Psoriaasi (psoriasis vulgaris) on monella tavalla
|
|
- Ville-Veikko Majanlahti
- 7 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 Katsaus Miten psoriaasi syntyy monitekijäisen taudin geenien jäljillä Kati Asumalahti, Ulpu Saarialho-Kere ja Juha Kere Psoriaasin genetiikka ja patogeneesi askarruttavat edelleen tutkijoita, vaikka ensimmäinen psoriaasin geeniassosiaatio löydettiin jo yli 20 vuotta sitten ja ihmisen perimä on nyt kokonaan sekvensoitu. Psoriaasin genetiikka on hyvä malli monitekijäisten tautien geenitutkimukselle yleensä. Uudet löydökset ihmisen perimän hienorakenteesta auttavat ymmärtämään tähänastisen tutkimuksen vaikeuksia, asettavat uusia haasteita ja luovat näköaloja siihen, miten tieto geneettisestä komponentista muutetaan tiedoksi riskigeeneistä monissa muissakin taudeissa. Psoriaasi (psoriasis vulgaris) on monella tavalla ihanteellinen lääketieteellinen tutkimuskohde tautien patogeneesistä kiinnostuneille. Se on tavallinen sairaus: sen esiintyvyydeksi arvioidaan 2 3 %, ja se kuormittaa sekä avohoitovastaanottoja että ihotautiosastoja. Diagnoosi on kliininen ja kokeneelle lääkärille helppo. Sairas kudos on helposti tutkittavissa jopa lievästi invasiivisin menetelmin ilman suurta haittaa näytteitä voidaan ottaa paitsi sairaasta kohdasta myös tarvittaessa terveistä ihonkohdista. Kudosopilliselta rakenteeltaan iho on ainakin päällisin puolin melko yksinkertainen, sillä sen pääsolutyypit ovat keratinosyytit epidermiksessä ja fibroblastit dermiksessä, joskin lukuisat hienorakenteet (karvatupet, hikirauhaset) monimutkaistavat kuvaa. Iho on immunologisesti aktiivinen kudos, ja solutyypeistä vähemmistönä esiintyvät makrofagit, dendriittiset solut ja lymfosyytit ovat merkityksellisiä myös psoriaasin patogeneesissä. Yhdessä suhteessa psoriaasitutkija on huonommassa asemassa kuin monen muun tavallisen taudin tutkijat: psoriaasille ei tunneta luonnollista eläinmallia, ja lukuisat siirtogeenisillä hiirillä aikaansaadut psoriaasin kaltaiset ihotulehdusmallit eivät vastaa ihmisihon fysiologisia mekanismeja (Schon 1999). Alttiusgeenit ja psoriaasi Perinnöllisyydellä on kiistämätön osuutensa psoriaasin synnyssä. Joka kolmannella psoriaasipotilaalla on samaa tautia sairastavia sukulaisia. Identtisillä kaksosilla toisen parikin sairastumisriski on noin 70 %, jos toisella on tauti. Psoriaasin vahva yhteys HLA-alueen merkkigeeneihin on tunnettu jo 1970-luvulta lähtien, ja suomalaiset tutkijat tekivät vuosikymmenen lopulla tärkeän alkuperäishavainnon psoriaasin vahvasta yhteydestä HLA-Cw6-alleeliin (Tiilikainen ym. 1980). Jopa puolella alle 40-vuotiaista psoriaasipotilaista on tämä alleeli, vaikkakin sen omaavista vain noin joka kymmenes sairastuu (kuva 1). Tämä tilanne onkin tyypillinen taudeille, jotka syntyvät perintö- ja ympäristötekijöiden yhteisvaikutuksesta. Geenin olemassaolo ei suinkaan merkitse todennäköistä sairastumista vaan vain suurentunutta riskiä, ja ilman geeniäkin taudin voi saada (Kere 2000). Toisaalta tunnetaan lukuisia ympäristötekijöitä, Duodecim 2003;119:
2 Koko väestö Riskigeeni Psoriaasi 10 % 2 3 % Kuva 1. Monitekijäinen tauti ja sen alttiusgeeni väestössä; esimerkkinä psoriaasi. Koko väestöstä (suuri ympyrä) pieni osa, 2 3 %, sairastuu psoraasiin (pienin ympyrä). Alttiusgeeni on noin 10 %:lla väestöstä (keskikokoinen ympyrä). Psoriaasiin sairastuneista kuitenkin noin puolella on alttiusgeeni, joten sen yhteys tautiin on tilastollisesti erittäin merkitsevä. Alttiusgeenin omaavista vain osa sairastuu; geenin penetranssin sanotaan olevan pienentynyt. Penetranssiin saattavat vaikuttaa ympäristötekijät, muut geenit tai sattuma. jotka saattavat laukaista psoriaasin. Näihin kuuluvat streptokokki-infektiot, runsas alkoholinkäyttö, tietyt lääkeaineet, ihon vammat, tupakointi ja stressi (Farber ja Nall 1974). Siten psoriaasi kuuluu sairautena niin sanottujen monitekijäisten tautien suureen ryhmään, ja geenit ovat kiistattomasti olennaisia sairastumisriskin osatekijöitä. Myöhemmät geneettiset kytkentätutkimukset ovat vahvistaneet HLA-alueen merkityksen ja osoittaneet, että kyseessä on tärkein alttiusgeenialue ihmisen perimässä. Tälle kromosomissa 6p sijaitsevalle psoriaasin alttiuslokukselle on annettu nimi PSORS1, ja tähän lokukseen kuuluu HLA-C-geenin lisäksi muutamia muitakin geenejä. Kytkentätutkimuksissa on kuitenkin paikannettu HLA-alueen lisäksi ainakin kuusi muuta lokusta (PSORS2 7) (taulukko 1), joissa sijaitsevilla geeneillä on vähäisempi tai väestökohtaisesti rajoittunut riskivaikutus psoriaasin syntyyn (Capon ym. 2002). Tutkimalla suomalaisia PSORS1-lokuksen suhteen riskittömiä psoriaasiperheitä paikansimme uuden riskilokuksen kromosomin 18 lyhyeen haaraan (Asumalahti ym. 2003a). Jokainen paikannustulos saattaa paljastaa patogeneesin kannalta tärkeän geenin sijaintipaikan, mutta vaihtelevat tulokset eri tutkimuksissa saattavat heijastella väestöjen välisiä eroja joidenkin melko harvinaisten altistavien mutaatioiden yleisyydessä. Mistä geneettinen riski johtuu? Näistä selkeistä lähtökohdista huolimatta psoriaasin patogeneettinen mekanismi on vielä olennaisilta osiltaan selvittämättä. Tulokset puhuvat selvästi sen puolesta, että sekä keratinosyyttien poikkeava jakautuminen että lymfosyyttien säätelyrooli ovat olennaisia patogeneesin osatekijöitä, mutta kumpi on muna ja kumpi kana, on yhä epävarmaa. Tutkimus on keskittynyt viime vuosina etenkin tärkeimmän, PSORS1-lokuksessa sijaitsevan alttiusgeenin etsintään ja sen kautta alttiuden molekyylimekanismin selvittämiseen. Psoriaasin ja HLA-Cw6-alleelin välinen voimakas geneettinen yhteys tarjoaa hyvän lähtökohdan psoriaasin patogeneesin tutkimukselle. Sijaitseehan tämä yhteys ikään kuin patogeneet- Taulukko 1. Varmistetut psoriaasilokukset PSORS1 7, niiden sijainti kromosomistossa sekä lokuksen Online Mendelian Inheritance in Man -numero (OMIM) ( OMIM tarjoaa kustakin lokuksesta lyhyen tiivistelmän ja kirjallisuusluettelon. Lokus Sijainti OMIM-numero Havaintoa tukevat tutkimusaineistot PSORS1 6p21.3 * Lähes kaikki tutkitut PSORS2 17q25 * Yhdysvaltalainen ja saksalainen PSORS3 4q35 * Yksi suuri irlantilainen perhe PSORS4 1q21 * Italialainen PSORS5 3q21 * Ruotsalainen PSORS6 19p13 * Saksalainen PSORS7 1p * Englantilainen 1518 K. Asumalahti, ym.
