BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA Ekologian linja Fysiologian ja genetiikan linja Biologian opettajan linja www.sci.utu.fi/biologia/opiskelu/opetusohjelma KOULUTUSOHJELMAN TAVOITTEET Biologian keskeisiä tutkimuskohteita ovat mm. eliöiden monimuotoisuus ja kehitys, eliöiden vuorovaikutusten seuraukset yksilötasolta ekosysteemitasolle, toiminta ja perinnöllisyys eliöyhteisöistä aina solu- ja molekyylibiologiselle tasolle asti sekä ympäristömuutosten vaikutukset. Koulutusohjelma tarjoaa ajankohtaiseen tieteelliseen tutkimukseen perustuvat tiedot eliökunnan rakenteesta, toiminnasta ja kehittymisestä sekä perehdyttää opiskelijat alan tärkeimpiin tutkimusmenetelmiin ja biologian teorioihin. Biologian laaja-alaisuuden vuoksi sekä luonnontieteiden kandidaatin tutkinto (3 vuotta, 180 opintopistettä) että tämän jälkeen suoritettava filosofian maisterin tutkinto (2 vuotta, 120 opintopistettä) voidaan suorittaa kolmen eri linjan mukaisesti. Lisäksi opintoja voidaan yhdistellä henkilökohtaisessa opintosuunnitelmassa (HOPS) asetettujen tavoitteiden toteuttamiseksi opintoneuvojan kanssa sovittavalla tavalla. Ekologian linja Opiskelijat perehtyvät erityisesti eliöiden ja niiden ympäristön välisiin suhteisiin yksilö-, populaatio-, yhteisö- ja ekosysteemitasoilla. Linjan opetuksen päämääränä on rakentaa alan töissä ja jatkoopinnoissa tarvittava ymmärrys eliöiden ja niiden ympäristön muodostamien systeemien toimintaperiaatteista. Evolutiivinen näkökulma ja numeeristen menetelmien hallinta ovat tieteenalan opetuksessa ja tutkimuksessa keskeisessä asemassa. Pääaineopintoihin voi kuulua myös muiden linjojen opintoja henkilökohtaisessa opintosuunnitelmassa sovitulla tavalla. Fysiologian ja genetiikan linja Linja antaa opiskelijoille perustiedot eliöiden rakenteesta, elintoiminnoista ja perinnöllisyydestä molekyyli-, solu- ja yksilötasolla eliöiden eri kehitysvaiheissa sekä perinnöllisyyden ja toimintojen merkityksestä eliöiden evoluutiossa, ympäristösopeutumissa ja vasteissa ympäristön tilan muutoksiin. Linjan opetuksen päämääränä on myös saada opiskelijat ymmärtämään eliöiden rakenteeseen, elintoimintoihin ja kehitykseen sekä ympäristöön sopeutumiseen liittyviä säätelymekanismeja. Perinteisen laboratoriobiologian lisäksi linja sopii myös evoluutio- ja ympäristöbiologiasta kiinnostuneille opiskelijoille. Pääaineopintoihin voi kuulua myös muiden linjojen opintoja henkilökohtaisessa opintosuunnitelmassa sovitulla tavalla. Biologian opettajan linja Biologian opettajan linjan tavoitteena on antaa opiskelijalle opettajan työssä tarvittava kokonaiskuva biologiasta, sekä johdattaa tieteelliseen tutkimukseen jollakin biologian osa-alueella. Kandidaatin ja maisterin tutkinnot muodostavat yhdessä kokonaisuuden, joka tuottaa pätevyyden peruskoulun, lukion ja muiden oppilaitosten opettajiksi. Sijoittuminen eri ammattialoille Koulutusohjelma tuottaa valmiudet työskentelyyn tutkija- ja asiantuntijatehtävissä tutkimuslaitoksissa, hallinnossa, bioalan yrityksissä ja yliopistoissa. Lisäksi biologian opettajalinja antaa valmiudet toimia koulujen biologian opettajana. Biologian opettajia tarvitaan myös jossain määrin ammattikorkeakoulujen ja muun aikuiskoulutuksen tehtävissä. Lisäksi kaikki koulutusohjelman linjat antavat valmiudet tohtorin tutkintoon johtaviin jatko-opintoihin.
OPINTOJEN SUORITTAMINEN Opiskelumuodot Biologian koulutusohjelman opetukseen kuuluu luentoja, seminaareja ja harjoitustöitä. Seminaareihin ja harjoitustöihin osallistuminen on pakollista ja kurssin suorittaminen vaatii aktiivista osallistumista. Luennoilla yleensä kerätään osallistujalista, jonka perusteella myönnetään oikeuksia esimerkiksi verkossa oleviin kurssimateriaaleihin (http://moodle.utu.fi). Harjoitustöihin ilmoittaudutaan pääsääntöisesti netissä (http://nettiopsu.utu.fi) (ilmoittautumisohjeet löytyvät kunkin kurssin verkkosivulta: http://www.sci.utu.fi/biologia/opiskelu/opetusohjelma). Poikkeuksena on kuitenkin ensimmäisen vuoden ensimmäisen periodin harjoitustyöt, joiden ryhmäjako suoritetaan sille opetusohjelmassa varattuna päivänä periodin alussa. Ajankohtaiset tiedot opetuksesta löytyvät biologian laitoksen www-sivuilla (http://www.sci.utu.fi/biologia/opiskelu/opetusohjelma ). Kuulustelut Luentosarjan lopuksi on yleensä tentti. Usein ensimmäinen tenttikerta on järjestetty erillisenä ja kaksi muuta tenttimahdollisuutta ovat biologian yleisinä tenttipäivinä.yleiseen tenttiin ilmoittaudutaan elektronisesti NettiOpsun kautta (katso lähemmin http://nettiopsu.utu.fi ). Kirjatenttejä voidaan suorittaa ko. kirjatentistä annettujen ohjeiden mukaisina biologian yleisinä tenttipäivinä. Kesän yleisinä tenttipäivinä voi tenttiä kaikkia kirjatenttejä. Lisäksi lukuvuoden aikana järjestettyjen kurssien tenttejä voi tenttiä opettajan ilmoittamina kesätenttipäivinä sopimuksen mukaisesti. Kesätenttiin on ilmoittauduttava toukokuun loppuun mennessä. Kuulustelun hyväksytty suoritus edellyttää vastaamista jokaiseen kysymykseen ja jokaisesta vastuksesta tulee myös saada pisteitä, ellei kuulustelua vastaanottava opettaja ole toisin ilmoittanut. Kuulustelun läpäiseminen (arvosana 1/5) edellyttää, että kokonaispistemäärä on vähintään puolet kuulustelun maksimipistemäärästä. Tutkielmat ja tutkintotodistuksen hakeminen Tutkielmien tarkastamisesta vastaa tutkielman aihealueeseen perehtynyt professori. Sekä LuKettä pro gradu -tutkielmien tarkempi ohjeistus löytyy biologian laitoksen www -sivuilta (http://www.sci.utu.fi/biologia/opiskelu/opiskeluohjeet/ ). Ennen FM-tutkintotodistuksen hakemista tarkastutetaan pääaineeseen kuuluvat opinnot joko linjan opetuksesta vastaavalla professorilla (ekologian linja) tai pro gradu -tutkielman aiheen hyväksyneellä professorilla (fysiologian ja genetiikan linja). Opettajalinjan suoritukset tarkistaa opettajalinjan opinnoista vastaava biologian lehtori. Opintokokonaisuuksien arvosanat lasketaan ja kokonaisuudet viedään opintorekisteriin biologian laitoksen kanslian toimesta sen jälkeen kun sisällöt on hyväksytty. Kandidaatin tutkintoon ei voi sisältyä syventäviä opintoja, mutta niitä voi kuitenkin suorittaa jo LuK-vaiheessa. Katso tarkemmat ohjeet tutkintotodistuksen anomisesta tiedekunnan verkkosivulta (http://www.sci.utu.fi/tdk/opiskelu/ opiskelijalle/valmistuminen.html). Linjavalinnat ja erikoistuminen Biologian koulutusohjelma on jaettu kolmeen linjaan: ekologian linjaan, fysiologian ja genetiikan linjaan sekä opettajalinjaan. Linjavalinnat tehdään ensimmäisenä lukuvuonna syyslukukauden lopussa. Linjavalinta ilmoitetaan laitoksen kansliaan. Fysiologian ja genetiikan linjalla toisena sivuaineena kaikilla opiskelijoilla on solu- ja molekyylibiologia. Opettajalinjalla sivuaineina ovat toinen opetettava aine (yleensä maantiede tai kemia) ja kasvatustiede. Biologian opettajalinjalla on opiskelijavalinnassa kiintiö. Maisteriopinnoissa opiskelija voi suuntautua linjan sisällä jollekin erikoistumisalalle, jonka aihepiiristä myös pro gradu tutkielma tehdään.
