Koulutusohjelmassa on valittavana kolme luonnontieteiden kandidaatin tutkintoon johtavaa linjaa.

Transkriptio

1 1 BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA Lukuvuonna vain ensimmäisen vuoden opetus toteutetaan uuden kaksiportaisen tutkintojärjestelmän mukaisesti. Muu opetus perustuu lukuvuoden opintooppaassa olevaan opetussuunnitelmaan. Luonnontieteiden kandidaatin tutkinto 180 op Koulutusohjelmassa on valittavana kolme luonnontieteiden kandidaatin tutkintoon johtavaa linjaa. Ekologian linja Opiskelijat perehtyvät erityisesti eliöiden ja niiden ympäristön välisiin suhteisiin yksilö-, populaatio-, yhteisö- ja ekosysteemitasoilla. Evolutiivinen näkökulma ja menetelmien hallinta ovat tieteenalan opetuksessa ja tutkimuksessa keskeisessä asemassa. Ekologian linja tarjoaa tiedolliset ja taidolliset valmiudet työtehtäviin sekä ylemmän korkeakoulututkinnon opintoihin ekologian, biodiversiteettitutkimuksen ja ympäristötieteen alalla. Fysiologian ja genetiikan linja Linja antaa opiskelijoille perustiedot eliöiden rakenteesta ja elintoiminnoista sekä periytymisestä molekyyli-, solu- ja yksilötasolla eliöiden eri kehitysvaiheissa. Tavoitteena on myös perehdyttää opiskelijat ymmärtämään eliöiden rakenteeseen, elintoimintoihin ja kehitykseen sekä ympäristöön sopeutumiseen liittyviä säätelymekanismeja. Linja tarjoaa valmiudet työtehtäviin ja ylemmän korkeakoulututkinnon opintoihin eläinfysiologian, genetiikan, kasvifysiologian, solu- ja molekyylibiologian sekä ympäristötieteen alalla. Biologian opettajan linja Biologian opettajan linjan tavoitteena on antaa opiskelijalle opettajan työssä tarvittava kokonaiskuva biologiasta, sekä johdattaa tieteelliseen tutkimukseen jollakin biologian osa-alueella. Kandidaatin ja maisterin tutkinnot muodostavat yhdessä kokonaisuuden, joka tuottaa pätevyyden peruskoulun, lukion ja muiden oppilaitosten opettajiksi, sekä antaa myös jatko-opintokelpoisuuden. Linja antaa hyvän perustan myös muihin laaja-alaista biologista näkemystä vaativiin tehtäviin esim. valtionhallinnossa, kustannus- ja tiedotusaloilla sekä kansalaisjärjestöissä.

2 2 Luonnontieteiden kandidaatin tutkinto 180 op Ekologian linja Fysiologian ja genetiikan linja Biologian opettajan linja Biologian perusteet 25 Biologian perusteet 25 Biologian perusteet 25 Kehitys, toiminta ja evoluutio 25 Kehitys, toiminta ja evoluutio 25 Yhteiset biologian aineopinnot opettajille Muut yhteiset opinnot 15 Muut yhteiset opinnot 20 Muut yhteiset opinnot 10 Kieli- ja viestintäopinnot 10 Kieli- ja viestintäopinnot 10 Kieli- ja viestintäopinnot 10 Erikoistumisopinnot Erikoistumisopinnot Erikoistuminen ekologiaan/ fysiologiaan ja genetiikkaan Sivuaineet Sivuaineet: Solu- ja molekyylibiologia Muut 46 20/9 Sivuaineet: Toinen opetettava aine Vapaasti valittavat 0-10 Vapaasti valittavat 0-10 Vapaasti valittavat (ekologia/ fysiologia ja genetiikka) 9/16 Linjojen yhteiset opinnot Kaikilla kolmella linjalla suoritetaan ensimmäisen syksyn aikana biologian perusteet. Samanaikaisesti aloitetaan myös muita yhteisiä opintoja sekä kieliopintoja.. BIOLOGIAN PERUSOPINNOT (25 op, 15 ov) Ekologia 7 op 4,5 ov BIOL1001 Ekologian perusteet 5 op 3.5 ov BIOL1011 Ekologian perusteiden harjoitukset 2 op 1 ov Eliöiden rakenne ja tuntemus 6 op 3,5 ov BIOL1101 Eliöiden rakenne 3 op 1.5 ov BIOL1111 Eliöiden tuntemuksen perusteet 3 op 2 ov Eliöiden toiminta ja perinnöllisyys 12 op 7 ov BIOL1201 Eläinfysiologian perusteet 3 op 2 ov BIOL1301 Genetiikan perusteet 3 op 2 ov BIOL1401 Kasvifysiologian ja molekyylibiologian 3 op 1,5 ov perusteet BIOL1501 Eliöiden toiminnan ja perinnöllisyyden harjoitukset 3 op 1,5 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö BIOL1001 Ekologian perusteet (5 op, 3,5 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija ekologian ja evolutiikan keskeisimpiin käsitteisiin ja peruskysymyksiin.

3 3 Sisältö: Eliöiden keskinäisten suhteiden ja muiden ympäristötekijöiden vaikutus yksilötasolta ekosysteemitasolle, luonnonvalinta ja muut evoluutiomekanismit, mikro- ja makroevoluutio. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu. Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, johon sisältyy oppikirjasta Campbell & Reece 2004: Biology (7th Edition) luennolla ilmoitettavat osat. Ajankohta: 1. vuosi/ 1. periodi Vastuuopettaja: Kai Norrdahl, ekologia BIOL1011 Ekologian perusteiden harjoitukset (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija valittuihin ekologisiin tutkimusmenetelmiin ja Turun yliopiston tarjoamiin tutkimusympäristöihin. Sisältö: Ohjatut ekologiset harjoitukset, vierailu Turun yliopiston eläin- ja kasvimuseoissa ja retkeily Ruissalossa. Toteutustavat: Harjoitukset, vierailut ja retkeily. Suoritustavat: Osallistuminen harjoituksiin, vierailuihin ja retkeilyyn. Harjoitusten tuloksista ryhmätyönä tehty ja esitetty raportti. Ajankohta: 1. vuosi/ 1. periodi Arvostelu: Hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Ekologian assistentit BIOL1101 Eliöiden rakenne (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Perehtyä kasvien solukkojen ja eläinten kudosten mikroskooppisiin ja makroskooppisiin perusrakenteisiin ja oppia niitä kuvaava termistö. Sisältö: Mikroskooppipreparaateista, eliöiden osista ja kokonaisista eliöistä tapahtuva erilaisten solukkojen/kudosten sekä silmänvaraisesti erottuvien rakenteiden tunnistaminen. Toteutustavat: Ohjatut harjoitustyöt. Suoritustavat: Osallistuminen harjoituksiin ja kirjallinen kuulustelu. Ajankohta: 1. vuosi/ 1. periodi. Vastuuopettaja: Eira Kanervo, kasvifysiologia ja molekyylibiologia BIOL1111 Eliöiden tuntemuksen perusteet (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Oppia tunnistamaan runsaat 400 taksonia eliökunnan eri ryhmistä sekä tutustua erilaisten tunnistusapuneuvojen käyttöön. Sisältö: Tunnistettavien taksonien luettelo ja harjoituskokoelmat. Toteutustavat: Demonstraatiot ja omaehtoinen eliöiden tuntemuksen harjoittelu. Suoritustavat: Tuntemustentti. Ajankohta: 1. vuosi/ 1. periodi Vastuuopettaja: Kai Ruohomäki, ekologia BIOL1201 Eläinfysiologian perusteet (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija eläinten rakenteen ja toiminnan perusperiaatteisiin ja alalla käytettävään terminologiaan Sisältö: Luennolla käydään läpi eläinten rakenteen ja toiminnan pääpiirteet: ravitsemus, hengitys ja verenkierto, immunologia, vesi- ja ionitasapainon sekä lämmönsäätely, hormonitoiminta, lisääntyminen, aistit sekä hermo- ja lihastoiminta Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu. Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, johon sisältyy oppikirjasta Campbell & Reece 2004: Biology (7th Edition) luennolla ilmoitettavat osat. Ajankohta: 1. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Mikko Nikinmaa, eläinfysiologia

