BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA

BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA Ekologian linja (EKOL) Eläinfysiologian linja (ELFY) Genetiikan linja (GENE) Kasvifysiologian ja molekyylibiologian linja (KAFY) Biologian opettajan linja -Eri koulutusohjelmien tutkintoon vaadittavat kurssit Opintojen rakenne Perusopinnot Opintojen suorittaminen Sivuaineen saaminen biologian koulutusohjelmasta Koulutusohjelman tavoitteet Biologian koulutuksen tavoitteena on antaa kaikille opiskelijoille perustiedot eliökunnan kehityksestä ja monimuotoisuudesta, eliöiden ja niiden muodostamien yhteisöjen rakenteesta, toiminnoista ja toimintojen säätelystä geenitasolta yksilötasolle, eliöiden välisistä vuorovaikutuksista ja vasteista ympäristöönsä. Koulutus tähtää siihen, että filosofian maisterin tutkinnon suoritettuaan opiskelijalla on erikoisalansa mukaan monipuoliset menetelmälliset ja tiedolliset valmiudet niin kenttäoloissa kuin laboratorioissa tai teollisuusympäristöissä tapahtuvaan biologisen asiantuntemuksen käyttöön. Suoritettu tutkinto antaa opiskelijalle myös valmiudet tieteelliseen jatkokoulutukseen biologian eri osa-aloilla. Opettajaksi aikova perehtyy biologian osa-alueisiin niin, että hän opettajana pystyy ohjaamaan oppilaitaan ja kykenee itsenäisesti seuraamaan biologian alueeseen kuuluvien tieteenalojen kehitystä. Sijoittuminen työelämään Perinteisesti pääosa biologian koulutusohjelmasta valmistuneista on sijoittunut joko yliopistojen ja muun julkishallinnon (valtion tutkimuslaitokset, ympäristöhallinto) tutkija- ja asiantuntijatehtäviin tai biologian opettajiksi. Tehtyjen selvitysten mukaan biologian opettajien tarve on peruskoulujen yläasteella ja lukioissa lähivuosina voimakkaasti kasvamassa. Lisäksi biologian opettajia tarvitaan jossakin määrin ammattikorkeakoulujen ja muun aikuiskoulutuksen tehtävissä. Yliopistoissa biologit ovat sijoittuneet hyvin jatkokoulutusprojekteihin niin biologiassa kuin lääketieteessä. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/biologpaa.htm (1 of 2)13.2.2006 15:22:30

BIOLOGIAN KOULUTUSOHJELMA Viime vuosina biologeiksi valmistuneiden mahdollisuudet sijoittua koululaitoksen, yliopistojen ja julkishallinnon ulkopuolelle ovat selvästi parantuneet. Biologista asiantuntemusta vaativia tehtäviä on syntynyt erityisesti biotekniikan alalle lääke- ja elintarviketeollisuuteen, joissa biologeja toimii tutkimus-, tuotekehitys-, tuotanto-, valvonta- ja markkinointitehtävissä, sekä ympäristöalan yrityksiin, joissa biologit toimivat asiantuntija-, suunnittelu-, valvonta- ja tiedonvälitystehtävissä niin Suomessa kuin ulkomailla. Vaikka työmarkkinat ovat kohtuulliset, nopeaa työllistymistä voi helpottaa sisällyttämällä tutkintoon potentiaalisten työnantajien kaipaamaa erikoisainesta myös biologian ulkopuolelta. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/biologpaa.htm (2 of 2)13.2.2006 15:22:30

EKOLOGIAN LINJA Tavoitteena on perehdyttää opiskelija eliöiden ja niiden ympäristön välisiin suhteisiin yksilö-, populaatio-, yhteisö- ja ekosysteemitasoilla sekä ekologian eri osa- alueiden teorioihin ja tutkimusmenetelmiin. Evolutiivinen näkökulma ja menetelmien hallinta ovat tieteenalan opetuksessa ja tutkimuksessa keskeisessä asemassa. Ekologian linjan sisällä on mahdollisuus erikoistua biodiversiteettitutkimukseen. Biologisten sivuaineopintojen lisäksi ovat useimmiten tarpeen tilastotieteen ja tietojenkäsittelyn hyvät perustiedot. Linja tarjoaa tiedolliset valmiudet tutkijantyöhön erikoistumiseen sekä kotimaisiin ja kansainvälisiin ympäristöalan asiantuntijatehtäviin. Ekologian linjan opinnot sisältävät paljon valinnaisia jaksoja, ja siksi opiskelijan on syytä linjavalintavaiheessa tehdä henkilökohtainen opintosuunnitelma neuvontaassistentin kanssa. PÄÄAINEEN OPINNOT Biodiversiteettitutkimukseen erikoistuville pakollisissa opintojaksoissa on nimen perässä suluissa B, ja muille pakollisissa opintojaksoissa E PERUSOPINNOT (6 ov) EKOL1000 Ekologian ja evoluutiobiologian perusteet (B, E) 3 ov BDIV1014 Systematiikan ja biodiversiteettitutkimuksen perusteet (B, E) 3 ov AINEOPINNOT (B vähintään 39 ov, E vähintään 30 ov) Populaatio- ja yhteisöekologia (B vähintään 10 ov, E vähintään 9 ov) EKOL2001 Perustuotantoekologia (B, E) 1 ov EKOL2101 Yksilö- ja populaatioekologian luennot (B, E) 4 ov EKOL2102 Yhteisö- ja ekosysteemiekologian luennot (B, E) 4 ov EKOL2103 Ekologian laboratoriokurssi 2 ov EKOL2104 Populaatioekologian laskuharjoitukset 1 ov Yhteisöekologian laskuharjoitukset (B) 1ov Evoluutiotutkimus ja eliömaantiede (B vähintään 4 ov, E vähintään 2 ov) EKOL2201 Evoluutiotutkimuksen perusteet (B, E) 2 ov TAKS3400 Eliömaantiede (B) 2 ov TAKS 3402 Eliömaantieteen kirjallisuuskuulustelu 1,5 ov http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (1 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA BDIVxxxx Tropiikin ekosysteemit 3 ov EKOL2202 Elinkiertojen ekologia EKOL2203 Käyttäytymisekologia EKOL2204 Luonnonvalinnan teoria EKOL2205 Sukupuolivalinnan teoria EKOL2106 Kasvien lisääntymisekologia Lajintuntemus ja eliöiden rakenne (vähintään 3 ov) TAKS2110 Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus (B, E) 1 ov TAKS2112 Selkärankaisten lajintuntemus (B, E) 1 ov TAKS1102 Selkärangattomien lajintuntemus (B, E) 1 ov TAKS2111 Hyönteisten lajintuntemus 1 ov TAKS1104 Jäkälien lajintuntemus 1 ov TAKS1106 Sammalten lajintuntemus 1 ov TAKS1108 Hyötykasvien lajintuntemus 1 ov TAKS2109 Makrosienten lajintuntemus 1 ov TAKS3803 Havupuukurssi 1 ov TAKS3804 Dendrologia 2 ov TAKS3805 Makrosienten syvennetty lajintuntemus 2 ov KAEK4566 Trooppiset kasviheimot 1-2 ov Lapin putkilokasvien lajintuntemus 1 ov TAKS3806 Siemenkasvien syvennetty lajintuntemus 1 ov TAKS 1301 Kasviorganologia 1 ov Selkärangattomien anatomia 1 ov ELFY4959 Selkärankaisten anatomia 1 ov Kenttäkurssit (B 5 ov, E vähintään 2 ov) EKOL2301 Maaselkärankaisten kenttäkurssi (B) 1 ov EKOL2302 Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi (B) 1 ov EKOL2303 Maaselkärangattomien kenttäkurssi (B) 1 ov EKOL2304 Murtovesiekologian kenttäkurssi (B) 1 ov EKOL2305 Sisävesiekologian kenttäkurssi (B) 1 ov Metodiikka (B vähintään 8 ov, E vähintään 12 ov) BIOL4001 Atk:n ja mikroluokan käytön perusteet (B, E) 1 ov BIOL4002-4003 Tekstinkäsittely- ja taulukkolaskentaohjelmakurssit 2 ov EKOL2401 Biostatistiikan peruskurssi (B, E) 3 ov EKOL2402 Ekologinen aineisto ja analyysi: luennot (E) 2 ov http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (2 