Opintoneuvonta ja henkilökohtainen opintosuunnitelma HOPS Biologian yleisestä opinto-ohjauksesta vastaavat ensisijaisesti eri aihealueiden opintoneuvojat, mutta varsinkin yksityiskohtaisissa erityisalojen kysymyksissä kannattaa kääntyä suoraan alan professorin tai muun opettajan puoleen. Henkilökohtaisen neuvonnan lisäksi opintoneuvojat järjestävät yhteistilaisuuksia esim. linjavalinnoista, sivuaineista ja erikoistumismahdollisuuksista. Opintoneuvojiin kannattaa olla yhteydessä kaikissa opintojen suunnitteluun liittyvissä ongelmissa. Pienemmät ongelmat ratkeavat usein sähköpostitse ja laajempia asiakokonaisuuksia varten kannattaa sopia keskusteluaika. Kaikki opiskelijat laativat yhteistyössä opintoneuvojien kanssa henkilökohtaisen opintosuunnitelman (HOPS). HOPS tehdään, jotta opiskelijan opinnot etenisivät mahdollisimman joustavasti ja tarkoituksenmukaisesti. HOPS tehdään sähköisesti (ehops, http://hops.utu.fi). Ensimmäisen vuoden keväällä järjestetään ehops-perehdytys pienryhmissä. HOPS laaditaan ensin LuK-tutkintoa varten ja maisteriopintoihin kolmannen vuoden huhtikuun loppuun mennessä. HOPS päivitetään vuosittain. OPINTONEUVOJAT (ajantasainen ja yksityiskohtaisempi lista löytyy laitoksen verkkosivulta http://www.sci.utu.fi/biologia/opiskelu/neuvontahenkilokunta/) Biodiversiteettitutkimus, kansainvälinen opiskelijavaihto: Kalle Ruokolainen, LT 1, 2. krs, puh 333 6015 kalle.ruokolainen@utu.fi Ekologia: Veijo Jormalainen, LT 1, 3. krs, puh. 333 5818, veijo.jormalainen@utu.fi ja Harri Hakkarainen, LT1, 2. krs, puh. 333 8863, harri.hakkarainen@utu.fi Eläinfysiologia: Minna Vainio, LT 1, 1 krs, puh 333 5783, minna.vainio@utu.fi Genetiikka: Irma Saloniemi, LT 2, 4. krs, puh. 333 5721, irma.saloniemi@utu.fi Kasvifysiologia ja molekyylibiologia: Pirkko Mäenpää, LT 2, 2. krs, puh 3333 5799, pirkko.maenpaa@utu.fi Biologian opettajalinja ja OKL:n biologia: Kai Ruohomäki, LT 1, 2. krs, puh. 333 5766, kai.ruohomaki@utu.fi Amanuenssi: Otso Suominen, LT 1, 2. krs, puh. 333 5574, otso.suominen@utu.fi (vv. 31.10.2009 saakka) / Tapio Haavisto (mvs) tapio.haavisto@utu.fi Laajat korvausanomukset, tutkinnon rakenne, kokonaisuusmerkinnät biologiasta.
BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA, LuK 180 op Kaikkien kolmen linjan luonnontieteiden kandidaatin tutkinnot antavat valmiuden opintojen jatkamiseen ylempään korkeakoulututkintoon myös muilla biologian linjoilla edellyttäen, että henkilökohtaisen opintosuunnitelman mukaiset opinnot soveltuvat myös toiselle linjalle. Lisäksi opinnot sopivat hyvin pohjaopinnoiksi esimerkiksi englanninkielisiin maisteriopintoihin ympäristötieteissä ja bioinformatiikassa (Master's Degree Programme in Environmental Sciences, Master's Degree Programme in Bioinformatics). Kandidaatin tutkintoon ei voi sisällyttää syventäviä opintoja, mutta niitä voi kuitenkin jo suorittaa ja sisällyttää myöhemmin maisteriopintoihin. Luonnontieteen kandidaatin (LuK) tutkinnon rakenne Luonnontieteiden kandidaatin tutkinto 180 op Ekologian linja Fysiologian ja genetiikan linja Biologian opettajan linja Biologian perusteet 25 op 25 op 25 op Kehitys, toiminta ja evoluutio 25 op 25 op Sisältyy linjan aineopintohin sekä FM-opintoihin Muut yhteiset opinnot 15 op 20 op 10 op Kieli- ja viestintäopinnot 10 op 10 op 10 op Linjan aineopinnot 45-55 op 40-50 op yhteiset 45 op + erikoistuminen 22-30 op Vapaasti valittavat 0-10 op 0-10 op 0-8 op Sivuaineet 2 x 25 op tai 60 op Solu- ja molekyyli-biologia 25 op Muut 25 op Toinen opetettava aine 60 op Kaikkien linjojen yhteiset Luk-vaiheen opinnot BIOL1000 BIOL1000 BIOLOGIAN PERUSOPINNOT 25 op Kaikilla kolmella linjalla suoritetaan ensimmäisen syksyn aikana biologian koulutusohjelman yhteiset perusopinnot. Samanaikaisesti aloitetaan myös muita yhteisiä opintoja sekä kieliopintoja. Ekologia (BIOL1001 ja 1011) Eliöiden tuntemus (BIOL1101 ja 1111) Eliöiden toiminta ja perinnöllisyys (BIOL1201,1301, 1401 ja 1501). BIOL1001 Ekologian perusteet, 5 op BIOL1011 Ekologian perusteiden harjoitukset, 2 op BIOL1101 Eliöiden rakenne, 3 op BIOL1111 Eliöiden tuntemuksen perusteet, 3 op BIOL1201 Eläinfysiologian perusteet, 3 op BIOL1301 Genetiikan perusteet, 3 op BIOL1401 Kasvifysiologian ja molekyylibiologian perusteet, 3 op BIOL1501 Eliöiden toiminnan ja perinnöllisyyden harjoitukset, 3 op
Arviointi Numerolla 1-5 Lisätiedot Biologian opettajalinjalla merkitään koodilla XBIO4143 BIOL2000 Kehitys, toiminta ja evoluutio 25 op Opettajalinjan LuK-opinnoissa pakollisia suorituksia alle 25 op (ks. erittely alempana kohdassa Biologian opettajalinjan LuK-vaiheen aineopinnot ) KOULUTUSOHJELMAN YHTEISET AINEOPINNOT BIOL2010 Eläinten lisääntyminen ja kehitys, 3 op BIOL2020 Kasvien lisääntyminen ja kehitys, 2 op BIOL2030 Kehitysgenetiikka ja evoluutio, 2 op BIOL2040 Eliöiden toimintaan vaikuttavat ympäristötekijät, 2 op BIOL2050 Eläinten ekofysiologia, 2 op BIOL2060 Kasvien ekofysiologia, 3 op BIOL2071 Evolutionary and Quantitative Genetics, 3 op BIOL2080 Evolutiivisen ekologian perusteet, 4 op BIOL2090 Eliökunta, 2 op BIOL2100 Eliökunnan historia, 2 op Opintokokonaisuus on pakollinen ekologian sekä fysiologian ja genetiikan linjalla. Osia tästä kuuluu myös opettajalinjalla vaadittaviin suorituksiin (ks. opettajalinjan erikoistumisopinnot). MUUT KOULUTUSOHJELMAN YHTEISET OPINNOT 10 20 