4 4 BIOL1301 Genetiikan perusteet (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija genetiikkaan tutkimusalueena sekä tieteenalalla käytettyyn terminologiaan. Sisältö: Luennolla käydään läpi solusyklit, mitoosi ja meioosi, ominaisuuksien periytyminen, DNA:n rakenne, geenien rakenne prokaryooteilla ja eukaryooteilla, transkriptio, translaatio, DNAteknologia ja genomiikka sekä geenien hierarkinen toiminta yksilönkehityksessä Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu. Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, johon sisältyy oppikirjasta Campbell & Reece 2004: Biology (7th Edition) luennolla ilmoitettavat osat. Ajankohta: 1. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Seppo Nokkala, genetiikka BIOL1401 Kasvifysiologian ja molekyylibiologian perusteet (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija riittävän monipuolisesti kasvien rakenteen ja toiminnan peruskysymyksiin ja tieteenalalla käytettyyn terminologiaan. Sisältö: Luennolla selvitetään keskeiset kasvisolun ja -solukon rakenteet ja perehdytään kasvien vesi- ja ravinnetalouteen, kasvien kasvua ja kehitystä sääteleviin tekijöihin sekä eliöiden solutason energia-aineenvaihduntaan (fotosynteesi ja soluhengitys). Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu. Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, johon sisältyy oppikirjasta Campbell & Reece 2004: Biology (7th Edition) luennolla ilmoitettavat osat. Ajankohta: 1. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Eevi Rintamäki, kasvifysiologia ja molekyylibiologia BIOL1501 Eliöiden toiminnan ja perinnöllisyyden harjoitukset (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on antaa opiskelijalle perusvalmiudet kokeellisesta biologiasta ja laboratoriotyöskentelystä sekä tutustua malliorganismien ominaisuuksiin, käsittelyyn ja käyttöön tutkimuksessa. Sisältö: Harjoituksissa tutustutaan DNA:n eristykseen, mitoosiin ja meioosiin, ominaisuuksien periytymiseen, geenien kartoittamiseen, kalvojen toimintaan ja energiatalouteen. Laskuharjoituksissa syvennetään tietoa erilaisista periytymistavoista ja niiden matemaattisesta tarkastelusta. Toteutustavat: Harjoitustyöt, joista pidetään työpäiväkirjaa. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja tarkastettavan työpäiväkirjan pitäminen. Ajankohta: 1. vuosi/ 2. periodi. Arvostelu: Hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Kasvifysiologian yliassistentti KEHITYS, TOIMINTA JA EVOLUUTIO (25 op, 12,5 ov) Opintokokonaisuus on pakollinen ekologian sekä fysiologian ja genetiikan linjalla. Osia tästä kuuluu myös opettajalinjalla vaadittaviin suorituksiin (ks. opettajalinjan erikoistumisopinnot). Kehitysbiologia 7 op 3,5 ov BIOL2010 Eläinten lisääntyminen ja kehitys 3 op 1,5 ov BIOL2020 Kasvien lisääntyminen ja kehitys 2 op 1 ov BIOL2030 Kehitysgenetiikka ja evoluutio 2 op 1 ov Ekofysiologia 7 op 3,5 ov BIOL2040 Eliöiden toimintaan vaikuttavat 2 op 1 ov ympäristötekijät

5 5 BIOL2050 Eläinten ekofysiologia 2 op 1 ov BIOL2060 Kasvien ekofysiologia 3 op 1,5 ov Evoluutiobiologia 7 op 3,5 ov BIOL2070 Evolutionary Genetics 3 op 1,5 ov BIOL2080 Evolutiivisen ekologian perusteet 4 ov 2 ov Eliökunta ja sen historia 4 op 2 ov BIOL2090 Eliökunta 2 op 1 ov BIOL2100 Eliökunnan historia 2 op 1 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö BIOL2010 Eläinten lisääntyminen ja kehitys (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija eläinten lisääntymisen ja kehityksen perusteisiin Sisältö: Eläinten kehitysbiologia evoluutiobiologian näkökulmasta (genomiikka, proteomiikka); kehitysbiologiset malliorganismit; geenit ja erilaistumisen säätely; solujen, kudosten ja elinten erilaistumisen säätely ja signaalivälitys; kantasolututkimus; hedelmöitys ja siihen liittyvä solusignalointi; sukusolujen erilaistumisen säätely Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Luentokuulustelu; luennoilla jaettavan materiaalin tukena ovat kirjat: Sariola, H et al, Solusta yksilöksi. (Duodecim, 2003) ja Gilbert, SF: Developmental biology, 7. painos (Sinauer) Ajankohta: 1. vuosi/ 3. periodi Vastuuopettaja: Jorma Paranko, Biolääketieteen laitos, anatomia BIOL2020 Kasvien lisääntyminen ja kehitys (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija kasvien kehityksen perusteisiin. Sisältö: Luennolla kuvataan kasvien yksilönkehityksen vaiheet ja niitä säätelevien kehitysmekanismien pääpiirteet sisältäen kasvihormonit ja niiden aistimisen. Lisäksi perehdytään miten ympäristötekijät, erityisesti valo, säätelevät kasvien kehitystä. Kurssin näkökulma ulottuu kasvikunnan diversiteetin tasolta molekyylitasolle. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Luennot kuulusteluineen. Luennoilla jaettava materiaali. Ajankohta: 1. vuosi/ 4.periodi Vastuuopettaja: Esa Tyystjärvi, kasvifysiologia ja molekyylibiologia BIOL2030 Kehitysgenetiikka ja evoluutio (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat evolutiivisen kehitysbiologian perusteisiin, mukaanlukien kehitysgenetiikan pääpiirteet Sisältö: Luennolla käydään läpi yksilönkehityksen geneettisen säätelyn pääpiirteet eri eliöryhmissä, sitä ohjaavien geenien hierarkia, elinten kehityksen ja muodon geneettinen säätely ja kehitystä ohjaavien geenijärjestelmien evoluutio. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Oheismateriaalina käytetään teoksia Carroll, Greiner & Weathouse, From DNA to Diversity, 2. painos ja Wolpert. Principles of Development, 2. painos Ajankohta: 1. vuosi/ 4. periodi Vastuuopettaja: Seppo Nokkala, genetiikka BIOL2040 Eliöiden toimintaan vaikuttavat ympäristötekijät (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija niihin ympäristömuutoksiin, jotka voivat vaikuttaa eliöiden toimintoihin