3 tisten mekanismien solmukohdassa; se yhdistää toisiinsa käsitteellisesti sisäsyntyisen alttiuden ja immuunimekanismin. Mutta mikä voisi olla yhteyden ja alttiuden takana? Havaitulle HLA-Cw6-alleelin geneettiselle assosiaatiolle voi olla kaksi vaihtoehtoista selitystä. Joko assosioituva alleeli itse on patogeneettisesti merkittävä tai sitten tärkeä geeni sijaitsee perimässä hyvin lähellä ensin havaittua assosioituvaa geeniä, jolloin yhteys kertoo vain naapurigeenin vaikutuksesta. HLA-C-geeni kuuluu luokan I kudosantigeeneihin, jolloin ajateltavissa olevat patogeneettiset mekanismit liittyisivät immuunijärjestelmän virheelliseen säätelyyn. Viimeaikaisissa tutkimuksissa onkin etsitty mahdollisia yhteisiä epitooppeja HLA-Cw6-alleelin ja esimerkiksi streptokokin antigeenien välillä. Ajatuksena on ollut löytää tunnetun ympäristöalttiustekijän ja sisäsyntyisen alttiuden yhteinen tekijä. Vuosikymmeniä jatkuneesta tutkimuksesta huolimatta mahdolliset immunologiset laukaisumekanismit ovat kuitenkin yhä hypoteeseja (Bos ja De Rie 1999). Kun genomiprojektin edetessä koko HLAalueen DNA-sekvenssi luettiin, tuli mahdolliseksi tarkastella järjestelmällisesti myös HLA-Cgeenin naapurigeenejä. Ensimmäinen suurta mielenkiintoa herättänyt uusi geeni löytyi noin emäsparin etäisyydeltä HLA-C-geenistä (kuva 2). Myös S-geeniksi nimetty, ihon korneodesmosiinivalkuaista koodaava CDSN-geeni olikin toiminnallisesti lupaava ehdokas psoriaasin alttiusgeeniksi. Korneodesmosiinia syntyy ihossa keratinosyyttien erilaistumisen myöhäisvaiheessa, ja sen pilkkoutuminen marraskeden kypsyessä johtaa keratinosyyttien hilseilyyn ihon pinnasta, mikä taas on psoriaasissa häiriintynyt (Guerrin ym. 1998). CDSN-geenin ja HLA-Cgeenin välissä sijaitsee kuitenkin viisi muutakin geeniä (kuva 2), jotka siis sijaintinsa puolesta voisivat yhtä hyvin tulla kysymykseen varsinaisina alttiusgeeneinä (Capon ym. 2002). Yksi tapa ratkaista ongelma on tietysti tutkia kunkin geenin monimuotoisuutta (polymorfismia) ja etsiä geenien joukosta se, jolla on vahvin yhteys psoriaasiin. Tulokset osoittivat, että muista geeneistä yhdellä, HCR-geenillä, oli runsaasti vaihtoehtoisia muotoja, osin jopa sen koodaaman valkuaisen rakenteeseen vaikuttavia (Asumalahti ym ja 2002). Tietty muoto, ns. HCR*WWCC-alleeli, assosioituu lisäksi jokseenkin yhtä voimakkaasti psoriaasin kanssa kuin HLA-Cw6. Yhteyden havaittiin olevan useissa eri väestöissä samanlainen, mikä osaltaan vahvistaa ajatusta geenin roolista yleisenä patogeneettisenä tekijänä. Jäljelle jäi vain yksi mutta: selvää voittajaa ei voitu julistaa HLA- Cw6:n ja HCR*WWCC:n välisessä kilpailussa tautiassosiaation voimakkuudesta (Asumalahti ym. 2002, Veal ym. 2002). Sen sijaan CDSN jäi hieman heikommin assosioituvaksi. Miten tämä on ymmärrettävissä? Perimän hienorakenne ihmiskunnan lyhyestä historiasta on etuja ja haittoja tautigeenien etsimisessä Ihmisgenomin rakenteeseen kohdistunut, viime vuosina yhä yksityiskohtaisempi tutkimus on paljastanut yllättävän tuloksen, jolla on suuri cen 100 kb 17 kb 39 kb tel TCF19 HLA-C OTF3 HCR SPR1 CDSN STG SEEK1 Kuva 2. PSORS1-lokuksen geenikartta. Geenit, joilla on psoriaasiin vahvasti assosioituva muoto, on merkitty mustin laatikoin ja muut geenit avoimin laatikoin. cen (sentromeeri) ja tel (telomeeri) ilmaisevat kartan orientaation kromosomin 6 lyhyessä haarassa. Etäisyysasteikko on tuhansia emäksiä (kb). Geenien nimien perusteella voidaan hakea tiivistelmä niitä koskevista tutkimustuloksista OMIM-tietokannasta ( Miten psoriaasi syntyy monitekijäisen taudin geenien jäljillä 1519
4 vaikutus tautigeenitutkimukseen. On osoittautunut, että noin vuotta sitten ihmiskunta on kokenut ns. pullonkaulailmiön, jonka seurauksena vielä nykyäänkin havaitaan kussakin perimän kohdassa keskimäärin vain hieman yli viisi erilaista haplotyyppirakennetta, sadoista tai tuhansista teoriassa mahdollisista (Reich ym. 2001, Gabriel ym. 2002). Tämä hienorakenteen ilmiö näkyy vasta tarkasteltaessa DNA:n monimuotoisuutta jokseenkin lyhyissä jaksoissa, emäksen alueilla. Se on selvimmin näkyvissä, kun tutkitaan useissa väestöissä tavallisia alleeleita. Toisin sanoen perimää jatkuvasti muokkaavat rekombinaatiot eli tekijäinvaihdunnat jokaisen sukusolun kypsymisen yhteydessä eivät ihmiskunnan historian viime vuoden aikana ole vielä ehtineet purkaa perimässä hyvin lyhyellä matkalla esiintyviä emäsmuutosten välisiä yhteyksiä. Perimämme voidaan ajatella koostuvan muutamien tuhansien tai kymmenientuhansien emästen mittaisista niin sanotuista blokeista, joista on olemassa vain muutamia vaihtoehtoisia muotoja (kuva 3). Niiden vaihteleva yhdistely on tuottanut ihmiskunnan nykyisen monimuotoisuuden. Vielä kiistellään siitä, johtuuko blokkirakenne vain lyhyen historian ja sattumanvaraisten rekombinaatioiden yhdistelmästä vai onko perimän rakenteessa todella eroja,»kuumia» ja»kylmiä» kohtia rekombinaatioiden sijoittumiselle. Jatkuvasti syntyvät uudet mutaatiot eli emästen muutokset tietysti muokkaavat ja murentavat tätä yksinkertaista kuvaa. Ilmiö havaitaan väestössä harvinaisia polymorfismeja tutkimalla. Psoriaasin ratkaisemattomassa alttiusgeeniassosiaatiossa saattaa siis olla kysymys siitä, että rekombinaatiot HLA-C-geenin, HCR-geenin ja jopa CDSN-geenin välillä ovat niin harvinaisia, että oikea alttiusalleeli on jo kymmenientuhansien vuosien ajan kulkenut yhdessä tiettyjen naapurialleelien kanssa, eikä helppoon ratkaisuun päästä pelkästään geneettisen tutkimuksen avulla. Yrityksestä ei kuitenkaan ole luovuttu: kansainvälisessä yhteistyössä suunnitellaan aiempia tutkimuksia kymmenen kertaa suuremman aineiston yhteisanalyysia. Sen avulla voisi olla mahdollista löytää riittävästi harvinaisia rekombinaatioita geenien välillä, jotta syysuhteeseen ja naapuripaikkaan perustuvat geeniassosiaatiot voitaisiin erottaa toisistaan. A B C D Haplotyyppiblokki 4 vaihtoehtoista muotoa (esim. 2 8 = 256 mahdollisesta yhdistelmästä) 1 = tavallisempi alleeli 2 = harvinaisempi alleeli kahdesta vaihtoehtoisesta emäksestä Kuva 3. Ihmisen genomin hienorakenne. Tarkasteltaessa toisiaan hyvin lähellä (satojen tai tuhansien emästen välein) sijaitsevia monimuotoisia kohtia on havaittu, että ne periytyvät yhdistelminä, ns. haplotyyppiblokkeina (kuvassa merkitty numeroyhdistelmin, esim ). Erilaisista yhdistelmistä kussakin perimän kohdassa (kuvassa A D) on keskimäärin vain noin viisi vaihtoehtoista muotoa lukuisista mahdollisista (valkoiset ja harmaat laatikot), ja ne yhdistyvät peräkkäin (kuvassa yksi kromosomi kuvattu valkoisin laatikoin). Tulokset viittaavat vahvasti koko ihmiskunnan yhteiseen alkuperään, kapeaan»pullonkaulaan» sen alkuvaiheissa ja vain noin vuotiseen historiaan»pullonkaulan» jälkeen K. Asumalahti, ym.
