CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Luento1 31.10.2017 Heli Viskari Tervetuloa kurssille! 1
Kurssin sisältö (Oodista) Mikrobi-, kasvi- ja eläinsolujen solutason rakenteiden ja toiminnan vuorovaikutus Luokittelun perusteet toiminnallisista lähtökohdista (solujen pääluokat: mm. bakteerit, sienet, levät, kasvi- ja eläinsolut) Solutason geneettisen säätelyn periaatteet ja geenitekniikan työkalut Solujen kasvatus laboratoriossa ja eri tekijöiden vaikutukset kasvuun Solujen ja solutuotteiden hyötykäyttö 3 Kurssin sisältö Mikrobi-, kasvi- ja eläinsolujen rakenne ja toiminta - pro- ja eukaryoottisolut, yhtäläisyydet ja erot - mikroskopia - soluelimet ja organellit - solujen signalointimenetelmät - solujen ja solutuotteiden valmistuksen ja käytön esimerkkejä DNA:n ja proteiinien rakenne ja rakentuminen - geneettisen säätelyn periaatteet: transkriptio, translaatio, rekombinaatio Geenitekniikan työkalut - rekombinantti-dna-teknologia - sovellukset biotekniikassa 4 2
Osaamistavoitteet (Oodista) Kurssin suoritettuaan, opiskelija osaa: - luokitella pro- ja eukaryoottisolujen fysiologisia, kemiallisia ja biologisia ominaisuuksia - esittää rakenteiden ja toiminnan vuorovaikutuksia molekyylitasolla - kuvailla geenien säätelymekanismeja ja niiden vaikutuksia solujen fysiologiaan - kuvailla genetiikan menetelmiä - nimetä biologisen työskentelyn menetelmiä (mm. aseptinen työskentely) ja solujen kasvuun vaikuttavia tekijöitä - kuvailla pro- ja eukaryoottisolujen mikrobifysiologian hyötykäyttöä 5 Kandiohjelmatason ILOt = miksi tämä kurssi sisältyy kandiohjelmaan? Opiskelija osaa kuvailla aineen rakenteen atomi- ja sidostasolta mikroskooppiseen ja makroskooppiseen rakenteeseen asti ja kykenee vertailemaan ja selittämään eri rakennemittakaavojen välisiä yhteyksiä. Opiskelija osaa kuvata solujen aineenvaihduntaa, energiataloutta sekä solujen ja eliöiden toimintaan vaikuttavia tekijöitä ja ekologiaa erityisesti teollisten prosessien ja materiaalien yhteydessä. Hän tunnistaa biologisiin ja kemiallisiin prosesseihin, materiaaleihin ja niiden muokkaamiseen käytettäviin teknologioihin liittyviä riskejä ja lainsäädäntöä ja hallitsee työturvallisuuden perusteet tutkimus- ja teollisuusympäristössä. 6 3
Metataidot Mitä kompetensseja työelämässä vaaditaan? Substanssiosaaminen (mitä tämä tarkoittaa?) Tiedonhakutaidot Asiantuntijatyöskentely ja tiedon jakaminen Tiimityö- ja vuorovaikutustaidot Projektityöskentelytaidot Viestintä- ja kielitaidot 7 Kurssin tuntijakauma ja sisältö Esitiedot: CHEM-A1300 Biokemia/CHEM-A1310 5 op = 135 h Kontaktiopetus (22 h): Luennot (1-2 x viikossa), 11 x 2 = 22 h Oma työ (109 h): Kotitehtävät (elektroninen aineisto) 6 x 5 h = 30 h (20% kurssin arvosanasta) + Itsenäinen opiskelu 79 h Tentti 4h (80% kurssin arvosanasta) 8 4
Ajankäyttö! Huomaa, että kurssi on paljon muutakin kuin luennot! 13 tuntia itsenäistä opiskelua viikossa! - Varaa tarpeeksi aikaa kalenteristasi myös kotitehtävien tekoon sekä luentoaiheiden itseopiskeluun Oppiminen Opetus Opiskelu 9 Alustava arvosteluasteikko Tentti max. 24 pistettä Kotitehtävät: max. 6 lisäpistettä tentin pisteisiin Koko kurssin max. kokonaispistemäärä = 30 pistettä Eli: Parhaan arvosanan kurssista voi saada suorittamalla tentin ja kotitehtävät menestyksekkäästi. Ilman hyväksyttyä tenttisuoritusta et pääse kurssista läpi. 10 5
Koko kurssin alustava arvosteluasteikko 27-30 = 5 22-26.5 = 4 17-21.5 = 3 13-16.5 = 2 10.1-12.5 = 1 10 tai alle = hylätty 11 Huom! Ilmoittaudu kurssille! Ehdoton aikaraja maanantai 6.11. Tämän jälkeen ei enää jaeta esim. Masteringtehtäväalustan rekisteröintikoodeja 12 6
Kirja 1 Microbiology: an Introduction By Tortora et al. (Pearson) 12th global edition Saatte käyttöönne e-kirjana Luentodiat englanniksi 13 Kirja 2 Essential Cell Biology By Alberts et al. (Garland Science) 4 th edition Ei kurssin puolesta e-kirjana Luentodiat englanniksi 14 7