6 6 Sisältö: Luennolla käydään läpi abioottisten ja bioottisten ympäristömuutoksien merkitys eliöiden elintoimintoihin vaikuttavina tekijöinä Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytty luentokuulustelu Ajankohta: 2. vuosi/ 1. periodi Vastuuopettaja: Mikko Nikinmaa BIOL2050 Eläinten ekofysiologia (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Jaksolla tarkastellaan, miten eläinten elintoiminnot reagoivat ympäristön tilaan ja siinä tapahtuviin muutoksiin Sisältö: Luennolla käydään läpi, miten ympäristö vaikuttaa eläinten energiantuotantoon ja kulutukseen, hengitykseen, ravitsemukseen, vesi- ja ionitasapainoon, happo-emästasapainoon, lisääntymiseen ja hormonaaliseen säätelyyn yms. Lisäksi selvitetään, miten ympäristömuutoksia voidaan aistia ja epäedullisia ympäristöjä välttää. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, joka perustuu luentomonisteeseen. Lisä/taustalukemisena voi käyttää Willmer ym., Environmental Physiology of Animals, 2. painos. Ajankohta: 2. vuosi/ 1. ja 2. periodi Vastuuopettaja: Mikko Nikinmaa, eläinfysiologia BIOL2060 Kasvien ekofysiologia (3 op, 1,5 ov) Tavoitteet: Opintokokonaisuuden tavoitteena on selvittää eri ympäristötekijöiden vaikutusta kasvien elintoimintoihin. Lisäksi perehdytään kasvien rakenteelliseen ja toiminnalliseen sopeutumiseen eri ympäristöoloissa. Sisältö: Kasvien ekofysiologiassa perehdytään kasvien vesi- ja ravinnetalouteen sekä valon, kaasujen ja lämpötilan merkitykseen kasvien elintoiminnoille. Lisäksi käsitellään ääriolosuhteisiin sopeutumista ja kasvien puolustautumista sekä kasvien keinoja selvitä erilaisissa stressiolosuhteissa. Perehdytään myös bakteerien sopeutumiseen eri ympäristöolosuhteisiin. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Luennot kuulusteluineen. Luennoilla jaettava materiaali. Ajankohta: 2. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Kasvitieteen yliassistentti, kasvifysiologia ja molekyylibiologia BIOL2070 Evolutionary Genetics (3 op, 1,5 ov) Aims: To introduce students to the field of evolutionary genetics and its connection to evolutionary biology in a variety of biological systems. Content: Topics covered include, the origin of genetic variation; characterising genetic diversity; mutation, migration and genetic drift, natural selection and adaptation; quantitative genetics; speciation; molecular evolution; evolutionary physiology; the origin of life. Format: Lectures, computer and hands on calculation sessions, exam. Evaluation: Successful completion of the examination (which can be answered in Finnish or English) and computer and hands on calculation exercises When: 2 nd year/ 1 st period Examination: 1-5 Responsible lecturer: Craig Primmer, Genetics BIOL2080 Evolutiivisen ekologian perusteet (4 op, 2 ov) Edeltävät opinnot: Evolutionary genetics Tavoitteet: Tavoitteena on oppia ymmärtämään evolutiivisten prosessien toimintaa ja seurauksia eläin- ja kasvipopulaatioissa.

7 7 Sisältö: Tutustutaan elinkiertojen evoluutioon, lisääntymisjärjestelmiin, sukupuolivalintaan, käyttäytymisekologiaan, lajien välisiin interaktioihin ja koevoluutioon. Lisäksi havainnollistetaan ihmistoiminnan evolutiivisia vaikutuksia eliöpopulaatioissa. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 2. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Ekologian yliassistentti BIOL2090 Eliökunta (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Saada yleiskuva eliökunnan sukupuun rakenteesta ja sen päähaarojen luonteenomaisista piirteistä Sisältö: Eliökunnan päähaarojen esittely Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu, johon sisältyy kirjan Campbell & Reece 2004: Biology (7th Edition) luvut Ajankohta: 1. vuosi/4. periodi Vastuuopettaja: Kalle Ruokolainen, biodiversiteettitutkimus BIOL2100 Eliökunnan historia (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Elämän historian nivominen osaksi maapallon geologista historiaa Sisältö: Elämän historia, eri aikakausien tärkeimmät eliöryhmät sekä tärkeimmät sukupuuttoaallot Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu Ajankohta: 2. vuosi/ 1. periodi Vastuuopettaja: Jukka Salo, biodiversiteettitutkimus MUUT YHTEISET OPINNOT Kemia 2-7 op 1-3 ov BIOL4020 Kemian kurssi biologeille 2 op 1 ov (pakollinen kaikilla linjoilla) KEML1005 Kemian harjoitukset 3 op 1 ov (pakollinen vain fysiologian ja genetiikan linjalla) KEML5636 Lääketieteellinen kemia (pakollinen vain fysiologian ja genetiikan linjalla) 2 op 1 ov ATK:n, biostatistiikan ja bioinformatiikan alkeet 8 op 4 ov EKOL4001 ATK:n perusteet 4 op 2 ov (pakollinen kaikilla linjoilla) EKOL2421 Biostatistiikan ja bioinformatiikan perusteet (pakollinen kaikilla linjoilla) 4 op 2 ov Bioetiikka ja koesuunnittelu 5 op 3 ov (vain ekologian sekä fysiologian ja genetiikan linjalla kandidaatin tutkinnossa, opettajalinjalla maisterin tutkinnossa) ELFY1002 Bioetiikka 2 op 1 ov ELFY1003 Koesuunnittelu 3 op 2 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö

8 8 BIOL4020 Kemian kurssi biologeille (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Lukion kemian tietojen vahvistaminen ja kemian tietojen soveltaminen biologiassa. Sisältö: Kemia biologiassa, lukion kemia sekä ph-käsite ja -laskut, happoemästasapainot, pitoisuuskäsitteet ja laskut, työturvallisuus. Suoritustavat: Luentoja 16h sekä oheislukemistoa, kuulustelussa vaaditaan valikoidut osat lukion kemian kirjoista ja luentomonisteet. Ajankohta: 1. vuosi/ 2. periodi Vastuuopettaja: Arto Liljeblad, lääketieteellinen kemia KEML1005 Kemian harjoitukset (3 op, 1 ov) Tavoitteet: Sisältö: Perusmittaukset, mitta-analyysi (titrimetria), puskuriliuokset, polarimetria, spektrometria, elektroforeesi, kromatografia, konduktometria Toteutustavat: Harjoitustöitä 35 h Suoritustavat: Harjoitustöiden ja raporttien tarkastus Ajankohta: 1 vuosi/3. periodi Vastuuopettaja: Arto Liljeblad, lääketieteellinen kemia KEML5636 Lääketieteellinen kemia (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Sisältö: Johdatus biomolekyylien rakenteeseen, sidokset ja molekyylien väliset vuorovaikutukset, elektronegatiivisuus, termodynamiikka, massavaikutuksen laki ja reaktiivisuus, orgaanisten yhdisteiden rakenne ja funktionaaliset ryhmät, typpi- ja fosforiyhdisteiden sekä lipidien ja steroidien kemia, reaktiomekanismien alkeet: esteri- ja peptidisidoksen hydrolyysi sekä substituutio- ja eliminaatioreaktiot, käsitteet nukleofiili ja elektrofiili, isomeria ja molekyylien avaruusrakenne, reaktionopeus, 0. ja 1. kertaluvun reaktiot. Toteutustavat: Luentoja 20 h Suoritustapa: Kuulustelu luennoista ja luentomonisteesta. Ajankohta: 2. vuosi/ 1. tai 2. periodi Vastuuopettaja: Liisa Kanerva, lääketieteellinen kemia EKOL4001 ATK:n perusteet (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Kurssi antaa perustiedot internetin ja intranetin palveluista sekä tekstinkäsittelystä (Word), taulukkolaskennasta (Excel) ja esitysgrafiikasta (PowerPoint). Sisältö: Kurssi jakautuu neljään osaan: verkko- ja tietoturvaosaan, tekstinkäsittelyyn, taulukkolaskentaan ja esitysgrafiikkaan. Verkko- ja tietoturvaosuudessa perehdytään mm. yliopiston verkkopalveluihin, sähköpostin toimintoihin, koneiden tietoturvaan ja tiedon tallentamiseen. Tekstinkäsittelyssä käsitellään mm. sarkainten ja taulukoiden käyttöä, palstoitusta, tyylejä, sisällysluettelon tekemistä, kaavaeditoria, kuvien käsittelyä, muutosten hallintaa ja asiakirjan osiointia. Taulukkolaskennassa painotetaan soluosoitteiden hallintaa, kaavojen ja funktioiden käyttöä, luetteloiden käsittelyä ja kaavioiden tekemistä. Esitysgrafiikassa käsitellään dian rakennetta, teksti-, piirros- ja kuvaobjekteja sekä animointia. Toteutustavat: Mikroluokkaharjoitukset, harjoitustehtävät ja kuulustelu Suoritustavat: Harjoituksiin osallistuminen, harjoitustehtävien tekeminen ja hyväksytysti suoritettu päättökuulustelu. Ajankohta: Verkko- ja tietoturvaosuus 1. vuosi/ 1. periodi, loput 1. vuosi/ 3. periodi Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Matti Ketola EKOL2421 Biostatistiikan ja bioinformatiikan perusteet (4 op, 2 ov)

