MT 200204 DENDROKURSSIT 2004/ROVANIEMI 27-28.1.2004 KURSSIN JÄLKIVAIKUTELMIA JA UUTISIAKIN! Kiitokset osallistumisestasi Lustian ensimmäiseen laitostasoiseen lustotutkimusseminaariin. Seminaarin tavoitteena oli päästä saman pyöreän pöydän ääreen keskustelemaan lustotutkimuksen tarpeista Metlassa, pohdiskella erilaisia ratkaisuvaihtoehtoja ja samalla suunnata hankkeen toimintaa entistäkin palvelevammaksi. Seminaari osoitti lustotutkimuksen ja Lustian kehittämisen olevan tarpeellista myös laitostasolla. Tänä vuonna paneudutaan Lustian laitostasoisen viitekehyksen tarkentamiseen, mikä muun muassa tarkoittaa Metlan muiden tiedonhallintahankkeiden tavoitteiden huomioimista. Haasteena ovat myös asemien erilaiset lustotutkimuksen toimintamallit, joiden valtakunnallisessa yhteensovittamisessa tarvitaan systemaattista ja loogista lähestymistapaa. Toimintavuoden ohjelmassa panostetaan myös lustotutkimuksen käytännön laboratoriotoiminnan kehittämiseen. Siihen kuuluu esimerkiksi oheisen kurssiohjelmistopaketin jakaminen paitsi osallistujille myös muille kiinnostuneille. Lustian laatujärjestelmää kehitetään siten, että Metlan kaikissa lustotutkimusta suorittavissa yksiköissä on mahdollista itsenäisesti tuottaa aineistojen laatutarkistukset. Lustia-hankkeessa ovat rakentava palaute, hyvät ideat ja myös itse kunkin henkilökohtainen työpanos tervetulleita. Hankkeen keskeisen käytännön tavoitteen, Lustia-käsikirjan, laatiminen on meidän kaikkien lustotutkimuksen kehittämistoimintaan osallistuvien tiimityötä. Siksi toivonkin, että osioiden vastuuhenkilöiksi merkityt huolehtisivat oman sektorinsa vuosiraportin laatimisesta jokaisen toimintavuoden lopussa. Tähän vapaamuotoisesti laadittavaan raporttiin voi muun muassa kirjata aihepiirissä tapahtuneen toiminnan tulokset ja kehittämisehdotukset. Jos sinulla on ajatuksia lisätä jokin tärkeäksi arvioimasi osio Lustian hankesuunnitteluun, siihen ei ole ainakaan hanketeknisiä esteitä. Lustia on suunniteltu dynaamiseksi ja aikaansa seuraavaksi itsesäätyväksi hankkeeksi, jolloin hyvin perustellut ja hankkeen tavoitteita tukevat ehdotukset voidaan käynnistää toimintavuoden aikanakin. Samaten heikommin toimivat osiot voidaan varastoida, jolloin resursseja saadaan vapautetuksi uusiin tehtäviin. Jos uusi osio hankekokouksen päätöksellä käynnistetään, saa osion ideoija niin halutessaan sen myös vedettäväkseen. Osio on helposti
liitettävissä Lustian vuotuisohjelmaan Excel-pohjaisen suunnittelujärjestelmän ansiosta. Lustia on vasta nyt päässyt täyteen toimintavalmiuteensa. Omat odotukseni ovat korkealla. Hankkeen eteneminen ei ole ainakaan henkilöstöstä kiinni, sillä motivoituneisuutta ja työhaluja tuntuu löytyvän mukavasti. Oma työohjelmani on tänä vuonna melkoisen tiukka, mikä pakottaa säätämään ajankäyttöä. Osittain tästäkin syystä toivon, että pyritte tekemään osioissanne myös itsenäisiä ratkaisuja osion vastuuhenkilön kanssa neuvotellen. Päätöksenteon tukena ovat myös Lustian vuotuinen toimintasuunnitelma ja