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA EKOL2403 Ekologinen aineisto ja analyysi: harjoitustyöt (E) 4 ov Eliöyhteisöekologian menetelmäkurssi (B) 2 ov Biodiversiteettitutkimus (B vähintään 7 ov, jossa mukana ainakin 1 eliökunnan monimuotoisuuskurssi) BDIVxxxx Principles of Biological Diversity (B) 1 ov BDIV1011 Luonnon monimuotoisuus ja sen suojelu Suomessa (B) 2 ov TAKS2201 Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi (B) 2 ov TAKS1109 Eliökunnan monimuotoisuus: Kasvikunta 2 ov TAKS1103 Eliökunnan monimuotoisuus: Sienikunta 1 ov TAKS1101 Eliökunnan monimuotoisuus: Eläinkunta 1 ov TAKS4113 Eliökokoelma 1-3 ov TAKS3801 Putkilokasvisystematiikan jatkokurssi 2 ov Kasvillisuustutkimuksen kurssi 1 2 ov BDIV1015 Aineopintojen loppukuulustelu 2-4 ov Soveltava ekologia (vähintään 2 ov) Ekologinen ympäristötutkimus EKOL2501 Riistabiologia EKOL2502 Kalabiologia EKOL2503 Vesiekologia EKOL2504 Tuhoeläinbiologia EKOL2505 Metsäekologia EKOL2506 Sieniekologia EKOL2507 Viljelykasvit EKOL2603 Vuoristojen ekologia Saaristojen ekologia Saastumisekologia Aerobiologinen kurssi Mikrofossiilikurssi [EKOL2700 LuK tutkielma 3 ov] EKOLOGIAN SYVENTÄVÄT OPINNOT (vähintään 55 ov) GENE4917 Biologian historia (B, E) 1 ov BDIV1012 Paikkatietojärjestelmien (GIS) ja kaukokartoituksen käyttö biodiversiteettitutkimuksessa (B) 1-2 ov BDIV1013 Advanced Issues in Biodiversity (B) 2 ov http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (3 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA BDIV1010 Biologien koulutus asiantuntijatehtäviin (B, E) 2 ov EKOL3002 Ekologisen tutkimuksen kurssi (B, E) 5 ov EKOL3001 Tutkimusprojekti (B, E) 4-10 ov EKOL3003 Ekologian ja biodiversiteettitutkimuksen esitelmäsarja (B, E) 1 ov EKOL3004 Vierailijaseminaari (B, E) 1 ov EKOL3005-3006 Tieteellinen esitystaito (B, E) 4 ov Muut syventävät luennot, kurssit ja seminaarit 0-8 ov EKOL3007 Työharjoittelu (B, E) 1-3 ov EKOL3008-3009 Loppukuulustelut (B, E) 8-12 ov EKOL3012 Pro gradu -tutkielma (B, E) 20 ov SIVUAINEIDEN OPINNOT (vähintään 30 ov) Pakolliset sivuaineopinnot (9 ov) Biologian muiden linjojen perusteet 9 ov Suositeltavia sivuaineopintoja (valitaan suuntautumisen mukaan) GENE4921 Populaatiogenetiikka 1 ov GENE5007 Genetiikan jatkoluennot 3 ov ELFY4953 Eläinten ekofysiologian luennot 1 ov ELFY4956 Solubiologia 1 ov ELFY4957-4958 Kehitysbiologian perusteet 2 ov ELFY4960 Koe-eläintiede 2 ov ELFY4964 Mikroskooppitekniikat 3 ov KAFY3013 Elektronimikroskopia 2 ov KAFY4522-4523 Kasvianatomia ja -kehitysmorfologia 3 ov KAFY4153-4154 Kasvifysiologia ja -molekyylibiologia: luennot 1 ja 2. 2 ov KAFY4156 Molekyylibiologian perusteet 1 ov KAFY4198 Kasvien ekofysiologian luennot 1 ov KAFY4199 Kasvien ekofysiologian harjoitustyöt 2 ov XBIO4203 Solu- ja molekyylibiologian harjoitustyöt 2 ov MAAN1102 Kartografian perusteiden luennot 1 ov MAAN9602 Luonnonmaantieteen perusteiden luennot 1,5 ov MAAN9904 Johdatus tietokonekartografiaan 1 ov MAAN9614 Biogeografian ja geoekologian luennot 1 ov YMPS1006 Maailmanlaajuiset ympäristöongelmat 2 ov YMPS6018 Itämeren ympäristön tila ja tulevaisuus 1 ov Kemian kurssi biologeille: luennot 2 ov Tilastomenetelmien hallintaan johdattavia opintoja http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (4 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA VAIHTOEHTOISET SIVUAINEIDEN OPINNOT Sivuaineista on muodostuttava ainakin kaksi 15 ov sivuainetta, joista ainakin toinen on biologian ulkopuolelta tai yksi 35 ov sivuaine. Ekologian ja biodiversiteettitutkimuksen sivuaineeksi soveltuvat mm. ympäristönsuojelu, maantiede, geologia, tilastotiede, tietojenkäsittely, sovellettu matematiikka, fysiikka, kemia, biokemia, lääketieteelliset opinnot, filosofia, kaupalliset aineet, kasvatustieteet, oikeustieteet, hallintotieteet. Myös muussa oppilaitoksessa tai ulkomailla suoritettuja opintoja voidaan käyttää täydentämään sivu- ja pääaineopintoja. Huomaa myös esim. Åbo Akademin meribiologian tai solubiologian opetus. Suorittamalla 35 ov:n opettajan pedagogiset opinnot kasvatustieteellisessä tiedekunnassa osana tutkintoa tai sen jälkeen saa yleisen opettajapätevyyden linjavalinnoista riippumatta. Tämän lisäksi tietyn oppilaitoksen virkaan voidaan vaatia myös muita aineopintoja. Esimerkiksi opettamaan biologiaa peruskou-lussa tai lukiossa on tutkijalinjalainen pätevä, jos hän sisällyttää ekologian valinnaisiin aineopintoihin riittävästi (kts. opettajalinja) muiden biologisten aineiden opintoja. Moniin lehtoraatteihin vaaditaan lisäksi aineopinnot toisesta opetettavasta aineesta, mikä ylittää minimiaineyhdistelmän 10-20 ov. Pakolliset kieli- ja viestintäopinnot (3 ov) Toinen kotimainen kieli 1 ov Englannin kieli (tekstin ymmärtäminen) 1 ov Englannin kieli (osana ekologisen tutkimuksen kurssia) 1 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö Aineopinnot Populaatio- ja yhteisöekologia Sisältö: Populaatio- ja yhteisötason ilmiöiden ja niitä koskevien teorioiden tarkastelu ja soveltaminen. Tämä opintojakso on oltava suoritettuna ennen syventävien opintojen aloittamista. Opintojakso koostuu seuraavista osista: 1. Perustuotantoekologia (1 ov) 2. Yksilö- ja populaatioekologian luennot ja kirjatentti (4 ov) 3. Yhteisö- ja ekosysteemiekologian luennot ja kirjatentti (4 ov) 4. Ekologian laboratoriokurssi (2 ov) 5. Populaatioekologian laskuharjoitukset (1 ov) 6. Yhteisöekologian laskuharjoitukset (1 ov) Esitiedot: Ekologian ja evoluutiobiologian perusteet. Suoritustavat: Luennot ja harjoitukset kuulusteluineen. Aineenopettajat, jotka eivät ota ekologiaa syventävinä opintoina, suorittavat opintojaksosta vain luennot tenttimällä ne http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (5 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA erillisessä tentissä. Kaikki muut opintojakson suorittajat tenttivät luennot ja ensimmäisen alla mainituista kirjoista yhdessä luentoja vastaavasti kahdeksi tentiksi jaettuna, ensimmäinen osa 2. opintovuoden kevätlukukauden alussa ja toinen 3. syyslukukauden alkuun mennessä. Kirjallisuus: Begon M., Harper J.L. & Townsend, C.R. 1996. Ecology: Individuals, populations and communities (3. painos). Blackwell. Krebs, C. 1999. Ecological Methodology. Harper & Row. Evoluutiotutkimus ja eliömaantiede Sisältö: Opintojakso perehdyttää syvällisesti evoluutioteoriaan ja tarkastelee evoluution ilmenemistä eri eliöryhmissä ja ekologisissa vuorovaikutuksissa. Opintojaksoon sisältyy yksi pakollinen