9 9 Tavoitteet: Kurssilla perehdytään tilastotieteen ja tilastollisen bioinformatiikan peruskäsitteisiin, soveltamiseen biotieteisiin sekä tulosten tulkitsemiseen. Sisältö: Käsitellään otantaa, aineiston kuvausta, tunnuslukuja, luottamusvälejä ja tavallisimpia testejä luokitelluille ja jatkuville muuttujille (ei-parametrisine vastineineen). Kurssilla tehtävät harjoitustyöt edellyttävät erittäin hyvää Excel-ohjelman hallintaa. Esitiedot: ATK:n perusteet EKOL4001. Toteutustavat: Luennot (20 h biostatistiikkaa, 6 h bioinformatiikkaa), harjoitustehtävien palaute ja kuulustelu Suoritustavat: Harjoitustehtävien tekeminen ja hyväksytysti suoritettu kuulustelu. Ajankohta: 2. vuosi/3. ja 4. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Ekologian yliassistentti ELFY1002 Bioetiikka (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on kiinnittää opiskelijoiden huomio biologiassa esiin tuleviin eettisiin kysymyksiin Sisältö: Jaksolla käydään läpi opiskelijoiden esitysten ja keskustelujen pohjalta tärkeimmät biotieteisiin liittyvät eettiset kysymykset. Toteutustavat: Opiskelijoiden esitykset ja esitysten pohjalta käyty keskustelu Suoritustavat: minuutin esityksen laadinta ja esityksen pitäminen sekä aktiivinen osallistuminen muiden esityksistä käytävään keskusteluun. Ajankohta: 2. vuosi/2. periodi Arvostelu: suoritettu/hylätty Vastuuopettaja: Mikko Nikinmaa, eläinfysiologia ELFY1003 Koesuunnittelu (3 op, 2 ov) Laajuus: 3 op (2 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija tekijöihin, jotka on otettava huomioon biotieteellisen tutkimuksen suunnittelussa. Sisältö: Luennolla käydään läpi tieteen filosofian periaatteet, kokeen suunnittelussa ja kokeen analysoinnissa huomioonotettavat tekijät niin aineiston kuin siihen liittyvien käsittelyjen ja mittausmenetelmien osalta Toteutustavat: Luennot (ja kirjan G.D. Ruxton ja N. Colegrave, Experimental Design for the Life Sciences käyttö soveltuvin osin) Suoritustavat: Luennoille osallistuminen ja annettujen tehtävien ratkaiseminen Ajankohta: 2. vuosi/3. periodi Arvostelu: suoritettu/hylätty Vastuuopettaja: Mikko Nikinmaa, eläinfysiologia KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT Kieli- ja viestintäopinnot ovat samanlaiset kaikilla kolmella linjalla Ruotsin kieli 3 op 2 ov KIRU2361 Ruotsin kieli/ matemaattis-luonnontieteellinen 3 op 2 ov Englannin kieli 3 op KIEN2311 Englannin kieli / tekstin ymmärtäminen 3 op 1 ov (tai suullisen kielitaidon kurssi) Viestintäopinnot 4 op KISU3321 Kirjallinen viestintä: Matemaattisluonnontieteellinen 2 op 1 ov KISU3322 LuK-tutkielman kielentarkastus 1 op 0,5 ov

10 10 BIOL3010 Tieteellisen esitystaidon alkeet 1 op 0,5 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö Seuraavat kurssit kuuluvat kielikeskuksen opetustarjontaan. Ajankohtaiset tiedot ovat kielikeskuksen verkkosivuilla. KIRU2361 Ruotsin kieli/matemaattis-luonnontieteellinen (3 op, 2 ov) KIEN2311 Englannin kieli /Tekstin ymmärtäminen (3 op, 1 ov) KISU3321 Kirjallinen viestintä: Matemaattis-luonnontieteellinen (2 op, 1 ov) BIOL3010 Tieteellisen esitystaidon alkeet (1 op, 0.5 ov) Tavoitteet: Tieteellisen esitystaidon alkeiden omaksuminen Sisältö: Suullisen ja visuaalisen tieteellisen viestinnän perussäännöt ja niiden soveltaminen esitelmässä Toteutustavat: Luennot ja palautetilaisuudet Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja palautetilaisuuteen, esitelmän pitäminen. Kurssi suoritetaan linjan LuK-seminaarin yhteydessä. Ajankohta: 3. vuosi Arvostelu: Hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Linjan Luk-seminaarin vastuuopettajat Erikoistumisopinnot ekologian linjalla (45-55 op, 22,5-28,5 ov) Lajintuntemus 6 op 3 ov BDIV2101 Selkärankaisten lajintuntemus 2 op 1 ov BDIV2105 Selkärangattomien tuntemus 2 op 1 ov BDIV2106 Hyönteisten tuntemus 2 op 1 ov BDIV2212 Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus 2 op 1 ov Kenttäkurssit 4 op 2 ov EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi 2 op 1 ov EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi 2 op 1 ov EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kurssi 2 op 1 ov EKOL2308 Akvaattisen ekologian kurssi 3 op 2 ov Ekologian luennot 9 op 3 ov EKOL2212 Evolutiivinen ekologia 3 op 2 ov EKOL2108 Populaatioekologia 3 op 2 ov EKOL2109 Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologia 3 op 2 ov Ekologian muut pakolliset erikoistumisopinnot 23 op 12,5 ov EKOL2411 Ekologinen tilastotiede 6 op 4 ov EKOL2103 Ekologian laboratorioharjoitukset 3 op 2 ov EKOL2004 Ekologian aineopintojen lopputentti 6 op 3 ov EKOL2003 Ekologian LuK-seminaari 2 op 1 ov EKOL2700 LuK-tutkielma 6 op 3 ov Valinnaiset erikoistumisopinnot 5-15 op 2-8 ov BDIV4102 Eliökunnan monimuotoisuus: kasvikunta 4 op 2 ov BDIV4101 Eliökunnan monimuotoisuus: eläinkunta 2 op 1 ov

