WebOodissa Kurssien lyhenne kuvastaa suositeltavaa suoritusjärjestystä. Kursseille ja tentteihin ilmoittaudutaan WebOodin kautta. Tarkemmat tiedot kursseista löytyvät OpasOodista. KEMIA Luennot Yleinen ja epäorgaaninen kemia (YKEM010) 4 op Ajoitus: I periodi Tavoite: Yleisen ja epäorgaanisen kemian perusteiden hallinta Sisältö: Kurssilla käsitellään kemian peruskäsitteitä, atomien rakennetta, jaksollista järjestelmää, alkuaineiden ja yhdisteiden ominaisuuksia, kemiallisen kaavan ja reaktioyhtälön kirjoittamista sekä niiden antaman tiedon ymmärtämistä, erilaisia kemiallisia sidoksia ja vuorovaikutuksia, kemiallisia reaktiotyyppejä, reaktion tapahtumiseen vaikuttavia tekijöitä, reaktionopeutta, tasapainoreaktiota, ph- ja puskurikäsitettä, lämpö- ja sähkökemiaa sekä kemiaan liittyviä peruslaskuja. Teoriaharjoituksissa, joissa viikoittaiset kotitehtävät, harjoitellaan yhdisteiden ja reaktioyhtälöiden kirjoittamista ja kemian laskutehtäviä. Chang. R. General Chemistry-The Essential Concepts Teoriaharjoitukset: YKEM010/020 teoriaharjoitukset Kurssin luentomateriaali verkossa (Moodle) Suoritustavat: K34 H10 - R0 I60 järjestetään kolme uusintaa. Viikoittaisissa 5 min pikatesteissä kysytään edellisen viikon aikana käsiteltyjä asioita. Jokaisesta hyväksytystä pikatestistä saa yhden ensimmäiseen lopputenttiin lisättävän pisteen. Uusinnat ovat KEMBI-osaston yleisinä tenttipäivinä. Opiskelijat, joilla on paljon kemian taustatietoja, voivat suorittaa kurssin syyskuussa järjestettävässä yhteiskuulustelussa. Kuulusteluissa ei saa käyttää ohjelmoitavia laskimia eikä Maolin taulukoita. Yhteydet muihin opintojaksoihin: Opintojakso vastaa yhdessä opintojakson YKEM 020 (85020) kanssa aiemmin järjestettyä opintojaksoa YKEM100 (85011). Orgaanisen kemian perusteet (YKEM020) 4 op Ajoitus: II periodi Tavoite: Orgaanisen kemian perusteiden hallinta Sisältö: Kurssilla käsitellään orgaanisen kemian perusteita, orgaanisen kemian ja biokemian keskeisiä yhdisteryhmiä, niiden kemiallisia rakenteita, nimeämistä, kemiallisia ja fysikaalisia ominaisuuksia sekä keskeisiä kemiallisia reaktioita (substituutio, eliminaatio, additio, hapetus ja pelkistys). Teoriaharjoituksissa, joissa viikoittaiset kotitehtävät, tutustutaan orgaanisten yhdisteiden rakenteisiin, nimeämiseen ja reaktioihin. McMurry. J. Fundamentals of Organic

2 Chemistry Teoriaharjoitukset: YKEM010/020 teoriaharjoitukset Kurssin luentomateriaali verkossa (Moodle) Suoritustavat: K34 H10 - R0 I60 järjestetään kolme uusintaa. Viikoittaisissa 5 min pikatesteissä kysytään edellisen viikon aikana käsiteltyjä asioita. Jokaisesta hyväksytystä pikatestistä saa yhden ensimmäiseen lopputenttiin lisättävän pisteen. Uusinnat ovat KEMBI-osaston yleisinä tenttipäivinä. Opiskelijat, joilla on paljon kemian taustatietoja, voivat suorittaa kurssin lokakuussa järjestettävässä yhteiskuulustelussa. Kuulusteluissa ei saa käyttää ohjelmoitavia laskimia eikä Maolin taulukoita. Yhteydet muihin opintojaksoihin: Opintojakso vastaa yhdessä opintojakson YKEM 010 (85010) kanssa aiemmin järjestettyä opintojaksoa YKEM100 (85011). Fysikaalisen kemian luennot (YKEM110) 6 op / 4 ov Ajoitus: III/IV periodi Edeltävät opinnot: YKEM010 tai entinenykem100 vaaditaan Tavoite: Tavoitteena on perehdyttää keskeisimpiin luonnonlakeihin kemiassa ja näiden lakien matemaattiseen