Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Bakteerit suppea lista

Transkriptio

1 1 (46) Merkintöjen selitys N:ro Nimet Lääkärin ilmoitus Mikrobin tunnus. Tunnus on luku väliltä 1000 _ 9999, lisäksi tunnukseen on liitetty kaksinumeroinen tarkistusosa. Tartuntatauti-ilmoituslomakkeeseen tunnus pyydetään merkitsemään kokonaisuudessaan, tarkistusosa mukaanlukien. Mikrobit luetellaan aakkostettuna sekä ensisijaisen nimen että ensisijaisen nimen synonyymien mukaan. Ensisijainen nimi on merkitty tunnuksen ja nimen väliin sijoitetulla plusmerkillä (+), ja sen yhteydessä luetellaan myös mikrobin kaikki vaihtoehtoiset nimet. Vaihtoehtoisten nimien kohdalla ilmoitetaan ensisijainen nimi. Lääkärin ilmoitusvelvollisuus mikrobin aiheuttamassa taudissa Koodit viittaavat allaolevaan kriteeriluetteloon, josta käy ilmi, millä tavoilla saadut löydökset laboratorio ilmoittaa tartuntatautirekisteriin Koodi kriteerin kuvaus 1 Viljelty verestä 2 Viljelty likvorista 3 Viljelty kliinisestä näytteestä 4 Mikrobin suora osoitus (esim. elektronimikroskopia, parasiittien mikroskopia, pimeäkenttämikroskopia) 5 Antigeenin osoitus verestä tai likvorista 6 Diagnostinen vasta-ainelöydös 7 DNA/RNA -osoitus verestä tai likvorista 8 Viljelty genitaalialueelta 9 Viljelty vastasyntyneeltä 10 Viljelty syvästä punktiosta tai leikkausnäytteestä 11 Viljelty ulosteesta 12 EIA-antigeeninosoitus varmistettuna blocking- tai FA-menetelmällä 13 DNA/RNA-osoitus 14 Positiivinen HAV-AbM (IgM-vasta-ainelöydös hepatiitti A -virukselle) 15 Positiivinen HBc-AbM (IgM-vasta-ainelöydös hepatiitti B -viruksen core-osalle) 16 Positiivinen HBsAg (hepatiitti B -viruksen pinta-antigeeni) 17 Muu antigeenin osoitus (FA, TRFIA, EIA) 19 Viljely kliinisestä näytteestä (resistenssiominaisuus) 20 Toksiinin osoitus (antigeenin osoitus) 21 Viljelty ulosteesta ja toksiiniominaisuus Yhdistelyaikaväli Kantakokoelma Ominaisuudet Huomautukset Suppea lista Laaja listaus Aikaväli, jonka sisällä samasta henkilöstä tehdyt löydökset (ilmoitukset) yhdistyvät samaksi tapaukseksi, jos kyseessä ovat yhdisteltävät mikrobit. Mikrobin tautiluokka: yv (yleisvaarallinen), ilm (ilmoitettava) tai muu (muu rekisteröitävä) Mikrobin sisältyminen tartuntatautirekisterin kantakokoelmaan Mikrobiin mahdollisesti liitettyjä tartuntatautien rekisteröinnin kannalta tärkeitä ominaisuuksia (tyypit tms.) Mikrobiin mahdollisesti liitetyt huomautukset Suppea listaus kattaa mikrobinimikkeet pääsääntöisesti sukutasolla ja lisäksi lajitasolla, mikäli Suomessa on vuosien 1995 _ 2008 aikana ilmoitettu yksikin kyseisen suvun mikrobilöydös lajinimellä. Mikrobinimike sisältyy suppeaan listaan myös jos se on erikseen mainittu tartuntatautilaissa tai -asetuksessa. Laaja listaus sisältää suppean listan nimikkeiden lisäksi muut mahdolliset veri- tai likvorilöydökset sekä muut kliiniset merkittävät löydökset, jotka eivät kuitenkaan kuulu tartuntatautien ilmoitusjärjestelmän piiriin. Tartuntatautien mikrobinimikkeistöä ylläpitää Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen tartuntatautiseurannan ja - torjunnan osasto (info@tartuntatautirekisteri.fi), jonne mahdolliset muutosesitykset pyydetään osoittamaan.