11 11 BDIV4203 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi 3 op 2 ov Kenttäkursseja 4 op 2 ov Muita valinnaisia opintoja Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö Lajintuntemus (6 op) suoritetaan valitsemalla kolme seuraavista kursseista: BDIV2101 Selkärankaisten lajintuntemus (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Oppia tunnistamaan edustava otos Suomen ja maailman selkärankaislajeista. Sisältö: Tunnistettavien taksonien luettelo ja harjoituskokoelmat Toteutustavat: Demonstraatiot Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu tuntemuskuulustelu Ajankohta: 1. vuosi/3. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Esa Lehikoinen BDIV2105 Selkärangattomien tuntemus (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Oppia tunnistamaan edustava otos Suomen ja maailman selkärangattomista. Sisältö: Tunnistettavien taksonien luettelo ja harjoituskokoelmat Toteutustavat: Demonstraatiot Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu tuntemuskuulustelu Ajankohta: 1. vuosi/ 4. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Ilari E. Sääksjärvi BDIV2106 Hyönteisten tuntemus (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Oppia tunnistamaan edustava otos Suomen ja maailman hyönteislahkoista ja - heimoista. Sisältö: Tunnistettavien taksonien luettelo ja harjoituskokoelmat Toteutustavat: Demonstraatiot Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu tuntemuskuulustelu Ajankohta: 1. vuosi/ 4. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Ilari E. Sääksjärvi BDIV2212 Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Oppia tunnistamaan edustava n. 300 lajin otos Suomen putkilokasveista. Sisältö: Tunnistettavien taksonien luettelo ja harjoituskokoelmat Toteutustavat: Demonstraatiot Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu tuntemuskuulustelu Ajankohta: 1. vuosi/ 3. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Riitta Kotiluoto Kenttäkurssit (4 op) suoritetaan valitsemalla kaksi seuraavista kursseista. Loput kurssit kuuluvat valinnaisiin erikoistumisopintoihin. EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Eri elinympäristöjen maaselkärankaiseliöstöön tutustuminen ja lajintuntemuksen soveltaminen ekologiseen tutkimukseen. Yksilö-, populaatio- ja yhteisötason ekologisten tutkimusmenetelmien soveltaminen käytännön maastoekologiassa. Sisältö: Maasto- ja laboratorioharjoitukset. Maasto-osuus koostuu retkistä erilaisiin ympäristöihin. Retkillä kerätään tutkimusaineistot pääosin havainnoimalla. Myös pienen mittakaavan kokeiden

12 12 tekemistä harjoitellaan. Laboratorio-osuus on havaintojen ja kerätyn aineiston käsittelyä ja raportointia. Esitiedot: Eliöiden tuntemuksen perusteet. ATK:n perusteet (EKOL4001). Toteutustavat: Retkeilyt, kenttä- ja laboratoriotyöt. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kurssille ja kurssitöiden tulosten raportointi. Kenttäkurssit ovat intensiivikursseja, joiden aikana ei ole mahdollista osallistua muihin kursseihin tai käydä tenteissä. Ajankohta: 1. vuosi/toukokuu Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Esa Lehikoinen EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi 2 op, 1 ov) Tavoitteet: Eri elinympäristöjen eliöstöön tutustuminen ja selkärangattomien tuntemuksen soveltaminen ekologiseen tutkimukseen. Oppia maastotutkimuksissa käytettäviä selkärangattomiin soveltuvia keruumenetelmiä ja muita ekologisia tutkimusmenetelmiä sekä näytteiden käsittelyä ja säilöntää. Sisältö: Maasto- ja laboratorioharjoitukset. Maasto-osuus koostuu aineiston hankkimisesta havainnoimalla tai keräämällä näytteitä. Laboratorio-osuus on havaintojen ja kerätyn aineiston käsittelyä ja raportointia. Esitiedot: Eliöiden tuntemuksen perusteet. ATK:n perusteet (EKOL4001). Toteutustavat: Retkeilyt, kenttä- ja laboratoriotyöt. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kurssille ja kurssitöiden tulosten raportointi. Kenttäkurssit ovat intensiivikursseja, joiden aikana ei ole mahdollista osallistua muihin kursseihin tai käydä tenteissä. Ajankohta: 1. kesä/elokuu Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Kai Ruohomäki EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tutustuminen eri elinympäristöjen kasvillisuuteen ja lajistoon sekä kasviekologiseen tutkimukseen. Ekologisten tutkimusmenetelmien soveltaminen käytännön kenttä- ja laboratoriotöihin. Sisältö: Maasto- ja laboratorioharjoitukset. Maasto-osuus koostuu aineiston hankkimisesta havainnoimalla ja keräämällä näytteitä. Laboratorio-osuus on kerätyn aineiston käsittelyä ja raportointia. Esitiedot: Eliöiden tuntemuksen perusteet. ATK:n perusteet (EKOL4001). Toteutustavat: Retkeilyt, kenttä- ja laboratoriotyöt. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kurssille ja kurssitöiden tulosten raportointi. Kenttäkurssit ovat intensiivikursseja, joiden aikana ei ole mahdollista osallistua muihin kursseihin tai käydä tenteissä. Ajankohta: 1. kesä/elokuu Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Auli Rantio-Lehtimäki EKOL2308 Akvaattisen ekologian kenttäkurssi (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Murto- ja sisävesien elinympäristöihin sekä niiden fysikaalis-kemialliseen ympäristöön ja eliöstöön tutustuminen. Lajintuntemuksen soveltaminen ekologiseen tutkimukseen. Ekologisten tutkimusmenetelmien soveltaminen käytännön kenttä- ja laboratoriotöihin. Sisältö: Maasto- ja laboratorioharjoitukset. Maasto-osuus koostuu aineiston hankkimisesta havainnoimalla tai keräämällä näytteitä. Laboratorio-osuus on havaintojen ja kerätyn aineiston käsittelyä ja raportointia. Esitiedot: Eliöiden tuntemuksen perusteet. ATK:n perusteet (EKOL4001). Toteutustavat: Retkeilyt, kenttä- ja laboratoriotyöt.

13 13 Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kurssille ja kurssitöiden tulosten raportointi. Kenttäkurssit ovat intensiivikursseja, joiden aikana ei ole mahdollista osallistua muihin kursseihin tai käydä tenteissä. Ajankohta: 1. kesä/elokuu Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: avoin Ekologian luennot EKOL2212 Evolutiivinen ekologia (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Syvennetään ymmärrystä muuntelun ja evoluution merkityksestä yksilöiden ja populaatioiden ekologiassa Sisältö: Tutustutaan lisääntymisen ja seksin ekologiaan, käyttäytymisen ja ravinnonhankinnan ekologiaan sekä tapoihin mitata luonnonvalintaa, erilaistumista ja migraatiota. Esitiedot: Evolutiivisen ekologian perusteet (BIOL2080) Toteutustavat: Luennot, harjoitukset ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 2. vuosi/3. periodi Arvostelu: Luentokuulustelu arvostellaan asteikolla 1 5 Vastuuopettaja: Ekologian yliassistentti EKOL2108 Populaatioekologia (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Populaatiokoon vaihtelun ja populaatioiden välisten vuorovaikutusten keskeisten kvantitatiivisten ja kvalitatiivisten piirteiden ymmärtäminen. Sisältö: Populaatiotason ilmiöiden ja niitä koskevien teorioiden tarkastelu ja soveltaminen Esitiedot: Ekologian perusteet Toteutustavat: Luennot, tietokonedemonstraatiot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 2. vuosi/1. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Esa Lehikoinen EKOL2109 Eliöyhteisö- ja ekosysteemiekologia (3 op, 2 ov) Edeltävät opinnot: Tavoitteet: Eliöyhteisö- ja ekosysteemitason ilmiöiden ja niitä koskevien käsitteiden ja teorioiden ymmärtäminen. Sisältö: Eliöyhteisöjen rakennetta, diversiteettiä ja vakautta sääteleviin tekijöihin ja sukkessioon sekä ekosysteemien toimintaperiaatteisiin perehtyminen. Esitiedot: Ekologian perusteet Toteutustavat: Luennot, luentomoniste ja kuulustelut Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 2. vuosi/3. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Jouko Sarvala Ekologian muut pakolliset erikoistumisopinnot EKOL2411 Ekologinen tilastotiede (6 op, 4 ov) Tavoitteet: Ekologiassa käytettäviin tilastotieteellisiin menetelmiin perehtyminen (suunnittelu, otanta, koeasetelmat, tilastolliset mallintamismenetelmät). Tilastollisten tulosten ymmärtämisen kehittäminen. Biologian ja tilastotieteen oikean suhteuttamisen oppiminen. Sisältö: Otanta- ja koesuunnitteluteoriaa erityisesti ekologisia tutkimustilanteita painottaen. Lineaaristen mallien käyttö ekologisissa aineistoissa esiintyvien vaikutusten osoittamiseen. Esitiedot: ATK:n perusteet (EKOL4001) ja Biostatistiikan ja bioinformatiikan perusteet (EKOL2421)

