BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA Biokemian linja Biotekniikan linja Elintarvikekemian linja Elintarvikekemian linja - Kalateknologian suunta Opintojen rakenne Opintojen suorittaminen Kurssit Koulutusohjelman tavoitteet Biokemia on biologian ja kemian välimaastoon sijoittuva luonnontieteisiin kuuluva itsenäinen tieteenala. Se tutkii elävissä soluissa tapahtuvia kemiallisia reaktioita ja niiden säätelyä sekä solun kemiallista hienorakennetta. Viime vuosina tapahtunut biokemian ja varsinkin sen erään osa-alueen, molekyylibiologian, nopea kehittyminen on entisestään lisännyt biokemiassa hankitun tiedon merkitystä elävän luonnon tutkimisessa, suojelussa ja hyödyntämisessä. Biokemia perehdyttää opiskelijat biologista alkuperää olevien molekyylien rakenteeseen ja toimintaan sekä erillisten biokemiallisten tapahtumien merkitykseen yksityisille soluille ja koko organismille. Erityisesti pyritään antamaan tutkimuksessa tarvittava tietotaito sekä valmiudet soveltaa opittua tieteellisten ja käytännön ongelmien ratkaisemiseen. Elintarvikekemia tutkii biologisten materiaalien ja elintarvikkeiden kemiallista koostumusta, rakennetta ja ominaisuuksia sekä elintarvikkeissa tapahtuvia kemiallisia ja biokemiallisia muutoksia. Elintarvikekemia sijoittuu täten myös ravitsemustieteen lähialueelle sekä nojautuu läheisesti muihin luonnontieteisiin, erityisesti kemiaan ja biokemiaan. Elintarvikekemia on soveltava tieteenala, jonka laajan perustutkimuksen tuloksia sovelletaan käytännönläheisten ongelmien ratkaisemiseen. Elintarvikekemistin koulutuksen tavoitteena on antaa laaja-alainen näkemys elintarvikekemian kentästä sekä taata valmiudet toteuttaa elintarvikekemistin työsarkaa niin tutkimustyön, tuotekehityksen, valvonnan kuin hallinnonkin piirissä. Erityinen paino opetuksessa ja opiskelussa on elintarvikekemialliseen tutkimukseen perehtymisessä ja tämän tiedon soveltamisessa elintarvikealaa kehitettäessä. Biotekniikka tutkii ja kehittää elävien solujen, solun osien ja jopa yksittäisten molekyylien sekä biokemiallisten menetelmien käyttösovelluksia. Biotekniikalla on yhteyksiä useisiin eri tieteenaloihin ja sen merkitys on jatkuvasti lisääntynyt. Opetuksen tarkoituksena on perehdyttää opiskelijat biotekniikan menetelmiin, erityisesti molekulaariseen biotekniikkaan ja in vitro -diagnostiikkaan sekä biotekniikkaa soveltaviin ja hyödyntäviin prosesseihin. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/koulutusohj.htm (1 of 2)13.2.2006 15:07:02
BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA Sijoittuminen eri ammattialoille Koulutusohjelmasta valmistuneet filosofian maisterit sijoittuvat hyvin monenlaisiin tehtäviin. Yleisimmin työpaikka löytyy tutkimuksen, opetuksen, laadunvalvonnan, tuotekehityksen, informaatiopalvelun, ympäristönsuojelun, markkinoinnin sekä hallinnon parista. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/koulutusohj.htm (2 of 2)13.2.2006 15:07:02
BIOKEMIAN LINJA PÄÄAINEEN OPINNOT BIOKEMIAN ALAN PERUSOPINNOT 15 ov BKEM3519 Orientoivat opinnot: biokemia, biotekniikka, elintarvikekemia 1 ov BKEM3506 Solu ja biomolekyylit 4 ov BKEM3511 Aineenvaihdunta 5 ov BKEM3124 Laatujärjestelmät 1 ov FOOD3507 Elintarvikekemian perusteet 2 ov BTEK4000 Biotekniikan perusteet 2 ov BIOKEMIAN AINEOPINNOT 20 ov Aineopinnot antavat opiskelijalle tiedot solun sisältämien yhdisteiden kemialli-sesta rakenteesta ja reaktioista sekä solun synteettisistä, hajoittavista ja energiaa tuottavista reaktioteistä. Opiskelija tutustuu erilaisiin biokemiallisiin analyysimenetelmiin ja oppii itsenäisesti analysoimaan ja eristämään biokemiallisesti tärkeitä yhdisteitä biologisesta materiaalista. BKEM3757 Biokemian perustyömenetelmät 2 ov BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt 7 ov BKEM3759 Geenien ilmeneminen 2 ov BKEM3760 Geenien säätely 2 ov BKEM3755 LuK -tutkielma ja seminaari. 3 ov BKEM8903 Tieteellinen viestintä 1 ov BKEM3111 Lopputentti 3 ov (Ritter: Biochemistry: A Foundation tai vastaava) BIOKEMIAN SYVENTÄVÄT OPINNOT 51 ov Syventäviin opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikois-kursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelu-tapaa kehittävää tutkimustyötä. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen sekä loppukuulusteluihin. Opiskelijat saavat perusvalmiudet toimia biokemian asiantuntijatehtävissä sekä sellaiset tiedot http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/biokemial.htm (1 of 4)13.2.2006 15:07:03
BIOKEMIAN LINJA ja taidot, jotka mahdollistavat yhteistyön biokemian lähialojen asiantuntijoiden kanssa. Biokemian syventävät opinnot antavat myös perustiedot ja -taidot biokemian alan tutkimustyöhön. Pakolliset opintojaksot 41 ov BKEM8904 Entsyymi- ja proteiinikemian luennot 3 ov BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harj.työt 3 ov BKEM3535 Geeniteknologian menetelmät 2 ov BKEM3585 Molekyylibiologian harj.työt perusosa 3 ov BKEM3586 Molekyylibiologian harj.työt jatko-osa 2 ov BKEM3587 Projektityö 3 ov BKEM3742 Erikoistyö 20 ov BKEM3593 Erikoistyöseminaari 1 ov BKEM3596 Loppukuulustelu 4 ov Vaihtoehtoiset opintojaksot 10 ov BKEM3588Sekvenssianalytiikka ja biotietoverkot 1 ov BKEM3561 Analyyttinen biokemia 2 ov BKEM3751 Eukaryoottigenomit 2 ov BKEM3761 Monimuotoiset geenit 2 ov BKEM3527 Työskentely tutkimusryhmissä 2 ov BKEM3102 Opetusharjoittelu 1-4 ov BKEM3595 Lopputentti (erikoisteos)* 1-3 ov FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia 1 ov BKEM3740 Proteiinien puhdistusmenetelmät 1 ov BKEM3545 Bioenergetiikka 1 ov FOOD3586 Nestekromatografia 1 ov BTEK3546 Biotekniikan sovelluksia 1 ov BTEK3752 Bioteknillistä diagnostiikkaa 2 ov BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka 2 ov BTEK4013 Fermentaatiotekniikka 3 ov FOOD3673 Ravitsemuksen biokemia 2 ov BTEK4045 Trends in biotechnology 2 ov Biotekniikan uusimmat suunnat BKEM3540 Työharjoittelu 2 ov *) Erikoisaloja: molekyylibiologia, biokemiallinen toksikologia, molekyylimallitus, proteiinikemia, kliininen biokemia, fysiologinen kemia, immunokemia. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/biokemial.htm (2 of 4)13.2.2006 15:07:03