5 Perimän niin sanotulla blokkirakenteella on tärkeä merkitys tautigeenien tutkijan kannalta. Toisaalta uutiset ovat huonoja. Kuten psoriaasin esimerkki osoittaa, saatamme tautigeenejä etsittäessä päätyä ratkaisemattomaan tilanteeseen. Kykymme erottaa geenejä loppuu kesken ihmiskunnan liian lyhyen historian vuoksi. Toisaalta tämä havainto merkitsee hyviä uutisia. Voimme odottaa, että moni alttiusgeeni naapureineen on mahdollista paikantaa perimään tutkimalla blokkien tautiyhteyksiä. Tämä työhypoteesi onkin johtanut uuden suuren kansainvälisen yhteishankkeen HapMap-projektin käynnistymiseen. Sen tavoitteena on kuvata koko ihmisen perimän laajuisesti sen blokkirakenne. Hankkeen nimi viittaa haplotyyppikarttaan. Psoriaasia muistuttavat taudit ja geenitutkimus Myös psoriaasin kaltaisten mutta kliinisesti siitä erillisten tautien tutkimus voi valaista eri geenien osuutta. Palmoplantaarinen pustuloosi, jota luonnehtivat steriilit märkärakkulat punoittavalla, hilseilevällä käsien ja jalkapohjien iholla, luokitellaan usein psoriaasin paikalliseksi muodoksi, ja neljänneksellä sitä potevista on myös psoriaasi. Psoriasis guttata, jolle ovat tyypillisiä lapselle tai nuorelle nopeassa tahdissa erityisesti streptokokki-infektion jälkeen ilmaantuvat punoittavat pienet papulaiset hilseilevät muutokset, edeltää usein myöhemmin kehittyvää psoriaasia. Näiden tautien geneettinen tutkimus osoitti, että guttatamuoto on yhteydessä yhtä vahvasti kaikkiin PSORS1- alueen geeneihin kuin psoriaasikin. Sen sijaan palmoplantaarinen pustuloosi vaikuttaa geneettisesti kokonaan eri taudilta (Asumalahti ym. 2003b). Geenitutkimus on siten pystynyt vastaamaan kauan esillä olleeseen kliiniseen kysymykseen YDINASIAT samankaltaisten mutta kuitenkin eri tautien sukulaisuudesta sekä niiden patogeneesin yhtäläisyyksistä ja eroista. Ehdokasgeenien toiminnallinen tutkimus Varsinaisen genetiikan lisäksi molekyylibiologia tarjoaa tietysti monia muitakin työkaluja geenien toiminnan tutkimukseen. Erityisesti psoriaasitutkimuksen ongelmana on kuitenkin luonnollisen hiirimallin ja muidenkin eläinmallien puuttuminen kokonaan. Kun HCR-geenin fysiologinen tehtävä on täysin tuntematon, yksi keino sen toiminnan selvittämiseen on siirtogeenisten hiirien tuottaminen. Päätimme tuottaa hiiriä, joilla HCR-geeniä ilmennetään ihossa sopivan promoottorin avulla. Vaikka lopullisia tuloksia näistä tutkimuksista saadaan vielä odottaa, näyttää siltä, että ilmentämällä HCR-geenin alttiusmuotoa hiiren ihossa saadaan aikaan samankaltaisia muutoksia muiden geenien säätelyssä kuin ihmisen psoriaattisessa ihossa, vaikka hiirelle ei synnykään ihmisen psoriaasia muistuttavaa ihosairautta (julkaisemattomia havaintoja). Tutkimalla kerralla tuhansien geenien säätelyn muuttumista DNA-sirujen avulla voidaan saada runsaasti tietoa sellaisessakin tilanteessa, jossa siirtogeenisen hiiren ilmiasu ei muutu tai tauti ei ilmene siinä. Tutkimustulokset auttavat parhaassa tapauksessa ymmärtämään monitekijäi- Psoriaasin tärkein alttiusgeenialue on PSORS1 lähellä HLA-lokusta kromosomissa 6. Psoriaasille ei tunneta luonnollista eläinmallia, eivätkä lukuisat keinotekoiset psoriaasin kaltaiset hiirimallit ole ratkaisseet ihmisihon fysiologisia mekanismeja. Perimämme on havaittu koostuvan muutamien tuhansien tai kymmenientuhansien emästen mittaisista niin sanotuista blokeista, joista on olemassa vain muutamia vaihtoehtoisia muotoja. Koska ihmiskunnan historia on lyhyt, ei geneettinen tutkimus kykene helposti erottelemaan lähekkäisten geenien riskivaikutuksia. Miten psoriaasi syntyy monitekijäisen taudin geenien jäljillä 1521
6 sen sairauden mekanismia vaihe vaiheelta, samaan tapaan kuin syövissä aiemmin. Taudista geeniin ja geenistä tautiin Patogeneesin ja geneettisen alttiuden tutkimus on yhä suuri haaste useimpien lääketieteellisesti tärkeiden monitekijäisten tautien osalta. Psoriaasi on erinomainen ja yhä haasteellinen mallitauti, ja genomin hienorakenteen uusimmat tutkimustulokset sopivat yhteen vahvasti toisiinsa assosioituvien PSORS1-alueen geenien kanssa. Koska ihmiskunnan historia on liian lyhyt, ei geneettinen tutkimus helposti kykene erottelemaan lähellä toisiaan sijaitsevien geenien riskivaikutuksia. Yhdistämällä molekyyligenetiikan ja molekyylibiologian tutkimusmenetelmiä voidaan silti edetä perustekijöiden tutkimuksessa. Taudin patogeneesin mekanistinen selittäminen edellyttää kuitenkin runsaasti monitieteistä yhteistyötä. Genomiprojektin valmistuminen on tarjonnut tautimekanismien tutkimukselle erinomaiset mahdollisuudet. *** Outi Elomaa, Johanna Lahtinen, Tarja Laitinen, Inkeri Majuri ja Sari Suomela työskentelevät psoriaasiryhmässämme ja ovat keskeisesti osallistuneet tässä kuvattuun tutkimukseemme. Suomalaisen psoriaasikonsortion työhön ovat osallistuneet seuraavat kliinikkotutkijat: Raija Itkonen-Vatjus, Christer Jansén, Jaakko Karvonen, Seija-Liisa Karvonen, Katri Kivekäs, Timo Reunala, Erna Snellman ja Tutta Uurasmaa. Ilman heidän panostaan geenitutkimukset eivät olisi mahdollisia. Kirjallisuutta Asumalahti K, Laitinen T, Itkonen-Vatjus R, ym. A candidate gene for psoriasis near HLA-C, HCR (Pg8), is highly polymorphic with a disease-associated susceptibility allele. Hum Mol Genet 2000; 9: Asumalahti K, Veal C, Laitinen T, ym. Coding haplotype analysis supports HCR as the putative susceptibility gene for psoriasis at the MHC PSORS1 locus. Hum Mol Genet 2002;11: Asumalahti K, Laitinen T, Lahermo P, ym. Psoriasis susceptibility locus on 18p revealed by genome scan in Finnish families unlinked to PSORS1. J Invest Dermatol 2003(a) (painossa). Asumalahti K, Ameen M, Suomela S, ym. Genetic analysis of PSORS1 distinguishes guttate psoriasis and palmoplantar pustulosis. J Invest Dermatol 2003(b);120: Bos JD, De Rie MA. The pathogenesis of psoriasis: immunological facts and