käsittelyyn. Sisältö: Kurssilla käsitellään keskeisimmiltä osin kaasujen kineettistä teoriaa, viskositeettiä, diffuusiota, termodynamiikan pääsääntöjä ja niiden soveltamista, seosten ominaisuuksia, kemiallista tasapainoa, reaktiokinetiikkaa ja sähkökemiaa. Chang. R Physical Chemistry for Chemical and Biological Sciences. University Science Books. (osittain), tai Chang, Raymond (2004): Physical Chemistry for the Biosciences. University Science Books. (osittain). Suoritustavat: K68 - H12 - R0 - I82 Arviointi: Kaksi välikuulustelua, joista järjestetään kolme uusintaa. Kurssin hyväksymiseen tarvitaan 50 % välikokeiden yhteenlasketusta maksimipistemäärästä. Lisätiedot: Kurssin luentomateriaali saatavana Moodlessa Soveltava orgaaninen kemia (YKEM200) 6 op / 4 ov Ajoitus: I/II periodi Edeltävät opinnot: YKEM010 ja YKEM020 tai entinenykem100 vaaditaan Tavoite: Kurssin tavoitteena on oppia orgaanisten molekyylien rakenteita, kemiallista luonnetta ja reaktiomekanismeja. Käsitellään myös orgaanisten aineiden roolia, käyttäytymistä ja kulkeutumista sekä biologisessa maailmassa että ympäristössä. Sisältö: Orgaanisten molekyylien rakenne ja funktionaaliset ryhmät. Rakenteesta seuraavat pooliset ominaisuudet, reaktiot, reaktiotavat ja reaktiomekanismit. Aineryhmien valmistus, käyttö, käyttäytyminen ja kulkeutuminen. Työmuotoina viikoittaiset ryhmätyöt, henkilökohtaiset tehtävät ja oppimisportfolio. McMurry. J , 2010 Organic Chemistry. Brooks/Cole, tai vastaava muu orgaanisen kemian oppikirja. Itsenäisesti etsittävä materiaali luentomateriaali Suoritustavat: K22 - H0 - R35 - I103 Arviointi: Ryhmätyöt, kurssilla annetut tehtävät ja oppimisportfolio Lisätiedot: Kurssilla käytetään ongelmalähtöistä oppimismenetelmää (OLO, PBL), joka edellyttää aktiivista osallistumista viikoittaiseen ryhmätyöskentelyyn ja itsenäistä tiedon hankintaa. Spektrometrian luentokurssi (YKEM210) 3 op / 2 ov YKEM100 ja YKEM101 vaaditaan Tavoite: Tavoitteena on oppia spektroskopian perusteet ja mittausmenetelmät ja antaa valmiudet spektrien tulkintaan. Sisältö: Opiskellaan spektrometrian perusteet, tutustutaan spektrometrisiin mittausmenetelmiin (UV- Vis, IR, MS, NMR, AAS, ICP) ja sovellutuksiin. Opiskellaan spektrintulkintaa ja tehdään tulkintaharjoituksia. Pavia. D.L., Lampman. G.M. & Kriz. G.S Introduction to spectroscopy. A guide for students of organic chemistry Luennolla jaettava materiaali. Suoritustavat: K30 - H0 - R0 - I50 Arviointi: Kirjallinen lopputentti Kromatografian luentokurssi (YKEM220) 3 op / 2 ov YKEM100 sekä YKEM101 vaaditaan Tavoite: Tavoitteena on ymmärtää kromatografian periaatteet. Sisältö: Tutustutaan kromatografisten erotusten periaatteisiin ja kromatografisiin tekniikoihin (TLC, GC, HPLC, CE) ja niissä käytettäviin instrumentteihin ja välineisiin. Suoritustavat: K30 - H0 - R20 - I30 Arviointi: Tehtävien hyväksytty suorittaminen tai loppukuulustelu Lisätiedot: Kurssi koostuu luennoista, parityöskentelynä tehtävästä artikkelireferaatista sekä opetusportfoliosta. Bioepäorgaaninen kemia (YKEM310) 3 op / 2 ov Ajoitus: Kurssi järjestetään parittomina vuosina; II periodi. Edeltävät opinnot: YKEM010 ja YKEM020 tai entinenykem100 suositellaan Tavoite: Perehdyttää alkuaineiden kemiallisiin ominaisuuksiin, niiden biologisiin tehtäviin ja analytiikkaan. Sisältö: Kurssilla käsitellään alkuaineiden jaksollisia ominaisuuksia, biologista merkitystä ja analytiikkaa sekä kompleksiyhdisteitä. luentomateriaali e-kirjat Suoritustavat: K28 - H0 - R20 - I33