kurssi: 1. Evoluutiotutkimuksen perusteet (2 ov) ja yksi biodiversiteettitutkimukseen erikoistuville pakollinen kurssi: 2. Eliömaantiede (2 ov) Esitiedot: Ekologian ja evoluutiobiologian perusteet. Suoritustapa: Luennot ja loppukuulustelu Lisäksi tarjolla on aika ajoin erikseen ilmoitettavia valinnaisia kursseja kuten: 3. Tropiikin ekosysteemit 4. Elinkiertojen ekologia 5. Käyttäytymisekologia 6. Luonnonvalinnan teoria 7. Sukupuolivalinnan teoria 8. Kasvien lisääntymisekologia Kirjallisuus: Opetuksessa käytetään esim. seuraavia kirjoja: Futuyma, D.J. 1997. Evolutionary biology. Sinauer. Cockburn, A. 1996. An introduction to evolutionary ecology. Blackwell. Stearns, S.C. & Hoekstra, R.F. 2000. Evolution. Oxford. Lajintuntemus ja eliöiden rakenne Sisältö: Tähän jaksoon sisältyvät kurssit antavat perustiedot eliöiden rakenteesta ja lajintuntemuksesta. Opintojaksoon sisältyy kolme pakollista lajintuntemuskurssia, jotka on tarkoitettu suoritettaviksi heti perusopintojen jälkeen. Kasviorganologian kurssi suositellaan käytäväksi ennen kasvien lajintuntemuskurssia. Pakolliset lajintuntemuskurssit: 1. Kotimaisten putkilokasvien lajintuntemus (1 ov) 2. Selkärankaisten lajintuntemus (1 ov) 3. Selkärangattomien lajintuntemus (1 ov) Valinnaisia lajintuntemuskursseja: 4. Hyönteisten lajintuntemus (1 ov) 5. Jäkälien lajintuntemus (1 ov) 6. Sammalten lajintuntemus (1 ov) http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (6 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA 7. Hyötykasvien lajintuntemus (1 ov) 8. Makrosienten lajintuntemus (1 ov) 9. Havupuukurssi (1 ov; parillisten vuosien keväällä) 10. Dendrologia (1 ov) 11. Makrosienten syvennetty lajintuntemus (2 ov) 12. Trooppiset kasviheimot (1-2 ov; parittomien vuosien syksyllä) 13. Lapin putkilokasvien lajintuntemus (1 ov; parittomien vuosien keväällä) 14. Kotimaisten putkilokasvien syvennetty lajintuntemus (1 ov; parittomien vuosien syksyllä) Valinnaisia eliöiden rakenteeseen liittyviä kursseja: 15. Kasviorganologia (1 ov) 16. Selkärangattomien anatomia (1 ov) 17. Selkärankaisten anatomia (1 ov) Suoritustapa: Demonstraatiot, harjoitustyöt ja kuulustelut. Kirjallisuus: Opetus pohjautuu monisteisiin, luennoilla ja kursseilla jaettavaan materiaaliin ja määritysoppaisiin. Ekologian kenttäkurssit Sisältö: Ekologisten tutkimusmenetelmien soveltaminen käytännön kenttä- ja laboratoriotöihin sekä lajintuntemuksen syventäminen. Suoritus toisena kesänä. Kurssit koostuvat viidestä osasta, joista jokaisen laajuus on 1 ov. Biodiversiteettitutkimukseen erikoistuville ovat kaikki osat pakollisia, muille vain 2 ov pakollista: 1. Maaselkärankaisten kenttäkurssi 2. Terrestrisen kasviekologian kenttäkurssi 3. Maaselkärangattomien kenttäkurssi 4. Murtovesiekologian kenttäkurssi 5. Sisävesiekologian kenttäkurssi Kursseille pääsyä voidaan joutua rajoittamaan, jolloin etusija on niillä opiskelijoilla, joille kurssi on pakollinen (ekologia pääaineena tai aineenopettajan linjalle valitut). Yksittäisten kenttäkurssien suorittaminen on myös mahdollista. Esitiedot: Selkärankaisten, selkärangattomien ja putkilokasvien lajintuntemuskurssit. Suoritustavat: Maastossa ja laboratoriossa tehtävät harjoitukset työselostuksineen. Kirjallisuus: Tausta-aineistoina määritysoppaat, osaston tuottamat kenttäkurssioppaat ja mm. seuraavat kirjat: Brower, J., Zar, J. & Von Ende, C. 1990. Field and Laboratory Methods for General Ecology. 4. painos. Wm.C. Brown Publishers. Cox, G.W. Laboratory Manual of General Ecology. 6. painos. Wm.C. Brown Publishers. Ekologian metodiikka Sisältö: Opintojaksossa opetellaan biologiassa käytettävät tilastotieteelliset perus-menetelmät ja tilasto-ohjelmien käyttöä. Tämän jälkeen perehdytään vaati-vam-piin ekologisiin analyysimenetelmiin ja niiden soveltamiseen käytännön tutki-muksessa. Kurssisarjan tavoitteena on saavuttaa hyvä kyky ymmärtää kvan-ti-ta-tii-vis-ta analyysia sisältävää http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (7 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA ekologista kirjallisuutta ja itse tuottaa analyysejä ymmär-ret-tä-väs-sä ja tilastollisesti korkeatasoisessa muodossa. Opintojakso koostuu viidestä osasta, joista kurssit 1-3 ovat vaatimuksena muille pääsyyn. Kurssi 4 keskittyy varianssianalyysiin ja lineaarisiin malleihin. Kurssi 5 keskittyy monimuuttujamenetelmiin ja sille pääsyn edellytyksenä on yhteisöekologian laskuharjoitusten suorittaminen. 1. Atk:n ja mikroluokan käytön perusteet (1ov) 2. Tekstinkäsittely- ja taulukkolaskentaohjelmakurssit (2 ov) 3. Biostatistiikan peruskurssi (3 ov) 4. Ekologinen aineisto ja analyysi: luennot ja harjoitukset (2+4 ov) 5. Eliöyhteisöekologian menetelmäkurssi (2 ov) Suoritustapa: Luennot, demonstaatiot, harjoitukset, lopputyö ja loppukuulustelu tai päätöstentti. Kirjallisuus: Opetus pohjautuu omiin kurssimonisteisiin, ohjelmisto-oppaisiin sekä mm. seuraaviin kirjoihin: Jongman, R.H.G., ter Braak, C.J.F. & van Tongeren, O.F.R. (toim.) 1995. Data analysis in community and landscape ecology. (3.) Ranta E., Rita, H. & Kouki, J. 1992. Biometria (4. tai uudempi painos). Yliopistopaino. (1. & 2.) Scheiner, S.M. & Gurevitch, J. (toim.) 1993. Design and analysis of ecological experiments. Chapman & Hall. (2.) Sokal, R.R. & Rohlf, F.J. 1995. Biometry. WH Freeman. (1. & 2.) Underwood, A.J. 1996. Experiments in ecology. Cambridge University Press. (2.) Zar, J. 1995. Biostatistical Analysis. Prentice Hall. (1. & 2.) Biodiversiteettitutkimus Sisältö: Perustiedot eliökunnan monimuotoisuudesta, siihen kohdistuvista uhkista, monimuotoisuuden tilasta sekä biodiversiteetin tutkimusmenetelmistä. Suoritustapa: Kurssikohtaiset luennot, harjoitukset, loppukuulustelu. 1. Principles of Biological Diversity (1 ov) 2. Luonnon monimuotoisuus ja sen suojelu Suomessa (2 ov) 3. Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi (2 ov) 4. Eliökunnan monimuotoisuus: Kasvikunta (2 ov) 5. Eliökunnan monimuotoisuus: Sienikunta (1 ov) 6. Eliökunnan monimuotoisuus: Eläinkunta (1 ov) 7. Eliökokoelma (1-3 ov) 8. Siemenkasvisystematiikan jatkokurssi (2 ov) 9. Kasvillisuustutkimuksen kurssi (1-2 ov) 10. Aineopintojen loppukuulustelu (2-4 ov) Soveltava ekologia Sisältö: Perehtyminen ekologian soveltamiseen erilaisiin käytännön kysymyksiin. Ohjelma http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (8 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA vaihtelee vuosittain, mutta mm. seuraavat aihepiirit toistuvat aika-ajoin: 1. Ekologinen ympäristötutkimus (1-2 ov): Perehtyminen ihmisen aiheuttamien ympäristömuutosten ekologisiin seurauksiin ja niiden tutkimusmenetelmiin. 