speculations. Immunol Today 1999;20:40 6. Capon F, Munro M, Barker J, Trembath R. Searching for the major histocompatibility complex psoriasis susceptibility gene. J Invest Dermatol 2002;118: Farber EM, Nall ML. The natural history of psoriasis in 5,600 patients. Dermatologica 1974;148:1 18. Gabriel SB, Schaffner SF, Nguyen H, ym. The structure of haplotype blocks in the human genome. Science 2002;296: Guerrin M, Simon M, Montezin M, Haftek M, Vincent C, Serre G. Expression cloning of human corneodesmosin proves its identity with the product of the S gene and allows improved characterization of its processing during keratinocyte differentiation. J Biol Chem 1998;273: Kere J. Geenitesteissäkö kohtalomme avaimet? Duodecim 2000;116: Reich DE, Cargill M, Bolk S, ym. Linkage disequilibrium in the human genome. Nature 2001;411: Schon MP. Animal models of psoriasis what can we learn from them? J Invest Dermatol 1999;112: Tiilikainen A, Lassus A, Karvonen J, Vartiainen P, Julin M. Psoriasis and HLA-Cw6. Br J Dermatol 1980;102: Veal CD, Capon F, Allen MH, ym. Family-based analysis using a dense single-nucleotide polymorphism- based map defines genetic variation at PSORS1, the major psoriasis susceptibility locus. Am J Hum Genet 2002;71: KATI ASUMALAHTI, tutkija Helsingin yliopisto, Lääketieteellisen genetiikan osasto ja tautigeenien huippututkimusyksikkö PL 63, Helsingin yliopisto ULPU SAARIALHO-KERE, akatemiatutkija, apulaisopettaja Helsingin yliopisto, iho- ja sukupuolitautien klinikka HUS:n ja iho- ja allergiasairaala HUS JUHA KERE, professori Helsingin yliopisto, Lääketieteellisen genetiikan osasto ja tautigeenien huippututkimusyksikkö och Kliniskt forskningscentrum, Institutionen för biovetenskaper vid Novum Karolinska Institutet Huddinge Sverige 1522
Biopankit miksi ja millä ehdoilla?
Suomalaisen Tiedeakatemian 100 v-symposium, Helsinki 4.9.2008 Biopankit miksi ja millä ehdoilla? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm, Sverige ja Helsingin yliopisto Tautien tutkimus Geeni/ valkuaisaine
LisätiedotPerinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana. Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere
Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere 17.11.2011 Mistä lihastauti aiheutuu? Suurin osa on perinnöllisiä Osassa perimä altistaa
LisätiedotPerinnöllisyyden perusteita
Perinnöllisyyden perusteita Eero Lukkari Tämä artikkeli kertoo perinnöllisyyden perusmekanismeista johdantona muille jalostus- ja terveysaiheisille artikkeleille. Koirien, kuten muidenkin eliöiden, perimä
LisätiedotEpigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia 21.1.2014 Epigeneettinen säätely Epigenetic: may be used for anything to do with development, but nowadays
LisätiedotVallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Vallitseva periytyminen Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; and the London IDEAS Genetic
LisätiedotKEESHONDIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS
KEESHONDIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS 2 3. 0 1. 2 0 1 1 K A A R I N A Marjut Ritala DNA-diagnostiikkapalveluja kotieläimille ja lemmikeille Polveutumismääritykset Geenitestit Serologiset testit Kissat, koirat,
LisätiedotGeenitutkimuksista. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Geenitutkimuksista Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; Huhtikuussa 2008 Tätä työtä
LisätiedotX-kromosominen periytyminen. Potilasopas. TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, 20521 Turku puh (02) 3131 390 faksi (02) 3131 395
12 X-kromosominen periytyminen TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, 20521 Turku puh (02) 3131 390 faksi (02) 3131 395 FOLKHÄLSANS GENETISKA KLINIK PB 211, (Topeliusgatan 20) 00251 Helsingfors tel (09)
LisätiedotGeneettisen tutkimustiedon
Geneettisen tutkimustiedon omistaminen Tutkijan näkökulma Katriina Aalto-Setälä Professori, sisätautien ja kardiologian erikoislääkäri Tampereen Yliopisto ja TAYS Sydänsairaala Etiikan päivät 9.3.2016
LisätiedotPeittyvä periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Peittyvä periytyminen Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; and the London IDEAS Genetic
LisätiedotNarkolepsian immunologiaa ja Pandemrixiin liittyvät tutkimkset
Narkolepsian immunologiaa ja Pandemrixiin liittyvät tutkimkset Outi Vaarala, Immuunivasteyksikön päällikkö, THL Narkolepsian kulku - autoimmuunihypoteesiin perustuva malli Hypokretiinia Tuottavat neuronit
LisätiedotKEESHONDIEN MHC II-GEENIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS
KEESHONDIEN MHC II-GEENIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS Koirilla esiintyy useita erilaisia perinnöllisiä sairauksia samalla tavalla kuin ihmisilläkin. Rotuhistoriasta johtuen perinnöllisten sairauksien yleisyys
LisätiedotTerveyteen liittyvät geenitestit
Terveyteen liittyvät geenitestit Terveyteen liittyvät geenitestit Jokaisella meistä on vanhemmiltamme perittynä oma yksilöllinen geenivalikoimamme. Tämä geneettinen rakenteemme yhdessä erilaisten ympäristön
LisätiedotPerinnöllisyyden perusteita
Perinnöllisyyden perusteita Perinnöllisyystieteen isä on augustinolaismunkki Gregor Johann Mendel (1822-1884). Mendel kasvatti herneitä Brnon (nykyisessä Tsekissä) luostarin pihalla. 1866 julkaisu tuloksista
LisätiedotGeenikartoitusmenetelmät. Kytkentäanalyysin teoriaa. Suurimman uskottavuuden menetelmä ML (maximum likelihood) Uskottavuusfunktio: koko aineisto
Kytkentäanalyysin teoriaa Pyritään selvittämään tiettyyn ominaisuuteen vaikuttavien eenien paikka enomissa Perustavoite: löytää markkerilokus jonka alleelit ja tutkittava ominaisuus (esim. sairaus) periytyvät
LisätiedotParkinsonin tauti on monitekijäinen tauti, jonka synnyssä erilaisilla elämän aikana vaikuttavilla tekijöillä ja perimällä on oma osuutensa.