op Osakokonaisuuden laajuus ekologian linjalla 15 op, fysiologian ja genetiikan linjalla 20 op ja biologian opettajan linjalla 10 op. BIOL4020 Kemian kurssi biologeille, 2 op BIOL4040 ATK:n perusteet, 4 op BIOL4050 Biostatistiikan alkeet, 4 op Ekologian sekä fysiologian ja genetiikan linjalla, opettajalinjalla vasta FM-tutkinnossa: BIOL4060 Bioetiikka, 2 op BIOL4055 Koesuunnittelu, 3 op Vain fysiologian ja genetiikan linjalla: FALL1005 Kemian harjoitukset, 3 op sekä kemian jatkokurssi, suoritettava yksi allaolevista KEML5636 Lääketieteellinen kemia, 2 op BIOL4030 Kemian kurssi biologeille 2, 2 op Kieli- ja viestintäopinnot, 10 op Kieli- ja viestintäopinnot ovat samanlaiset kaikilla kolmella linjalla: BIOL3010 Tieteellisen esitystaidon alkeet,1 op KIRU2361 Ruotsin kieli / matemaattis-luonnontieteellinen 3 op KIEN2311 Englannin kieli / tekstin ymmärtäminen 3 op (tai suullisen kielitaidon kurssi) KISU3321 Kirjallinen viestintä: Matemaattis-luonnontieteellinen 2 op KISU3322 Kirjallisen työn laatimiseen liittyvä opetus 1 op BIOL3010 Tieteellisen esitystaidon alkeet 1 op
EKOLOGIAN LINJAN LuK-VAIHEEN AINEOPINNOT Opiskelijat perehtyvät erityisesti eliöiden ja niiden ympäristön välisiin suhteisiin yksilö-, populaatio-, yhteisö- ja ekosysteemitasoilla. Linjan opetuksen päämääränä on rakentaa alan töissä ja jatkoopinnoissa tarvittava ymmärrys eliöiden ja niiden ympäristön muodostamien sys-teemien toimintaperiaatteista. Evolutiivinen näkökulma ja numeeristen menetelmien hallinta ovat tieteenalan opetuksessa ja tutkimuksessa keskeisessä asemassa. Pääaineopintoihin voi kuulua myös muiden linjojen opintoja henkilökohtaisessa opintosuunnitelmassa sovitulla tavalla. EKOL2000 EKOLOGIAN AINEOPINNOT 45 55 op Erikoistumisopinnot ekologian linjalla Lajintuntemus 6 op Suoritettava vähintään 6 op EKOL2351 Selkärankaisten lajintuntemus, 2 op EKOL2352 Selkärangattomien tuntemus, 2 op EKOL2353 Hyönteisten tuntemus, 2 op EKOL2354 Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus, 2 op Kenttäkurssit 4 op Suoritettava vähintään 4 op EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi, 2 op EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi, 2 op EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi, 2 op EKOL2308 Akvaattisen ekologian kenttäkurssi, 3 op Ekologian luennot, 8 op EKOL2213 Evolutiivinen ekologia, 4 op EKOL2108 Populaatioekologia, 2 op EKOL2109 Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologia, 2 op Ekologian muut pakolliset erikoistumisopinnot 25 op EKOL2405 Ekologian tilastolliset menetelmät, 8 op EKOL2103 Ekologian laboratorioharjoitukset, 3 op EKOL2004 Aineopintojen loppukuulustelu, 6 op EKOL2006 Ekologian LuK-seminaari, 2 op EKOL2700 LuK-tutkielma, 6 op Valinnaiset erikoistumisopinnot 2 12 op Voi sisältää myös kenttäkursseja 4op tai muita valinnaisia kursseja EKOL3130 Eliökunnan monimuotoisuus: kasvikunta, 4 op EKOL3129 Eliökunnan monimuotoisuus: eläinkunta, 2 op EKOL2412 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi, 3 op Vapaasti valittavat opinnot, 0-10 op esim. EKOL2508 Puutarhakasvit, 2 op SIVUAINEET EKOLOGIAN LINJALLA 50 60 op Kandidaatin tutkintoon tarvitaan joko kaksi 25 op sivuainekokonaisuutta tai yksi 60 op kokonaisuus. Ekologian linjalla voidaan biologian sisäisenä sivuaineena suorittaa fysiologian ja genetiikan kokonaisuus (25 op tai laajempi), johon voidaan yhdistää myös solu- ja molekyylibiologian opintojaksoja opintoneuvojan kanssa sovittavalla tavalla.
Sivuaineilla on merkitystä työelämään sijoittumisessa ja/tai kandidaattivaihetta seuraavien opintojen suuntaamisessa. Ekologian linjan opetus mahdollistaa pätevöitymisen moniin erilaisiin tehtäviin. Siksi myös mahdollisten sivuaineiden kirjo on ekologiassa suuri. Sivuainevalintojen tulisi tukea opiskelijan suuntautumista linjan sisällä. Jos maisterivaiheen erikoistumisala on jo selvillä, kannattaa katsoa FM-vaiheen opinnoista, mitä sivuaineita eri erikoistumisalat mahdollisesti edellyttävät. Kandidaatin tutkintoon ei voi sisältyä syventäviä opintoja, mutta niitä voi suorittaa jo LuKvaiheessa. Sivuainevalinnat merkitään opiskelijan henkilökohtaiseen opintosuunnitelmaan, kun niistä on keskusteltu opintoneuvojan kanssa. Kandidaatin tutkintoon tarvitaan joko kaksi 25 op sivuainekokonaisuutta tai yksi 60 op kokonaisuus. Ekologian linjalla voidaan biologian sisäisenä sivuaineena suorittaa fysiologian ja genetiikan kokonaisuus (25 op tai laajempi), johon voidaan yhdistää myös solu- ja molekyylibiologian opintojaksoja opintoneuvojan kanssa sovittavalla tavalla. Syventävissä opinnoissa evoluutiobiologiaan suuntautuville suositellaan sivuaineeseen ainakin seuraavia opintojaksoja (yht. 18 op): SOMO1001 Molekyylibiologian luennot, SOMO 1002 Molekyylibiologian harjoitustyöt, SOMO1011 Genetiikan jatkoluennot, FYGE2211 Genetics of natural populations, FYGE2231 Evoluutiogenetiikan harjoitukset. Muiksi sivuaineiksi soveltuvat mm. ympäristötiede, maantiede, geologia, tilastotiede, tietojenkäsittelytiede, matematiikka, biokemia, kemia, fysiikka, filosofia, kaupalliset aineet, kasvatustieteet, ympäristöoikeus ja hallintotieteet. Myös muissa oppilaitoksissa tai ulkomailla suoritettuja opintoja voidaan käyttää täydentämään sivu- ja pääaineopintoja, esimerkiksi Åbo Akademin meribiologian, ympäristötieteen tai solu-biologian opintoja.