2 2 (46) Achromobacter xylosoxidans ssp. denitrificans Alcaligenes xylosoxidans ssp. denitrificans Achromobacter xylosoxidans ssp. xylosoxidans Alcaligenes xylosoxidans ssp. xylosoxidans Acinetobacter sp Acinetobacter anitratus -> Acinetobacter baumannii Acinetobacter baumannii Acinetobacter anitratus Acinetobacter calcoaceticus Acinetobacter calcoaceticus ssp. calcoaceticus Acinetobacter calcoaceticus ssp. calcoaceticus -> Acinetobacter calcoaceticus Acinetobacter calcoaceticus ssp. lwoffii -> Acinetobacter lwoffii Acinetobacter haemolyticus Acinetobacter junii Acinetobacter lwoffii Acinetobacter calcoaceticus ssp. lwoffii Actinobacillus sp Actinobacillus actinomycetemcomitans Haemophilus actinomycetemcomitans Actinobacillus mallei -> Burkholderia mallei Actinobaculum schalii Actinomadura sp Actinomyces sp Actinomyces israelii Actinomyces meyeri Actinomyces naeslundii Actinomyces neuii ssp. neuii Actinomyces odontolyticus Actinomyces pyogenes -> Arcanobacterium pyogenes Actinomyces ramosus -> Clostridium ramosum Actinomyces viscosus Aerobacter aerogenes -> Enterobacter aerogenes Aerococcus sp Aerococcus urinae Aerococcus viridans Aeromonas sp Aeromonas caviae Aeromonas hydrophila Pseudomonas hydrophila Aeromonas shigelloides -> Plesiomonas shigelloides Aeromonas veronii biotyyppi sobria Aeromonas veronii biotyyppi veronii Agrobacterium tumefaciens -> Rhizobium radiobacter Alcaligenes sp Alcaligenes faecalis Alcaligenes odorans, Pseudomonas odorans Alcaligenes odorans -> Alcaligenes faecalis Alcaligenes xylosoxidans ssp. denitrificans -> Achromobacter xylosoxidans ssp. denitrificans Alcaligenes xylosoxidans ssp. xylosoxidans -> Achromobacter xylosoxidans ssp. xylosoxidans Alloiococcus otitis Alteromonas putrefaciens -> Shewanella putrefaciens Anaerobiospirillum succiniciproducens

3 3 (46) Anaerococcus prevotii Peptostreptococcus prevotii Anaerococcus tetradius Peptostreptococcus tetradius Arcanobacterium haemolyticum Corynebacterium haemolyticum Arcanobacterium pyogenes Actinomyces pyogenes, Corynebacterium pyogenes Arthobacter sp Atopobium sp BCG -> Mycobacterium bovis BCG ei kyllä 12kk/50v ilm 3 tai 13 Huom: Lääkärit ilmoittavat ainoastaan rokotusten haittavaikutukset käyttäen "Ilmoitus rokotuksen haittavaikutuksesta-lomaketta (KTL/ROKO/101) Kantakokoelma: Kaikki Bacillus sp Bacillus Calmette Guerin -> Mycobacterium bovis BCG ei kyllä 12kk/50v ilm 3 tai 13 Huom: Lääkärit ilmoittavat ainoastaan rokotusten haittavaikutukset käyttäen "Ilmoitus rokotuksen haittavaikutuksesta-lomaketta (KTL/ROKO/101) Kantakokoelma: Kaikki Bacillus anthracis kyllä ei 3kk/12kk yv 3 tai Bacillus cereus Bacillus subtilis Bacteroides sp Bacteroides asaccharolyticus -> Porphyromonas asaccharolytica Bacteroides bivius -> Prevotella bivia Bacteroides buccae -> Prevotella buccae Bacteroides caccae Bacteroides fragilis ryhmä 3452A Bacteroides capillosus Bacteroides capillus -> Prevotella buccae Bacteroides corporis -> Prevotella corporis Bacteroides corrodens (osa kannoista) Bacteroides denticola -> Prevotella denticola Bacteroides disiens -> Prevotella disiens Bacteroides distasonis Bacteroides eggerthii Bacteroides endodontalis -> Porphyromonas endodontalis Bacteroides fragilis Bacteroides fragilis -ryhmä Bacteroides fragilis T4-1 -> Bacteroides merdae Bacteroides fragilis ryhmä 3452A -> Bacteroides caccae Bacteroides fragilis ssp. a -> Bacteroides stercoris Bacteroides gingivalis -> Porphyromonas gingivalis Bacteroides gracilis (osa kannoista) ei ei 3kk/12kk muu Bacteroides loescheii -> Prevotella loescheii Bacteroides melaninogenicus ssp. asaccharolyticus -> Porphyromonas asaccharolytica Bacteroides melanogenicus -> Prevotella melaninogenica Bacteroides melanogenicus ssp. melanogenicus -> Prevotella melaninogenica Bacteroides merdae Bacteroides fragilis T Bacteroides oralis -> Prevotella oralis Bacteroides oris -> Prevotella oris Bacteroides ovatus