1 1/2011 Parkinsonin taudin perinnöllisyys Geenien ja ympäristötekijöiden vuorovaikutus sairastumisen taustalla Parkinsonin tauti on monitekijäinen tauti, jonka synnyssä erilaisilla elämän aikana vaikuttavilla
LisätiedotBiologia. Pakolliset kurssit. 1. Eliömaailma (BI1)
Biologia Pakolliset kurssit 1. Eliömaailma (BI1) tuntee elämän tunnusmerkit ja perusedellytykset sekä tietää, miten elämän ilmiöitä tutkitaan ymmärtää, mitä luonnon monimuotoisuus biosysteemien eri tasoilla
LisätiedotBioteknologian perustyökaluja
Bioteknologian perustyökaluja DNAn ja RNAn eristäminen helppoa. Puhdistaminen työlästä (DNA pestään lukuisilla liuottimilla). Myös lähetti-rnat voidaan eristää ja muuntaa virusten käänteiskopioijaentsyymin
LisätiedotEpigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia 12.12.2017 Epigenetic inheritance: A heritable alteration in a cell s or organism s phenotype that does
LisätiedotPotilasopas. 12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu?
12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu? ei halua, että hänen näytettään käytetään näihin tarkoituksiin. Kuten muutkin lääketieteelliset näytteet, DNA katsotaan osaksi potilaan potilasasiakirjoja, joten
LisätiedotIhmisten erilaisuuden geneettinen perusta
hmisten erilaisuuden geneettinen perusta etter ortin hmisen genomin tutkimus on astunut uuteen vaiheeseen kun on alettu tutkia ihmisen geneettisen monimuotoisuuden määrää ja laatua. seita tätä tutkimushanketta
LisätiedotAvainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.
Avainsanat: mutaatio Monitekijäinen sairaus Kromosomisairaus Sukupuu Suomalainen tautiperintö Geeniterapia Suora geeninsiirto Epäsuora geeninsiirto Kantasolut Totipotentti Pluripotentti Multipotentti Kudospankki
LisätiedotAutoimmuunitaudit: osa 1
Autoimmuunitaudit: osa 1 Autoimmuunitaute tunnetaan yli 80. Ne ovat kroonisia sairauksia, joiden syntymekanismia eli patogeneesiä ei useimmissa tapauksissa ymmärretä. Tautien esiintyvyys vaihtelee maanosien,
LisätiedotJokaisesta sairausgeenistä saa lisätietoa klikkaamalla kyseisen sairauden kohtaa ohjelmassa.
Genoscoopper julkaisi MyCatDNA-testin 13.06.2018. MyCatDNA-testi voidaan ottaa niin rodullisesta kuin roduttomasta kissasta ja kaiken ikäisistä kissoista. Testi tarkistaa jokaisesta kissasta yli 40 eri
LisätiedotHarvinaissairauksien diagnostiikan ja hoidon tulevaisuuden näkymiä
Harvinaissairauksien diagnostiikan ja hoidon tulevaisuuden näkymiä Helena Kääriäinen Perinnöllisyyslääkäri Tutkimusprofessori 19.10.2018 Geenitiedosta genomitietoon / Helena Kääriäinen 1 Sidonnaisuudet
LisätiedotKymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet?
Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet? Harvinaiset-seminaari TYKS 29.9.2011 Jaakko Ignatius TYKS, Perinnöllisyyspoliklinikka Miksi Harvinaiset-seminaarissa puhutaan
LisätiedotSELVITYS SIITÄ MITEN ERÄÄT PERINNÖLLISET SAIRAUDET (KUTEN GPRA JA FUCOSIDOSIS) PERIYTYVÄT ENGLANNINSPRINGERSPANIELEISSA
SELVITYS SIITÄ MITEN ERÄÄT PERINNÖLLISET SAIRAUDET (KUTEN GPRA JA FUCOSIDOSIS) PERIYTYVÄT ENGLANNINSPRINGERSPANIELEISSA Kaikki koiran perimät geenit sisältyvät 39 erilliseen kromosomipariin. Geenejä arvellaan
Lisätiedotvauriotyypit Figure 5-17.mhc.restriktio 9/24/14 Autoimmuniteetti Kudosvaurion mekanismit Petteri Arstila Haartman-instituutti Patogeeniset mekanismit
vauriotyypit Kudosvaurion mekanismit Autoimmuniteetti Petteri Arstila Haartman-instituutti Antigeenin tunnistus HLA:ssa pitää sisällään autoimmuniteetin riskin: jokaisella on autoreaktiivisia lymfosyyttejä
LisätiedotTavallisten tautien genetiikkaa
Perinnölliset taudit Tavallisten tautien genetiikkaa Yhden geenin sairaudet Monitekijäiset sairaudet Irma Järvelä Lääketieteellisen genetiikan osasto Helsingin yliopisto 2012 Ilmiasu Säätelevä geeni Alttiusgeeni
LisätiedotPositional cloning. Pedigreessä etenevä ominaisuus kartoitetaan ensin karkeasti ja sitten tehdään yhä tarkempaa työtä molekyylimarkkereilla.
Positional cloning Pedigreessä etenevä ominaisuus kartoitetaan ensin karkeasti ja sitten tehdään yhä tarkempaa työtä molekyylimarkkereilla. Lopulta kohdegeeni sekvensoidaan ja mutaatio tai mutaatiot tunnistetaan
LisätiedotHammaslääketiede Perinnöllisten tautien diagnostiikka ja perinnöllisyysneuvonta
Hammaslääketiede Perinnöllisten tautien diagnostiikka ja perinnöllisyysneuvonta Ryhmäopetus 22.11.2012 Irma Järvelä Ihmisen kromosomisto: 46 kromosomiparia, joista kaksi sukupuolen määräävää: Naiset 46,
LisätiedotMiten väestötutkimuksista ja biopankeista saadaan tietoa yksilöllisestä sairausriskistä?
Miten väestötutkimuksista ja biopankeista saadaan tietoa yksilöllisestä sairausriskistä? Markus Perola, LT, dosentti THL, KATO, Kansantautien geenien tutkimusyksikkö, kvantitatiivisen genetiikan ryhmä
LisätiedotGeenitekniikan perusmenetelmät
Loppukurssikoe To klo 14-16 2 osiota: monivalintatehtäväosio ja kirjallinen osio, jossa vastataan kahteen kysymykseen viidestä. Koe on auki klo 14.05-16. Voit tehdä sen oppitunnilla, jolloin saat tarvittaessa
LisätiedotSÄTEILYN GENEETTISET VAIKUTUKSET
8 SÄTEILYN GENEETTISET VAIKUTUKSET Sisko Salomaa SISÄLLYSLUETTELO 8.1 Ihmisen perinnölliset sairaudet... 122 8.2 Perinnöllisten sairauksien taustailmaantuvuus... 125 8.3 Perinnöllisen riskin arviointi...