14 14 Toteutustavat: Luennot, tietokoneharjoitukset, kuulustelu ja päättökoe Suoritustavat: Kuulustelun ja päättökokeen hyväksytty suorittaminen Ajankohta: 3. vuosi/1 ja 2. periodi Vastuuopettaja: Esa Lehikoinen EKOL2103 Ekologian laboratorioharjoitukset (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Tutustuttaa opiskelija siihen, miten ekologian teorian periaatteet toimivat käytännössä. Sisältö: Harjoitustöissä perehdytään populaation kehitykseen kokeellisessa ympäristössä Esitiedot: Populaatioekologia Toteutustavat: Harjoitukset Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoituksiin ja kurssitöiden tulosten raportointi. Ajankohta: 2.vuosi/2. periodi Arvostelu: suoritettu/hylätty Vastuuopettaja: ekologian assistentit EKOL2004 Ekologian aineopintojen lopputentti (6 op, 3 ov) Tavoitteet: Yleiskuvan muodostuminen opiskelijan erikoistumisalalta Sisältö: Sovittavan kirjan lukeminen ja kirjallinen kuulustelu Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: ekologian professorit EKOL2003 Ekologian LuK-seminaari (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Ohjata ja tukea opiskelijaa LuK-tutkielman tekemisessä Sisältö: LuK-tutkielman tekemisen ohjeistus, aikataulutus ja vuorovaikutteinen etenemisen raportointi. Seminaarin yhteydessä suoritetaan myös Tieteellisen esitystaidon alkeet. Toteutustavat: Luennot, keskustelutilaisuudet ja opiskelijaesitysten palautetilaisuudet Suoritustavat: Osallistuminen kokoontumisiin ja seminaarin aikana annettujen tehtävien suorittaminen. Ajankohta: 3. vuosi Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Kai Norrdahl EKOL2700 LuK-tutkielma Laajuus: 6 op (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehtyminen tutkielman aihepiiriin, tieteellisen tiedon hakemiseen ja kokoavaan esittämiseen tieteellisen kielenkäytön periaatteiden mukaisesti. Tutkielman aiheen hyväksyy oppiaineen professori tai hänen valtuuttamansa opettaja. Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: ekologian professorit Pääaineen valinnaiset erikoistumisopinnot (15 op) Ekologian kursseja tai kirjatenttejä tarjonnan mukaan, esimerkiksi: BDIV4203 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Taksonomisen tutkimuksen kysymyksenasettelun ja työjärjestyksen oppiminen sekä tutustuminen keskeisiin tutkimusmenetelmiin Sisältö: Taksonomisen työn etenemisjärjestys, lajien sisäisen ja välisen muuntelun erottamisen ongelma, lajikäsitykset, museotoiminta, elektronimikroskopiaan tutustuminen, kladistiikan perusteet. Toteutustavat: Luentoja, tutkijaesitelmiä, opiskelijan harjoituksia ja niiden esittely loppuseminaarissa

15 15 Suoritustavat: Osallistuminen tutkijaesitelmiin, loppuseminaariesitelmä ja hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 3. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Kalle Ruokolainen BDIV4102 Eliökunnan monimuotoisuus: kasvikunta (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Kasvikunnan sukupuun rakenteen ja sen päähaarojen ominaisuuksien hahmottaminen Sisältö: Tärkeimpien levä-, sammal-, sanikkais- ja siemenkasviryhmien rakenne- ja elinkiertopiirteiden, ekologisen merkityksen ja taloudellisen käytön esittely ja ryhmien sijoittaminen sukupuuhun. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 3. ja 4. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Kalle Ruokolainen BDIV4101 Eliökunnan monimuotoisuus: eläinkunta (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Eläinkunnan sukupuun rakenteen ja sen päähaarojen ominaisuuksien hahmottaminen Sisältö: Tärkeimpien eläinryhmien rakenne- ja elinkiertopiirteiden, ekologisen merkityksen ja taloudellisen käytön esittely ja ryhmien sijoittaminen sukupuuhun. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu. Ajankohta: 3. periodi Arvostelu: 1 5 Vastuuopettaja: Ilari E. Sääksjärvi Sivuaineet ekologian linjalla Sivuaineilla on merkitystä työelämään sijoittumisessa ja/tai kandidaattivaihetta seuraavien opintojen suuntaamisessa. Ekologian linjan opetus mahdollistaa pätevöitymisen moniin erilaisiin tehtäviin. Siksi myös mahdollisten sivuaineiden kirjo on ekologiassa suuri. Sivuainevalintojen tulisi tukea opiskelijan suuntautumista linjan sisällä. Sivuainevalinnat merkitään opiskelijan henkilökohtaiseen opintosuunnitelmaan, kun niistä on keskusteltu opintoneuvojan kanssa. Kandidaatin tutkintoon tarvitaan joko kaksi 25 op sivuainekokonaisuutta tai yksi 60 op kokonaisuus. Ekologian linjalla voidaan biologian sisäisenä sivuaineena suorittaa fysiologian ja genetiikan kokonaisuus (25 op tai laajempi), johon voidaan yhdistää myös solu- ja molekyylibiologian opintojaksoja opintoneuvojan kanssa sovittavalla tavalla. Muiksi sivuaineiksi soveltuvat mm. ympäristötiede, maantiede, geologia, tilastotiede, tietojenkäsittelytiede, matematiikka, biokemia, kemia, fysiikka, filosofia, kaupalliset aineet, kasvatustieteet, ympäristöoikeus ja hallintotieteet. Myös muissa oppilaitoksissa tai ulkomailla suoritettuja opintoja voidaan käyttää täydentämään sivu- ja pääaineopintoja, esimerkiksi Åbo Akademin meribiologian, ympäristötieteen tai solubiologian opintoja. Erikoistumisopinnot fysiologian ja genetiikan linjalla (40-50 op) VALINNAISET LUENNOT JA KURSSIT op (alla olevasta listasta koottuna) Anatomia, histologia ja morfologia 8 op 4 ov KAFY5011, Kasvianatomia ja -kehitysmorfologia 4 op 2 ov KAFY5012 ELFY4990 Selkärankaisten anatomia ja histologia 4 op 2 ov