3 Arviointi: Seminaari ja oppimispäiväkirja tai tentti Biojalostamot (YKEM410) 5 op / 3.5 ov Edeltävät opinnot: Kandidaatin tutkinto tai vastaavat perustiedot Tavoite: Yleiskuva nykyisistä ja tulevista metsä- ja maataloussektorin biojalostamoista ja niiden arvoketjuista erityisesti bioteknisten menetelmien kannalta. Sisältö: Kurssin pääpaino on bioteknisissä menetelmissä ja prosesseissa, mutta myös muut menetelmät käydään läpi (biojalostamojen taustat, bioraaka-aineiden kemia ja biotekniikka, bioenergia, liikenteen biopolttoaineet, sekä maa- ja metsäteollisuuden biojalostamokonseptit). Luentomateriaali, artikkeleita aihepiiristä Suoritustavat: K24 - H0 - R0 - I100 Arviointi: Kurssiin kuuluu lopputentti kurssin lopussa ja tarvittaessa kaksi uusintaa Vastuuhenkilö: Liisa Viikari Lisätiedot: Yhteiskurssi TKK:n kanssa, luennot Viikissä ja Otaniemessä. Kurssikieli englanti (tai suomi osallistujista riippuen) Biopolttoaineet (YKEM420) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: I periodi, lv Edeltävät opinnot: Kemiallisesti tai bioteknisesti painottunut kanditutkinto tai vastaavat perustiedot Tavoite: Kokonaiskuva bioteknisistä menetelmistä biopolttoaineiden tuotossa uusiutuvista raaka-aineista. Biopolttoaineita ovat mm. etanoli, butanoli, biodieselöljyt, vety ja metaani. Sisältö: Biotekniikan mahdollisuudet biopolttoaineiden tuotossa: uusiutuvien raaka-aineiden entsymologia ja fermentaatio erilaisiksi polttoaineiksi. Oppimateriaali ilmoitetaan luennolla. Suoritustavat: Luennot (14 h), seminaariesitykset (14 h), itsenäinen työskentely (100 h) Arviointi: Kurssiin kuuluu lopputentti kurssin lopussa ja kaksi uusintaa Vastuuhenkilö: Liisa Viikari Lisätiedot: Kurssikieli englanti (tai suomi osallistujista riippuen) Laboratoriokurssit Kemian työt (YKEM101) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: I ja II periodi niille opiskelijoille, joilla kemia on ollut pakollinen pääsykoeaine, III tai IV periodi muille Tavoite: Kurssin tavoitteena on oppia tuntemaan laboratoriovälineet ja niiden oikeat käyttötavat sekä laboratoriossa noudatettavat toimintatavat ja työturvallisuus. Oppia kemiallisanalyyttisten menetelmien perustaidot, tulosten laskeminen ja tulkinta sekä työpäiväkirjan/työvihon kirjoittaminen. Sisältö: Epäorgaanisia ja orgaanisia laboratoriotöitä. Kvalitatiivisen ja kvantitatiivisen analytiikan periaatteet, analyysimenetelmien teoreettinen perusta ja mittauslaitteiden toimintaperiaatteet. Harjoitustyömoniste Suoritustavat: K0 - H66 - R0 - I67 Arviointi: Ohjattu laboratoriokurssi tiettyinä aikoina. Läsnäolo kurssin aikana välttämätön, työtentti ja työpäiväkirja. Vastuuhenkilö: Jaana Valo Lisätiedot: Ryhmään otetaan 10 opiskelijaa (min. 8). Ilmoittautuminen on sitova. Ilmoittautumisen saa perua vain painavan syyn takia tai jos hankkii tilalle toisen opiskelijan. Muussa tapauksessa ei voi osallistua laboratoriokurssille seuraavalla lukukaudella. Fysikaalisen kemian työt (YKEM111) 3 op / 2 ov Ajoitus: Elo-syyskuussa Edeltävät opinnot: YKEM010 tai entinen YKEM100, YKEM101 ja YKEM110 vaaditaan Tavoite: Perehdyttää luonnontieteellisiin mittauksiin, tulosten käsittelyyn, virhearviointiin ja tulosten