BIOKEMIAN LINJA BKEM3764 PRO GRADU -TUTKIELMA 8 ov PAKOLLISET SIVUAINEET KEMIA 35 ov Kemian opintojen tavoitteena on antaa opiskelijalle vankka kemiallinen perusta, jota biokemian opiskelu vaatii ja jota biokemisti ammatissaan tarvitsee. KEMIAN PERUSOPINNOT 15 ov Kemian perusteet (1. sl.) 5 ov Työturvallisuus (1. sl.) 1 ov Kemian perusharjoitustyöt I (1. sl.). 2 ov Orgaaninen kemia/perusopinnot (1. kl.) 3 ov Fysikaalinen kemia/perusopinnot (1. kl.) 1 ov Kemian perusharjoitustyöt II (1. kl.) 3 ov KEMIAN AINEOPINNOT 20 ov Kemian opintoihin tulee sisällyttää valittu opintokokonaisuus kokonaan, eli luennot, työmenetelmäluennot ja harjoitustyöt. Harjoitustöihin pääsy edellyttää aina ko. alan luentojen ja työmenetelmäluentojen suorittamisen. Orgaaninen kemia/aineopinnot 4 ov Orgaaninen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät 5 ov Fysikaalinen kemia/aineopinnot (A+B) 7 ov Fysikaalinen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät 4 ov Analyyttinen kemia/aineopinnot 4,5 ov Analyyttinen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät 3 ov Epäorgaaninen kemia/aineopinnot 3,5 ov Epäorgaaninen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät 3,5 ov Spektroskopian perusteet 1,5 ov Ympäristökemia 2 ov Muita vähintään aineopintotasoisia kemian opintoja. BKEM3520 MIKROBIOLOGIAN OPINNOT 10 ov http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/biokemial.htm (3 of 4)13.2.2006 15:07:03
BIOKEMIAN LINJA Mikrobiologia on tärkeä tieteenala biokemiaa pääaineenaan opiskeleville. Koulutusohjelma tarjoaa mahdollisuuden hankkia perustiedot, joita opiskelija voi itsenäisesti laajentaa ja monipuolistaa. Pakolliset opintojaksot 7 ov BKEM3521 Mikrobiologian perusteet 3 ov BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt 2 ov BKEM3748 Immunologian perusteet 2 ov Vaihtoehtoiset opintojaksot 3 ov BKEM9510 Immunologian harjoitustyöt 1 ov BKEM3547 Immunologian menetelmät 1 ov BKEM3123 Ympäristö- ja soveltavan mikrobiologian perusteet 1 ov Opintojaksoja muilta linjoilta, koulutusohjelmista ja yliopistoista. VAIHTOEHTOISET SIVUAINEOPINNOT 15 ov Vaihtoehtoisiksi sivuaineopinnoiksi voi valita lähes kaikkea sitä, mikä jollain tavoin laajentaa tai rikastuttaa pääaineen opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opintojaksoja voi ottaa elintarvikekemiasta, biotekniikasta, mikrobiologiasta, biologiasta, fysiikasta, matematiikasta, tietojenkäsittelyopista, tilastotieteestä, ympäristönsuojelusta, kemiasta sekä lääketieteen ja terveyden biotieteiden koulutusohjelmista. Sivuaineopinnoiksi voi valita myös kieli- ja viestintäopintoja sekä kaupallisen alan opintoja. Sivuaineopinnot voi pyrkiä keskittämään vain yhteen tai kahteen tieteenalaan tai sitten ottaa opintojaksoja useilta eri tieteenaloilta. KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT 6 ov Pakolliset 3 ov Äidinkielen opinnot 1 ov Toisen kotimaisen kielen opinnot 1 ov Vieraan kielen opinnot 1 ov Vaihtoehtoiset 3 ov Kieliopintoja opiskelijan oman valinnan mukaan. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/biokemial.htm (4 of 4)13.2.2006 15:07:03
Perusopinnot Perusopinnot Perusopinnot ovat yhteiset kaikille kolmelle linjalle sekä kalateknologian suunnalle. BKEM3519 Orientoivat opinnot (1 ov) Orientoivien opintojen tarkoituksena on tutustuttaa ensimmäisen vuoden opiskelijat biokemian koulutusohjelmaan ja sen kolmeen linjaan: biokemiaan, elintarvikekemiaan ja biotekniikkaan. Opiskelijoille kerrotaan opetuksen tavoitteista, opetusohjelmista, vaihtoehtoisista opiskelumuodoista, tutkimuksesta sekä työelämään sijoittumisesta. Opintojaksossa tarkastellaan myös sivuaineopintoja ja tutustutaan oppiaineen opetus- ja tutkimustiloihin sekä Arcanumissa että BioCityssä. Opintojakson päättää loppukoe sekä opiskelijoiden ja opettajien yhteinen tutustumistilaisuus. Matti Karp. BKEM3506 Solu ja biomolekyylit (4 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakso perehdyttää opiskelijat keskeisten biomolekyylien, kuten aminohappojen, proteiinien, hiilihydraattien, lipidien ja nukleiinihappojen rakenteisiin, toiminnallisiin ominaisuuksiin, biokemialliseen merkitykseen ja niiden osuuteen solun rakenteessa ja toiminnassa. Esitiedot: Suoritettava ennen aineenvaihduntaluentoja (5 ov). Suositellaan kuunneltavaksi ennen osallistumista elintarvikekemian perusteiden ja biotekniikan perusteiden luennoille. Kirjallisuus: Ritter: Biochemistry: A Foundation (1. painos, 1996) luvut 1, 2, 3, 4, 6, 7, 9, ja 16. Kirja hankitaan yhteistilauksena (tiedustelut opintojakson toteuttajalta). Suoritustavat: Osallistuminen kontaktiopetukseen, mikä muodostuu luennoista, ryhmätyöskentelystä, välitenteistä ja loppukuulustelusta. Voidaan suorittaa myös kirjatenttinä. Seppo Sarimo. BKEM3511 Aineenvaihdunta (5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksolla perehdytään yleisellä tasolla siihen, miten elävä olento hankkii elintoiminnoissaan tarvitsemansa biokemiallisen energian (bioenergetiikka) sekä niihin reaktioihin, joilla solu tuottaa soluaineksen rakentamiseen tarvittavia yhdisteitä (aineenvaihdunta). Luentojen sisältö on lyhennetty ja parannettu alla mainitun oppikirjan osista 5, 8, 11-15. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja kuulusteluihin tai tenttimällä ko. oppikirjan osat soveltuvin kohdin. Jukka Heinonen. Kirjallisuus: Ritter: Biochemistry. A Foundation (1. painos, 1996), luvut 5, 8, 11-15. Esitiedot: Edellyttää Solu ja biomolekyylit -opintojakso suorittamista. BTEK4000 Biotekniikan perusteet (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksossa selvitetään mitä biotekniikka on käsittelemällä mm. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/perusopinnot.htm (1 of 2)13.2.2006 15:07:03
Perusopinnot biotekniikan mahdollisuuksia ja saavutuksia lääketieteessä, maanviljelyksessä ja ympäristötutkimuksessa. Lisäksi selvitetään geeni-tekniikan merkitystä uuden biotekniikan kehityksessä. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Timo Lövgren Kirjallisuus: Luentomoniste. FOOD3507 Elintarvikekemian perusteet (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle yleiskuva elintarvikekemian eri osaalueista ja niiden liittymisistä muihin tieteisiin. Kurssi antaa perustiedot elintarviketieteen suomen- ja englanninkielisestä sanastosta. Opintojaksolla perehdytään elintarvikkeiden ja niiden raaka-aineiden tärkeimpien yhdisteryhmien kemialliseen koostumukseen ja tarkastellaan näiden vaikutusta elintarvikkeiden ominaisuuksiin. Kurssilla tutustutaan myös keskeisten elintarvikeanalyysien kemiallisiin ja fysikaalisiin perusteisiin sekä analyysien suoritukseen. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Luentomoniste. Luentojen lähdekirjallisuutena voi käyttää aineopintojen loppukuulustelukirjoja: Coultate, T.P.,1988 Food The Chemistry of its Components, 2 nd ed., James C.S. 1995. Analytical Chemistry of Foods. ss 1-67. BKEM3750 Laatujärjestelmät (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat mm. seuraaviin laatujärjestelmiin: GMP, GLP, GMO ja ISO järjestelmä. Suoritustavat: Luentojen kuunteleminen. Loppukuulustelu. Pekka Mäntsälä http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/perusopinnot.htm (2 of 2)13.2.2006 15:07:03