16 16 Eläinfysiologian harjoitustyöt 18 op 9,5 ov ELFY4992 Eläinfysiologian harjoitustyöt 4 op 2 ov ELFY4960 Koe-eläintiede 4 op 2 ov ELFY4964 Mikroskooppitekniikat 5 op 3 ov ELFY4991 Neurobiologia 5 op 2,5 ov Yksilönkehitys ja siihen liittyvä perinnöllisyys 8 op 4 ov ELFY4993 Kehitysbiologian harjoitustyöt 2 op 1 ov GENE3021 Kehitysgenetiikan harjoitukset 6 op 3 ov Evolutiivinen genetiikka 8 op 4 ov GENE3001 Evolutionary genetics 2 2 op 1 ov GENE3002 Laboratory methods in evolutionary genetics 6 op 3 ov Kromosomitutkimus ja solusyklit 8 op 4 ov GENE3011 Kromosomitutkimuksen luennot 2 op 1 ov GENE3012 Kromosomitutkimuksen harjoitukset 6 op 3 ov Kasvibiokemia 6 op 3 ov KAFY5001 Kasvibiokemian luennot 3 op 1,5 ov KAFY5002 Kasvibiokemian harjoitustyöt 3 op 1,5 ov Kasvit ja ympäristö 5 op 2,5 ov KAFY5031 Kasvit ja ympäristö, luennot 2 op 1 ov KAFY5032 Kasvit ja ympäristö, harjoitustyöt 3 op 1,5 ov Kasvigenetiikka ja -biotekniikka 8 op 4 ov KAFY5021 Kasvigenetiikan ja biotekniikan luennot 5 op 2,5 ov KAFY5022 Kasvigenetiikan ja biotekniikan harjoitukset 3 op 1,5 ov Vaihtuvia luentosarjoja/kursseja 10 op 5 ov MUUT OPINNOT Seminaari ja tutkielma 9 op 5 ov BIOL3000 Fysiologian ja genetiikan Luk-seminaari 3 op 2 ov ELFY4994, GENE5009, KAFY3008 LuK-tutkielma 6 op 3 ov Aineopintojen loppukuulustelu (vähintään 10 op vähintään kahdesta eri oppiaineesta) BIOL Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukuulustelu 1 ja 2 10 op 5 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö Valinnaiset luennot ja kurssit KAFY5011, KAFY5012 Kasvianatomia ja kehitysmorfologia (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on oppia kasvin anatomiset ja morfologiset perusrakenteet solukkotasolla ja soveltuvin osin solu- ja molekyylibiologisilla tasoilla.

17 17 Sisältö: Kasvisoluorganellien erilaistuminen, kasvisolukkojen anatomiset ominaispiirteet, juuren, varren, lehden ja lisääntymisrakenteiden anatomia näiden kasvielinten solukkospesifisiin tehtäviinsä erilaistumisen kannalta. Toteutustavat: Luennot (KAFY5011, 2 op) ja harjoitustyöt (KAFY5012, 2 op) kuulusteluineen Suoritustavat: Luento- ja harjoitustyökuulustelun hyväksytty suoritus sekä aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin. Ajankohta: 3. periodi Vastuuopettaja: Eira Kanervo, kasvifysiologia ja molekyylibiologia ELFY4990 Selkärankaisten anatomia ja histologia (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Kurssilla perehdytään eri selkärankaisryhmiä edustavien eläinten elimistön anatomiseen rakenteeseen sekä erilaisten kudosten hienorakenteeseen. Tavoitteena on perehdyttää opiskelija rakenteen ja toiminnan välisiin yhteyksiin. Sisältö: Makroskooppiseen anatomiaan tutustutaan preparointiharjoituksissa. Kudosten hienorakenteita käydään läpi mikroskooppipreparaattien ja luentojen avulla. Toteutustavat: Ohjatut harjoitukset sekä itsenäinen mikroskooppipreparaattien opiskelu osittain verkkotyöskentelynä, kuulustelu Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytysti suoritettu kuulustelu Ajankohta: Vastuuopettaja: Minna Vainio, eläinfysiologia ELFY4992 Eläinfysiologian harjoitustyöt (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija eläinfysiologisiin tutkimusmenetelmiin ja syventää opiskelijan tietämystä eläinten elintoimintojen säätelystä Sisältö: Käytettävissä olevilla mittausmenetelmillä tutkitaan eläinten elintoimintojen säätelyä solu-, kudos- ja yksilötasolla. Opetuksessa hyödynnetään myös tietokonesimulaatioita. Toteutustavat: Harjoitustyöt, joista tehdään työselostukset Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytyt työselostukset Ajankohta: Vastuuopettaja: Eeva Rissanen, eläinfysiologia ELFY4960 Koe-eläintiede (4 op, 2 ov) Tavoitteet: Kurssi on koe-eläinlainsäädännön mukainen opetusohjelmaan kuuluva koe-eläinten käyttöön opastava kurssi ja on edellytyksenä itsenäiseen koe-eläinten käyttöön tieteellisessä tutkimuksessa Sisältö: Kurssilla perehdytään koe-eläinlainsäädäntöön, koe-eläinten käyttöön sekä tilanteisiin, joissa korvaavia menetelmiä voidaan käyttää. Käytännön harjoittelussa perehdytään selkärankaisten käsittelyn perustekniikoihin erityisesti hiirtä, rottaa ja kaloja käyttäen. Toteutustavat: Luennot, harjoitustyöt ja kuulustelu Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytysti suoritettu kuulustelun Ajankohta: Vastuuopettaja: Tomi Streng, eläinfysiologia ELFY4964 Mikroskooppitekniikat (5 op, 3 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on antaa opiskelijalle perusvalmiudet käyttää erilaisia mikroskooppeja. Lisäksi tavoitteena on selvittää opiskelijalle kudos- ja soluvalmisteiden käsittelyn periaatteet ja kehittää opiskelijan valmiuksia tehdä tavallisimmat valmisteet ja värjäykset histo- ja sytotekniikan periaatteita noudattaen Sisältö: Valomikroskopia, fluoresenssimikroskopia, konfokaalimikroskopia sekä elektronimikroskopia. Kudosten ja solujen fiksaation periaatteet, parafiini- ja jääleikkeet, konventionaaliset värjäykset, entsyymi- ja immunohistologia

18 18 Toteutustavat: Luennot, harjoitustyöt työselostuksineen sekä kuulustelu Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin, hyväksytyt työselostukset ja hyväksytysti suoritettu kuulustelu Ajankohta: 3. periodi Vastuuopettaja: Tiina Henttinen, eläinfysiologia ELFY4991 Neurobiologia (5 op, 2.5 ov) Tavoitteet: Ymmärtää hermoston ja aistien rakenne/toiminta (myös tietyissä sairaustiloissa) sekä niiden tutkimusmenetelmiä. Sisältö: Luennolla perehdytään keskus- ja ääreishermoston sekä sähköisen/kemiallisen johtumisen rakenteisiin. Edelleen tutustutaan aistien toimintaan ja neurobiologian tutkimusmenetelmiin. Esimerkkitapauksia hermostollisista sairauksista. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Hyväksytysti suoritettu luentokuulustelu Ajankohta: Vastuuopettaja: Tomi Streng, eläinfysiologia ELFY4993 Kehitysbiologian harjoitustyöt (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on havainnollistaa yksilönkehityksen eri vaiheita Sisältö: Harjoitustöissä perehdytään alkionkehitykseen mikroskooppipreparaatteja käyttäen Toteutustavat: Harjoitustyöt ja kuulustelu Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytysti suoritettu kuulustelu Ajankohta: 3. periodi Vastuuopettaja: eläinfysiologian yliassistentti GENE3021 Kehitysgenetiikan harjoitukset (6 op, 3 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija geenijärjestelmien hierarkiseen aktivoitumiseen yksilönkehityksen eri vaiheissa. Sisältö: Yksilönkehityksen ajoitus, eri ikäisten embryoiden kerääminen ja geeniekspressioiden tutkiminen, maternelliefektigeenit, aukkogeenit, parisäääntögeenit, segmenttien polaarisuus geenit, Hox-geenit, mutaatioiden vaikutus yksilönkehitykseen näissä järjestelmissä, kudosten kehitysgeneettiset lokerot. Toteutustavat: Harjoitustyöt työselostuksineen Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytyt työselostukset. Ajankohta: 3. periodi Arvostelu: hyväksytty/ hylätty Vastuuopettaja: genetiikka GENE3001 Evolutionary genetics 2 (2 op, 1 ov) Aims: To gain a deeper understanding of various evolutionary genetic topics introduced in Evolutionary Genetics 1 (KETE3010) Content: Natural selection and adaptation; quantitative genetics; speciation; molecular evolution; comparative genomics. Students will also prepare and present a seminar (in groups) on an evolutionary genetic topic. Format: Lectures and seminars, written examination. Mode of assessment: Successful preparation and presentation of a seminar and completion of a written examination. When: 3rd period Evaluation: 1-5 Course contact: Craig Primmer, Genetics GENE3002 Laboratory methods in evolutionary genetics (6 op, 3 ov)