raportointiin Sisältö: Viisi harjoitustyötä, jotka ovat spektroskooppisia, reaktiokineettisiä, kalorimetrisiä, nesteiden fysikaalisiin ominaisuuksiin sekä kemialliseen tasapainoon liittyviä mittauksia. Töistä tehdään työselostukset. Harjoitustyömoniste Suoritustavat: K2 - H15 - R0 - I64 Arviointi: Työselostukset Lisätiedot: Työmoniste saatavana Moodlessa Orgaaninen rakenneanalyysi (YKEM211) 4 op / 3 ov Edeltävät opinnot: YKEM101, YKEM200, YKEM210 ja YKEM220 vaaditaan Tavoite: Tavoitteena on perehtyä menetelmiin, laitteisiin, välineisiin ja reagensseihin, joita käytetään orgaanisessa analyyttisessä työskentelyssä. Annetaan valmiudet itsenäiseen turvalliseen työskentelyyn orgaanisen kemian laboratoriotöissä. Sisältö: Tuntemattoman yhdisteen eristäminen biologisesta materiaalista. Kromatografiset puhdistusmenetelmät TLC, kaasukromatografia, pylväskromatografia. Aineen tunnistus spektroskopialla: IR, NMR, MS. Opiskellaan oikeat ja turvalliset työtavat. Kurssi toteutetaan itsenäisenä laboratoriotyöskentelynä. Kurssilla jaettava materiaali Suoritustavat: K0 - H60 - R0 - I47 Arviointi: Hyväksytty työseloste Kaasukromatografia (YKEM221) 2 op / 1.5 ov Ajoitus: Periodi III tai IV, erikseen sovittavina YKEM100, YKEM101 sekä YKEM220 vaaditaan Tavoite: Kurssin tavoitteena on perehdyttää opiskelija laitteella tapahtuvaan analyyttiseen työskentelyyn, laiteparametrien määrittämiseen ja yksinkertaisiin kunnossapito- ja huoltotoimenpiteisiin. Sisältö: Kaasukromatografilla tapahtuva käytännön työskentelyn ja kaasukromatografisen erotuksen optimointi. Suoritustavat: K0 - H33 - R0 - I20 Arviointi: Teoriakuulustelu osoitetun kirjallisuuden mukaan ja työselostukset Lisätiedot: Kurssi järjestetään viikon pituisena intensiivikurssina.

4 Nestekromatografia (YKEM222) 2 op / 1.5 ov Ajoitus: Periodi I ja /tai IV, erikseen sovittavina YKEM100, YKEM101 ja sekä YKEM220 vaaditaan Tavoite: Kurssin tavoitteena on perehdyttää opiskelija nestekromatografialaitteella tapahtuvaan analyyttiseen työskentelyyn, laiteparametrien määrittämiseen ja yksinkertaisiin kunnossapito- ja huoltotoimenpiteisiin. Sisältö: Nestekromatografialaitteella tapahtuva käytännön työskentely sekä käänteisfaasi- ja suorafaasimenetelmän optimointi. Suoritustavat: K0 - H33 - R0 - I20 Arviointi: Teoriakuulustelu osoitetun kirjallisuuden mukaan ja työselostukset Lisätiedot: Kurssi järjestetään viikon pituisena intensiivikurssina. Projektityöskentely (YKEM400) 2-5 op / 1-3 ov Ajoitus: Periodit I/II/III/IV, erikseen sovittavina Tavoite: Projektityöskentelyn hallinta ja raportointi. Sisältö: Osallistuminen osaston tutkimusprojekteihin tai opetuksen kehittämisprojekteihin. Opintopistevastaavuudet määritellään tapauskohtaisesti. Suoritetusta työstä kirjoitetaan selostus. Suoritustavat: K0 - H0 - R I10-40 Arviointi: Suoritetusta työstä kirjoitetaan selostus. Suoritus arvioidaan hyväksytty / hylätty. BIOKEMIA Luennot Biokemia I (BKEM100) 5 op / 3.5 ov tai entinen YKEM100 suorittaminen tai vastaavat tiedot Tavoite: Kurssin tavoitteena on tutustuttaa osallistujat solun makromolekyylien rakenteen ja toiminnan perusperiaatteisiin sekä kemiasta että biologiasta käsin. Tämä tarkoittaa sitä, että makromolekyylejä ja niiden reaktiota tarkastellaan kemiallisten vuorovaikutusten ja termodynamiikan lisäksi myös yhteydessä niiden toimintaympäristöön