FYSIOLOGIAN JA GENETIIKAN LINJAN LuK-VAIHEEN AINEOPINNOT Linja antaa opiskelijoille perustiedot eliöiden rakenteesta, elintoimin-noista ja perinnöllisyydestä molekyyli-, solu- ja yksilötasolla eliöiden eri kehitysvaiheissa sekä perinnöllisyyden ja toimintojen merkitykses-tä eliöiden evoluutiossa, ympäristösopeutumissa ja vasteissa ympä-ristön tilan muutoksiin. Linjan opetuksen päämääränä on myös saada opiskelijat ymmärtämään eliöiden rakenteeseen, elintoimintoihin ja kehitykseen sekä ympäristöön sopeutumiseen liittyviä säätelymekanismeja. Perinteisen laboratoriobiologian lisäksi linja sopii myös evo-luutio- ja ympäristöbiologiasta kiinnostuneille opiskelijoille. Pää-aineopintoihin voi kuulua myös muiden linjojen opintoja henkilökoh-taisessa opintosuunnitelmassa sovitulla tavalla. FYSIOLOGIAN JA GENETIIKAN LINJAN AINEOPINNOT 40 50 op Valinnaiset luennot ja kurssit 22 32 op (Alla olevasta koottuna. Osa järjestetään vain joka toinen vuosi.) Anatomia, histologia ja morfologia 13 op FYGE2001 Kasvianatomian ja kehitysmorfologian luennot, FYGE2002 Kasvianatomian ja kehitysmorfologian harjoitustyöt, FYGE2021 Mikroskooppitekniikat, FYGE2031 Selkärankaisten anatomia ja histologia, 2 op 2 op 5 op 4 op Eläinten toiminta ja sen säätely 15 op (Kaikkien, jotka aikovat myöhemmin käyttää selkärankaisia tutkimuksissa, on koe-eläintoiminnasta annetun lain 10 mukaan suoritettava koe-eläinkurssi) FYGE2101 Eläinfysiologian harjoitustyöt, 4 op FYGE2111 Neurobiologia, 5 op PGS_1024 Koe-eläinkurssi, 6 op Yksilönkehitys ja siihen liittyvä perinnöllisyys 4 op FYGE2201 Kehitysgenetiikan harjoitukset, Populaatio- ja evoluutiogenetiikka 8 op FYGE2211 Genetics of natural populations, FYGE2221 Evoluutiogenetiikan harjoitukset, Genetiikan tilastolliset ja epidemiologiset sovellutukset 4 op FYGE2231 Geneettisiä tilastosovelluksia, Mikrobien molekyyligenetiikka 7 op FYGE2241 Mikrobien molekyyligenetiikka, FYGE2242 Mikrobigenetiikan harjoitustyöt Kromosomitutkimus 6 op FYGE2251 Kromosomitutkimuksen luennot, FYGE2252 Kromosomitutkimuksen harjoitukset Kasvibiokemia 6 op FYGE2301 Kasvibiokemian luennot, FYGE2302 Kasvibiokemian harjoitustyöt Kasvit ja ympäristö 5 op FYGE2311 Kasvit ja ympäristö, luennot FYGE2312 Kasvit ja ympäristö, harjoitustyöt Kasvigenetiikka ja -biotekniikka 8 op FYGE2321 Kasvigenetiikan ja -biotekniikan luennot FYGE2322 Kasvigenetiikan ja -biotekniikan harjoitukset 4 op 4 op 4 op 4 op 3 op 4 op 2 op 4 op 3 op 3 op 2 op 3 op 5 op 3 op
Vaihtuvia luentosarjoja/kursseja 0-10 op (FYGE3000-199) MUUT OPINNOT 18 op FYGE1001 Fysiologian ja genetiikan LuK-seminaari, FYGE1002 Fysiologian ja genetiikan LuK-tutkielma, Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukuulustelu 1 ja 2 10 op FYGE1011 Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukuulustelu 1 FYGE1012 Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukuulustelu 2 Vapaasti valittavat opinnot (FYGE) 0-10 op esim. FYGE1100 Astrobiologian peruskurssi 2 op, FYGE3100 Elämän synty, 2 op 6 op 4 7 op 4 7 op 2 op SIVUAINEET FYSIOLOGIAN JA GENETIIKAN LINJALLA 50 op Kandidaatin tutkintoon tarvitaan joko kaksi 25 op sivuainekokonaisuutta tai yksi 60 op kokonaisuus. Fysiologian ja genetiikan linjalla on pakollisena sivuaineena solu- ja molekyylibiologian 25 op kokonaisuus. Kandidaatin tutkintoon ei voi sisältyä syventäviä opintoja, mutta niitä voi suorittaa jo LuK-vaiheessa. Linjan opiskelijoille suositellaan toiseksi 25 op sivuaineeksi joko ekologian linjan tai biokemian kokonaisuuden suorittamista. Jos linjan opiskelija ei suorita biokemian sivuainetta, on suositeltavaa, että ainakin seuraavat biokemian opintojaksot sisältyvät LuK-tutkintoon. : BKEM1240 Biomolekyylit I, BKEM1241 Biomolekyylit II, BKEM1231 Aineenvaihdunta, BKEM3521 Mikrobiologian perusteet. Syventävissä opinnoissa evoluutiobiologiaan suuntautuville suositellaan ainakin seuraavia ekologian opintojaksoja (yht. 8 op): EKOL2108 Populaatioekologia, EKOL2213 Evolutiivinen ekologia ja joko EKOL2414 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi tai sekä lajintuntemuskurssi (EKOL2341-4) että kenttäkurssi (EKOL2301-8). Muiksi sivuaineiksi sopivat esim. fysiikka, kemia, bioinformatiikka, matematiikka, terveyden biotieteet ja useat lääketieteellisen tiedekunnan opintokokonaisuudet. Jos maisterivaiheen erikoistumisala on jo selvillä, kannattaa katsoa FM-vaiheen opinnoista, mitä sivuaineita eri erikoistumisalat mahdollisesti edellyttävät. Opiskelijalle sopivimmat sivuaineet on selvitettävä henkilökohtaista opintosuunnitelmaa (HOPS) laadittaessa. Tavanomaisista merkittävästi poikkeavat sivuaineyhdistelmät saattavat muodostua erityisvahvuuksiksi muuttuvilla työmarkkinoilla. SOMO1000 Solu- ja molekyylibiologia (pakollinen) 25 op SOMO1001 Molekyylibiologian luennot, SOMO1002 Molekyylibiologian harjoitustyöt, SOMO1011 Solubiologian luennot, SOMO1012 Solubiologian harjoitukset, SOMO1021 Genetiikan jatkoluennot, SOMO1025 Bioinformatiikka, SOMO1023 Solu- ja solukkoviljelytekniikat, Biokemia (suositeltavat opintojaksot) 16 op BKEM1240 Biomolekyylit I, BKEM1241 Biomolekyylit II, BKEM1231 Aineenvaihdunta, BKEM3521 Mikrobiologian perusteet, 4 op 6 op 3 op 4 op 3 op 2 op 3 op 5 op 4 op 4 op 4 op
BIOLOGIAN OPETTAJAN LINJAN LuK-VAIHEEN AINEOPINNOT Biologian opettajan linjan tavoitteena on antaa opiskelijalle opettajan työssä tarvittava kokonaiskuva biologiasta, sekä johdattaa tieteelliseen tutkimukseen jollakin biologian osa-alueella. Kandidaatin ja maisterin tutkinnot muodostavat yhdessä kokonaisuuden, joka tuottaa pätevyyden peruskoulun, lukion ja muiden oppilaitosten opettajiksi. Vastuuopettaja: Kai Ruohomäki kairuo@utu.fi YHTEISET OPINNOT 45 op Ekologia 7 op EKOL2108 Populaatioekologia, 2 op EKOL2109 Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologia, 2 op EKOL2308 Akvaattisen ekologian kenttäkurssi, 3 op Eliöiden tuntemus 6 op EKOL2351 Selkärankaisten lajintuntemus, 2 op EKOL2352 Selkärangattomien tuntemus, 2 op EKOL2354 Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus, 2 op Kehitysbiologia ja eläinfysiologia (Kehitys, toiminta ja evoluutio) 9 op BIOL2010 Eläinten lisääntyminen ja kehitys, 3 op BIOL2020 Kasvien lisääntyminen ja kehitys, 2 op BIOL2030 Kehitysgenetiikka ja evoluutio, 2 op FYGE2160 Ihmisen fysiologia, 2 op Evoluutiobiologia (Kehitys, toiminta ja evoluutio) 7 op BIOL2071 Evolutionary and Quantitative Genetics, 3 op BIOL2080 Evolutiivisen ekologian perusteet, 4 op Solu- ja molekyylibiologia 14 op SOMO1001 Molekyylibiologian luennot, 4 op SOMO1011 Solubiologian luennot, 3 op SOMO1021 Genetiikan jatkoluennot, 3 op SOMO1031 Solu- ja molekyylibiologian harjoitustyöt aineenopettajille (1+3 op), 4 op Ympäristötiede (ks. Ympäristötiede) 2 op YMPS1006 Maailmanlaajuiset ympäristöongelmat (3 op) kurssista suoritetaan opettajalinjalle tarkoitettu 2 op osuus BIOLOGIAN OPETTAJAN LINJAN ERIKOISTUMISOPINNOT 22 30 op Ekologiaan erikoistuvat Kehitys toiminta evoluutio -kokonaisuudesta BIOL2090 Eliökunta, 2 op BIOL2100 Eliökunnan historia, 2 op Erikoistumisopintoja ekologian linjalta EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi, 2 op EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi 2 op EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi 2 op EKOL2005 Aineopintojen loppukuulustelu (opettajalinja) 4 op EKOL2006 Ekologian LuK-seminaari 2 op EKOL2700 LuK-tutkielma 6 op Muita ekologian aineopintoja, 0-8 op
Fysiologiaan ja genetiikkaan erikoistuvat Fysiologian ja genetiikan linjan aineopinnot FYGE1011 Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukuulustelu 1 FYGE1001 Fysiologian ja genetiikan LuK-seminaari FYGE1002 Fysiologian ja genetiikan LuK-tutkielma Muita fysiologian ja genetiikan aineopintoja, 5-16 op FYGE2001-FYGE2399 4 7 op 2 op 6 op Kenttäkurssit Yksi seuraavista kenttäkursseista on pakollinen ja muut suositellaan sisällyttämään valinnaisiin opintoihin: EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi, 2 op EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi, 2 op EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi, 2 op BIOLOGIAN OPETTAJAN LINJAN VALINNAISET OPINNOT, 0-8 op Suositellaan seuraavia opintojaksoja: BIOL4070 Opetustyöharjoittelu, 1 3 op Eliöiden tuntemus 4 op ks. Erikoistumisopinnot ekologian linjalla, esim. EKOL2353 Hyönteisten tuntemus, 2 op Kenttäkurssit 4 op (EKOL2301, 2302 ja 2303 ks. edellä) Biokemia BKEM1240 Biomolekyylit I, 5 op BKEM1241 Biomolekyylit II, 4 op Koe-eläinkurssi Huom. Selkärankaisten eläinten käyttö opetuksessa tai tutkimuksessa edellyttää koe-eläinlainsäädännön mukaan Koe-eläinkurssin PGS_1024 (6 op) suorittamista SIVUAINEET OPETTAJAN LINJALLA 60 op Biologian opettajan linjalla suoritetaan sivuaineena toisen opetettavan aineen opinnot, 60 op. Toinen opetettava aine on yleensä ollut maantiede (ks. maantieteen opetus), mutta myös kemia (ks. kemia), terveystieto tai muu peruskoulussa ja lukiossa opetettava aine tai luokanopettajan monialaiset opinnot, jos saa sivuaineoikeuden ko. opintoihin (selvitettävä HOPSia tehtäessä). Kandidaatin tutkintoon ei voi sisältyä syventäviä opintoja, mutta niitä voi kuitenkin jo suorittaa, ja sisällyttää myöhemmin maisteriopintoihin.