2. Riistabiologia (1 ov): Riistaeläinten biologiaan ja tutkimusmenetelmiin perehtyminen. 3. Kalabiologia (1-2 ov): Perehtyminen käytännön kalatutkimukseen 4. Vesiekologia (1-2 ov): Perehtyminen vesieliöiden ekologiaan ja vesiekosysteemin toimintaperiaatteisiin. 5. Tuhoeläinbiologia (1 ov): Perehtyminen maa- ja metsätalouden tärkeimpiin tuhoeläimiin sekä niiden ekologiaan ja torjuntamenetelmiin (mm. biologinen torjunta). 6. Metsäekologia (parillisten vuosien keväällä) 7. Sieniekologia 8. Viljelykasvien ekologia (1 ov): Suoritetaan tenttimällä Rousi, A. 1997. Auringonkukasta viiniköynnökseen. 9. Vuoristojen ekologia (parillisten vuosien keväällä) 10. Saaristoekologia (parittomien vuosien keväällä) 11. Saastumisekologia 12. Aerobiologian kurssi 13. Mikrofossiilikurssi Valinnaiset ekologian opinnot Sisältö: Osasto järjestää valinnaisia luentoja ja kursseja resurssien ja opet-ta-javoi-mien sallimissa rajoissa. Valinnaiset kurssit kelpaavat pääsääntöisesti (sovittava opettajien kanssa) sekä aine- että syventäviin opintoihin. Myös FM-tutkintoon sisäl-tyvä LuK -tutkielma luetaan valinnaisiksi opinnoiksi. Valinnaisten kurssien epä-sään--nöllisen tarjonnan vuoksi ilmoitustauluja kannattaa seurata tiiviisti. Syventävät opinnot Ekologian syventävien opintojen valinnaiset kurssit Sisältö: Aineopintoihin sisältyvien valinnaisten kurssien lisäksi osasto järjestää mahdollisuuksien mukaan tiettyyn erikoisalaan liittyviä valinnaisia syventäviä kursseja. Osa opetuksesta annetaan englanniksi. Kursseista ilmoitetaan ilmoitustaululla. Ekologisen tutkimuksen kurssi (5 ov) Sisältö: Tieteelliseen, erityisesti ekologiseen metodiin perehdyttäminen ja tieteen tekemisen kaikkiin vaiheisiin harjaannuttaminen. Osa kieliopinnoista (vieras kieli 1 ov) suoritetaan tämän kurssin yhteydessä tekemällä harjoitustyön raportti ja siihen pohjautuva esitelmä englanniksi Kielikeskuksen ohjauksen tukemana. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (9 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA Esitiedot: Ekologian metodiikka kokonaisuudessaan. Suoritustavat: Luentoja tieteellisestä metodista, ekologisen tutkimuksen suunnittelusta, rahoituksesta, ekologin työmahdollisuuksista ja tieteellisen työn tulosten raportoinnista. Tutustuminen ekologiseen kirjallisuuteen. Laaja harjoitustyö. Biologian historia (1 ov) Sisältö: Kirjatentti. Ks. Genetiikan linja. Paikkatietojärjestelmien (GIS) ja kaukokartoituksen käyttö biodiversiteettitutkimuksessa (1-2 ov) Sisältö: Paikkatietojärjestelmät (Geographical Information Systems, GIS) ovat tietokoneavusteisia menetelmiä, joiden avulla voidaan järjestää ja analysoida lajeihin ja ekosysteemeihin liittyviä laajoja tietoaineistoja, kuten kaukokartoituksessa käytettäviä ilmavalokuvia ja satelliittikuvia. Näiden menetelmien käyttö on keskeisellä sijalla modernissa eliömaantieteellisessä ja ekologisessa tutkimuksessa, ja niitä käytetään myös ympäristöhallinnon ja asiantuntijatehtävien yhteydessä erilaisten biodiversiteettiselvitysten ja arvioiden laadinnassa. Opintojakso koostuu seuraavista osista: 1. Luento-osa ja kirjatentti (yht. 1 ov) 2. Demonstraatio-osa, jossa esitellään menetelmien soveltamista käytännössä (1 ov) Esitiedot: Kurssille osallistuvien oletetaan hallitsevan sekä perinteisen että tietokoneavusteisen kartografian perusteet. Nämä valmiudet voi hankkia esim. suorittamalla maantieteen laitoksella luennot MAAN1002 ja MAAN9904. Suoritustavat: Luennot ja harjoitukset kuulusteluineen. Advanced Issues in Biodiversity (2 ov) Sisältö: Kurssi perehdyttää opiskelijat biodiversiteettiin liittyviin ajankohtaisiin tutkimus- ja selvityshankkeisiin. Pääpaino on soveltavassa tutkimuksessa, erityisesti biodiversiteettisopimuksen toimialaan liittyvissä kysymyksissä (mm. maa- ja alueselvitykset, biodiversiteetin suojelustrategiat, sosioekonomiset kysymykset, biodiversiteetin lainsäädäntö). Suoritustapa: Ryhmätöinä kirjoitettavat esseet, luennot, seminaarit ja tentti. Kirjallisuus: Opetuksessa käytetään mm. seuraavia kirjoja: UNEP 1995. Global Biodiversity Assessment. Academic Press. Krattiger et al. (toim.) 1994. Widening Perspectives on Biodiversity. IUCN and The International Academy of the Environment. Biologien koulutus asiantuntijatehtäviin (2 ov) Sisältö: Biologeille on avautunut joukko uusia työmahdollisuuksia kansallisina ja kansainvälisinä asiantuntijoina mm. kehitysyhteistyön, YK:n, järjestöjen ja yksityisen sektorin http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (10 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA piirissä. Toimiminen näissä tehtävissä poikkeaa usein paljon traditionaalisesta tutkijan toimenkuvasta. Toisaalta tutkijakoulutus antaa hyvän pohjan myös toimimiseen asiantuntijatehtävissä. Kurssilla käsitellään mm. projektityön ja kehitysyhteistyöhankkeiden perusteita, konsulttitoimintaa, toimimista kansainvälisissä järjestöissä, luonnonsuojelubiologian soveltamista ympäristöhankkeisiin, raportoinnin tekniikoita ja ympäristönsuojeluun liittyviä poliittisia kysymyksiä. Suoritustapa: Ryhmätöinä kirjoitettavat esseet, luennot, seminaarit ja tentti. Ekologisen tutkimuksen kurssi (5 ov) Sisältö: Tieteelliseen, erityisesti ekologiseen metodiin perehdyttäminen ja tieteen tekemisen kaikkiin vaiheisiin harjaannuttaminen. Osa kieliopinnoista (englannin kieli 1 ov) suoritetaan tämän kurssin yhteydessä tekemällä harjoitustyön raportti ja siihen pohjautuva esitelmä englanniksi Kielikeskuksen ohjauksen tukemana. Esitiedot: Ekologian metodiikka. Suoritustavat: Luentoja tieteellisestä metodista, ekologisen tutkimuksen suunnittelusta, rahoituksesta, ekologin työmahdollisuuksista ja tieteellisen työn tulosten raportoinnista. Tutustuminen ekologiseen kirjallisuuteen. Laaja harjoitustyö. Tutkimusprojekti (4-10 ov) Sisältö: Osallistuminen usean kuukauden pituisen käytännön tutkimusprojektin suunnitteluun, toteutukseen ja raportointiin. Opintojaksoon kuuluu myös luentoja ja seminaareja tutkimuksen aihepiiristä. Esitiedot: Aineopinnot ja ekologisen tutkimuksen kurssi. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen. Vuosittain pyritään järjestämään 1-2 osaston tutkimusaloja koskevaa projektia. Ekologian ja biodiversiteettitutkimuksen esitelmäsarja (1 ov) Sisältö: Lähinnä kotimaisten vierailijoiden ja osaston omien tutkijoiden esitelmiä ajankohtaisista tutkimusaiheista. Suoritustapa: Osallistuminen kuulijana ja keskustelijana 20 esitelmävierailuun toisen opintovuoden syksystä alkaen. Vierailijaseminaari (1 ov) Sisältö: Ulkomaisten vierailijoiden englanninkieliset esitelmät. Suoritustapa: Aktiivinen osallistuminen vierailuesitelmätilaisuuksiin kuulijana ja tiivistelmän laatiminen kymmenestä esitelmästä vierailun isäntänä toimivalle opettajalle tai tutkijalle. Vierailijaseminaareihin ovat tervetulleita kaikki opiskelijat, mutta opintosuoritusta varten tehtävien tiivistelmien tekemisen voi aloittaa vasta kun pääaine on valittu. Mahdollisimman http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (11 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA moneen esitelmätilaisuuteen osallistumalla opiskelija saa laaja-alaisen näkemyksen osaston edustamien tutkimusalojen kansainvälisistä yhteyksistä ja ajankohtaisista näkökulmista. Tieteellinen esitystaito (4 ov) Sisältö: Harjoitusaine- ja gradukurssi, esitelmä- ja posterikurssi. Kursseilla käsitellään kunkin opiskelijan pro gradu -työn aihetta ja annetaan ohjeita pro gradu -työn ja harjoitusaineen kirjoittamiseen sekä opastetaan tieteellisten postereiden ja esitelmien laadintaan ja esittämiseen. Käytännön harjoituksena kukin opiskelija laatii ohjattuna yhden harjoitusaineen ja posterin sekä pitää yhden esitelmän. Loppukuulustelut (8-12 ov) Tentitään yleensä kahtena viiden opintoviikon kuulusteluna. Lopputenttiin kannattaa valita uusimpia kirjoja oman kiinnostuksen mukaisesti. Tentittävät kirjat tai artikkelit sovitaan hyvissä ajoin professorin kanssa. Esimerkkejä sopivista kirjoista löytyy edellisten opintojaksojen kirjallisuudesta ja alla olevasta luettelosta. Evolutiivinen ekologia ja populaatioekologia Andersson, M. 1994. Sexual selection. Princeton. Avise, J.C. 1994. Molecular markers, natural history and evolution. Chapman & Hall. Cappuccino, N. & Price, P.N. 1995. Population dynamics: New approaches and synthesis. Academic Press. Crawley M.J. (toim.) 1997. Plant ecology. Blackwell Science. Deacon, J.W. 1997. Modern mycology. Blackwell. Endler, J. 1986. Natural selection in the wild. Princeton. Falconer, D.S. & Mackay, T.F.C. 1996. Introduction to quantitative genetics. Longman. Freeman, S. & Herron, J.C. 1998. Evolutionary analysis. Prentice Hall. Futuyma, D.J. 1997. Evolutionary biology. Sinauer. Geber, M.A., Dawson, T.E. & Delph, L.F. (toim.) 1999. Gender and sexual dimorphism in flowering plants. Springer. Krebs, J.R. & Davies, N.B. 1997. Behavioural Ecology: An Evolutionary approach. Blackwell. Manly J.A. 1985. The statistics of natural selection. Chapman & Hall. Niklas, K.J. 1997. The evolutionary biology of plants. Chicago University Press. Ridley, M. 1996 Evolution. Blackwell Science. Roff, D. A. 1992. The evolution of life histories. Chapman & Hall. Schlichting, C.D. & Pigliucci, M. 1998. Phenotypic evolution. A reaction norm perspective. Sinauer. Silvertown, J., Franco, M. & Harper, J.L. (toim.) 1997. Plant life histories. Ecology, phylogeny and evolution. Cambridge University Press. Speight, M.A., Hunter, M.D. & Watt, A.D. 1999. Ecology of insects. Concepts and applications. Blackwell Science. Stearns, S.C. & Hoekstra, R.F. 2000. Evolution. Oxford. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (12 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA Sutherland, W.J. 1996. From individual behaviour to population ecology. Oxford University Press. Vuorisalo, T. & Mutikainen, P. (toim.) 1999. Life history evolution in plants. Kluwer. Wyatt, R. (toim.) 1996. Ecology and evolution of plant reproduction. New approaches Kasvi-herbivorisuhde Fritz, R.S. & Simms, E.L. 1992. Plant resistance to herbivores and pathogens: Ecology, Evolution and Genetics. Karban, R. & Baldwin, I.T. 1997. Induced responses to herbivory. University of Chicago Press. Olff, H., Brown, V.K. & Drent, R.H. (toim.) 1999. Herbivores: Between plants and predators. Blackwell Science. Tallamy, D.W. & Raupp, M.J. 1991. Phytochemical induction by herbivores. John Wiley. Tollrian, R. & Harvell, C.D. (toim.) 1999. The ecology and evolution of inducible defenses. Princeton University Press. Akvaattinen ekologia Allan, J.D. 1995. Stream ecology. Structure and function of running waters. Chapman & Hall. Gerking, S.D. 1994. Feeding ecology of fish. Academic Press. Horne, A. J. & Goldman, C.R.1994. Limnology, 2. painos. McGraw-Hill. Lampert, W. & Sommer, U. 1997. Limnoecology. The ecology of lakes and streams. Oxford University Press. Levinton, J.S. 1995. Marine biology. Function, biodiversity, ecology. Oxford University Press. Moss, B. 1998. Ecology of fresh waters: Man and medium. Blackwell. Scheffer, M. 1997 Ecology of shallow lakes. Chapman & Hall. Wetzel, R.G. 1983. Limnology, 2. painos. Saunders. Wootton, R.J. 1998. Ecology of teleost fishes. Chapman & Hall. Ekologian metodiikka Hairston, N.G., Sr.1989. Ecological experiments. Cambridge University Press. Jongman, R.H.G., ter Braak, C.J.F. & van Tongeren, O.F.R. (toim.) 1995. Data analysis in community and landscape ecology. Krebs, J. 1998. Ecological methodology. Addison Wesley Longman. Manly, B.F.J. 1992. The design and analysis of research studies. Cambridge University Press. Legendre, P. & Legendre, L. 1998. Numerical ecology. Scheiner, S.M. & Gurevitch, J. (toim.) 1993. Design and analysis of ecological experiments. Chapman & Hall. Underwood, A.J. 1996. Experiments in ecology. Cambridge University Press. Biodiversiteettitutkimus Bell, P. 1992. Green Plants. Their origin and diversity. Berkes, F. & Folke, C. 1998. Linking social and ecological systems. Management practices and social mechanisms for building resilience. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (13 of 14)13.2.2006 15:22:31

EKOLOGIAN LINJA Daily, G.C. 1997. Nature's services. Societal dependence on natural ecosystems. Eggleton, P. & Vane-Wright, R. (toim.) 1994. Phylogenetics and ecology. Gaston, K.J. (toim.) 1996. Biodiversity: a biology of numbers and difference. Graham, L. 1993. Origins of land plants. Hawksworth, D.L. ym. (toim.) 1997. Biodiversity information: needs and options. Huston, M.A. 1996. Biological diversity.the coexistence of species in changing landscapes. Krattiger, A.F. ym. 1994. Widening perspectives on biodiversity. Rosenzweig, M.L. 1995. Species diversity in space and time. Smith, A.B. 1994. Systematics and the fossil record. Discovering evolutionary patterns. Taylor, D.W. & Hickey, L.J. 1996. Flowering plant origin, evolution and phylogeny. UNEP 1995. Global biodiversity assessment. Kieli- ja viestintäopinnot (väh. 3 ov) Sisältö: Kirjallisuuden käytön ja tutkimustulosten raportoinnin edellyttämien kirjallisten ja suullisten valmiuksien hankkiminen. Suoritustavat: Toinen kotimainen kieli (1 ov) ja enlannin kielen kirjallinen osuus (1 ov) suoritetaan kielikeskuksen kurs-seilla. Laitoksen järjestämään opetukseen kuuluu opintojaksoja, joiden eng-lan-ninkieliset raportit ja seminaarit yhdessä kielikeskuksen antaman tuen kanssa tuottavat 1 ov englannin kielen opintoja. Kielikeskuksen kurssitarjontaa kannattaa hyödyntää. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/ekologianl.htm (14 of 14)13.2.2006 15:22:31