solussa. Osallistujat perehdytetään solun kalvorakenteisiin ja niiden toimintaan sekä annetaan johdanto solun energia-aineenvaihduntaan. Tavoitteena on, että kurssilaiset opintojakson jälkeen tuntevat pääaineopintoja ajatellen riittävän laajasti biokemian perusteet. Sisältö: Kurssilla opiskellaan proteiinien, entsyymien, lipidien ja hiilihydraattien perusbiokemiaa ja niihin liittyvää terminologiaa. Opiskellaan sekä liukoisten että kalvoproteiinien yleisrakenteet ja tehtävät. Entsyymien toimintaperiaatteisiin kiinnitetään erityistä huomiota. Lipidit ja hiilihydraatit, erilaisten yhdisteiden kuljetus solukalvon läpi sekä biosignaloinnin perusteet opiskellaan solukalvojen ja kalvoproteiinien yhteydessä. Energia-aineenvaihdunnan perusperiaatteet esitellään. Horton. H. R., Moran. L. A., Scrimgeour. K. G., Perry. M. D., Rawn. J. D., 2006, Principles of Biochemistry Luentomateriaali Suoritustavat: K40 - H0 - R0 - I93 Arviointi: Luennot tai omatoiminen perehtyminen kurssin materiaaliin. Opiskelijan tulee perehtyä kurssin materiaaliin ennen luentoja. Kurssiin kuuluu lopputentti, josta järjestetään kaksi uusintaa. Ensimmäinen tentti on kurssin lopussa, uusinnat ovat KEMBI-osaston yleisinä tenttipäivinä. Vastuuhenkilö: Marko Virta kautta viimeistään viikkoa ennen tenttiä. Biokemia II (BKEM200) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: I periodi tai entinen YKEM100 sekä BKEM100 suorittaminen vaaditaan Tavoite: Kurssin tavoitteena on muodostaa kokonaiskuva siitä, kuinka solut saavat energiaa ravintoaineista, ja kuinka lähtöaineet makromolekyylien biosynteesejä varten syntetisoidaan soluissa. Sisältö: Solujen energia-aineenvaihdunnan ja makromolekyylien prekursoreiden biosynteesien keskeiset reitit ja niiden säätely. Horton. H. R., Moran. L. A., Scrimgeour. K. G., Perry. M. D., Rawn. J. D., 2006, Principles of Biochemistry Suoritustavat: K42 - H0 - R0 - I91 järjestetään kaksi uusintaa. Ensimmäinen tentti on kurssin lopussa, uusinnat ovat KEMBI-osaston yleisinä tenttipäivinä. kautta viimeistään viikkoa ennen tenttiä Molekulaarinen solubiologia (BKEM300) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: II periodi Kurssi suositellaan käytäväksi kolmannen opintovuoden aikana. Edeltävät opinnot: Kurssien BKEM100 ja BIOT200 suorittaminen vaaditaan; kurssin BKEM200 suorittamista suositellaan. Tavoite: Kurssin tavoitteena on antaa opiskelijoille näkemys eukaryoottisolun toiminnasta kokonaisuutena. Sisältö: Kurssilla tutustutaan proteiinien elinkaareen niiden synteesistä hajotukseen. Eukaryoottisolujen organellien erityispiirteet ja tehtävät ovat kurssilla keskeisesti esillä. Solusignalointi ja solujen väliset vuorovaikutukset kuuluvat kurssin aihepiiriin. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Walter, P. (toim.) Molecular biology of the cell, (Garland Science, USA), 5. painos. Suoritustavat:. K26 - H0 - R0 - I107 Arvionti: Opiskelijan tulee perehtyä kurssin materiaaliin ennen luentoja. Kurssiin kuuluu lopputentti, josta järjestetään kaksi uusintaa. Ensimmäinen tentti on kurssin lopussa. Uusintatenttien päivämäärät ilmoitetaan kurssin yhteydessä. Tentteihin ilmoittaudutaan WebOodin kautta viimeistään viikkoa