hankesuunnitelma, jotka ovat luettavissa www.lustia.fi linkissä. Koetan tietenkin omalta osaltani parhaani mukaan organisoida toimintoja ja mukauttaa hanketta myös näkemystenne suuntaan. Toivon, että Lustiassa toimisi jatkossa muidenkin yksiköiden kuin Rovaniemen ja Kolarin edustajia, onhan kyseessä valtakunnallinen hanke. Rovaniemi ja Kolari ovat siinä hyvin edustettuna, mistä kiitokseni sekä asianosaisille hankeaktiiveille että molempien asemien johtajille. Jotta hankkeen valtakunnallisessa kehittämistyössä päästäisiin eteenpäin, tulen vierailemaan toimintavuoden aikana kaikissa lustotutkimusta suorittavissa yksiköissä. Hyvää kevään jatkoa toivottaen! Mauri PS1. Sinikka Rovanperä toimii hankkeen yhdys- ja monitoimihenkilönä, joten hänen puoleensa voi lisäkseni kääntyä useimmissa Lustia-hankkeeseen liittyvissä asioissa. Hänen yhteystietonsa ovat: sinikka.rovanpera@metla.fi, p.010211 4421. PS2. Valitettavasti edellinen.zip-pakattu kurssiohjelmisto ei avautunut. Lähetän ohessa +seuraavassa viestissä liitetiedostoina uudet ja hiukan paremmin dokumentoidut zipit. Älkää kuitenkaan säikähtäkö dokumenttien kirjavuutta: ne jalostetaan vähitellen Lustiakäsikirjan sivuiksi. Liitin mukaan myös joukon mastereita ja muuta dataa teille, jotka haluatte ajoittaa tai laatia lustosarjoja. PS3. Vilkaiskaapa vielä lopuksi päivän uutista, Saima-laboratorion vastikään julkistamaa datapankkia http://www.joensuu.fi/ktl/saima/homepage3/dataa1.htm. Olen tehnyt laboratorion perustajan ja johtajan, dos. Jouko Meriläisen, kanssa yhteistyötä noin kymmenen vuoden ajan. Olemme kehitelleet kuluvan talven aikana kotimaisen lustotiedon jakeluformaatin, joka täyttää kansainvälisen lustotietopankin ITRDB:n laatuvaatimukset ja merkitsee saadun palautteen perusteella ehkä jotakin muutakin. Hän on vain joitakin päiviä sitten toimittanut uuden formaatin mukaisen suurehkon aineistoerän, mm. Itä- Suomen 1700-vuoden pituisen lustosarjan aineiston, tieteen maa-
ilmanperinnön pyhättöön, kuuluisaan Boulderin data-arkistoon (linkki http://www.ngdc.noaa.gov/paleo/ftp-treering.html ). Boulderin data-arkiston paleoklimaattiselle osastolle tulee päätymään säilytettäväksi osa Metlankin lustoaineistoista, ainakin Sirénin 780-vuotinen metsänrajamännyn lustosarja ja kotimaisen lustotutkimuksen lippulaivana pidettävä metsänrajamännyn 7520- vuotinen lustosarja, jota hallinnoivat Metlan lisäksi Helsingin ja Joensuun yliopistot. ITRDB:stä vastaavat Connie Woodhouse, Bruce Bauer ja Henri Grissino-Mayer ovat antaneet erittäin innostuneen palautteen uudesta jakeluformaatistamme. Heidän mukaansa selkeälukuinen ja visuaalisesti näyttävä esitystapa asettaa uuden standardin kansainvälisten lustoaineistojen taltiointiin. Olen piakkoin Boulderissa selvittelemässä lähemmin, mistä kaikesta oikein on kysymys ja miten jatketaan eteenpäin. Muutaman viikon kuluttua tiedän tarkemmin, miten Lustiaa mahdollisesti on säädettävä vastaamaan nopeasti etenevän kehityksen haasteisiin. Tästäpä on hyvä jatkaa! Terveisin sama.