LisätiedotMetsägenetiikan sovellukset: Metsägenetiikan haasteet: geenit, geenivarat ja metsänjalostus
Katri Kärkkäinen Matti Haapanen Metsägenetiikan sovellukset: Metsägenetiikan haasteet: geenit, geenivarat ja metsänjalostus Katri Kärkkäinen ja Matti Haapanen Metsäntutkimuslaitos Vantaan tutkimuskeskus
LisätiedotGeenitutkimusta: evoluutiosta kohti geenivarojen suojelua ja jalostusta
Geenitutkimusta: evoluutiosta kohti geenivarojen suojelua ja jalostusta 19.10.2016 Metsätieteen päivä Outi Savolainen, Oulun yliopisto, Genetiikan ja fysiologian tutkimusyksikkö Käyttölisenssi: CC BY 4.0
LisätiedotAstman ja atopian genetiikka miten ehdokasgeenitutkimuksien tuloksia tulkitaan? Tarja Laitinen, Lauri A. Laitinen ja Juha Kere
Genomi Astman ja atopian genetiikka miten ehdokasgeenitutkimuksien tuloksia tulkitaan? Tarja Laitinen, Lauri A. Laitinen ja Juha Kere Astman ja atopian genetiikaa käsittelevien julkaisujen määrä on viimeisten
LisätiedotYleisten tautien ja ominaisuuksien genetiikka kansantautien perimä ja sen merkitys
Yleisten tautien ja ominaisuuksien genetiikka kansantautien perimä ja sen merkitys Markus Perola, LT, geneettisen epidemiologian tutkimusprofessori THL, KATO, GETY markus.perola@thl.fi Määritelmiä L3/13.9.2012
LisätiedotBioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30
Tampereen yliopisto Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe 21.5.2015 Henkilötunnus - Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 30 3. a) Alla on lyhyt jakso dsdna:ta, joka koodaa muutaman aminohappotähteen
LisätiedotTiedonjyväsiä cavalierien geenitestauksista imuroituna maailmalta
Tiedonjyväsiä cavalierien geenitestauksista imuroituna maailmalta Genetiikan tutkijat Englannin Kennel Clubin ja AHT:n kanssa yhteistyössä ovat laatineet seuraavanlaisen artikkelin Episodic Fallingista
LisätiedotKANSAINVÄLINEN KATSAUS AJANKOHTAISEEN YMPÄRISTÖSAIRAUSTUTKIMUKSEEN
KANSAINVÄLINEN KATSAUS AJANKOHTAISEEN YMPÄRISTÖSAIRAUSTUTKIMUKSEEN Suomen Ympäristösairauskeskus perustettiin viime vuonna ajantasaisen ympäristösairaustiedon asiantuntijakeskukseksi. Tavoitteena on ajantasaisen,
LisätiedotMonitekijäisten tautien genetiikka
Juha Kere, Samuli Ripatti ja Markus Perola TEEMA: LEENA PELTONEN-PALOTIE Monitekijäisten tautien genetiikka Monitekijäisillä taudeilla tarkoitetaan sellaisia, paljolti tavallisia tauteja, joiden syntyyn
LisätiedotDNA testit sukututkimuksessa
DNA testit sukututkimuksessa Pakkasten sukuseura ry:n 20 v juhlakokous 19.9.2015 Jyväskylä Raimo Pakkanen, sukuneuvoston pj A,T,G,C. Ihmisen genetiikan lyhyt oppimäärä mtdna diploidinen kromosomisto =
LisätiedotDNA sukututkimuksen tukena
Järvenpää 12,2,2019 Teuvo Ikonen teuvo.ikonen@welho.com DNA sukututkimuksen tukena DNA sukututkimuksessa (Peter Sjölund: Släktforska med DNA) tiesitkö, että olet kävelevä sukukirja? on kuin lukisit kirjaa
LisätiedotEnemmän kuin pintaa - harjoitteluita ja opinnäytteitä Psoriasisliittossa. SoveLi-messut 11.3.2011
Enemmän kuin pintaa - harjoitteluita ja opinnäytteitä Psoriasisliittossa SoveLi-messut 11.3.2011 Psoriasis on tulehduksellinen, pitkäaikainen iho ja tai nivelsairaus, jota sairastaa n. 2,5 3 % väestöstä
LisätiedotTietoa ja tuloksia tutkittavalle: miten ja miksi?
Tietoa ja tuloksia tutkittavalle: miten ja miksi? Helena Kääriäinen tutkimusprofessori 29.1.16 HK 1 Potilaat ja kansalaiset ovat tutkimuksen tärkein voimavara Biopankkien pitäisi olla kansalaisen näkökulmasta
LisätiedotPERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto
PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA Robert Winqvist SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto PROFESSORILIITON SYYSSEMINAARI TUTKIMUSTA KAIKKIEN HYÖDYKSI
LisätiedotMultippeliskleroosi geenitutkimus apuna taudin biologisen palapelin kokoamisessa
Katsaus Suvi P. Kallio, JannA Saarela ja Leena Peltonen-Palotie Multippeliskleroosi geenitutkimus apuna taudin biologisen palapelin kokoamisessa Multippeliskleroosin tiedetään olevan synnyltään monitekijäinen,
LisätiedotMonogeeniset sairaudet. Monogeeninen periytyminen. Perinnöllisten tautien prevalenssi. Monitekijäiset sairaudet. Dominantti vs.
Monogeeniset sairaudet Monogeeninen Pirkka-Pekka Laurila, LL Lääketieteellisen genetiikan osasto, HY Finnish Institute for Molecular Medicine, FIMM Mutaatio yhdessä geenissä riittävä aiheuttamaan sairauden
Lisätiedota. Mustan ja lyhytkarvaisen yksilön? b. Valkean ja pitkäkarvaisen yksilön? Perustele risteytyskaavion avulla.
1. Banaanikärpänen dihybridiristeytys. Banaanikärpäsillä silmät voivat olla valkoiset (resessiivinen ominaisuus, alleeli v) tai punaiset (alleeli V). Toisessa kromosomissa oleva geeni määrittää siipien
LisätiedotYleisten tautien ja ominaisuuksien genetiikka kansantautien perimä ja sen merkitys
Yleisten tautien ja ominaisuuksien genetiikka kansantautien perimä ja sen merkitys Markus Perola, LT, geneettisen epidemiologian tutkimusprofessori THL, KATO, GETY markus.perola@thl.fi Määritelmiä L3/28.8.2013
LisätiedotVoidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä?
Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä? Duodecimin vuosipäivä 14.11.2014 Veikko Salomaa, LKT, tutkimusprofessori 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 1 Sidonnaisuudet Ei ole 21.11.2014 Esityksen
LisätiedotPsoriasista voidaan ehkä helpottaa vaniliinilla, kertoo Medical News Today
Psoriasista voidaan ehkä helpottaa vaniliinilla, kertoo Medical News Today Psoriasista voidaan ehkä helpottaa vaniliinilla, kertoo Medical News Today 2.12.2017. Synteettinen vanilja eli vanilliini voi
LisätiedotSymbioosi 2 VASTAUKSET
Luku 13 Symbioosi 2 VASTAUKSET 1. Termit Vastaus: a= sukusolut b= genotyyppi c= F2-polvi d= F1-polvi e= P-polvi 2. Termien erot a. Fenotyyppi ja genotyyppi Vastaus: fenotyyppi on yksilön ilmiasu, genotyyppi
LisätiedotSelkäydinneste vai geenitutkimus?