Opintojen ajoitus, LuK 1. vuosi/ 1. periodi: kaikille yhteinen opetus op Johdantopäivät, Laitoksen tiedotustilaisuus, HOPS-neuvonta, ATK:n perusteet, 1. osa Englannin kieli/tekstin ymmärtäminen (1.-2. periodi), 1. osa Ekologian perusteet Ekologian perusteiden harjoitukset Eliöiden rakenne Eliöiden tuntemuksen perusteet *Eläinfysiologian perusteet, 1. osa *Genetiikan perusteet, 1. osa *Kasvifysiologian ja molekyylibiologia perusteet, 1. osa 1. vuosi/ 2. periodi: Kaikille yhteinen opetus op Opintoneuvontapäivä ja linjavalinnat - Kemian kurssi biologeille 2 Englannin kieli/tekstin ymmärtäminen (1.-2. periodi), 2. osa 3 *Eläinfysiologian perusteet, 2. osa 3 *Genetiikan perusteet, 2. osa 3 *Kasvifysiologian ja molekyylibiologia perusteet, 2. osa 3 Eliöiden toiminnan ja perinnöllisyyden harjoitukset 3 - - 5 2 3 3 - - - 1. vuosi/ 3. periodi Ekologian linja op Fysiologian ja genetiikan linja ATK:n perusteet, 2.osa Eläinten lisääntyminen ja kehitys *Lajintuntemus: Selkärankaiset, Kotimaiset putkilokasvit Sivuaineopintoja Eliökunta Kasvien lisääntyminen ja kehitys *Tuntemus: Selkärangattomat Hyönteiset Sivuaineopintoja 4 3 2 2 5 2 2 2 4 ATK:n perusteet, 2.osa Eläinten lisääntyminen ja kehitys Genetiikan jatkoluennot Kemian harjoitukset Kemian kurssi Molekyylibiologian luennot, 1. osa 1. vuosi/ 4. periodi Eliökunta Kasvien lisääntyminen ja kehitys Molekyylibiologian luennot Molekyylibiologian harjoitustyöt Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja op 4 3 3 3 2-2 2 4 6 2 Biologian opettajan linja ATK:n perusteet, 2. Eläinten lisääntyminen ja kehitys Lajintuntemus: Kotimaiset putkilokasvit *Selkärankaiset Molekyylibiologian luennot, 1. osa Genetiikan jatkoluennot Muita opintoja: Ekologiaan erikoistuvat Muita opintoja: Fys.gen. erikoistuvat Eliökunta (erik. ekol.) Kasvien lisääntyminen ja kehitys Molekyylibiologian luennot Molekyylibiologian harjoitustyöt Tuntemus: Selkärangattomat Muita opintoja: Ekologiaan erikoistuvat Fys.gen. erikoistuvat op 4 3 2 2-3 0-2 2 2 2 4 3 2 0-2 3-4 Pakolliset kenttäkurssit (toukokuussa ja elokuussa) 1. kesä 4 Kenttäkurssit : Ekologiaan erikoistuvat Kenttäkurssit : Fys.gen erikoistuvat 9 5
LuK 2. vuosi/1. periodi Ekologian linja op Fysiologian ja genetiikan linja Eliöiden toimintaan vaikuttavat ympäristötekijät Eläinten ekofysiologia, 1. osa Kasvien ekofysiologia Eliökunnan historia Populaatioekologia Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 2 1 3 2 2 5 Eliöiden toimintaan vaikuttavat ympäristötekijät Eläinten ekofysiologia 1. osa Kasvien ekofysiologia Eliökunnan historia Solubiologian luennot Bioinformatiikka Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja op 2 1 3 2 3 2 2 Biologian opettajan linja Solubiologian luennot Ekol. erikoistuvat: Populaatioekologia 2. opetettava aine op 3 2 9 Eläinten ekofysiologia, 2. osa Evolutiivisen ekologian perusteet Ekologian laboratoriotyöt Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 1 4 3 7 2. vuosi/ 2. periodi Eläinten ekofysiologia, 2. osa Evolutiivisen ekologian perusteet Solubiologian harjoitukset Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 1 4 4 3 Solubiologian harjoitustyöt 2. opetettava aine 1 13 Evolutiivinen ekologia Yhteisö- ja ekosysteemiekologia Ruotsin kieli Biostatistiikka Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 4 2 - - 6 2. vuosi/ 3. periodi Ruotsin kieli Solu- ja solukkoviljelytekniikat Biostatistiikka Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja - 3-10 Ihmisen fysiologia Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologia Ruotsin kieli Biostatistiikka Maailmanlaajuiset ympäristöongelmat 2. opetettava aine 2 2 - - 2 7 Biostatistiikka Ruotsin kieli Kehitysgenetiikka ja evoluutio Molekyylibiologian luennot Koesuunnittelu Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 4 3 2 4 3 6 2. vuosi/ 4. periodi Ruotsin kieli Kehitysgenetiikka ja evoluutio Biostatistiikka Koesuunnittelu Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 3 2 4 3 7 Biostatistiikka Ruotsin kieli Kehitysgenetiikka ja evoluutio 2. opetettava aine 4 3 2 9 2. kesä Valinnaiset kenttäkurssit 0-4 2. opetettava aine (maant. kenttäkurssi) 3. vuosi Bioetiikka Viestintäopinnot Evolutionary and Quantitative Genetics Ekologian tilastolliset menetelmät Aineopintojen lopputentti LuK-seminaari LuK-tutkielma Linjan aineopintoja ja Sivuaineopintoja 2 4 3 8 6 2 6 29 Bioetiikka Viestintäopinnot Evolutionary and Quantitative Genetics LuK-seminaari LuK-tutkielma Lopputentit Linjan aineopintoja ja sivuaineopintoja 2 4 3 2 6 10 33 Viestintäopinnot Eliökunnan historia (erik. ekol.) Evolutionary and Quantitative Genetics Evolutiivisen ekologian perusteet LuK-seminaari LuK-tutkielma Lopputentti 2. opetettava aine Muita opintoja (eko) Muita opintoja (fyge) 3 4 2 3 4 2 6 4-7 19 4-8 7-11 * Tähdellä merkittyjen opintojaksojen kontaktiopetusta järjestetään myös periodin viimeisellä viikolla.
BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA, FM 120 op Sisältö Filosofian maisterin tutkinnossa on kolme linjaa: ekologian, fysiologian ja genetiikan sekä biologian opettajan linja. Edellytykset Linjojen pohjakoulutuksena on soveltuva luonnontieteiden kandidaatin tutkinto. Muissa tapauksissa, linjaa koulutusohjelman sisällä vaihdettaessa, on edeltä käsin sovittava linjan opintoneuvojien kanssa, että poikkeava pohjakoulutus sopii linjan peruskoulutukseksi ja tarvittaessa sisällytettävä lisäopinnot henkilökohtaiseen opintosuunnitelmaan. Filosofian maisterin (FM) tutkinnon rakenne Filosofian maisterin tutkinto 120 op Ekologian linja Fysiologian ja genetiikan linja Biologian opettajan linja Yhteiset opinnot 25 op 18-22 op 7 op Pro gradu 40 op 40 op 20 op Erikoistumiskurssit 20 op 20 op 25 op Loppukuulustelut 10 op 15-20 op 8 op Vapaasti valittavat opinnot 25 op 18-27 op 0 op Opettajan pedagogiset opinnot 0 op 0 op 60 op EKOLOGIAN LINJAN FM-VAIHEEN OPINNOT Ekologian linja antaa valmiudet alan tieteellisen tiedon ja tieteellisten menetelmien soveltamiseen, toimimaan työelämässä alansa asiantuntijana ja kehittäjänä sekä jatkokoulutukseen biologian, ympäristötieteen tai maatalous-metsätieteiden eri aloilla. Ekologian linjalla osa maisteriopinnoista on kaikille yhteisiä, osassa opintoja erikoistutaan suppeammalle erikoistumisalalle henkilökohtaisen opintosuunnitelman mukaisesti. Pro gradu-tutkielma tehdään erikoistumisalalta. Erikoistua voi jollekin ekologian opetuksen painopistealalle, joita ovat biodiversiteetti, yhteisö- ja ekosysteemiekologia sekä ympäristöekologia. Vaihtoehtoisesti opiskelija voi erikoistua evoluutiobiologiaan, jonka erikoistumisopetus järjestetään yhdessä fysiologian ja genetiikan linjan kanssa. Erikoistumisala voi olla myös pelkkä ekologia.
YHTEISET SYVENTÄVÄT OPINNOT 25 op Pakolliset opinnot Suoritettava 21 opintopistettä EKOL2406 Ekologian analyysiharjoitus 4 op EKOL2427 Tieteen filosofia ja kokeellisen tutkimuksen metodiikka 2 op EKOL3002 Ekologisen tutkimuksen kurssi 6 op EKOL3021 Ekologian käsitteiden kehityshistoria 3 op EKOL3004 Visitor seminar 2 op EKOL3016 Graduseminaari 2 op EKOL3007 Työharjoittelu 2 6 op Soveltavan ekologian valinnaiset kurssit Suoritetaan 4 op tarjonnan mukaisesti. Esimerkiksi: BIOL5000 Agroekologian ja -evoluution kurssi 3 5 op EKOL2601 Pikkunisäkkäiden ekologia 2 op EKOL2501 Riistabiologia 2 op ERIKOISTUMISOPINNOT (Ekologian linja) Valinnaisia erikoistumisopintoja henkilökohtaisen opintosuunnitelman mukaisesti. Ekologian opetuksen painopistealalle kuuluvat erikoistumiskurssit opetetaan pääsääntöisesti vuorovuosina. Säännöllisesti järjestettävien erikoistumiskurssien lisäksi erikoistumisopintoihin voi kuulua muita laitoksen ja muiden yliopistojen järjestämiä kursseja. Lisäksi opiskelija tekee erikoistumisalalta tutkielman. EKOL3012 Pro gradu -tutkielma, 40 op Erikoistumiskurssit 20 op valinnaisia kursseja valitulta erikoistumisalalta HOPSin ja kurssitarjonnan mukaan. Biodiversiteetti 20 op Biodiversiteettierikoistumisen voi suunnata biologisen monimuotoisuuden ja sen suojelun tutkimukseen, taksonomiaan ja systematiikkaan sekä laji-informatiikkaan, jota on hyvä täydentää fysiologian ja genetiikan linjan opetuksella molekyylitason informatiikasta (bioinformatiikka) ja maantieteen laitoksen geoinformatiikan kursseilla. Osastossa tehdään myös ympäristöalan kansainväliseen yhteistyöhön liittyvää tutkimusta. Näihin kysymyksiin erikoistuville suositellaan ympäristötieteen ja ympäristöoikeuden sivuaineopintoja. Biodiversiteettikysymyksiin erikoistuvien on syytä huomioida Environmental Sciences -maisteriohjelman opetustarjonta. Systematiikkaan ja fylogeneettiseen tutkimukseen suuntautuvien on suositeltavaa suorittaa geologian laitoksen tarjoama kurssi GEOL1113 (Maapallon geologinen ja biologinen kehitys) sen täydessä laajuudessa (osuus eliökunnan historiasta on kaikille biologeille pakollinen). Biodiversiteettiin erikoistumisen 20 opintopisteen vähimmäisvaatimuksesta biologian alan opintoja on oltava vähintään 14 op. Vastuuprofessori: Pekka Niemelä Pakollisena jompi kumpi seuraavista kursseista: EKOL3129 Eliökunnan monimuotoisuus: eläinkunta, 2 op EKOL3130 Eliökunnan monimuotoisuus: kasvikunta, 4 op
Erikoistumiseen soveltuvia muita kursseja ovat esimerkiksi: EKOL3132 Advanced issues in Biodiversity Research, 4 op EKOL3128 Taksonomian ja systematiikan opintopiiri, 3 op EKOL3134 Use of GIS and Remote Sensing in Studying Biodiversity, 2 op EKOL3133 Biologit asiantuntijatehtävissä, 2 op EKOL3135 Biodiversity Informatics, 2 op YMPS6043 Conservation Biology, 2 4 op GEOL1113 Maapallon geologinen ja biologinen kehitys, enintään 4 op EKOL3153 Boreaalisen vyöhykkeen monimuotoisuus ja sen ylläpito, 6 op EKOL2358 Spiders and their identification, 2 op EKOL3154 Sienituntemuksen jatkokurssi, 4 op Yhteisö- ja ekosysteemiekologia 20 op Tavoitteet Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologiaan erikoistuminen antaa valmiudet ymmärtää ja analysoida populaatiodynaamisia prosesseja ja niiden yhteisöekologisia seurauksia erityyppisissä ekosysteemeissä sekä perus- että soveltavan tutkimuksen näkökulmasta. Erikoistumista voi painottaa eri tavoin suunnitellun uran mukaisesti, esimerkiksi maa- tai vesiekosysteemitutkimukseen, kasvi- tai eläinyhteisöjen tutkimukseen, tai yksilötason vuorovaikutuksista ekosysteemien energia- ja ainevirtoihin. Yhteisö- ja ekosysteemiekologiaan erikoistumiseen soveltuvia kursseja tarjotaan erityisesti kolmannella periodilla. Lisätiedot Vastuuprofessori: Lauri Oksanen Parillisina alkavina lukuvuosina järjestettäviä kursseja: EKOL2311 Geographical plant ecology I: Vegetation processes in arctic, alpine and arid environments 4 op EKOL2315 Geographical plant ecology II [Vegetation processes in forested biomes] 4 op EKOL2316 Tunturiekologia (kenttäkurssi, 4. periodin jälkeen) 4 op EKOL3140 Kasvien populaatioekologia 6 op Parittomina alkavina lukuvuosina järjestettäviä kursseja: EKOL2313 Populaatio- ja yhteisödynamiikka, 6 op EKOL2312 Peto-saalis -vuorovaikutukset, 4 op Muita erikoistumiseen soveltuvia kursseja ovat esimerkiksi: EKOL2503 Vesiekologia 4 op EKOL3113 Tropical limnology 2 15 op EKOL2424 Kvantitatiivinen ekologia 3 op EKOL3155 Akvaattinen herbivoria 4 op EKOL3125 Census and Survival Analysis of Vertebrate Populations 5 op Ympäristöekologia 20 op Ympäristöekologiassa koulutetaan ekologeja, joilla on tiedolliset ja menetelmälliset valmiudet tutkia ja ymmärtää ihmistoiminnan vaikutuksia ekologisiin vuorovaikutuksiin ja ratkoa ihmistoiminnan seurauksena syntyviä ekologisia ongelmia. Ympäristöekologian menetelmäopintoihin kuuluvat esimerkiksi paikkatiedon ja pitkäkestoisten seuranta-aineistojen analysointimenetelmät. Ympäristöekologiaan erikoistujalle suositellaan ympäristötieteen sivuaineopintoja. Pohjatietoina edellytetään seuraavien kurssien tiedot: YMPS1006 Maailmanlaajuiset ympäristöongelmat ja YMPS1014 Ympäristöekologia.