KINSYS-DPL-KURSSIOHJELMISTO Ohessa kurssilla käytetty lustoanalyysiohjelmisto. Se toimii toistaiseksi ainoastaan Windows-käyttöjärjestelmän (W98, W2000, NT) DOS-ikkunassa. XP-järjestelmässä se ei toistaiseksi toimi. Uusi versio on työn alla, joka tulee toimimaan myös XP:llä. LUSTOAINEISTOJEN PERUSKÄSITTELY COF10K.EXE KIN10K.EXE KINDATA.EXE KINDATA.INF KINDATA.INI kindata.pif KINDATGB.INF KINDATSF.INF INDEKSILASKENTA CRONOL.EXE KIG.EXE 1 KIGRAPGB.DOC KIGRAPGB.INF KIGRAPGB.INI KIGRAPGB.PAR KIGRAPGB.RYH KIGRAPH.INF KIGRAPH.INI KIGRAPH.NIM KIGRAPH.RYH KIGRAPH.PAR KIGRAPH.TXT KIGRAPSF.DOC KIGRAPSF.INF KIGRAPSF.INI KIGRAPSF.PAR KIGRAPSF.RYH VUOSILUSTOSARJOJEN KEHITTÄMINEN COFCOR.EXE COFCOR.INI COFEDIT.EXE MUUNNOKSET EXCEL-OHJELMAN.TXT-MUODOSTA TUCSON-FORMAATTIIN DATTOMTX.EXE DATTOMTX.INI TIEDOSTOMUUNNOKSET KIFMT.EXE KIFMT.INF KIFMT.INI KIPRO.EXE KIPRO.INF KIPRO.INI KIPROGB.INF KIPROSF.INF TUKIOHJELMAT DOSXMSF.EXE RUN386.EXE T.COM DATOJA LEVULA1.MIT LEVULA1.TUC
KINSYS-LUSTOTIETOJÄRJESTELMÄ KINSYS-järjestelmä (The KINSYS an integrated tree-ring research system) on Metlan kasvututkimuksen tarpeisiin kehitetty vuosilustojen tutkimusjärjestelmä. Se on integroitu kansainvälisen lustotutkimuksen standardina pidettyyn amerikkalaiseen ITRDB-järjestelmään. Lisäksi se sisältää yhteisen KINSYS-ITRDB-osion, jossa molempien järjestelmien hyviä ominaisuuksia yhdistämällä on voitu kehittää nopea COFECFA-KINSYS-ajoitusmenetelmä. KINSYS-järjestelmä koostuu vuosilustotiedon hallintajärjestelmästä ja siihen kytkeytyvästä monitoimiohjelmistosta. Lustotiedon hallinta perustuu KSlustonmittausmalliin ja KINSYS-tietorakenteisiin. Kaksikielinen (Suomi/Englanti) ohjelmisto muodostuu alla kuvatussa taulukossa esitetyistä ohjelmista sisältäen mm. merkkipohjaisen lustotietoarkiston, datankäsittely- ja kuvausohjelmiston, aikasarjoihin liittyvän tilastosovellusohjelmiston ja grafiikkaohjelmiston. Ohjelmistolla lasketaan mm. vuosilustoindeksejä, ajoitetaan puunäytteitä, tarkistetaan mittaustuloksia, tulostetaan graafisia esityksiä ja tehdään tilastollisia mallituksia. KINSYS-ohjelmisto 28.01.2004 Aliohj. Fortran-ohjelmakoodin määrän kuvaus: Ohjelma Toiminta lkm Rivien lkm Merkkien lkma4-sivuja* Tot.% 1999 KINDATA Lustodatojen esikäsittely 187 31 958 991 322 496 100 KIFMT Lustotiedostojen muunnokset 55 6 375 185 914 93 100 KIPRO Lustotietojen sovittaminen PC-ohjelmistoihin 72 10 389 291 036 146 100 COFCOR Automaattiset ajoitustoiminnot 11 1 652 47 914 24 100 COFEDIT Ajoituseditori 12 964 27 772 14 100 KINGRAPH Graafiset ja tilastolliset analyysit 366 54 042 1 660 886 830 100 KINREKO Mallitusohjelmisto 186 21 647 579 302 290 100 REKORES RCS-laskenta KINREKOn jäännösvaihtelusta 3 756 22 042 11 100 KINDAILM Ojansuu-Henttosen ilmastotiedot KINSYSiin 9 699 21 660 11 100 KINDACL Ilmastolaskenta 34 9 833 386 364 193 100 DATTOMTX Excel-taulukoiden muunnos ITRDB-formaattiin 21 1 894 48 960 24 100 KINRECLI Ilmastomallitusdatan luontiohjelma 33 6 116 186 944 93 100 KINDAENV Kohteiden taustatietojen luonti 5 3 940 105 807 53 100 ITRFILES Lustodatat ITRDB-formaattiin 14 2 223 70 304 35 100 KINSTAT Lustotietokannan tilastollinen yleiskuvaus 12 1 024 30 166 15 50 KIND1 Lustotietojen muokkaus tilast. analyyseihin 16 2 413 76 405 38 100 KIND2 Kasvuindeksien ja -ennusteiden laskenta 62 10 612 352 550 176 100 KINDKPL Hyönteistuhojen kasvunarviointi 22 2 350 72 200 36 100 KINFRT Lustoaineistojen jakaumien tilast. analyysi 40 2 959 78 504 39 85 KINSSW Lustoaineistojen manipulointi 73 3 536 78 972 39 50 Yhteensä KINSYS-ohjelmiston laajuus 1 233 175 382 5 315 024 2 658 Taulukko 1. KINSYS-lustotutkimusjärjestelmän ohjelmisto. * A4-sivu: 2000 merkkiä KINSYS-ohjelmisto lienee laajin koskaan Metlassa kehitetty tietokoneohjelmisto. Se koostuu 1233 aliohjelmasta ja 175 000 koodirivistä, mikä vaatii levytilaa 5.3 MB (Taulukko 4). A4-sivuina mitaten jo pelkästään ohjelmiston fortran-koodista tulisi 2658-sivuinen moniste, mikä saisi suunnilleen 53 kappaletta 25-sivuista julkaisuja (1 sivu = 2 liuskaa).