5 ennen tenttiä. Vastuuhenkilö: Marko Virta Lisätietoja: Kurssi järjestetään yhteistyössä Bio- ja ympäristötieteellisen tiedekunnan kanssa. Geenitekniikan perusteet (BIOT200) 2 op Edeltävät opinnot: kurssien YKEM010 ja YKEM020 tai entinen YKEM100 suorittaminen vaaditaan; kurssin BKEM100 suorittamista suositellaan Tavoite: Kurssin tavoitteena on perehdyttää osallistujat nykyaikaisessa molekyylibiologisessa tutkimuksessa ja bioteknisissä sovellutuksissa tarvittaviin geenitekniikan menetelmiin. Tavoitteena on, että kurssin suoritettuaan osallistujat ymmärtävät geenin kloonauksen eri vaiheet ja DNA:ta modifioivien entsyymien toimintamekanismit. Kurssin aikana tutustutaan geenitekniikan sovellutuksiin. Sisältö: Kurssin alussa opiskellaan molekyylibiologian keskusdogma ja geeniekspression säätelyn perusteet, jotka luovat perustan yhdistelmä-dna-teknologian ymmärtämiselle. Kurssilla tutustutaan yhdistelmä- DNA-molekyylien tuottamisen, monistamisen ja analysoinnin menetelmiin. Käytettävien DNA:ta modifioivien entsyymien toimintaperiaatteisiin kiinnitetään erityistä huomiota. Opiskelijat perehdytetään DNA:n sekvensointiin sekä PCR- ja hybridisaatiotekniikoihin. Opiskelijoille esitellään lyhyesti geenitekniikan sovellutusalueita ja työskentelyyn liittyvää etiikkaa ja lainsäädäntöä. Moodlen kautta jaettava materiaali sekä Brown T. A. (2010) Gene cloning and DNA analysis: an introduction. 6th edition Suoritustavat: K20 - H0 - R0 - I33 Arviointi: Tentti ja annetut tehtävät. Ensimmäinen tentti on kurssin lopussa, uusinnat ovat KEMBIosaston yleisinä tenttipäivinä. Vastuuhenkilö: Kristiina Mäkinen kautta viimeistään viikkoa ennen tenttiä. selvittämään entsyymien toimintaa ja toiminnan säätelyä. Sisältö: Tyrosinaasientsyymin (in vitro) ja malolaktoentsyymin (in vivo) toiminnan ja säätelyn tutkiminen. Kurssimoniste Boyer. R. F Modern Experimental Biochemistry. Suoritustavat: K0 - H100 - R0 - I33 Arviointi: Tentti ja työselostus Geenitekniikan harjoitustyöt (BIOT201) 3 5 op Edeltävät opinnot: Kurssille BIOT200 osallistuminen ja kurssin YKEM101 suorittaminen vaaditaan Tavoite: Kurssi antaa valmiudet molekyylibiologian ja biotekniikan laboratorioissa käytettävien perusmenetelmien hallintaan. Sisältö: Harjoitustyössä monistetaan DNA:ta PCR:n avulla, käydään läpi geenin kloonauksen vaiheet ja harjoitellaan DNA:n puhdistamista ja elektroforeettista analysointia. Kurssimoniste Suoritustavat: K0 - H R0 - I27 Arviointi: Työselostus Vastuuhenkilö: Kristiina Mäkinen Lisätiedot: Kurssille ilmoittaudutaan Weboodin kautta. Osallistujien määrä on rajoitettu. Ilmoittautuminen on sitova. Laboratoriokurssit Biokemia I harjoitustyöt (BKEM101) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: I, III, IV periodi tai entinen YKEM100, YKEM101 sekä BKEM100 suorittaminen vaaditaan Tavoite: Kurssilla opitaan biokemian keskeisiä laboratoriotyöskentelyn menetelmiä sekä tekemään johtopäätöksiä saaduista tuloksista. Sisältö: Kurssityö koostuu entsyymin eristämisestä, puhdistamisesta ja karakterisoinnista sekä proteiinien ja hiilihydraattien kvantitatiivisista ja kvalitatiivisista määritysmenetelmistä. Kurssimoniste Boyer. R. F Modern Experimental Biochemistry. Suoritustavat: K0 - H100 - R0 - I33 Arviointi: Tentti ja työselostus Biokemia II harjoitustyöt (BKEM201) 5 op / 3.5 ov Ajoitus: Parillisina vuosina, II periodi tai entinen YKEM100, YKEM101, BKEM100, BKEM101 sekä BKEM200 suorittaminen vaaditaan. Tavoite: Kvantitatiivisiin mittauksiin perustuen opitaan