Vastuuprofessori: Kai Norrdahl Seuraavista ympäristöekologian kursseista vähintään 6 op: Parillisina alkavina lukuvuosina järjestettäviä kursseja: YMPS6043 Conservation Biology 2 4 op EKOL3141 Advanced Conservation Ecology 6 op Parittomina alkavina lukuvuosina järjestettäviä kursseja: EKOL3142 Ympäristömuutosten ekologiset vaikutukset, 6 op Ympäristöekologian menetelmäopintoja, vähintään 3 op Esimerkiksi: EKOL3134 Use of GIS and Remote Sensing in Studying Biodiversity 2 op EKOL2425 Populaatiokoon määritys- ja kannanseurantamenetelmät 3 op EKOL2426 Elossasäilyvyysanalyysi 3 op Muita erikoistumiseen soveltuvia kursseja ovat esimerkiksi: Soveltavan ekologian kurssit EKOL2313 Populaatio- ja yhteisödynamiikka 6 op YMPS1004 Ympäristönsuojelun lainsäädäntö ja hallinto 3 op ESCE0008 Principles of Ecotoxicology 2 op Evoluutiobiologia 20 op Evoluutiobiologiaan erikoistuminen voi painottua HOPS:ssa määriteltävällä tavalla yksilö- ja populaatiotasolta lajiutumiseen ja lajiryhmien fylogeniaan, tai yhdistellä näitä tarkoituksenmukaisesti. Ekologian linjan opiskelijan tulee ottaa fysiologian ja genetiikan sivuaine. Evoluutiobiologiaan erikoistuminen edellyttää sekä ekologian (vähint. 6 op) että genetiikan (väh. 6 op) maisteritason evoluutio-opintoja. Evoluutiobiologian lukupiiri on pakollinen opintojakso. Katso myös erikoistumisalan opintojen kuvausta fysiologian ja genetiikan linjan FM-opetuksen kohdalta. Vastuuprofessori: Jouko Sarvala FYGE5301 Evoluutiobiologian lukupiiri 3 op -Ekologian syventäviä evoluutio-opintoja vähintään 6 op Esimerkiksi: EKOL2203 Käyttäytymisekologia, 6 op EKOL3128 Taksonomian ja systematiikan opintopiiri, 3 op EKOL2214 Evoluutio ja ihmisen käyttäytyminen, 4 op -Genetiikan syventäviä evoluutio-opintoja 6 op Suoritettava vähintään 6 op Loppukuulustelut 10 op Loppukuulustelut tentitään kahdessa osassa. Loppukuulustelukirjat sovitaan professorin kanssa. Esimerkkejä sopivista tenttikirjoista löytyy kurssikuvauksesta. EKOL3017 Syventävien opintojen loppukuulustelu 1 4 6 op EKOL3018 Syventävien opintojen loppukuulustelu 2 4 6 op
VAPAASTI VALITTAVAT OPINNOT 25 op esim. EKOL3152 Ekologisten tilastomenetelmien keskustelupiiri, 2 op EKOL3156 Kasvimakrofossiilikurssi, 2 op EKOL2508 Puutarhakasvit, 2 op PGS_1024 Koe-eläinkurssi, 6 op EKOL3028 Ekologian opetusharjoittelu, 3 10 op Vapaasti valittavien opintojen tulisi tukea opiskelijan erikoistumista. Huomautus: Kaikkien, jotka aikovat myöhemmin käyttää selkärankaisia tutkimuksissa, on koeeläintoiminnasta annetun lain 10 mukaan suoritettava koe-eläinkurssi. FYSIOLOGIAN JA GENETIIKAN LINJAN FM-VAIHEEN OPINNOT Fysiologian ja genetiikan linja antaa valmiudet alan tieteellisen tiedon ja tieteellisten menetelmien soveltamiseen, toimimiseen työelämässä alansa asiantuntijana ja kehittäjänä sekä jatkokoulutukseen biologian, biolääketieteen tai maatalous-metsätieteiden eri aloilla. Fysiologian ja genetiikan linjalla osa maisteriopinnoista on kaikille yhteisiä, osassa opintoja erikoistutaan alalle, josta pro gradu -tutkielma tehdään. Erikoistumisaloja ovat ekofysiologia, eläinfysiologia, evoluutiobiologia (yhdessä ekologian linjan kanssa), genetiikka, kasvifysiologia ja solu- ja molekyylibiologia. Henkilökohtainen opintosuunnitelma on perusta erikoistumisopinnoille. Koska sivuaineet on järkevää valita tukemaan erikoistumisopintoja, kannattaa erikoistumista suunnitella jo LuK-opinnoissa. Pro gradu -tutkielma tehdään erikoistumisalalta. YHTEISET SYVENTÄVÄT OPINNOT 18 22 op FYGE4001 Solu- ja molekyylibiologian menetelmäopinnot, FYGE4201 Työharjoittelu, FYGE4101 Tutkijakurssi, FYGE4301 Syventävien opintojen seminaari, 8 op 2 6 op 4 op 4 op Erikoistumisopinnot (Fysiologian ja genetiikan linja) Erikostumisopinnot koostuvat laitoksella järjestettävistä erikoiskursseista, loppukuulusteluista ja pro gradu -tutkielmasta. Loppukuulustelujen toinen osuus sisältää alan vastuuprofessorin kanssa sovittua erikoistumisalan kirjallisuutta. Pro gradu -tutkielma tehdään erikoistumisalalta ja aihe sovitaan alan vastuuprofessorin kanssa. Laitoksella järjestettävien oman koulutusohjelman erikoiskurssien lisäksi erikoistumiseen voidaan hyväksyä myös muiden laitosten tai muiden yliopistojen tarjoamia kursseja. Lisäksi erikoistumiseen voidaan sisällyttää myös LuK-vaiheen aineopintoja, jos niitä ei ole sisällytetty LuK-tutkintoon. Järjestettävistä erikoiskursseista informoidaan kunkin lukukauden alussa ja samalla kerrotaan, mitkä niistä soveltuvat kunkin erikoistumisalan opintoihin. Opintojakso 'FYGE4211 Tutkimusprojekti' soveltuu kaikkien erikoistumisalojen opintoihin. Tutkimusprojektin aihe ja laajuus sovitaan erikoistumisalan vastuuprofessorin kanssa. Alla olevassa listassa olevat kurssit ovat esimerkkejä aikaisemmin järjestetystä kurssitarjonnasta tai suunnitteilla olevista kursseista. FYGE4501 Pro gradu -tutkielma, 40 op Erikoistumiskurssit 20 op valinnaisia kursseja valitulta erikoistumisalalta HOPSin ja kurssitarjonnan mukaan. Vapaasti valittavien joukossa mainittu opintojakso FYGE4211 Tutkimusprojekti soveltuu myös kaikkien erikoistumisalojen opintoihin.