KINSYS-OHJELMISTON LYHYT KUVAUS: KINSYS Lustotutkimuksen monitoimipaketti, joka muodostuu tiedonhallintaosasta (KINSYStietorakenne) ja monitoimiohjelmistosta (datankäsittely, indeksinlaskenta, aikasarjaanalyysit, grafiikka, ks. taulukko). KINSYS muodostaa dendrokronologian laboratorion toiminnan ytimen sisältäen keskeisen kotimaisen metodisen lustotutkimusosaamisen. Käyttökieleksi on valittavissa suomi tai englanti. Ohjelmisto koostuu yli 1200 aliohjelmasta ja noin 175 000 koodirivistä. KINDATA Ohjelma muuntaa kattavasti lustotiedostoja muodosta toiseen KINSYS- ja ITRDBjärjestelmien välillä. On tärkein COFECHA-KINSYS -ajoitusmenetelmän osa. Päätoiminnot: mittausaineistojen muokkaus, lajittelu, ryhmittely, yhdistäminen, päivittäminen, laatutarkistus, ajoitus ja tilastotunnukset (RBAR, EPS), ym. Sisältää yli 80 toimintoa. Ohjelma koostuu noin 80:stä aliohjelmasta. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1-näppäimellä. Ohjelmointiväline: Lahey-fortran, version 5.20. Laajuus 187 aliohjelmaa, 32000 koodiriviä (496 A4-sivua). Kansainvälinen (suomi/englanti). KIFMT Ohjelma muuntaa lustotiedostoja muodosta toiseen KINSYS- ja ITRDB-järjestelmien välillä. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1-näppäimellä. Ohjelmointiväline: Lahey-fortran v. 5.20. Laajuus 35 aliohjelmaa, 6400 koodiriviä (93 A4-sivua). Kansainvälinen (suomi/englanti). KIPRO Ohjelma sovittaa KINSYS-tulostukset yleisiin MS/Windows-ohjelmiin. Päätoiminnot: indeksitiedostojen muunto MS/EXCEL-muotoon, REKO-mallien jäännösvaihtelun muunto indekseiksi, KINGRAPHin.SKE-piikkivuositiedoston muokkaus KINGRAPH/.PARparametritiedostoa varten, KINGRAPHin.KIX-indeksitiedoston muokkaus.piitiedostoksi, KINSYS- ja ITRDB-ohjelmilla laskettujen indeksisarjojen yhteensovittaminen ym. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1-näppäimellä. Laajuus 72 aliohjelmaa, 10400 koodiriviä (146 A4-sivua). Kansainvälinen (suomi/englanti). COFCOR On COFECHA KINSYS -ajoitusmenetelmän osa. Ohjelma mahdollistaa nopean ja tehokkaan puoliautomaattisen näytteiden ajoituksen. Se analysoi etukäteen määriteltyjen parametrien perusteella COFECHA-ohjelman ajoitustulosteet ja tekee niistä selväkielisen.cor-tyyppisen ajoitusehdotuksen (ajoitustiedoston). Käyttäjä voi tehdä tässä vaiheessa myös omat ratkaisunsa. Ajoitusehdotus muunnetaan tiedostoksi KINDATA-ohjelmassa ja verifioidaan COFECHAN laatutarkistuksessa. Hyväksytyt näytteet voidaan vielä lopuksi viimeistellä COFEDIT-ohjelmassa. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1-näppäimellä. Laajuus 11 aliohjelmaa, 1650 koodiriviä eli 24 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). COFEDIT COFECHA-KINSYS-ajoitusmenetelmän osa. Ohjelma viimeistelee ajoitetut näytteet paikallistamalla näytteiden heikosti korreloivat reunaosat. Lähtökohtana on COFCORohjelma luotu.cor-tiedosto, johon trimmaukset merkataan KINDATAA varten. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1-näppäimellä. Laajuus 12 aliohjelmaa, 1000 koodiriviä eli 14 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). KINGRAPH Ohjelma analysoi lustoaineistoja ja tulostaa grafiikkaa. Päätoiminnot: lustosarjojen analysointi, lustonäytteiden ajoittaminen, vuosilustoindeksien laskenta, indeksisarjakoosteiden luonti ja piikkivuosien laskenta, lustoaineistojen perustulostus, lustosarjojen tilastotunnusten graafinen esitys ym. Sisältää yli 200 toimintoa. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1- näppäimellä. Ohjelmointiväline: Lahey-fortran v. 5.20. Laajuus 366 aliohjelmaa, 54000 koodiriviä eli 830 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). KINREKO Regressioanalyysiohjelmasta REKO luotu ilmastomallitusversio. Tulostaa KINSYSformaatin mukaisia regressiomallituksia. Analyysimenetelmät: tavallinen regressioanalyysi, harjanneanalyysi, askeltava regressioanalyysi, askeltava harjanneanalyysi, RCSmallitus, mallitus side-ehdoin ym. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 55 aliohjelmaa, 22000 koodiriviä eli 290 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). REKORES Ohjelma laskee KINREKOn RCS-mallituksen jäännösvaihtelusta trendit paljastavan keskiarvosarjan. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 3 aliohjelmaa, 756 koodiriviä eli 11 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). KINRECLI Ohjelma luo Ojansuu-Henttosen ilmastomallin tai muun ilmastodatan perusteella johdetun ilmastodatan, joka sisältää vuosilusto- ja lustoindeksitietojen lisäksi edustavan valikoiman perusmuuttujia ja niistä johdettuja muunnoksia. Ohjelma tulostaa KINREKO-analysointia varten tarvittavat formaatit ja muuttujakuvaukset. KINRECLI KINREKO -yhdistelmä on tehokas, esimerkiksi parhaimmin selittävien ilmastomuuttujien seulonta 1000:sta muuttujasta vaatii vain 1-2 minuutin laskennan. Ikkunoitu käyttöliittymä, opasteet F1- näppäimellä. Laajuus 33 aliohjelmaa, 6100 koodiriviä eli 93 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). KINDACL Ohjelma laskee Ojansuu-Henttosen mallilla tai muilla keinoin muodostetusta KIN- SYS/.ILM -tiedostosta kuukausittaisia ja vuosittaisia tilastoja.. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 38 aliohjelmaa, 4000 koodiriviä eli 53 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). KINDAENV Ohjelma muodostaa kohteittaiset taustatiedot. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 162 aliohjelmaa, 18000 koodiriviä eli 233 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti).
KINSTAT KIND1 KIND2 KINDKPL KINFRT KINSSW Ohjelma muodostaa tilastoja lustoaineistoista. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 12 aliohjelmaa, 1000 koodiriviä eli 23 A4-liuskaa. Kansainvälinen (suomi/englanti). Ohjelma muodostaa lustonmittaustiedoista.lus -tyyppisen työtiedoston KIND2- ohjelmaa varten. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 16 aliohjelmaa, 2400 koodiriviä eli 38 A4-liuskaa. Kotimainen (suomi). Ohjelma laskee monin tavoin perinteisiä vuosilustoindeksejä ja muokkaa lustotietoja KPL-laskentaa varten. muodostaa lustonmittaustiedoista. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 62 aliohjelmaa, 10600 koodiriviä eli 176 A4-liuskaa. Kotimainen (suomi). Ohjelma on kehitetty pienten kasvunmuutosten analysointiin. KINDKPL koostuu kahdesta osasta, kasvunvaihtelu- ja kasvunlaskentaosasta. Kasvunvaihteluosan tieto-rakenteet perustuvat KINSYS-standardiin ja kasvunlaskennassa sovelletaan KPL-standardia. Ohjelma laskee vuosilustoindekseihin perustuen normaaliolosuhteita vastaavat lustoleveyksien estimaatit ja valmistelee kasvudatat KPL-laskentaan. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 22 aliohjelmaa, 2400 koodiriviä eli 36 A4-liuskaa. Kotimainen (suomi). Entisestä frekvenssitaulu-ohjelmasta FRT muokattu lustoversio. Ohjelma laskee yksinkertaisia jakaumatunnuksia ja testaa keskiarvojen välisiä eroja. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 35 aliohjelmaa, 2900 koodiriviä eli 38 A4-liuskaa. Kotimainen (suomi). Entisestä datojen manipulointiohjelmasta SSW muokattu lustoversio. Ohjelma erottelee, yhdistelee ja lajittelee aineistoja. MS/DOS-pohjainen käyttöliittymä, opasteet?-merkillä. Laajuus 68 aliohjelmaa, 3500 koodiriviä eli 40 A4-liuskaa. Kotimainen (suomi).