Selkäydinneste vai geenitutkimus? 19.5.2016 Anne Remes, professori, ylilääkäri, Itä-Suomen yliopisto, KYS, Neurokeskus Nuorehko muistipotilas, positiivinen sukuhistoria Päästäänkö diagnostiikassa tarkastelemaan
LisätiedotNCL australiankarjakoirilla
NCL australiankarjakoirilla Yleistä NCL-ryhmään kuuluvat sairaudet ovat kuolemaan johtavia, yleensä resessiivisesti periytyviä sairauksia. Niissä mutaatiosta johtuva geenivirhe aiheuttaa sen, että hermosoluihin
LisätiedotPerimän lukemisesta luetun ymmärtämiseen
Juha Kere ÄYRÄPÄÄN LUENTO 2011 Perimän lukemisesta luetun ymmärtämiseen Lääketieteen tutkimusmenetelmät ovat kehittyneet nopeasti viime vuosikymmeninä, ja yhä kiihtyvä kehitys näyttää jatkuvan vailla merkkiä
LisätiedotSuomen Lihastautirekisteri osana kansainvälistä yhteistyötä. Jaana Lähdetie Erikoislääkäri, Suomen Lihastautirekisterin vastuuhenkilö TYKS
Suomen Lihastautirekisteri osana kansainvälistä yhteistyötä Jaana Lähdetie Erikoislääkäri, Suomen Lihastautirekisterin vastuuhenkilö TYKS Taustaa Miksi uudet tutkimustulokset lihastautien perimmäisistä
LisätiedotVERIRYHMÄT JA VERIRYHMÄVASTA-AINEET
VERIRYHMÄT JA VERIRYHMÄVASTA-AINEET Raskaudenaikaiset veriryhmäimmunisaatiot 2018 Kati Sulin Biokemisti 12.4.2018 Sisältö Veriryhmät ABO Rh-veriryhmäjärjestelmä Sikiön veriryhmämääritykset äidin verinäytteestä
LisätiedotEnnakoivat Geenitutkimukset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
Ennakoivat Geenitutkimukset Tämän potilasoppaan on kehittänyt The Genetic Interest Group. Kääntänyt Tiina Lund-Aho. Toukokuussa 2009 Tätä työtä tuki EuroGentest, joka on Euroopan yhteisön tutkimuksen kuudennen
LisätiedotKäänteentekevä brittiläinen syöpätutkimus kertoo, että lasten akuutti lymfoplastileukemia on ehkä ehkäistävissä!
Käänteentekevä brittiläinen syöpätutkimus kertoo, että lasten akuutti lymfoplastileukemia on ehkä ehkäistävissä! Noin kolmannes lasten syövistä on leukemioita ja yleisin niistä on akuutti lymfoblastileukemia.
LisätiedotPerinnöllisyys. Enni Kaltiainen
Perinnöllisyys Enni Kaltiainen Tällä tunnilla: - Lyhyt kertaus genetiikasta - Meioosi - Perinnöllisyyden perusteet - Risteytystehtävät h"p://files.ko-sivukone.com/refluksi.ko-sivukone.com/j0284919.jpg Kertausta
LisätiedotGENOMINEN VALINTA HEVOSJALOSTUKSESSA. Markku Saastamoinen MTT Hevostutkimus
GENOMINEN VALINTA HEVOSJALOSTUKSESSA Markku Saastamoinen MTT Hevostutkimus Genominen valinta genomisessa valinnassa eläimen jalostusarvo selvitetään DNA:n sisältämän perintöaineksen tiedon avulla Genomi
LisätiedotMuuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito SNP 14.1.2013 Tiina Immonen Biolääketieteen laitos Biokemia ja kehitysbiologia Jakson luennot Mitä on genomilääketiede? Dan Lindholm Genomin ylläpito Tiina Immonen
Lisätiedot- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,
Syöpä, osa II Syöpäkriittiset geenit - Geenejä, joiden mutaatiot usein havaitaan syöpien kanssa korreloituneena - Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan, - dominoiviin onkogeeneihin - resessiivisiin
LisätiedotGeeneistä genomiin, mikä muuttuu? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm
Geeneistä genomiin, mikä muuttuu? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm 5 ATCACACACACACAGTCCTGACGTGC 3! 3 TAGTGTGTGTGTGTCAGGACTGCACG 5! Informaatioteknologian mullistus 1978 2013 2048? Molekyylibiologian
LisätiedotPerinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen
Perinnöllisyys 2 Enni Kaltiainen Tunnin sisältö: Kytkeytyneiden geenien periytyminen Ihmisen perinnöllisyys Sukupuu Mutaatiot Kytkeytyneet geenit Jokainen kromosomi sisältää kymmeniä geenejä (= kytkeytyneet)
LisätiedotTilastollinen päättely genominlaajuisissa assosiaatioanalyyseissä. Matti Pirinen
Tilastollinen päättely genominlaajuisissa assosiaatioanalyyseissä Matti Pirinen Suomen molekyylilääketieteen instituutti (FIMM) Helsingin Yliopisto 17.2.2015 Tilastollisen päättelyn kurssi Kumpula Sisältö
Lisätiedotmåndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda
GENETIIKKA: KROMOSOMI DNA & GEENI Yksilön ominaisuudet 2 Yksilön ominaisuudet Perintötekijät 2 Yksilön ominaisuudet Perintötekijät Ympäristötekijät 2 Perittyjä ominaisuuksia 3 Leukakuoppa Perittyjä ominaisuuksia
LisätiedotTehty yhteistyönä tri Jan Torssanderin kanssa. Läkarhuset Björkhagen, Ruotsi.
idslofi04.12/06.2 Tehty yhteistyönä tri Jan Torssanderin kanssa. Läkarhuset Björkhagen, Ruotsi. Galderma Nordic AB. Box 15028, S-167 15 Bromma. Sweden Tel +46 8 564 355 40, Fax +46 8 564 355 49. www.galdermanordic.com
LisätiedotGenomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia
Genomin ylläpito 14.1.2014 Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia Luennon sisältö DNA:n kahdentuminen eli replikaa8o DNA:n korjausmekanismit Replikaa8ovirheiden korjaus Emäksenpoistokorjaus
LisätiedotDNA:n informaation kulku, koostumus
DNA:n informaation kulku, koostumus KOOSTUMUS Elävien bio-organismien koostumus. Vety, hiili, happi ja typpi muodostavat yli 99% orgaanisten molekyylien rakenneosista. Biomolekyylit voidaan pääosin jakaa
LisätiedotUusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx keystocancer.fi FI/FMI/1810/0067 Lokakuu 2018 FoundationOne CDx -geeniprofilointi FoundationOne CDx on kattava geeniprofilointipalvelu, jossa tutkitaan syöpäkasvaimen
LisätiedotIstukkanäytetutkimus. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Istukkanäytetutkimus Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy s and St Thomas Hospital, London, United Kingdom; the Royal College of Obstetricians
LisätiedotHLA alueen geenit ja niiden funktiot. Maisa Lokki, dosentti Transplantaatiolaboratorio Haartman Instituutti
HLA alueen geenit ja niiden funktiot Maisa Lokki, dosentti Transplantaatiolaboratorio Haartman Instituutti 29.1.2014 Vieras versus oma Immuunijärjestelmä puolustaa elimistöä haitallisia organismeja vastaan
LisätiedotKutsu. Professoriluennot torstaina 4.12.2014 LÄÄKETIETEELLINEN TIEDEKUNTA
Kutsu Professoriluennot torstaina 4.12.2014 LÄÄKETIETEELLINEN TIEDEKUNTA Kutsu kuulemaan niitä julkisia esitelmiä, jotka Oulun yliopiston nimitetyt professorit pitävät lääketieteellisen tiedekunnan Leena
LisätiedotMiten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä
Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä Genomitiedon vaikutus terveydenhuoltoon työpaja 7.11.2014 Sitra, Helsinki Jaakko Ignatius, TYKS Kliininen genetiikka Perimän
LisätiedotS Laskennallinen systeemibiologia
S-114.2510 Laskennallinen systeemibiologia 3. Harjoitus 1. Koska tilanne on Hardy-Weinbergin tasapainossa luonnonvalintaa lukuunottamatta, saadaan alleeleista muodostuvien eri tsygoottien genotyyppifrekvenssit
LisätiedotArkkitehtuurien tutkimus Outi Räihä. OHJ-3200 Ohjelmistoarkkitehtuurit. Darwin-projekti. Johdanto
OHJ-3200 Ohjelmistoarkkitehtuurit 1 Arkkitehtuurien tutkimus Outi Räihä 2 Darwin-projekti Darwin-projekti: Akatemian rahoitus 2009-2011 Arkkitehtuurisuunnittelu etsintäongelmana Geneettiset algoritmit
Lisätiedot11. Elimistö puolustautuu
11. Elimistö puolustautuu Taudinaiheuttajat Tautimikrobit (= patogeenit): Bakteerit (esim. kolera), virukset (esim. influenssa), alkueliöt (esim. malaria), eräät sienet (esim. silsa) Aiheuttavat infektiotaudin
LisätiedotTranslationaalinen tutkimus, mitä, miksi, miten?