Ekofysiologia 20 op Ekofysiologian erikoistumisalalla perehdytään ympäristötekijöiden ja niiden muutosten vaikutukseen kasvien ja eläinten elintoimintoihin. Kurssitarjonnassa voidaan käyttää hyväksi biologian koulutusohjelmaan kuuluvien kurssien lisäksi ympäristötieteen maisteriohjelman (ESCE) kursseja. Vastuuprofessori: Mikko Nikinmaa Erikoistumiseen soveltuvia kursseja ovat esimerkiksi: ESCE0008 Principles of Ecotoxicology, FYGE5101 Vertaileva eläinfysiologia, FYGE5120 Fish physiology, FYGE5130 Ympäristötekijät transkription säätelijöinä, FYGE5500-99 Kasvifysiologian kursseja (vaihtelevat vuosittain) 2 op 2 op 3 op 6 op 10 op Eläinfysiologia 20 op Eläinfysiologian erikoistumisalalla perehdytään eläinten elintoimintojen tutkimiseen yksilö-, kudosja solutasolla. Eläinfysiologiaan erikoistuville suositellaan oman linjan kurssien lisäksi esimerkiksi farmakologian, ravitsemustieteen tai immunologian kurssien sisällyttämistä opintoihin. LuK-vaiheen opinnoissa tulisi olla suoritettuna ainakin kaksi kurssia seuraavista valinnaisista aineopinnoista: FYGE2031 Selkärankaisten anatomia ja histologia, FYGE2101 Eläinfysiologian harjoitustyöt tai FYGE2111 Neurobiologia. Tarvittaessa nämä voi sisällyttää maisteriopintoihin, jos eivät kuulu LuKtutkintoon. PGS_1024 Koe-eläinkurssi on pakollinen eläinfysiologian erikoistumisalalla. Jos sitä ei ole suoritettuna LuK-tutkinnossa, on se sisällytettävä maisteriopintoihin. Vastuuprofessori: Mikko Nikinmaa Erikoistumiseen soveltuvia biologian laitoksen kursseja ovat esimerkiksi: FYGE5201 Hormonaalinen säätely, FYGE5211 Hormonaalisen säätelyn ja solunsisäisen viestinnän mittausmenetelmät FYGE5120 Fish physiology FYGE5101 Vertaileva eläinfysiologia 4 op 4 op 3 op 2 op Evoluutiobiologia (fysiologia ja genetiikka) 20 op Erikoistuminen evolutiiviseen biologiaan on mahdollista sekä ekologian että fysiologian ja genetiikan tutkijalinjoilla, mutta erilaiset tutkintovaatimukset (katso myös ekologia) on sovitettu kummankin linjan tarpeisiin sopiviksi. Erikoistuminen on helpointa aloittaa sisällyttämällä tutkintoon esimerkiksi sivuaineena vähintään pakolliset ekologian kurssit (alla luetellut 9 op), ja suorittamalla jo Lukopinnoissa kurssit Genetics of Natural Populations ja Evoluutiogenetiikan harjoitukset. Vaihtoehtoisesti nämä kurssit voi valita myös maisteriohjelman vapaasti valittaviksi kursseiksi. Evoluutiobiologian maisteriopinnot alkavat Evoluutiobiologian lukupiirillä ja Seminar skills -kurssilla. Opiskelija valitsee lisäksi kaksi seuraavista kursseista: Ecological Genomics, Evolutionary Applications, Conservation Genetics ja Molecular Systematics. Erikoistumisopintoihin on sisällytettävä vähintään 6 op ekologian syventäviä kursseja. Vastuuprofessori: Craig Primmer Tutkintoon (LuK, FM tai sivuaine) sisällytettävät aineopintojen kurssit FYGE2211 Genetics of natural populations, 4 op FYGE2221 Evoluutiogenetiikan harjoitukset, 4 op EKOL2108 Populaatioekologia, 2 op EKOL2213 Evolutiivinen ekologia, 4 op
EKOL2412 tai lajintuntemus (EKOL2351-4) tai kenttäkurssi (EKOL2301-8) 3 4 op EKOL2412 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi, 3 op Syventävät erikoistumiskurssit: Suoritettava kurssit FYGE5400 ja 5301 sekä kaksi seuraavista: FYGE5301, 5310, 5320, 5330, 5350. FYGE5400 Academic writing and seminar skills in Genetics, 4 op FYGE5301 Evoluutiobiologian lukupiiri, 3 op FYGE5310 Ecological genomics, 3 op FYGE5320 Evolutionary applications, 4 6 op FYGE5330 Conservation Genetics, 3 op FYGE5350 Molecular systematics, 3 6 op Erikoistumiseen soveltuvat myös esim.: (BIOL5000, FYGE5101, FYGE5600-99) BIOL5000 Agroekologian ja -evoluution kurssi, 3 5 op FYGE5101 Vertaileva eläinfysiologia, 2 op FYGE5601 Systeemibiologian erikoiskurssit, 2 10 op Genetiikka 20 op Genetiikan erikoistumisala antaa laajan teoreettisen ja käytännöllisen valmiuden geneettisten menetelmien ja tutkimusstrategioiden käyttöön ja soveltamiseen genetiikan eri osa-alueilla sekä biologisessa tutkimuksessa yleisesti. Genetiikkaan erikoistuville sopivia lähialojen kursseja tarjoavat muun muassa mikrobiologia, biokemia, biotekniikka, bioinformatiikka, terveyden biotieteet sekä kemia ja fysiikka. Vastuuprofessori: Harri Savilahti ja Craig Primmer Erikoistumiseen soveltuvia biologian laitoksen kursseja ovat esimerkiksi: FYGE5400 Academic writing and seminar skills in Genetics, FYGE5410 Recombination Mechanisms, FYGE5420 Immunologiset menetelmät genetiikassa, FYGE5310 Ecological genomics, FYGE5330 Conservation Genetics, FYGE5350 Molecular systematics, 4 op 3 op 6 op 3 op 3 op 3 6 op Systeemibiologian kurssit (FYGE5600-99, vaihtelevat vuosittain) 12 op FYGE5130 Ympäristötekijät transkription säätelijöinä, 6 op FYGE3207 Cancer Functional Genetics: From Mechanisms to Drug Discovery 4 op Kasvifysiologia 20 op Erikoistumisala syventää opiskelijan tietoja kasvin rakenteesta ja elintoiminnoista molekyyli-, soluja yksilötasoilla kasvin eri kehitysvaiheissa. Lisäksi pyrkimyksenä on antaa hyvä ymmärtämys kasvien ympäristöön sopeutumisen mekanismeista, kasvi-mikrobi-vuorovaikutusmekanismeista, bioenergiasta ja muista kasvifysiologian sovelluskohteista. Opinnoissa voi myös erikoistua muiden autotrofisten eliöiden, kuten syanobakteerien biologiaan ja esimerkiksi fotosynteesiin perustuvaan energiantuotantoon. LuK- vaiheen opinnoissa tulisi olla suoritettuna vähintään 10 op:n verran seuraavassa listassa lueteltuja aineopintojen opintojaksoja: FYGE2001-2002 Kasvianatomia ja kehitysmorfologia; FYGE2301-2302 Kasvibiokemia; FYGE2311-2312 Kasvit ja ympäristö; FYGE2321-2322 Kasvigenetiikka ja biotekniikka. Tarvittaessa näitä opintoja voi sisällyttää maisteriopintoihin, jos ne eivät kuulu LuK-tutkintoon. Vastuuprofessori: Eevi Rintamäki ja Eva-Mari Aro
Erikoistumiseen soveltuvia biologian laitoksen kursseja ovat esimerkiksi: FYGE5500-99 Kasvifysiologian kursseja (vaihtelevat vuosittain) Systeemibiologian kurssit (FYGE5600-99, vaihtelevat vuosittain) FYGE5701 Plant biology seminar, FYGE5420 Immunologiset menetelmät genetiikassa, FYGE5710 Kasvibiologian kirjallisuutta, FYGE5515 Towards sustainable bioenergy/biofuel production, FYGE5516 Kasvien ja syanobakteerien ympäristöstressit, 10 op 12 op 4 op 6 op 2 4 op 4 op 2 5 op Solu- ja molekyylibiologia 20 op Erikoistumisala antaa opiskelijoille laajat tiedot bakteeri-, kasvi- ja eläinsolujen toiminnasta. Lisäksi tavoitteena on antaa monipuolinen valmius käyttää ja edelleen kehittää moderneja solu- ja molekyylibiologian menetelmiä. Vastuuprofessori: Eevi Rintamäki ja Eva-Mari Aro Erikoistumiseen soveltuvia kursseja ovat esimerkiksi: Systeemibiologian kurssit (FYGE5600-99, vaihtelevat vuosittain) 12 op FYGE5500-99 Kasvifysiologian kursseja (vaihtelevat vuosittain) 10 op FYGE5130 Ympäristötekijät transkription säätelijöinä 6 op FYGE5410 Recombination Mechanisms 3 op FYGE5420 Immunologiset menetelmät genetiikassa 6 op FYGE5701 Plant biology seminar 4 op FYGE3207 Cancer Functional Genetics: From Mechanisms to Drug Discovery 4 op Cell signaling (ÅA_283007.0) 8 op FYGE5515 Towards sustainable bioenergy/biofuel production, 4 op FYGE5516 Kasvien ja syanobakteerien ympäristöstressit, 2 5 op Loppukuulustelut 15 20 op Loppukuulustelut tentitään kahdessa osassa. Loppukuulustelukirjat sovitaan professorin kanssa. FYGE4401 Loppukuulustelu 1, 5 10 op FYGE4402 Loppukuulustelu 2, 5 10 op Vapaasti valittavat opinnot (FYGE) 18 27 op Esimerkiksi: FYGE4202 Fysiologian ja genetiikan linjan opetusharjoittelu, 3 10 op FYGE4211 Tutkimusprojekti, 4 20 op BIOL5000 Agroekologian ja -evoluution kurssi, 3 5 op