Suomenhevosen geneettisen vaihtelun arviointi sukupuutiedoista

Koko: px

Aloita esitys sivulta:

Download "Suomenhevosen geneettisen vaihtelun arviointi sukupuutiedoista"

Kaija Hakala
7 vuotta sitten
Katselukertoja:

1 Jalostuspäivät Suomenhevosen geneettisen vaihtelun arviointi sukupuutiedoista Asko Mäki Tanila Helsingin yliopisto Jalostuspäivät AMT

2 Sillon tlee hyvä vuas, kom pyhämiäste ja joulun välill aurink paista eres see verra, ett kerkke heose valjastama sinä aikan. MARKUS SILTAMÄKI Laitilan murteen sanakirja Kukkaroho ja plakkarihi (toim. Heli Laaksonen) VILLE ELORANTA: 125 myyttiä suomen kielestä kirjasta ori-sanan saa nykyisin taivuttaa joko vanhalla vanhalla tavalla oriin, oritta tai vähitellen yleistyneen mallin orin, oria mukaan. Jalostuspäivät AMT

3 Helsingin Sanomat TIEDE sivut Jalostuspäivät AMT

4 Top 20 -orit jälkeläismäärässä Anna Ettala 2015 pro gradu Isoisä Synt. vuosi BLUP Jalostussuun Jälkeläisten ta lkm Ero Lohko Hilu Luonnos Ero Ponsi J 413 Vieteri TJ 773 Hiluri J 504 Vokker J 935 Vekseli J 642 V.T. Ajatus J 651 Viltter J 474 Kihin Muisto J 572 Suikku J Vinkaus Patrik J 431 Mikker J 388 Turo J Suikun Ero J 413 Viesker J Hovi Ari J 483 Liising J 716 Apassi J 388 Jalostuspäivät AMT

5 Tämän esityksen ja omien analyysieni herättäjinä ovat Helsingin yliopistossa tehtyinä tuore tutkimus Anna Ettala 2015 pro gradu aiempi tutkimus Hanne Oikarinen 2006 pro gradu Jalostuspäivät AMT

6 Yritetään päästä kärryille muutoksista sukulaisuudessa kaikissa hevosissa kantakirjatuissa ravureissa oleellisten isien määrästä Jalostuspäivät AMT

7 Miten orit ja suuret jälkeläismäärät näkyvät sukupuutietojen (orien ja sukulinjojen vaikutuksen) analysoinnissa. Yleensä otetaan esille sukusiitoksen kehitys sukusiitos tarkoittaa sukulaisten paritusta tarkastellaan sekä sukusiitosta että sukulaisuutta koko populaatiossa kantakirjatuissa ravihevosissa S u k u l a i s u us on laajempi käsite kuin sukusiitos. Jalostuspäivät AMT

8 Meidän ihmisten omien sukulaisuuksien selvityksessä kannattaa aina keskustella vanhojen ihmisten kanssa sama pätee hevosten sukulaisuuksien (sukusiitoksen) tarkastelussa Suomenhevosen rekisteri lukumäärä erittäin laaja (yli hevosta ja niiden vanhemmat) ei sisällä juurikaan virheitä synt vuosi Jalostuspäivät AMT

9 Miten sukupuutietojen syvyys vaikuttaa analyysien tuloksiin? Jalostuspäivät AMT

10 Otetaan rekisteristä vuonna 2013 tai sen jälkeen syntyneet hevoset (kaikkiaan 1000 hevosta) ulotetaan sukupuutiedot ensin pelkästään lähivuosille (1990 ) ja sitten kauemmas sukupuun syvyys > 1990 > 1960 > 1930 hevosia yht sukulaisuus sukusiitos tarvitaan tilanteen kuvaamiseen työkalu joka ei riipu sukupuutietojen syvyydestä Jalostuspäivät AMT

11 Tarkastellaan ravihevosien ja muiden hevosten tietoja 30 viimeisen vuoden ajalta Jalostuspäivät AMT

12 Kantakirjatut ravihevoset, synt yhteensä 2735, isiä yhteensä 386 isien jälkeläismäärät jälkeläisiä suuruus järjestyksessä XS i i s ä o r i t Jalostuspäivät AMT

13 SUKULAISUUS (sukusiitos) kantakirjatut ravihevoset (poimittuja sukupuutietoja yht. > 8100) viimeisiltä vuosilta niin vähän hevosia että keskiarvot heittelehtivät sukulaisuus sukusiitos synt vuosi Jalostuspäivät AMT

14 Jalostuspäivät AMT

15 SUKULAISUUS (sukusiitos) satunnainen otos 2700 muuta hevosta samalta jaksolta (poimittuja sukupuutietoja yht. > 10900) sukulaisuus sukusiitos synt vuosi Jalostuspäivät AMT

16 SUKULAISUUS (sukusiitos) yhteisesitys kantakirj ravurit muut hevoset ravihevosten sukulaistuminen sukusiitos sama trendi synt vuosi Jalostuspäivät AMT