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA Eläinfysiologian linjalla opetetaan eläinten ja ihmisen elintoimintoja, niiden säätelyä molekyyli-, solu- ja organismitasolla, eläinten ympäristösopeutumien mekanismeja ja ympäristön saastumisen vaikutuksia eläimiin. Oppiaineen kokeellisesta luonteesta johtuen opetus painottuu käytännön laboratoriotyöhön. Eläinfysiologian laboratorion tutkimuksen painopisteitä ovat solubiologia ja solufysiologia, joissa tutkitaan erityisesti geeniekspression säätelyä, ohjattua solukuolemaa, solun sisäistä viestintää sekä solukalvon ja solun tukirangan toimintaa, kehitysbiologia, jossa tutkitaan sikiökauden aikaista sukupuolista erilaistumista ja ekotoksikologia, jossa selvitetään erityisesti eläinten lisääntymishäiriöiden syitä ja ympäristömyrkkyjen solu- ja populaatiotason vaikutuksia niin kaloja, lintuja kuin nisäkkäitä käyttäen. PÄÄAINEEN OPINNOT PERUSOPINNOT (3 ov) ELFY8004-8005 Eläinfysiologian perusteet 3 ov ELÄINFYSIOLOGIAN AINEOPINNOT (28 ov) ELFY#### Solubiologian luennot 1. 1 ov ELFY#### Solubiologian luennot 2. 1 ov ELFY4957-4958 Kehitysbiologian luennot ja harjoitustyöt 2 ov KAFY4156 Molekyylibiologian perusteet 1 ov XBIO4203 Solu- ja molekyylibiologian harjoitustyöt 2 ov ELFY4953 Eläinten ekofysiologian luennot 1 ov ELFY4967 Ekotoksikologian perusteet 1 ov ELFY4959 Selkärankaisten anatomia 1 ov ELFY4960 Koe-eläintiede 2 ov GENE4995 Fysiologian ja genetiikan seminaari 1 ov ELFY4964 Mikroskooppitekniikat 3 ov ELFY4972 Eläinfysiologian harjoitustyöt 5 ov ELFY4866-4867 Aineopintojen loppukuulustelut 7 ov [LuK -tutkielma 3 ov] ELÄINFYSIOLOGIAN SYVENTÄVÄT OPINNOT (55 ov) http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (1 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA GENE4917 Biologian historia 1 ov ELFY4969 Genetiikan ja fysiologian tutkijakurssi 2 ov ELFY4886-4887 Tutkijaseminaari 2 ov Syventävien opintojen luentoja ja kursseja 8-13 ov Luennot ja kurssit voidaan valita eläinfysiologian vuosittain vaihtelevan tarjonnan lisäksi muiden yliopistojen tarjoamista tai kansainvälisten yhteistyökumppaneiden järjestämistä erikoiskursseista. Kurssien yhteydessä kirjoitetaan harjoitusaine ELFY4883. ELFY4965 Tutkimusprojekti7-12 ov Projektin yhteydessä kirjoitetaan harjoitusaine ELFY4884 ELFY4900-4902 Syventävien opintojen loppukuulustelu(t) 10-12 ov ELFY4888 Pro gradu -tutkielma 20 ov SIVUAINEIDEN OPINNOT (ohjeelliset, sovitaan yksityiskohtaisesti linjan ohjaajien kanssa) Pakolliset biologian sivuaineopinnot (17 ov) Biologian muiden linjojen perusteet 12 ov Evoluutiotutkimuksen perusteet 2 ov Eliökunnan monimuotoisuus (eläintuntemuskurssit) 3 ov Biokemian opinnot (>= 12 ov) Biomolekyylit ja aineenvaihdunta (luennot) 3 ov Biokemian perustyömenetelmät 2 ov Biokemian perusharjoitustyöt 7 ov Muita biokemian opintoja Biokemian opintojen lisäksi tai sijasta voidaan opettajien kanssa tehtävän sopimuksen mukaan tutkintoon sisällyttää biokemian ja molekyylibiologian opintoja joko terveyden biotieteiden koulutusohjelmasta, lääketieteellisestä tiedekunnasta tai muista yliopistoista. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (2 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA Muut biologian tukiaineopinnot (9-14 ov) Kemian kurssi biologeille 3 ov luennot 2 ov harjoitustyöt 1 ov Tilastomenetelmien hallintaan johdattavia opintoja 3-7 ov ATK-laitteiden ja -ohjelmien hallintaan johdattavia opintoja 3-7 ov Vaihtoehtoiset sivuaineopinnot (30-36 ov) Sivuainekokonaisuuksiksi soveltuvat erityisesti genetiikan ja muut biologian linjat, mutta myös biokemia, bioteknologia, ympäristönsuojelu, maantiede ja useat lääketieteellisen tiedekunnan oppiaineet. Sivuaineet on valittava siten, että FM -tutkintoon sisältyy ainakin kaksi vähintään 15 ov:n sivuainetta. Vapaasti valittavat opinnot (>=2 ov) Voivat täydentää pää- tai sivuaineen opintoja tai kieliopintoja. Opinnot voidaan valita myös aineista, jotka eivät muuten kuuluisi sivuaineiden joukkoon ja niihin voi kuulua muissa oppilaitoksissa tai ulkomailla suoritettuja opintoja. Vapaasti valittaviin opintoihin kuuluu myös ELFY4921 Fysiologisen eläintieteen työharjoittelu (3 ov), jota järjestetään mahdollisuuksien mukaan eri harjoittelupai-koissa ja suositellaan suoritettavaksi syventävien opintojen alkuvaiheissa. KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT (3 OV) Äidinkieli (sis. yhden harjoitusaineen kielentarkastuksen) 1 ov Toinen kotimainen kieli 1 ov Muut kieliopinnot 1 ov Opintojaksojen tavoitteet ja sisältö Aineopinnot ELFY#### Solubiologia 1 (1 ov) ja ELFY#### Solubiologia 2 (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Solubiologian luennoilla perehdytään solujen hienorakenteeseen, rakenteen ja toiminnan yhteyksiin ja solutoimintojen säätelyn pääpiirteisiin. Suoritustavat: Luennot kuulusteluineen http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (3 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA ELFY4957-ELFY4958 Kehitysbiologian perusteet (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Jakson päämääränä on opettaa ymmärtämään eläinten yksilönkehityksen yleisiä perusmekanismeja ja säätelyä sukusolujen kehityksestä ja hedelmöityksestä elinaiheiden muodostukseen ja kasvuun. Harjoitustöissä perehdytään alkiokehitykseen mikroskooppipreparaatteja käyttäen. Suoritustavat: Luennot ja harjoitustyöt kuulusteluineen KAFY4156 Molekyylibiologian perusteet (1 ov) (Ks. Kasvifysiologia ja molekyylibiologia) XBIO4203 Solu- ja molekyylibiologian harjoitustyöt (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tarkoituksena on tutustuttaa opiskelijat solu- ja molekyylibiologian keskeisiin perusmenetelmiin käytännön harjoitusten avulla. Kurssilla suoritetaan plasmidi-dna: n puhdistusta ja restriktioanalyysiä, perehdytään