Aineopinnot Aineopinnot BIOKEMIAN LINJA BKEM3105 Biokemian perustyömenetelmät (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tarkoitus on perehdyttää opiskelija biokemiallisten perusmenetelmien teoreettiseen taustaan sekä niissä käytettävien laitteistojen toimintaan. Käsiteltäviä asioita ovat mm. fotometria, kromatografia, elektroforeesi, sentrifugointi ja radioisotooppitekniikat. Suoritustavat: Perustyömenetelmät monisteen tenttiminen (tentti suoritettava elokuun kesätentissä tai syyslukukauden tenttipäivinä, ei kuitenkaan enää viimeisenä tenttipäivänä), harjoitustöiden suorittaminen ja työselostusten laatiminen. Perustyömenetelmille varattuna aikana tehdään myös perusharjoitustöiden hiilihydraattijakso. Sen voi aloittaa, kun perustyömenetelmätyöt on tehty ja selostukset hyväksytty. Hiilihydraattijakson työselostusten tulee olla hyväksytty ennen perusharjoitustöiden seuraavan jakson aloittamista. Esa-Matti Lilius. Kirjallisuus: Luentomoniste. Esitiedot: Solu ja biomolekyylit tai biokemian suppea kurssi, kemian perusharjoitustyöt tai kemian kurssi biologeille harjoitustöineen on oltava täysin suoritettuja ennen kuin voi osallistua perustyömenetelmät kurssille. BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt (7 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle käytännön peruskoulutus biokemiallisessa laboratoriotyöskentelyssä ja ensikosketus biologisen materiaalin tutkimiseen biokemiallisin menetelmin. Harjoitustyöt sisältävät kokeellisia töitä hiilihydraateista, lipideistä, nukleiinihapoista, aminohapoista ja entsyymeistä. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä osallistuminen työt ulos -kuulusteluun. Jukka Heinonen. Kirjallisuus: Biokemian perusharjoitustyöt -moniste. Esitiedot: Aineenvaihdunta ja biokemian perustyömenetelmät oltava täysin suoritettuina. BKEM3759 Geenien ilmeneminen (2 ov) BKEM3760 Geenien säätely (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija molekyylitasolla solun geneettisen informaation varastointiin, siirtoon, ilmenemiseen ja säätelyyn. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun tai tenttimällä luennoitsijan kanssa sovittava oppikirja. Reijo Lahti. Kirjallisuus: Lewin: Genes VI. Esitiedot: Edellyttää perustietoja varsinkin proteiineista ja nukleiinihapoista sekä niiden rakennekomponenteista. Siksi osallistujan oletetaan suorittaneen opintojaksot: solu ja http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (1 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot biomolekyylit sekä aineenvaihdunta. BKEM3755 (BTEK4022, FOOD8812) LuK-tutkielma ja seminaari (3 ov) sekä BKEM8903 tieteellinen viestintä (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tieteellisen viestinnän luennoilla opiskelija saa ohjeet tutkielman laadintaa ja seminaariesitelmää varten. Erityistä huomiota kiinnitetään kirjallisuuden hakuun ja käyttöön liittyviin seikkoihin. Opiskelijan tulee perehtyä oman linjansa erityiskysymykseen osoitetun kirjallisuuden avulla. Hänen tulee laatia aiheesta tieteellinen, n. 15 sivun mittainen LuK -tutkielma sekä pitää noin 30 min. pituinen esitelmä. Tavoitteena on harjoituttaa opiskelijaa kirjallisen tiedon julkistamiseen sekä harjaannuttaa hänen suullista esitystaitoaan, havaintovälineiden käyttämistään sekä keskustelutaitoaan. Suoritustavat: Annetusta aiheesta kirjoitetaan LuK -tutkielma, joka jätetään ao. linjan professorille ennen seminaarin pitämistä. Tutkielma tarkastutetaan myös äidinkielen opettajalla. Itse pitämänsä seminaarin lisäksi opiskelijan tulee osallistua muiden pitämiin seminaareihin yhden lukukauden ajan. Tutkielmasta kirjoitetaan kypsyysnäyte. Tutkielman hyväksyy laitosneuvosto tai laitoksen johtaja. Kirjallisuus: Biokemian oppikirjat, kokooma-artikkelit ja osittain myös alkuperäisjulkaisut. MIKROBIOLOGIA BKEM3521 Mikrobiologian perusteet (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Mikrobiologian luennot eli teoriaosa tutustuttaa opiskelijat mikrobiologian perusteisiin, kuten tieteenalan historiaan, solumorfologiaan ja mikroskopiaan, prokaryoottisolun koostumukseen ja rakenteeseen, mikrobien kasvuun, ravintovaatimuksiin ja antimikrobiaalisiin tekijöihin, mikrobien biokemiaan, mikro-organismien luokitteluun sekä bakteeriviruksiin. Suoritustavat: Osallistuminen kontaktiopetukseen, mikä muodostuu luennoista, keskusteluista, välitenteistä ja loppukuulustelusta. Voidaan suorittaa myös kirjatenttinä. Seppo Sarimo. Kirjallisuus: Prescott, Harley & Klein: Microbiology (kolmas painos). Kirja hankitaan yhteistilauksena (tiedustelut opintojakson toteuttajalta). Esitiedot: Suoritettava ennen mikrobiologian harjoitustöihin osallistumista. BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden päämääränä on antaa opiskelijoille perusvalmiudet oikeanlaiseen mikrobiologiseen työskentelyyn. Kurssilla perehdytään mm. aseptiseen työskentelyyn, siirrostusmenetelmiin, mikrobien tunnistamiseen, värjäysmenetelmiin, ravintoalustoihin, mikrobien tuhoamiseen ja bakteerien kvantitatiiviseen määrittämiseen. Työt ovat yleisen ja soveltavan mikrobiologian eri alueilta. Suoritustavat: Osallistuminen laboratoriotöihin, demonstraatioihin ja keskusteluihin. Töiden http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (2 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot raportointi ja päättökuulustelu. Seppo Sarimo. Kirjallisuus: Harley & Prescott: Laboratory Exercises in Microbiology (toinen painos, 1993) ja "flow-kaaviot" - moniste). Esitiedot: Opintojakso mikrobiologian luennot on suoritettava ennen harjoitustöihin osallistumista. BKEM3748 Immunologian perusteet (2 ov) Sisältö: Opintojakso kuvaa immuunijärjestelmän sekä sellulaaristen että liukoisten tekijöiden rakennetta, toimintaa, säätelyä ja evoluutiota. Immuunijärjestelmän tehtävä on erottaa vieras rakenne isännän omasta rakenteesta. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Esa-Matti Lilius. Esitiedot: Kemian ja biokemian perusteet tunnettava. BKEM3123 Ympäristö- ja soveltavan mikrobiologian perusteet (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakso sopii vaihtoehtoiseksi sivuaineopinnoksi. Ympäristö- ja soveltava mikrobiologia ovat mikrobiologian erityisalueita, joiden ymmärtämisellä on luonnon ja ihmisen hyvinvoinnille erittäin suuri merkitys. perehtymällä tenttikirjan näitä aiheita käsitteleviin lukuihin, opiskelijalla on mahdollisuus hankkia perustiedot kyseisistä mikrobiologian osaalueista. Samalla he voivat täydellisemmin hyödyntää hankkimansa oppikirjan tiedot myös opintosuoritusmielessä. Suoritustavat: Tenttimällä kirjan: Prescott-Harley-Klein: Microbiology (3. ed.) Chapters 40-44. Kuulustelu järjestetään kunkin kuukauden ensimmäisenä biokemian tenttipäivänä. Tentin ottaa vastaan lehtori Seppo Sarimo. BKEM9510 Immunologian harjoitustyöt (1 ov) Töissä tehdään valkosolujen immunofenotyypitys IgG- ja IgA-reseptorien ja komplementtireseptorien suhteen virtaussytometrilla käyttäen reseptorispesifisiä fluoresenssileimattuja monoklonaalisia vasta-aineita. Reseptorien sitomiskapasiteetti ja fagosytoosiaktiivisuus mitataan virtaussytometrilla käyttäen fluoresenssileimattuja partikkeleita. Fagosyyttien "respiratory burst" aktiivisuus mitataan luminometrisesti samoja partikkeleita hyväksikäyttäen. Esa-Matti Lilius. BKEM3547Immunologian menetelmät (1 ov) Luentomoniste tai sopimuksen mukaan vastaavat oppikirjan sivut, joissa käsitellään immunologisessa tutkimuksessa käytettäviä menetelmiä ja menetelmiä, jotka käyttävät hyväkseen immunologisia komponentteja. Esa-Matti Lilius. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (3 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot BIOTEKNIIKAN LINJA BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka (2 ov) Kurssi järjestetään siten, että opiskelijat pitävät kurssin aikana 4-6 "Journal Club" -tyyppistä esitelmää suomeksi Glick & Pasternak "Molecular Biotechnology" 2 nd ed. -kirjan pohjalta ja siihen liittyvistä valikoiduista julkaisuista. Yhden kahden tunnin jakson aikana esiintyy neljä opiskelijaa. Esitysten pohjalta keskustellaan aiheeseen liittyvistä kysymyksistä, esiintymistavoista ja -menetelmistä. Jokaisella tunnilla on läsnäolopakko. Ei kuulustelua. Matti Karp BTEK4023 Aineopintojen harjoitustyöt (8 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat käytännön tasolla osaan aiheista, joita on käsitelty " Molekulaarinen biotekniikka" luennoilla. Kurssi sisältää kuusi erillistä työkokonaisuutta, jotka käsittelevät mm. eläinsoluviljelytekniikoita, bioluminesenssia, nukleiinihappohybridisaatiota sekä immunomääritysmenetelmiä. Suoritustavat: Osallistuminen pareittain tai pienryhmissä tehtäviin harjoitustöihin, "show and tell" tilaisuuksiin sekä hyväksyttävät työselostukset. Biotekniikan assistentti. Esitiedot: Ennakkoilmoittautuminen biotekniikan assistentille loppukeväällä. Opintojakso tulee suorittaa opintojen ohjeellisena ajankohtana (3. opiskeluvuoden syksy), muulloin suoritetaan karsintaa. BTEK4013 Fermentaatiotekniikka (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakso sisältää pääasiallisesti fermentaatio-tekniikkaa, mikrobien kasvukinetiikkaa eri kasvatuksissa, teollisesti tärkeiden mikrobien eristystä ja parannusta, sterilisaatioprosessin optimointia, fermentoreiden rakennetta ja käyttöä, ilmastoinnin (hapensaannin) merkitystä fermentaatioprosessissa, down stream - prosessia ja fermentaatiojätteiden käsittelyä. Lisäksi tutustutaan biotekniikkaan elintarviketeollisuudessa ja kemian tuotannossa sekä biosensoreiden toimintaperiaatteisiin. Luennoidaan joka toinen vuosi. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päätöskuulusteluun. Matti Karp. BTEK4022 LuK -tutkielma, ja seminaari (3 ov) BKEM8903 Tieteellinen viestintä (1 ov) Katso biokemian linjan ao kohta. ELINTARVIKEKEMIAN LINJA http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (4 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot FOOD3803 Kasviperäiset elintarvikkeet (3 ov) FOOD3804 Eläinperäiset elintarvikkeet (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksojen tarkoituksena on antaa perustiedot elintarvikeryhmien koostumuksesta, ominaisuuksista ja elintarvikkeissa tapahtuvista kemiallisista reaktioista. Opintojaksolla käsitellään elintarvikkeiden eri aineosien suhdetta rakenteeseen sekä kemiallisiin ja fysikaalisiin muutoksiin. Lisäksi tarkastellaan ko. elintarvikeryhmien kulutuslukuja ja niiden mahdollisia vaikutuksia ravitsemukseen. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, demonstraatioihin sekä väli- ja päättökuulusteluun. Seppo Salminen, Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Beliz & Brosch, 1986: Food Chemistry, kappaleet 1 1-15 17 18, Alais, C. & Linden, G. 1991. Food Biochemistry, Part II: Biochemistry of the Principal Foods, ss. 119-218. Esitiedot: Elintarvikekemian perusteet ja Aineenvaihdunta -luennot. FOOD8801 Kalan biokemia (ks. kalateknologian opintolinja, 2 ov) FOOD3750 Elintarvikekemian harjoitustyöt (5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden tarkoituksena on perehdyttää opiskelija tavanomaisiin elintarvikeanalytiikassa käytettäviin menetelmiin ja laitteisiin. Harjoitustyöt sisältävät kvalitatiivisia ja kvantitatiivisia määrityksiä eri elintarvikeryhmistä kuten kalasta, viljasta, marjoista, lihavalmisteista ja makeisista. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, työselostukset ja päättö-kuulustelu. Yliassistentti Esitiedot: Ennen töiden aloittamista on biokemian perusharjoitustyöt ja mikrobiologian kurssi oltava suoritettuina ja kasvi- ja eläinperäisten elintarvikkeiden luentojen kuuntelu aloitettu. Lisäksi on suotavaa, että seuraavat opintojaksot olisi suoritettu ennen töihin tuloa: kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia, nestekromatografia ja AAS-kurssi. FOOD3672 Elintarviketeknologian perusteet (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luentojen tarkoituksena on selvittää elintarvikkeiden teollista valmistusta erilaisiksi tuotteiksi. Pääsisältönä ovat teolliset käsittely- ja valmistusmenetelmät. Mahdollisuuksien mukaan järjestetään ekskursioita. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, ekskursioille ja päättökuulusteluun. Anne Nykänen. Kirjallisuus: Fellows, 1988: Food Processing. Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet ja Kalan biokemia suoritettu. FOOD3673 Ravitsemuksen biokemia (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehtyä ihmisen ravitsemuksen biokemiaan. Opintojaksossa keskitytään erityisesti hiilihydraattien, lipidien ja proteiinien ruuansulatukseen, http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (5 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot imeytymiseen, kuljetukseen ja varastointiin. Luennoilla ja oheismateriaalien avulla selvitetään ravintoaineiden tehtäviä ja merkitystä ihmisen biokemiallisissa reaktioissa ja fysiologiassa. Luennoidaan joka toinen vuosi. Oppijaksossa on englanninkielisiä osioita. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille kirjallisiin harjoituksiin ja päättökuulusteluun. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Aro et al., 1993: Kliininen ravitsemus (Duodecim); T.M. Devlin, ed., 1993: Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations (Wiley-Liss). Esitiedot: Aineenvaihduntaluennot ja kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet tai vastaavat tiedot. FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla opitaan käyttämään kapillaarikromato-grafiatekniikkaa elintarvikkeiden ja muun biologista alkuperää olevan mate-riaalin haihtuvien (GLC) ja haihtumattomien (SFC) aineosien tunnistamiseen ja määrälliseen analysointiin. Erityisesti tutustutaan menetelmien käyttöalueisiin ja rajoituksiin. Kurssiin kuuluvien harjoitustöiden avulla opetellaan analyysien tekninen suoritus vaiheittain sekä yleisimpien suoritusvirheiden eliminointi. Harjoitustyöosan sisäänotto rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen ja päättökuulustelu. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Kallio, H. Kapillaarikaasukromatografian perusteista ja sovellutuksista (luentomoniste), Schomburg, G. 1990, Gas Cromatography, uusin painos. Esitiedot: Kemian perusopinnot. FOOD3586 Nestekromatografia (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla käsitellään modernin nestekromatografian (HPLC) laitteistoa, työskentelytekniikkaa sekä HPLC-analytiikassa esiintyviä yleisimpiä käytännön ongelmia. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja harjoitustöihin sekä työselostusten laatiminen ja päättökuulustelun suorittaminen. Harjoitustöiden osanottajamäärä on rahoitettu, etusija on linjan opiskelijoilla. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi ennen elintarvikekemian harjoitustöitä siten, että esim. kaikki kemian opinnot on suoritettu. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Moniste sekä Matissek R. & Wittkowski R. 1993: High Performance Liquid Chromatography in Food Control and Research ss. 19-83. FOOD3630 Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on antaa perustiedot elintarvikkeiden aistittavien ominaisuuksien - ulkonäön, rakenteen, hajun ja maun analysoin-nista. Kurssin pääpaino on erilaisten analyyttisten menetelmien, kuten erotustestien ja kuvailevien menetelmien esittelyllä. Lisäksi kurssilla käsitellään ihmisten aistimekanismeja. Opiskelijoille pyritään antamaan perusvalmiudet arviointiryhmien kokoamiseen ja harjaannuttamiseen sekä asianmukaisten laboratoriotilojen suunnitteluun. Kuluttaja- ja mieltymystestien hyväksikäyttöä käsitellään http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (6 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot suppeasti. Kurssin oleellisena osana ovat harjoitustyöt, joissa opiskelijat toimivat arviointiryhmänä ja perehtyvät näin käytännössä eri arviointimenetelmien hyväksikäyttöön. Harjoitustyökurssin sisäänotto on rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä päättökuulustelu. Anja Lapveteläinen. Kirjallisuus: Lawless, H.T. & Heymann, H, 1998 Sensory Evaluation of Food Principles and Practices, Chapman & Hall, Tuorila, H. & Hellemann, U. (toim.), 1993 Elintarvikkeet aistien puntarissa, Yliopistopaino Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet, elintarvikekemian harjoitustyöt sekä tilastotieteen perusteet on oltava suoritettuina ennen kurssille osallistumista. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi opintojen loppuvaiheeseen siten, ettei muita työkursseja ole samanaikaisesti suoritettavana. FOOD8801 Kalan biokemia (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tarkoituksena on perehdyttää opiskelija kalan rakenteeseen, koostumukseen ja elintoimintoihin. Luennoilla käsitellään kalan biokemiaa sen eri kehitysvaiheissa, paaston, ruokinnan ja ympäristöolosuhteiden vaikutuksia kalaan sekä post mortem -muutoksia. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Anne Nykänen Kirjallisuus: Love, 1980: The Chemical Biology of Fishes, Hochachka & Mommsen, 1991: Biochemistry and molecular biology of fishes, vol. 1. Phylogenetic and biochemical perspectives. Esitiedot: Aineenvaihduntaluennot. FOOD3511 Loppukuulustelu (2 ov) Tentittävät kirjat: Coultate, T.P. 1988. Food The Chemistry of its Components. 2 nd ed., James, C.S., 1995. Analytical Chemisty of Foods, ss. 1-67. FOOD8812 LuK -tutkielma ja seminaari (3 ov) BKEM8903 Tieteellinen viestintä (1 ov) Katso biokemian linjan ao. kohta. KALATEKNOLOGIAN SUUNTA FOOD8802 Kalatalouden perusteet (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla käsitellään Suomen kalatalouden pääpiirteitä: kalastus, viljely, http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (7 of 8)13.2.2006 15:07:04
Aineopinnot teollisuus, kauppa, saaliit, kulutus. Kurssilla tutustutaan kalatalouteen myös vierailujen avulla. Luennoidaan joka toinen vuosi. Suoritustavat: Luennot, ekskursiot, lyhyt harjoitusaine ja päättökuulustelu. Anne Nykänen. Kirjallisuus: Kotimaisen kalan toimikunnan mietintö, 1990, Suomen Kalastuslehti, Suomen Kalan-kasvattaja. FOOD8810 Kalateknologian harjoitustyöt (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelija kasvatetun kalan (kirjolohen) sekä eri menetelmillä pyydetyn kalan (silakan) käsittelyyn. Kurssilla kiinnitetään huomiota laadunarviointiin kentällä, osittain Suomen kalatalous- ja ympäristöinstituutissa. Järjestetään joka toinen vuosi. Suoritustavat: Harjoitustyöt ja työselostus. Anne Nykänen. Esitiedot: Elintarviketeknologian perusteet. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/aineopinnot.htm (8 of 8)13.2.2006 15:07:04