Kurssiin sisältyvät kappaleet, alustava jako 1/2 HUOM! EI LUENTOJA KE 8.11. EIKÄ TI 14.11.! Tämän sijaan luento ma 27.11. klo 13-15 salissa Ke2! Luento 1: Yleisten asioiden jälkeen: MB, luku 1 (s. 28-49) Luento 2: Luku 1 jatkuu + Mikrobien kasvu ja kasvatus alkaa, MB luvut 6 ja 7 (s. 175-226) Luento 3: Mikrobien kasvu ja kasvatus, MB luvut 6 ja 7 (s. 175-226) Luento 4: Mikroskopia, mikrobien luokittelu alkaa, MB luvut 3 ja 10 (s. 77-97, 290-315) Luento 5: Virukset yleisesti, bakteerit ja arkit, MB luvut 13 ja 11 (s. 384-405 + tehtävät, 316-344) Luento 6: Eukaryootit, MB luku 12 (s. 345-367 + tehtävät) 15 Kurssiin sisältyvät kappaleet, alustava jako 2/2 Luento 7: Mikrobigenetiikka, MB luku 8 (s. 227-263) Luento 8: Bioteknologia ja DNA-teknologia, MB luvut 9 ja 28 (s. 264-289, 820-836) Luento 9: Soluorganellit ja proteiinien kuljetus, ECB luku 15 (s. 487-563) Luento 10: Solusignalointi, ECB luku 16 (s. 487-563) Luento 11: Solusykli, ECB luku 18 16 8
Kotitehtävät Pearson: MasteringMicrobiology (vastaava kuin MasteringBiology Biotieteen perusteissa) Kurssi: CHEM-C2300 s-2017 CourseID: MMBS2017 Koodi tulee sähköpostissa ja/tai MyCoursesiin viim. torstaina 2.11. Tehtävät muodostavat 20% kurssin arvosanasta Katso myös MyCourses: tutorial kirjautumiseen yms. Voit tehdä tehtäviä koko kurssin ajan (alkaen 2.11.), mutta suositeltavaa olisi pysyä kurssilla käsiteltävien aiheiden tahdissa, jotta loppukurssista ei tulisi kiire Ehdoton takaraja tehtäville on to 14.12.2017 17 Huom! Tenttikysymyksistä Luentokalvot eivät ole yhtä kuin tenttiinluku-materiaali - Kalvot ovat raami, avuksi opettajalle ja opiskelijoille luennoilla, opiskelijat tekevät tarvittaessa lisämuistiinpanoja Tenttikysymykset voivat muodostua - luennoilla läpikäydyistä aiheista - kaikista kurssille määritellyistä kirjan kappaleista - kirjan sisältämistä Study Questions -osuuksista - elektronisesta oppimateriaalista (= MasteringMicrobiology) - muusta materiaalista, joka on jaettu kurssin aikana 18 9
Biotieteen perusteissa läpikäytyä (CHEM-A1310, Prof. Markus Linder) Proteiinien rakenne ja toiminta, entsyymit DNA:n rakenne ja toiminta Hiilihydraatit ja lipidit Solujen rakenteet Metabolia glykolyysi fotosynteesi Geenit, geenien säätely Evoluutio 19 Miksi biotekniikka? Miten voisit määritellä termin biotekniikka? Mitä kaikkea biotekniikan avulla voidaan valmistaa/käsitellä? 20 10
Biotuotteiden ja biotekniikan laitos Biohybridimateriaalit, Prof. Mauri Kostiainen Bioprosessitekniikka, Prof. Sandip Bankar Biojalostamot, Prof. Herbert Sixta Biomolekyylimateriaalit, Prof. Markus Linder Biopohjaiset kolloidit ja materiaalit (BiCMat), Prof. Orlando Rojas Biopohjaisten materiaalien teknologia, Prof. Thad Maloney Biotuotekemia, Prof. Monika Österberg Mikrobiologia, Prof. Katrina Nordström 21 Biotuotteiden ja biotekniikan laitos Molekyylibioteknologia, Prof. Alexander Frey Nanorakenteet ja -materiaalit, Prof. Päivi Laaksonen Painatustekniikka, Prof. Patrick Gane Paperin jalostus- ja pakkaustekniika, Prof. Jouni Paltakari Puhtaat teknologiat, Prof. Olli Dahl Puukemia, Prof. Tapani Vuorinen Puumateriaalitiede ja -tekniikka, Prof. Lauri Rautkari Puun materiaalitekniikka, Prof. Mark Hughes Selluloosan materiaalikemia, Prof. Eero Kontturi 22 11
Biotekniikasta on moneksi biopolttoaineet biologiset materiaalit ympäristötekniikka korroosio biofilmit nanotekniikka biopohjaiset kemikaalit vedenpuhdistus elintarvikkeet lääketiede genomianalyysi 23 Pienpanimoiden kasvu www.mtv3.fi/uutiset https://www.kegworks.com/wp/wp-content/uploads/2013/10/biodesic-brewery-count.png 24 12
Sekvenssidatan ja tietokantojen kasvu www.nature.com/scitable/content/the-phenomenal-growth-of-sequence-data-in-78429 25 Tutorial: näin kirjaudut MasteringMicrobiologyyn 26 13
Start at : http://www.pearsoned.co.uk/masteringmicrobiologyip Select Register 14
Accept terms Select a Username/Password 15
Enter your account details Account is created 16
Now you join your course Use new username/password 17
You are in your course! Course ID MMBS2016 For easy entry if you are logged out www.masteringmicrobiology.com **only to be used after the full registration 18