Translationaalinen tutkimus, mitä, miksi, miten? Mikko Hiltunen, FT, dosentti Tutkimusjohtaja, Akatemiatutkija Kliininen lääketiede Neurologia, ISY mikko.hiltunen@uef.fi Translationaalinen tutkimus, mitä?
LisätiedotPakolliset kurssit (OL PDDLOPD%,,
Pakolliset kurssit (OL PDDLOPD%,, tuntee elämän tunnusmerkit ja perusedellytykset sekä tietää, miten elämän ilmiöitä tutkitaan ymmärtää, mitä luonnon monimuotoisuus biosysteemien eri tasoilla tarkoittaa
LisätiedotGEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA
GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA GEENITEKNIIKKKA ON BIOTEKNIIKAN OSA-ALUE! Biotekniikka tutkii ja kehittää elävien solujen, solun osien, biokemiallisten menetelmien sekä molekyylibiologian uusimpien menetelmien
LisätiedotEuromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä
Mitkä mitokondriot? Lyhyt johdatus geenitutkijoiden maailmaan Ihmisen kasvua ja kehitystä ohjaava informaatio on solun tumassa, DNA:ssa, josta se erilaisten prosessien kautta päätyy ohjaamaan elimistön,
LisätiedotKipu. Oleg Kambur. Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 23.6.2015
Katekoli-O-metyylitransferaasi ja kipu Oleg Kambur Kipu Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 1 Katekoli-O-metyylitransferaasi (COMT) proteiini tuotetaan
LisätiedotKehitysvamma autismin liitännäisenä vai päinvastoin? Maria Arvio
Kehitysvamma autismin liitännäisenä vai päinvastoin? Maria Arvio Mitä yhteistä autismilla (A) ja kehitysvammalla (KV)? Elinikäiset tilat Oireita, ei sairauksia Diagnoosi tehdään sovittujen kriteereiden
LisätiedotPienryhmä 3 immuunipuolustus
Pienryhmä 3 immuunipuolustus 1. Biologian yo 2013 mukailtu. Merkitse onko väittämä oikein vai väärin, Korjaa väärien väittämien virheet ja perustele korjauksesi. a. Syöjäsolut vastaavat elimistön valikoivasta
LisätiedotDrosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1
Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1 replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA
LisätiedotFarmakogeneettiset testit apuna lääkehoidon arvioinnissa
Farmakogeneettiset testit apuna lääkehoidon arvioinnissa Farmakogeneettiset testit Farmakogenetiikalla tarkoitetaan geneettisiä variaatioita, jotka vaikuttavat lääkeainevasteeseen. Geneettisen tiedon hyödyntäminen
LisätiedotPia Soronen (FM, LK, väitellyt) 21.3.2013
Pia Soronen (FM, LK, väitellyt) 21.3.2013 Yleistä periytyvyydestä ja genetiikasta Miten perinnöllisyyttä tutkitaan Kytkentäanalyyseistä nykypäivään Tärkeimmät löydökset Ehdokasgeeni esimerkkejä Uudet GWAS
LisätiedotKromosomimuutokset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com. Huhtikuussa 2008
16 Kromosomimuutokset Huhtikuussa 2008 Tätä työtä tuki EuroGentest, joka on Euroopan yhteisön tutkimuksen kuudennen puiteohjelman rahoittama verkosto. Kääntänyt Tiina Lund-Aho yhteistyössä Väestöliiton
LisätiedotAktivoiva luento-opetus & sillanrakennus kliiniseen opetukseen
Aktivoiva luento-opetus & sillanrakennus kliiniseen opetukseen Opintori 10.5.2012 Minna Männikkö Biolääketieteen laitos Lääketieteellisen biokemian ja molekyylibiologian kurssi 15 op, 170 opiskelijaa Kemia:
LisätiedotTulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi
Tulehduksen osuus syövän synnyssä Ari Ristimäki, professori Patologia Helsingin yliopisto esiasteissa ja useissa eri syöpäkasvaintyypeissä. 1 A Mantovani, et al. NATURE Vol 454 24 July 2008 Figure 15.22d
LisätiedotPerinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita
Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita 14. Useamman ominaisuusparin periytyminen 1. Avainsanat 2. Mendelin lait 3. Dihybridiristeytys 4. Mendelin tulosten taustaa 5. Tekijäinvaihdunta
LisätiedotHallikaisten varhaisvaiheet ja suvun DNA-tulokset Ari Kolehmainen Suku- ja historiapalvelu Menneen jäljet
Hallikaisten varhaisvaiheet ja suvun DNA-tulokset 28.7.2018 Ari Kolehmainen Suku- ja historiapalvelu Menneen jäljet Tutkijan esittely ja sukututkimustausta Suomen historian maisteri (Joensuun yliopisto
LisätiedotSuomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013
Suomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013 FIMM - Institiute for Molecular Medicine Finland Terveyden ylläpito vauvasta vanhuuteen Elintavat Taudit Terve
LisätiedotPotilasopas. 2 PL 24, 90029 OYS puh (08) 315 3218 faksi (08) 315 3105
2 PL 24, 90029 OYS puh (08) 315 3218 faksi (08) 315 3105 Perinnöllisten Syöpien Ennakoivat Geenitutkimukset TAYS Kliinisen genetiikan yksikkö PL 2000, 33521 Tampere Perinnöllisyyspoliklinikka puh (03)
LisätiedotPerimmäinen kysymys. Työllistämisen tukitoimien vaikuttavuuden arvioinnista. Mitkä ovat tukitoimen X vaikutukset Y:hyn? Kari Hämäläinen (VATT)
Työllistämisen tukitoimien vaikuttavuuden arvioinnista Kari Hämäläinen (VATT) VATES päivät, 5.5.2015 Perimmäinen kysymys Mitkä ovat tukitoimen X vaikutukset Y:hyn? 1 Kolme ehtoa kausaaliselle syy seuraussuhteelle
LisätiedotEvoluutio. BI Elämä ja evoluutio Leena Kangas-Järviluoma
Evoluutio BI Elämä ja evoluutio Leena Kangas-Järviluoma 1 Evoluutio lajinkehitystä, jossa eliölajit muuttuvat ja niistä voi kehittyä uusia lajeja on jatkunut elämän synnystä saakka, sillä ei ole päämäärää
LisätiedotGenomitiedon hyödyntäminen yksilötasolla ja tiedon omistajuus
Kuka omistaa genomitiedon - työpaja 12.09.2014 Genomitiedon hyödyntäminen yksilötasolla ja tiedon omistajuus Kristiina Aittomäki, prof., ylilääkäri HUSLAB, Helsingin yliopisto Genomistrategia työryhmä
Lisätiedot