Syventävät opinnot Syventävät opinnot BIOKEMIAN LINJA BKEM3535 Geeniteknologian menetelmät (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla tutustutaan geenien siirtoon ja karakterisointiin liittyviin menetelmiin kuten esim. geenipankkien valmistukseen, kloonausstrategioihin, DNA:n sekvensointiin ja nukleiinihappojen hybridisaatioihin sekä mutageneesitekniikoihin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulustelu. Vaaditaan molekyylibiologian harjoitustöihin. Reijo Lahti. BKEM8904 Entsyymi- ja proteiinikemia (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on opettaa entsyymikemian periaatteet eri- koisesti entsyymikinetiikan osalta ja selvittää proteiinin rakenne sekä rakennemääritysmenetelmät. Luentoihin liittyy demonstraatioita kineettisten tulosten ja proteiinirakenteen selvittelyssä. Suoritustavat: Osallistuminen demonstraatioihin ja päättökuulusteluun. Biotekniikan ja biokemian professori. Esitiedot: Aineenvaihduntaluennot ja perusharjoitustyöt. BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt (3 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään entsyyminpuhdistukseen ja entsyymikinetiikkaan sekä atk: n käyttöön entsyymikinetiikassa. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja keskusteluihin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Esitiedot: Biokemian perusharjoitustöiden suorittaminen. BKEM3585 Molekyylibiologian harjoitustyöt, perusosa (3 ov) BKEM3586 Molekyylibiologian harjoitustyöt, jatko-osa (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään modernin molekyylibiologian menetelmiin. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja keskusteluihin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Toteutetaan osittain englanniksi. Esitiedot: Biokemian perusharjoitustöiden, Geenien ilmeneminen, ja Geeniteknologian menetelmät -luentojen suorittaminen. BKEM3587 Projektityö (3 ov) Tehdään ennen erikoistyötä ja eri tutkimusryhmässä kuin erikoistyö joko yhdessä ryhmässä 6 viikkoa tai kahdessa eri ryhmässä kummassakin 3 viikkoa. Projektityön aihe valitaan keväällä samanaikaisesti kuin erikoistyön aihekin. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (1 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot BKEM3742 Erikoistyö (20) Tavoitteet ja sisältö: Erikoistyö on ohjaajan valvonnassa tehty noin viiden kuukauden mittainen intensiivinen tutkimustyö, jonka tarkoituksena on perehdyttää opiskelija tieteellisen tutkimuksen suunnitteluun, toteuttamiseen ja kriittiseen tarkasteluun. Erikoistyöaiheen valinta suoritetaan kevätlukukaudella maalis-huhtikuussa syventävien opintojen harjoitustöiden päätyttyä. Erikoistöiden aiheista päättävät töiden ohjaajat. Opiskelijoiden aihevalinnoista päättää ohjaajien työryhmä opiskelijoiden toivomusten pohjalta. Suoritustavat: Osallistuminen tutkimuksen suunnitteluun ja toteuttamiseen sekä käytettyjen menetelmien, tulosten ja johtopäätösten kirjaaminen. Erikoistyöselostus laaditaan tarvittaessa. Erikoistyön ohjaaja. BKEM3593 Erikoistyöseminaari (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opintojakson tarkoitus on perehdyttää opiskelija omien tutkimustulostensa esittämiseen julkisesti tavoilla, jotka ovat käytössä tieteellisissä kokouksissa. Suoritustavat: Erikoistyössään saamiensa tulosten pohjalta opiskelija laatii ns. tieteellisen julisteen eli posterin sekä pitää tiiviin, 20 min. pituisen esitelmän. Hän kirjoittaa työstään myös Iyhennelmän eli abstraktin, joka julkaistaan. Esitiedot: Erikoistyö joko saatettu loppuun tai loppuvaiheessa. BKEM3764 Pro gradu -tutkielma (8 ov) Tavoitteet ja sisältö: Laboratoriotyön lisäksi erikoistyöhön kuuluu aiheeseen liittyvään kirjallisuuteen perehtyminen. Tutkielma, johon kuuluu sekä kirjallisuusosa että kokeellinen osa, laaditaan erikoistyön ja siihen liittyvän kirjallisuuden perusteella. Tutkielman aiheen antaa erikoistyön ohjaaja. Tutkielman ohjeellinen laajuus on 60-70 koneella kirjoitettua sivua. Tutkielma luovutetaan kahtena kappaleena professorille. Tutkielman aiheesta kirjoitetaan aine, ns. kypsyysnäyte tai jos se on kirjoitettu LuK -tutkielman yhteydessä, kirjoituskoe. Tämän jälkeen laitoksen määräämät tarkastajat esittävät tutkielman laitosneuvoston tai laitoksen johtajan hyväksyttäväksi ja ehdottavat arvolauseen. Suoritustavat: Perehtyminen tutkielman aiheeseen liittyvään kirjallisuuteen, kokeellisen työn ja sen tulosten tiivistäminen julkaisutyyppiseksi kokonaisuudeksi ja tutkielman kirjoittaminen. BKEM3596 Loppukuulustelu (yleisteos) (4 ov) Biokemian loppukuulustelulla/yleisteos tarkoitetaan laajaa kirjatenttiä. Sen tarkoituksena on yhteenvetomaisesti koota opiskeluaikana hankitut tiedot järjestäytyneeksi kokonaisuudeksi. Suoritustavat: Opiskelija lukee ja tenttii biokemian yleisteoksen, joka voi olla joko Zubay: Biochemistry, Stryer: Biochemistry, Lehninger, Nelson & Cox: Principles of Biochemistry tai http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (2 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot vastaava. Tentin ottaa vastaan professori Pekka Mäntsälä. BKEM3751 Eukaryoottigenomit (2 ov) BKEM3751 Eukaryotic genomes and gene expression (2 cu) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla käsitellään eukaryoottigenomin organisaatiota: genomin koko, intronit ja eksonit, geenien määrä, soluorganellien genomit, toistosekvenssit, genomin pakkaus, nukleosomit sekä transkriptiota ja RNA:n prosessointia: transkriptiokompleksi, transkription säätely, RNA:n silmukointi, RNA katalyyttinä. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Pekka Mäntsälä. Kirjallisuus: Lewin: Genes VI. BKEM3595 Loppukuulustelu (erikoisteos) (1-3 ov) Luettava erikoisteos valitaan professorin ja opiskelijan yhteisellä päätöksellä ja se voi edustaa opiskelijan opiskelussaan painottamaa biokemian erikoisalaa tai laitoksen dosenttien edustamaa erikoisalaa, kuten biokemiallista toksikologiaa, molekyylimallitusta, proteiinikemiaa, kliinistä kemiaa, fysiologista kemiaa, immunokemiaa. Suoritustavat: Teokseen tutustuminen ja kirjallinen kuulustelu. Pekka Mäntsälä. Esitiedot: Erikoisteos tentitään yleensä erikoistyön suorittamisen jälkeen. BKEM3527 Työskentely tutkimusryhmissä (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Noin neljän viikon mittainen laboratorioharjoitustyö, joka liittyy laitoksella suoritettavaan tutkimukseen. Se antaa opiskelijalle mahdollisuuden tutustua omakohtaisesti johonkin häntä kiinnostavaan tutkimusprojektiin. Voi liittyä aiheeltaan myös erikoistyöhön. Suoritustavat: Kokeellinen laboratoriotyö täysipäiväisesti ja työselostus. Merkinnän saa, kun yliassistentti on hyväksynyt työselostuksen. BKEM3540 Työharjoittelu (2 ov) Koulutusohjelman opintoihin ei sisälly pakollista työharjoittelua. Harjoittelu on kuitenkin erittäin suotavaa kaikilla linjoilla. Harjoittelun voi sisällyttää valinnaisiin syventäviin opintoihin maksimimäärän ollessa 2 ov. Neljä harjoitteluviikkoa vastaa yhtä opintoviikkoa. Työharjoittelun sopivuudesta korvaaviksi opinnoiksi on hyvä neuvotella etukäteen linjan professorin kanssa. Jos harjoittelu suoritetaan muualla kuin yliopistossa, tulee siitä kirjoittaa raportti, joka jätetään linjan professorille. BKEM3761 Monimuotoiset geenit (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään molekyylibiologian uusimpiin saavutuksiin luentojen ja kirjallisuuden avulla tarkoituksena opiskelijan tietomäärän lisääminen erityisesti http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (3 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot molekyylibiologisen tutkimuksen painopistealoilla mahdollisine käytännön sovellutuksineen. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, keskusteluihin ja päättökuulusteluun. Pekka Mäntsälä. Kirjallisuus: Luentojen yhteydessä referoitavat alkuperäisjulkaisut ja Lewin: Genes VI. Esitiedot: Opintojaksot: Aineenvaihduntaluennot, Perusharjoitustyöt, Geenien ilmeneminen, Geenien säätely, Biotekniikan perusteet sekä Molekyylibiologian harjoitustyöt suoritettu. BKEM3740 Proteiinien puhdistusmenetelmät (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luentokurssilla selvitetään keskeisimmät ja uusimmat proteiinien puhdistusmenetelmät. Luentosarjaan liittyy demonstraatio proteiinipuhdistuksen strategiasta. Suoritustavat: Luentojen päättökuulustelu tai oppikirja Scopes R., Protein Purification, Springer Verlag (1982), s. 282 tai Janson J-C & Ryden L., Protein Purification, VCH Publishers (1989), s. 502. Professori. Esitiedot: Aineenvaihduntaluennot ja Perusharjoitustyöt suoritettu. BKEM3588 Sekvenssianalytiikka ja biotietoverkot (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa perustaidot nukleotidi- ja proteiinisekvenssien analysointiin ja tiedon hankkimiseen Internetistä. Kurssilla perehdytään GCG:n Wisconsinsekvenssianalysointiohjelmistoon sekä tutustutaan Internetin tarjoamiin mahdollisuuksiin sekvenssien analysoinnissa ja muun biotieteilijöille tärkeän tiedon hankinnassa. Biokemian assistentti. Suoritustavat. Osallistuminen luennoille ja tietokoneharjoituksiin sekä kurssin lopussa annettujen tehtävien suorittaminen. Esitiedot: Molekyylibiologian harjoitustyöt perusosa (3ov) ja jatko-osa (2 ov) suoritettu. BKEM3545 Bioenergetiikka (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään siihen, miten Escherichia coli tuottaa ja käyttää biokemiallista energiaa. Luentoihin liittyy kolme seminaaria, joissa tutustutaan asiaan alan uusimpia julkaisuja lukemalla. Osallistuminen seminaareihin on edellytys kurssin suorittamiselle. Loppukuulustelua ei järjestetä. Jukka Heinonen. BKEM3102 Biokemian opetusharjoittelu (1-4 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opetusharjoittelussa opiskelija toimii avustavana assistenttina jollakin biokemian koulutusohjelman harjoitustyökurssilla. Kurssista vastaava assistentti harkitsee työmäärän sekä päättää, kuinka monta opintoviikkoa ko. kurssin opetusharjoittelu on. Assistentti ilmoittaa kansliaan rekisteriin vientiä varten suoritetun opetusharjoittelun sekä kirjoittaa opiskelijalle todistuksen opetusharjoittelusta. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (4 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot BKEM3561 Analyyttinen biokemia (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Perehdyttää opiskelijat biokemiallisten yhdisteiden analytiikassa käytettäviin uusimpiin menetelmiin. Suoritustavat: Oppikirjan Holme, D. & Peck, H., Analytical Biochemistry, Longman, 3. painos tenttiminen erikseen ilmoitettavina tenttipäivinä. BIOTEKNIIKAN LINJA BKEM3752 Bioteknillistä diagnostiikkaa (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla käsitellään esimerkkitapausten valossa seuraavia diagnostiikan osa-alueita: immunokemialliset määritykset, sydäninfarktidiagnostiikka, reseptoririntasyöpädiagnostiikka. Opiskelijat perehtyvät oma-aloitteisesti alkuperäisaineistoon ja pitävät osa-aluekohtaisen alustuksen keskusteluineen. Toteutetaan osittain englanniksi. Suoritustavat: Aktiivinen osallistuminen kurssille (pakollinen). Kurssi suoritetaan opintojen ohjeellisena aikana (kolmannen opiskeluvuoden keväällä), muulloin suoritetaan karsintaa. Timo Lövgren. BTEK4025 Syventävien opintojen harjoitustyöt (6 ov) BTEK4025 Laboratory Course in Biotechnology (6 cu) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden tavoitteena on perehdyttää biotekniikan suuntautumisvaihtoehdon opiskelijat laitoksella tehtävään biotekniikan tutkimukseen. Opiskelijat osallistuvat 6 viikon ajan eri tutkimusryhmien toimintaan tekemällä itsenäisesti kaksi 3 viikon harjoitustyöjaksoa. Opiskelija voi tehdä harjoitustyöt itselleen sopivana aikana joko syys- tai kevätlukukaudella heti kun biotekniikan aineopintojen harjoitustyöt ja molekyylibiologian harjoitustyöt on suoritettu. Harjoitustyöaiheista on luettelo biotekniikan assistentilla, jolle myös ilmoittaudutaan töihin tultaessa. Suoritustavat: Harjoitustöiden suoritus, osallistuminen neljään "show and tell" -tilaisuuteen, joita pidetään vähintään kaksi kertaa lukukaudessa sekä hyväksyttävät työselostukset, jotka tulee palauttaa assistentille kuuden (6) kuukauden kuluessa työn lopettamisesta. Opetus annetaan osittain englanniksi. Biotekniikan assistentti. Esitiedot: Biotekniikan aineopintojen harjoitustyöt ja molekyylibiologian harjoitustyöt, perusosa suoritettu. BTEK4009 Loppukuulustelu 4 ov Biotekniikan loppukuulustelulla tarkoitetaan laajaa kirjatenttiä. Sen tarkoituksena on yhteenveto-omaisesti koota opiskeluaikana hankitut tiedot järjestäytyneeksi kokonaisuudeksi. Suoritustavat: Opiskelija lukee ja tenttii biotekniikan professorin kanssa sovittavat teokset. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (5 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot BTEK3100 Solu- ja entsyymiteknologia (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luentosarjassa käsitellään eläin- ja kasvisolujen viljelyä ja viljelmien käyttöä terapeuttisten aineiden ja proteiinien tuottamiseen, kasvinlisäykseen ja jalostukseen sekä selvitetään entsyymien tuottoa, puhdistusta ja käyttöä analyyttisiin, terapeuttisiin ja teollisiin sovellutuksiin. Suoritustavat: Luennot (2 ov) Loppukuulustelut. Timo Lövgren. BTEK3101 Biotekniikan uusimmat laboratoriotyömenetelmät (2 ov) Tehdään vuosittain vaihtuvista aiheista. Matti Karp. BTEK3546 Biotekniikan sovellukset (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Vaihtuva-aiheinen opintojakso, joka soveltuu sekä perustutkinnon syventäviin opintoihin että jatko-opintoihin. Opintojaksossa käsitellään yhtä tai muutamia seuraavista aiheista: lääkeaineiden ja eräiden muiden kemiallisten yhdisteiden teollinen tuotto, biokemiallisten prosessien säätö ja optimointi, geeni- ja immunoteknologian hyödyntäminen biotekniikassa, soluviljelytekniikat, entsyymien tuottaminen, hyväksikäyttö ja rakennemuokkaus. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Timo Lövgren. BKEM4045 Trends in Biotechnology (2 cu) Biotekniikan uusimmat suunnat (2 ov)the course is being held as "Journal Club" -type consisting of 72 lectures from selected publications by the students themselves. The areas selected change from year to year and this autumn we shall cover the following topics: Expression methods for recombinant proteins, Reporter genes, Phage and other suface display methods, Combinatorial chemistry libraries for the search of new leads of pharmaceutical interest, Recombinant receptors and signal transduction in drug design. Matti Karp. BTEK1016 Nukleiinihappojen biotekniset sovellutukset (2 ov) BTEK1016 Biotechnological Applications in Nucleic Acids (2 cu) Tavoitteet ja sisältö: Kurssi perehdyttää opiskelijat alan ajankohtaisiin biotekniikan sovellutuksiin ja niiden kehitysnäkymiin. Luennoilla käsitellään mm. nukleiinihapposekventointia, merkkiaineteknologioita, hybridisaatiomenetelmiä, nukleiinihappojen monistusta ja perinnöllisten sairauksien osoitusta. Luennoidaan englanniksi. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Timo Lövgren. Kirjallisuus: Luennoilla jaettava materiaali ja alan julkaisut. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (6 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot BTEK Lopputentti (erikoisteos) 2 ov Opiskelija valitsee tentittävän teoksen keskusteltuaan asiasta professorin kanssa. Katso seuraavien kurssien kuvaukset biokemian linjan kohdalta. BTEK4027 Erikoistyö (20 ov) BTEK4028 Erikoistyöseminaari (1 ov) BTEK4007 Pro gradu -tutkielma (8 ov) BTEK4021 Opetusharjoittelu (1-4 ov) BTEK1017 Työharjoittelu (1-2 ov) ELINTARVIKEKEMIAN LINJA FOOD8904 Hiilihydraatit (1 ov). Kurssilla käsitellään elintarvikkeiden hiilihydraatteja, niiden tehtäviä ja ominaisuuksia sekä keskinäistä toimintaa ja reaktioita sekä biologisten muutosten vaikutusta elintarvikkeiden laatuun ja ominaisuuksiin hiilihydraattien osalta. Kurssi koostuu luennoista, kirjallisista harjoituksista ja tehdasvierailuista. Rainer Huopalahti. Esitiedot: Linjan aineopintojen suoritus. Kirjallisuus: Whistler, R.L. ja BeMiller, J.N.: Carbohydrate Chemistry for Food Scientists. (American Association of Cereal Chemists Inc. MS 1997) ja Alistair M. Stephen: Food polysaccharides and their applications. (Marcel Dekker, 1995). FOOD3813 Aromit (1 ov). Tarkastelun kohteena ovat eri elintarviketyyppien ja elintarvikkeiden haihtuvat aromiaineet. Erityinen huomio kiinnitetään yhdisteiden luokitteluun, analytiikkaan, entsymaattiseen ja eientsymaattiseen muodostumiseen sekä merkitykseen ravinnon osana. Heikki Kallio. Suoritustavat: Luennot, luentomoniste ja alan julkaisujen analysointi. Esitiedot: Linjan aineopintojen suoritus. FOOD3823 Luonnon värit (1 ov). Luonnon väreistä flavonoidit (erityisesti antosyaniinit), betalaiinit, klorofyllit, globiinivärit ja karotenoidit sisältyvät opetusohjelmaan. Yhdisteiden rakenteiden ja esiintymisen lisäksi tarkastellaan niiden käyttäytymistä ja merkitystä elintarvikkeissa. Heikki Kallio. Suoritustavat: Luennot, kirjalliset harjoitustehtävät sekä lyhyet seminaarit. Kirjallisuus: Hendry G.A.F. and Houghtont, J.D.(ed) 1996: Natural Food Colorants. Esitiedot: Linjan aineopintojen suoritus. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (7 of 14)13.2.2006 15:07:05
Syventävät opinnot FOOD3814 Lipidit I (1 ov). Tarkastellaan lipidien koostumusta, esiintymistä ravinnossa ja biokemiallisia reaktioita. Tavoitteena on antaa yleiskuva alueesta erityisesti tuotekehityksen, ravitsemuksen ja elintarvikevalvonnan tarpeisiin. Kurssi muodostuu luennoista ja kirjallisista harjoituksista. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Gurr M.I. and Harwood J. L.: Lipid biochemistry. An Introduction, 4. painos Esitiedot: Linjan aineopintojen suoritus. FOOD8905 Proteiinit (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on elintarvikkeissa käytettävien proteiinien ja niiden rakenteiden tarkastelu siten, että voidaan hyödyntää prote-iinien teknologisia ja ravitsemuksellisia ominaisuuksia ja ymmärtää niiden suhteita elintarvikkeissa. Kurssi muodostuu luennoista ja luentomonisteesta. Vastuuhenkilöt Seppo Salminen ja Raija Tahvonen. Esitiedot: Linjan aineopintojen suoritus. FOOD3688 Elintarvikkeiden lisäaineet (2 ov) Tavoitteet ja sisältö: Opiskelijat perehdytetään lisäaineiden kemiaan ja elintarviketeknologiseen merkitykseen selvittämällä opiskelijoille lisäaineiden ryhmittelyä, käyttötarkoitusta ja haitattomuuden testaamista sekä analysointia ja säädöksiä. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Seppo Salminen. FOOD3683 Elintarvikkeiden laadunohjaus (1 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tarkoituksena on tutustuttaa opiskelijat elintarvikkeiden laadunvalvontaan ja -ohjaukseen teoriassa ja käytännössä. Luennoilla perehdytään laadunohjaukseen ja laadun optimointiin, laadunohjauksen organisaatioon ja laatukustannuksiin. Kurssin yhteydessä tutustutaan eri elintarviketeollisuusalojen käyttämiin laadunvalvonta- ja ohjausmenetelmiin. Kurssilla perehdytään myös elintarvikelaboratorion analyyttiseen laadunvarmistukseen ja hyvään laboratoriokäytäntöön (GLP). Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, demonstraatioihin ja päättökuulusteluun. Luennoidaan joka toinen vuosi. Seppo Salminen Kirjallisuus: Anon. 1990: Elintarvikelaboratorioiden GLP-periaatteet kemiallisia määrityksiä varten. NMKL-raportti no 8. ÄK-LIVS 1990: 1F. NORD 1990:48F, Biaudet, R. & Virtanen, V. 1995: ISO-9000 perusta toiminnan kehittämiselle. 5 s., Tekninen Tiedotus 3/90. metalliteollisuuden kustannus Oy, Helsinki. 84 s., Elintarvikevirasto. 1994: Elintarvikelaboratorioiden menettelytapaohjeet. Valvonta 3/94. Helsinki (1/17-17/17)., elintarvikevirasto. 1994: HACCP-järjestelmä. Periaatteet ja soveltaminen. Valvonta 2/1994. http://www.sci.utu.fi/tdk/oopas/99-00/biokemia/syventavat.html (8 of 14)13.2.2006 15:07:05