17 Populaatioiden geneettisen vaihtelun tilan selvittämisessä on tärkeintä seurata sukusiitoksen ja sukulaisuuksien M U UT O S T A Siitä saadaan käsitys siitä, mikä on populaation geneettinen koko N e ja kuinka (sukua olevien) orien määrän ja orien vaihtelevat jälkeläismäärät ovat ilmaistavissa vertailukelpoisella tavalla Tässä pitää tietää, kuinka nopeasti muutokset tapahtuvat ja pidettävä tarkasteluvälinä sukupolvien välistä aikaa Jalostuspäivät AMT

18 synt luku hevosta sukupolvien väli oripuolella v luku ISÄT isää ISÄNISÄT luku isänisää Jalostuspäivät AMT synt vuosi

19 Kantakirjatut ravihevoset sukusiitoksen kehityksen mukaan N e = (pitkä lyhyt sukupolvenväli) sukulaisuuden mukaan N e << 50 Muut hevoset sukusiitoksen ja N e = sukulaisuuden mukaan Jalostuspäivät AMT

20 Nykyään suositellaan että N e :n esim isäorien määrä per sukupolvi pitäisi olla välillä Silloin vaihtelu ei vähene valinnan ja kehityksen tulosten ennustaminen on luotettavaa (ei sattuman vaikutusta) populaatiossa tapahtuva pieni sukusiitos ja siitä seuraava taantuma kompensoituu laajasta vaihtelusta löytyvillä korjaavilla geeneillä hankalat (kaikissa yksilöissä esiintyvät) vikageenit eivät yleisty eivätkä peittyvät (resessiiviset) tule näkyviin varaa valita vielä vaikka DMTR3:n suhteen Jalostuspäivät AMT

21 Johtopäätöksiä tähän mennessä sukulaisuudet on hyödyllinen tapa tarkastella vaihtelun kehittymistä koska se ennustaa vaihtelun kehittymisen ja ennakoi jo pari polvea ennen sukusiitoksen riskin kasvun orit ovat ratkaiseva tekijä populaation vaihtelun määrääjinä suomenhevospopulaatiossa tehollinen orien määrä sukupolvessa on viime vuosikymmeninä ollut kantakirjatuilla ravihevosilla kehitys on huolestuttava, tehollinen orien määrä on sukupolvessa reilusti alle 50:n Jalostuspäivät AMT

22 Kuinka ravihevosten vaihtelun kehitys saadaan käännetyksi peukalosääntöjä tehokkaita tasapainoittavia orien käyttötapoja ei voida tuoda muualta eläinainesta Jalostuspäivät AMT

23 isät ja emät vaikuttavat jälkeläisten vaihteluun yhtä paljon isät emät jälkeläiset Jalostuspäivät AMT

24 isillä voi olla kymmeniä satoja jälkeläisiä ja niiden vaihtelun kaventuminen heijastuu jälkeläisten vaihtelun vähenemisenä isät emät jälkeläiset Jalostuspäivät AMT

25 populaation vaihtelu määräytyy täysin oreista siis isät paljon siitosoreja siitosorien pitäisi olla mahdollisimman vähän sukua keskenään vaihtelun kannalta ovat parhaimpia orit jotka ovat vähän sukua muille orien ja tammojen välisellä sukulaisuudella ei ole merkitystä (talonpoikaisjärki parituksissa) tasainen määrä jälkeläisiä eniten oreille jotka vähän sukua muille (myös keinosiemennyksessä) Jalostuspäivät AMT

26 yhdistetään sukulaisuuksien minimointi suorituskyvyltään ja kestävyydeltä (BLUP arvostelun) hyvien orien valintaan (jalostusarvon maksimointiin) sukulaisuudet jalostusarvo matala keskiarvo korkea hyvä keskinkertainen huono OPTIMI KONTRIBUUTIO Jalostuspäivät AMT

27 Top 20 -orit jälkeläismäärässä Anna Ettala 2015 pro gradu Isoisä Synt. vuosi BLUP Jalostussuun Jälkeläisten ta lkm Ero Lohko Hilu Luonnos Ero Ponsi J 413 Vieteri TJ 773 Hiluri J 504 Vokker J 935 Vekseli J 642 V.T. Ajatus J 651 Viltter J 474 Kihin Muisto J 572 Suikku J Vinkaus Patrik J 431 Mikker J 388 Turo J Suikun Ero J 413 Viesker J Hovi Ari J 483 Liising J 716 Apassi J 388 Jalostuspäivät AMT

28 Johtopäätökset sukulaisuus hyvä mittari kantakirjatuilla ravihevosilla sukulaisuuden kehitys on huolestuttava, tehollinen orien määrä on sukupolvea kohti reilusti alle 50:n pitäisi olla seurauksina vaihtelun väheneminen sekä riski sukusiitostaantumalle ja vikageenien esiin putkahtamiselle tilanne on korjattavissa orien optimoidulla valinnalla ja tasaisemmalla käytöllä Jalostuspäivät AMT

Samankaltaiset tiedostot

Sukusiitoksesta sukulaistumiseen - jalostustietojärjestelmä työkaluna. Rovaniemi Susanna Back, Suomen Hippos ry

Sukusiitoksesta sukulaistumiseen - jalostustietojärjestelmä työkaluna Rovaniemi 22.3.2018 Susanna Back, Suomen Hippos ry Sukulaisuussuhde Kahden yksilön yhteisten geenien todennäköinen osuus Riippuu eläinten