19 19 Aims: For students to gain experience in molecular genetic analysis methods applied in evolutionary genetic research Content:.Molecular genetic analysis methods applied in evolutionary genetic research as well as computer-based analysis methods used for subsequent data analysis Format: Laboratory sessions, laboratory report, written examination. Modes of assessment: Participation in all laboratory sessions, successful preparation and presentation of a seminar, a laboratory report and completion of a written examination. When: 3rd period Evaluation: 1-5 Course contact: Craig Primmer, Genetics GENE3011 Kromosomitutkimuksen luennot (2 op, 1 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija erilaisiin kromosomityyppeihin, niiden käyttäytymiseen mitoosissa ja meioosissa ja mekanismeihin, jotka ohjaavat karyotyyppien evoluutiota. Sisältö: Monosentrinen ja holosentrinen kromosomi, niiden rakenteellinen erilaisuus, kromosomien käyttäytyminen erilaisissa mitoosi- ja meioosityypeissä, bivalenttien ja univalenttien segregaation määräytyminen, akiasmaattiset segregaatiomekanismit, reduktio meioosissa, karyotyypit ja niiden evoluutio. Toteutustavat: Luennot ja kuulustelu Suoritustavat: Luentokuulustelun hyväksytty suorittaminen. Ajankohta: 1. periodi Vastuuopettaja: Seppo Nokkala, genetiikka GENE3012 Kromosomitutkimuksen harjoitukset (6 op, 3 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija monipuolisesti kromosomitutkimuksessa käytettäviin menetelmiin. Sisältö: Mitoosi- ja meioositutkimuksen perusmenetelmät sovellettuna hyönteis-, nisäkäs- ja kasvimateriaaleille. Kromosomien raitavärjäysmenetelmät, in situ -hybridisaatiomenetelmät, karyotyyppianalyysi Toteutustavat: Harjoitustyöt työselostuksineen. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytyt työselostukset. Ajankohta: 1. periodi Vastuuopettaja: Christina Nokkala, genetiikka KAFY5001, KAFY5002 Kasvibiokemia (6 op, 3 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija kasvisolun perusaineenvaihduntakiertoihin ja niiden merkitykseen kasvien elintoiminnoissa. Sisältö: Hiilihydraatti- ja lipidiaineenvaihdunta, siemenen itämisen biokemia, soluseinän rakenne ja biosynteesi, kasvien sekundaariyhdisteet ja niiden merkitys kasvin aineenvaihdunnassa. Toteutustavat: Luennot, harjoitustyöt, työselostukset, luennoilla jaettava kirjallisuus sekä kuulustelut. Suoritustavat: Luennot sisältäen kuulustelun (KAFY5001, 3 op) sekä harjoitustöiden (KAFY5002, 3 op) hyväksytyt työselostukset. Ajankohta: 1. periodi Vastuuopettaja: Eevi Rintamäki, kasvifysiologia ja molekyylibiologia KAFY5031, KAFY5032 Kasvit ja ympäristö (5 op, 3 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tarkastella kasvien rakenteellisia ja toiminnallisia strategioita (molekyylitasolta koko kasvin tasolle) niiden sopeutuessa elämään erilaisissa ja muuttuvissa ympäristöissä.

20 20 Sisältö: Abioottiset ja bioottiset ympäristömuutokset; kasvien sopeutumis- ja puolustusstrategiat, parasitismi ja karnivoria ja ääriolosuhteiden sietämisen strategiat. Toteutustavat: Luennot kuulusteluineen (KAFY5031, 2 op) ja harjoitustyöt (KAFY5032,3 op) työselostuksineen. Suoritustavat: Luentokuulustelun hyväksytty suoritus sekä aktiivinen osallistuminen harjoitustöihin ja hyväksytyt työselostukset. Ajankohta: 1. perioidi Vastuuopettaja: Kasvitieteen yliassistentti, kasvifysiologia ja molekyylibiologia KAFY5021, KAFY5022 Kasvigenetiikka ja biotekniikka (8 op, 4 ov) Tavoitteet: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelija kasvien molekyyligenetiikan ja kasvibiotekniikan perusteisiin ja sovellutuksiin sekä antaa käytännön valmiuksia käyttää erilaisia tutkimusmenetelmiä. Sisältö: Yleis- ja molekyyligeneettinen analyysi lituruohossa kasvibiologian mallina, geenitekniikka kasvinjalostuksessa, kasvibiotekniikan sovellutuksia, geenimuunneltujen organismien käytön lainsäädäntö ja etiikka. Toteutustavat: Luennot, harjoitustyöt, työselostukset, luennoilla jaettava kirjallisuus sekä kuulustelut. Suoritustavat: Luennot ja kirjallisuus (KAFY5021, 5 op) sisältäen kuulustelun ja referaatin sekä harjoitustöiden (KAFY5022, 3 op) hyväksytyt työselostukset. Ajankohta: 3. periodi. Vastuuopettaja: Paula Mulo, kasvifysiologia ja molekyylibiologia Seminaari ja tutkielma BIOL3000 LuK-seminaari (3 op, 2 ov) Tavoitteet: Omatoimisen opiskelun kehittäminen, opiskelijan totuttautuminen kirjallisten lähteiden käyttöön ja harjaantuminen suulliseen esittämiseen ja tieteelliseen kommunikointiin. Sisältö: LuK-tutkielman tekemisen ohjeistus, kirjallisuuden haku ja tutkijaksi kouluttautumisen periaatteet. Opiskelijoiden pitämät esitelmät eläin- ja kasvifysiologian ja genetiikan aloilta. Toteutustavat: Luennot, keskustelutilaisuudet ja opiskelijaesitysten palautetilaisuudet Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kokoontumisiin ja seminaarin aikana annettujen tehtävien suorittaminen. Ajankohta: 3. vuosi Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Eläinfysiologian, genetiikan sekä kasvifysiologian ja molekyylibiologian professorit ELFY4994, GENE5009, KAFY3008 LuK-tutkielma (6 op, 3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehtyminen tutkielman aihepiiriin, tieteellisen tiedon hakemiseen ja kokoavaan esittämiseen tieteellisen kielenkäytön periaatteiden mukaisesti. Tutkielman aiheen hyväksyy oppiaineen professori tai hänen valtuuttamansa opettaja. Arvostelu: hyväksytty/hylätty Vastuuopettaja: Eläinfysiologian, genetiikan sekä kasvifysiologian ja molekyylibiologian professorit. Loppukuulustelut BIOL Fysiologian ja genetiikan aineopintojen loppukulustelu 1 ja 2 Sisältö: Vähintään 10 op vähintään kahdesta eri oppiaineesta esimerkiksi seuraavasta listasta: Eläinfysiologia