DNA:n monistukseen polymeraasiketjureaktiotekniikalla (PCR) sekä tutustutaan proteiinien tunnistamiseen Western blotting-menetelmällä. Suoritustavat: Harjoitustyöt kuulusteluineen. Yhteydet muihin opintoihin: Kurssille pääsyn edellytyksenä on seuraavien luentosarjojen suorittaminen: KAFY 4156 Molekyylibiologian perusteet ja ELFY#### Solubiologia 1. ELFY4953 Eläinten ekofysiologian luennot (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Jakson päämääränä on opettaa, miten ympäristö vaikuttaa eläinten elintoimintoihin ja selvittää, mikä merkitys elintoimintojen säätelyllä on yksilöiden ja sitä kautta populaatioiden menestykseen. Suoritustavat: Luennot kuulusteluineen Yhteydet muihin opintoihin: Fysiologian perusteet on oltava suoritettuna ennen luennoille osallistumista. ELFY4967 Ekotoksikologian perusteet (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla perehdytään ympäristöön joutuvien kemikaalien leviämiseen ja muuntumiseen, kemikaalien kertymiseen eliöihin, vaikutuksiin eläimissä ja eritykseen. Lisäksi selvitetään, mitä fysiologisia ja biokemiallisia muuttujia käytetään hyväksi ympäristön tilan arvioinnissa (biomarkkerit). Suoritustavat: Luennot kuulusteluineen Yhteydet muihin opintoihin: Opintojakso suositellaan suoritettavaksi eläinten ekofysiologian luentojen jälkeen. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (4 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA ELFY4959 Selkärankaisten anatomia (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään eri selkärankaisryhmiä edustavien eläinten (etenkin nisäkäs, lintu ja kala) luuston, lihaksiston, hermoston ja verenkierron makroskooppiseen anatomiaan ja eri sisäelinten sijaintiin itsenäisen eläinten preparoinnin ja multimediamateriaalin avulla. Lisäksi kurssilla selvitetään anatomisen rakenteen ja toiminnan yhteyksiä. Suoritustavat: Harjoitustyöt, demonstraatiot ja kuulustelu Yhteydet muihin opintoihin: Kurssille osallistuminen edellyttää, että opiskelija on suorittanut fysiologian perusteet, solubiologian luennot 1 ja kehitysbiologian opintojaksot. ELFY4960 Koe-eläintiede (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään koe-eläinten käyttöön, tilanteisiin, joissa korvaavia menetelmiä voidaan käyttää ja koe-eläinlainsäädäntöön. Käytännön harjoittelussa perehdytään selkärankaisten käsittelyn perustekniikoihin erityisesti rottaa, hiirtä ja kaloja käyttäen. Kurssilla käytetään oheismateriaalina kirjaa Rottia Tutkijoita Tuloksia, T. Nevalainen, U.-M. Jaakkola, T. Kohila ja J. Pudas (toim.), FinLAS ry, 1995. Kurssi on koe-eläinlainsäädännön mukainen "opetusohjelmaan kuuluva koe-eläinten käyttöön opastava kurssi" ja on edellytyksenä itsenäiselle tieteellisten eläinkokeiden tekemiselle. Suoritustavat: Kurssia edeltää kirjan Rottia Tutkijoita Tuloksia, T. Nevalainen, U.-M. Jaakkola, T. Kohila ja J. Pudas (toim.), FinLAS ry, 1995 kuulustelu, joka on edellytyksenä harjoitustöihin osallistumiselle. Kurssi edellyttää aktiivista osallistumista harjoitustöihin. Yhteydet muihin opintoihin: Kurssille osallistuminen edellyttää, että opiskelija on suorittanut fysiologian perusteet, solubiologian luennot 1, kehitysbiologian opintojakson sekä selkärankaisten anatomian opintojakson. ELFY4964 Mikroskooppitekniikat (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on perehtyä valomikroskooppinäytteiden valmistukseen (parafiini- ja jääleiketekniikat sekä sivelyvalmisteet) sekä histokemiallisten ja immunosytokemiallisten menetelmien perusteisiin. Suoritustavat: Luennot, harjoitustyöt sekä kuulustelu tai työselostus/seminaariesitelmä Yhteydet muihin opintoihin: Eläinfysiologian perusteet, solubiologian luennot 1 ja kehitysbiologian opintojaksot ovat ehdottomana edellytyksenä kursseille osallistumiselle. Eläinfysiologian harjoitustyöt (5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehtyminen fysiologisessa tutkimuksessa käytettäviin menetelmiin pääasiassa käytännön harjoitustöiden avulla. Kurssi koostuu seuraavista jaksoista, jotka voidaan suorittaa myös erillisinä: ELFY4869 Soluviljelytekniikat, jossa tutustutaan http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (5 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA eläinsolujen primääriviljelmien tekemiseen, solulinjojen ylläpitoon ja solufysiologisten mittausten tekemiseen. ELFY4858 Kalvofysiologian mittausmenetelmät, jossa selvitetään solukalvon ominaisuuksia fluoresenssipolarisaatio-menetelmän avulla sekä aineiden kulkeutumista solukalvojen läpi isotooppimittauksien avulla. Jaksoon liittyy lyhyt johdatus radioaktiivisten isotooppien käyttöön biologisessa tutkimuksessa. ELFY4973 Hormonaalisen säätelyn ja solun sisäisen viestinnän mittausmenetelmät, jossa käytetään aikaerotteisia fluoresenssimittauksia, RIA-määrityksiä yms. ELFY4974 Aineenvaihdunnan mittausmenetelmät, jossa selvitetään hengityksen ja entsyymitoimintojen mittausmenetelmiä. Suoritustavat: Harjoitustyöt ja työselostus tai työkuulustelu. Yhteydet muihin opintoihin: Fysiologisen eläintieteen perusteet, solubiologian luennot 1 ja kehitysbiologian opintojaksot ovat ehdottomana edellytyksenä kursseille osallistumiselle. ELFY4866-ELFY4867 Aineopintojen loppukuulustelut I ja II (7 ov) Kaksi erillistä kuulustelua I (3 ov): pääaineopiskelijoille Wolpert, L. Principles of Development (1998) tai Müller, W. A.: Developmental Biology 1996; sivuaineopiskelijoille esim. ekofysiologian kirjallisuutta sopimuksen mukaan. II (4 ov): Randall, D., Burggren, W. & French, K.: Eckert Animal Physiology: Mechanisms and Adaptations (1997, 4. painos) Syventävät opinnot GENE4917 Biologian historia (1 ov) ELFY4969 Genetiikan ja fysiologian tutkijakurssi (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään tutkimuksen suunnittelussa, toteutuksessa ja raportoinnissa tärkeisiin asioihin mukaan lukien tutkimussuunnitelmien laatiminen, apurahahakemusten tekeminen, posteriesityksien ja esitelmien suunnittelu, julkaisun laatimisessa huomioonotettavat tekijät - kirjallisuushaut, tulosten graafinen esittäminen yms. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen lukuvuoden kestävään työskentelyyn ja työselostukset ELFY 4886, ELFY 4887 Syventävien opintojen seminaari (tutkijaseminaari) (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Seminaarityöskentelyn tarkoituksena on harjaannuttaa tieteellisen keskustelun ja esityksen eri muotoihin. Suoritustavat: Seminaarityöskentelystä saa opintoviikkoja seuraavasti: 1 ov osallistumisesta vähintään 20 seminaarikertaan siten, että opiskelija laatii seminaarireferaatin kolmesta http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (6 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA vierailuesitelmästä valintansa mukaan ja 1 ov kirjallisesta pro gradu tutkimussuunnitelmasta, joka käsitellään laboratorion keskustelutilaisuudessa, sekä pro gradu -työn tuloksia esittelevästä seminaariesityksestä. Syventävien opintojen luentoja ja kursseja (8-13 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehtyminen fysiologiseen tutkimukseen erikoisluentosarjojen, demonstraatioiden ja laboratoriotöiden avulla. Osaston vuosittain vaihtelevan tarjonnan lisäksi opiskelijat voivat sisällyttää näihin opintoihin muualla suoritettavia luentoja tai kursseja sopimuksen mukaan. Lukuvuoden aikana muualla järjestettävistä, opinto-ohjelmaan sopivista kursseista (esim. TY, matemaattis-luonnontieteellisen tiedekunnan muut oppiaineet kuten biokemia ja terveyden biotieteet, lääketieteellinen tiedekunta, Åbo Akademi, muut yliopistot, kansainväliset yhteistyötahot) pyritään tiedottamaan eläinfysiologian ilmoitustaululla. Jonkin kurssin aihepiiristä (opiskelijan valinnan mukaan) kirjoitetaan ELFY4883 harjoitusaine. Suoritustavat: Luennot, harjoitustyöt, kuulustelu tai työselostus; harjoitusaine Lukuvuonna 2000-2001 pyritään järjestämään seuraavat syventävien opintojen luentosarjat ja kurssit: ELFY4962 Lisääntymisbiologian kurssi (2 ov) Kurssilla käsitellään sukupuolielimistön kehitystä ja fertiliteetin saavuttamista nisäkkäillä ja kaloilla. Normaalin sikiökautisen ja syntymänjälkeisen (kaloilla kuoriutumisen jälkeisen) kehityksen lisäksi perehdytään lisääntymiselimistön kehityksen häiriöihin erityisesti ympäristöperäisistä syistä. ELFY4963 Ekotoksikologian fysiologiset mittausmenetelmät (2 ov) Kurssilla perehdytään fysiologisten mittausmenetelmien käyttöön kemikaalien ympäristövaikutuksia tutkittaessa ja käytön tieteellisiin perusteisiin. ELFY4975 Ympäristötekijät transkription säätelijöinä (2 ov) Kurssilla perehdytään menetelmiin, joiden avulla voidaan selvittää ympäristömuutok-sien vaikutuksia geeniekspressioon - erityisesti transkriptiotekijöiden toimintaa. ELFY4976 Solurangan rakenne ja toiminta (2 ov) Kurssilla käsitellään luentojen ja harjoitustöiden avulla solurangan rakennetta, toimintaa ja toiminnan säätelyä solujen normaalin kehityksen ja ohjatun solukuoleman (apoptoosi) kuluessa ELFY4970 Sekvenssianalytiikka biologisessa tutkimuksessa (2 ov) http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (7 of 8)13.2.2006 15:22:32

ELÄINFYSIOLOGIAN LINJA Jaksossa tutustutaan DNA-sekvensointiin ja sekvenssi-informaation käyttöön geenien ja geenituotteiden sukulaisuuden selvittämisessä. ELFY4971 Hormonit, reseptorit ja soluviestintä (2 ov) Luentosarjassa perehdytään hormoneihin, niiden solutason vaikutuksia välittäviin reseptoreihin ja solun sisäisiä vaikutuksia välittäviin viestintäreitteihin. ELFYxxxx Aistinfysiologia (1 ov) Luentosarjassa tutustutaan eläinten aistinmekanismeihin ja niiden merkitykseen ympäristövasteissa ELFY4965 Tutkimusprojekti (7-12 ov) Tavoite: Perehtyminen tieteelliseen työhön ja sen raportointiin oppiaineen tutkimusryhmissä ennen itsenäisemmän pro gradu -työn tekemistä. Tutkimusprojektien aiheet on esitetty eläinfysiologian ilmoitustaululla. Projektin yhteydessä kirjoitetaan ELFY4884 harjoitusaine Suoritustavat: Käytännön tutkimustyö ja harjoitusaine ELFY4900-ELFY4902 Syventävien opintojen loppukuulustelut I ja II (10 ov) Yksi tai useampia tenttejä kuulustelijan kanssa sovitusta kirjallisuudesta. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/elainfyslin.htm (8 of 8)13.2.2006 15:22:32

GENETIIKAN LINJA Genetiikan opintojen tavoitteena on perehdyttää opiskelijat lähinnä eukaryoottisten organismien formaali- genetiikkaan, sytogenetiikkaan, geneettiseen kehitysfysiologiaan, populaatiogenetiikkaan, ihmisgenetiikkaan ja molekyyligenetiikkaan. Genetiikan tutkimus Turun yliopistossa on keskittynyt geneettiseen kehitysfysiologiaan, sytogenetiikkaan, solusyklin tutkimukseen, evolutiiviseen genetiikkaan ja ihmisgenetiikkaan. PÄÄAINEEN OPINNOT PERUSOPINNOT (3 ov) GENE4916 Genetiikan perusteet 3 ov GENETIIKAN AINEOPINNOT (25 ov) GENE5007 Genetiikan jatkoluennot 3 ov (luennot + kirja A.J.F. Griffith,, J.H. Miller, D.T. Suzuki, R.C. Lewontin & W.M. Gelbart: An Inroduction to Genetic Analysis, 7th Ed. Freeman 2000) GENE4995 Fysiologian ja genetiikan seminaari 1 ov XBIO4203 Solu- ja molekyylibiologian harjoitukset 2 ov (Harjoituksiin osallistuminen edellyttää luentosarjojen KAFY4156 Molekyylibiologian perusteet, 1 ov, ja ELFY4956 Solubiologia I, 1 ov, suorittamista) GENE4940 Yleisen genetiikan kurssi 5 ov GENE4945 Sytogenetiikan kurssi 5 ov Erikoisluentosarjat 2 ov GENE5008 Genetiikan aineopintojen loppuseminaari 2 ov (Käydään läpi pienryhmissä perinnöllisyystieteen erityisalojen kirjallisuutta. Peruslukemistona on kaksi teosta seuraavista: Brown, T.A.: Genomes Hartl, D.L. & Clark, A.G.: Principles of Population Genetics 3rd Ed. Murray, A. & Hunt, T.: The Cell Cycle: An introduction; Stracham, T. & Read, A.P.: Human molecular genetics, 2 nd Ed.; Wolpert, L. et al.: Principles of Development.) http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/genetiikanl.htm (1 of 7)13.2.2006 15:22:33

GENETIIKAN LINJA GENE4951-4952 Aineopintojen loppukuulustelut 5 ov LuK -tutkinnossa lisäksi (15 ov) GENE4972 Harjoitusaine 2 ov Opintojaksoja syventävistä opinnoista 10 ov GENE5009 LuK -tutkielma 3 ov GENETIIKAN SYVENTÄVÄT OPINNOT (55 ov) GENE#### Syventävät erikoiskurssit 8 ov GENE#### Erikoisluentosarjat 3 ov GENE4972 Harjoitusaine 2 ov GENE5010 Erikoistyöseminaari 1 ov GENE5011 Kollokviot 1 ov GENE4917 Biologian historia 1 ov GENE5012 Tieteellisen tutkimustyön harjoittelu 8 ov GENE4969 Genetiikan ja fysiologian tutkijakurssi 2 ov GENE5013 Final Seminar for Advanced Studies in Genetics 1 ov (Syventävien opintojen seminaari) GENE4991-4992 Syventävien opintojen loppukuulustelut 8 ov GENE4980 Pro gradu -tutkielma 20 ov Yksi erikoisluentosarja voidaan korvata opintoretkeilyllä ja 3 ov:a tieteellisen tutkimustyön harjoittelusta voidaan korvata työharjoittelulla. SIVUAINEIDEN OPINNOT BIOLOGIAN PAKOLLISET SIVUAINEOPINNOT (12 ov) Biologian muiden linjojen perusteet 12 ov BIOLOGIAN TUKIAINEOPINNOT (8 ov) Biostatistiikan perusteet 3 ov Kemia 3 ov http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/00-01/biologia/genetiikanl.htm (2 of 7)13.2.2006 15:22:33