4 4 (46) Bacteroides pentosaceus -> Prevotella buccae Bacteroides pneumosintes -> Dialister pneumosintes Bacteroides praeacutus -> Tissierella praeacuta Bacteroides ruminicola ssp. brevis (osa kannoista) Bacteroides ruminicola ssp. brevis -> Prevotella buccae Bacteroides ruminicola ssp. ruminicola (osa kannoista) Bacteroides ruminicola ssp. ruminicola (osa kannoista) Bacteroides splanchnicus Bacteroides stercoris Bacteroides fragilis ssp. a Bacteroides symbiosus -> Clostridium symbiosum Bacteroides tectus Bacteroides thetaiotaomicron Bacteroides uniformis Bacteroides ureolyticus Bacteroides corrodens (osittain) Bacteroides vulgatus Bartonella sp Bartonella henselae Rochalimaea henselae Bartonella quintana Rochalimaea quintana Beneckea vulnifica -> Vibrio vulnificus Bergeyella zoohelcum CDC ryhmä IIj, Weeksella zoohelcum Bifidobacterium sp Bifidobacterium adolescentis Bifidobacterium breve Bilophila wadsworthia Bordetella parapertussis Bordetella pertussis ei kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6 tai 13 Kantakokoelma: Kaikki Bordetella-like sp. EF ryhmä Borrelia sp Borrelia afzelii ei ei 3kk/3v muu 3, 6 tai Borrelia burgdorferi sensu lato ei ei 3kk/3v muu 3, 6, 13 tai Borrelia burgdorferi sensu stricto ei ei 3kk/3v muu 3, 6, 13 tai Borrelia garinii ei ei 3kk/3v muu 3, 6 tai Branhamella catarrhalis -> Moraxella catarrhalis Brevibacterium sp Brevundimonas vesicularis Pseudomonas vesicularis Brucella sp. ei ei 3kk/3v muu 3 tai Brucella abortus ei ei 3v muu 3 tai Brucella melitensis ei ei 3kk/3v muu 3 tai Burkholderia sp Burkholderia cepacia Pseudomonas cepacia, Pseudomonas multivorans Burkholderia mallei Actinobacillus mallei, Pseudomonas mallei Burkholderia pseudomallei Pseudomonas pseudomallei CDC ryhmä 5d-1 -> Ochrobactrum anthropi CDC ryhmä DF-1 -> Capnocytophaga ochracea

5 5 (46) CDC ryhmä DF-2 -> Capnocytophaga canimorsus CDC ryhmä HB-1 -> Eikenella corrodens CDC ryhmä IId -> Cardiobacterium hominis CDC ryhmä IIf -> Weeksella virosa CDC ryhmä IIj -> Bergeyella zoohelcum CDC ryhmä IIk-1 -> Sphingomonas paucimobilis CDC ryhmä IIk-2 -> Sphingobacterium multivorum CDC ryhmä JK -> Corynebacterium jeikeium CDC ryhmä Vb-1 -> Pseudomonas stutzeri CDC ryhmä Vb-2 -> Pseudomonas mendocina Campylobacter sp. ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter cinaedi -> Helicobacter cinaedi Campylobacter coli ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter concisus ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter curvus ei ei 3kk/12kk muu 3 Wolinella curva Campylobacter fetus ssp. fetus ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter gracilis ei ei 3kk/12kk muu 3 Bacteroides gracilis (osittain) Campylobacter jejuni ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter jejuni ssp. doylei ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter jejuni ssp. jejuni ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter jejuni/coli ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter lari ei ei 3kk/12kk muu 3 Campylobacter laridis Campylobacter laridis -> Campylobacter lari ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter pyloridis -> Helicobacter pylori Campylobacter rectus ei ei 3kk/12kk muu 3 Wolinella recta Campylobacter showae ei ei 3kk/12kk muu Campylobacter upsaliensis ei ei 3kk/12kk muu Capnocytophaga sp Capnocytophaga canimorsus CDC ryhmä DF Capnocytophaga gingivalis Capnocytophaga ochracea CDC ryhmä DF Capnocytophaga sputigena Cardiobacterium hominis CDC ryhmä IId Cedecea sp Cedecea neteri Cedecea sp Cedecea sp. 4 -> Cedecea neteri Cellulomonas sp Chlamydia sp. ei ei 3kk muu 3 tai Chlamydia pneumoniae ei ei 3kk/12kk muu 3, 6 tai Chlamydia psittaci ei ei 3kk/12kk muu 3, 6 tai Chlamydia trachomatis ei ei 3kk ilm 3 tai Chryseobacterium sp Chryseobacterium gleum Flavobacterium gleum Chryseobacterium indologenes Flavobacterium indologenes Chryseobacterium meningosepticum Flavobacterium meningosepticum

6 6 (46) Chryseomonas luteola -> Pseudomonas luteola Citrobacter sp Citrobacter amalonaticus Levinea amalonatica Citrobacter braakii Citrobacter diversus -> Citrobacter koseri Citrobacter farmeri Citrobacter freundii (osa kannoista) Citrobacter freundii (osa kannoista) Citrobacter freundii Colobactrum freundii Citrobacter genomospecies 10 -> Citrobacter gillenii Citrobacter genomospecies 11 -> Citrobacter murliniae Citrobacter gillenii Citrobacter freundii (osittain), Citrobacter genomospecies Citrobacter koseri Citrobacter diversus Citrobacter murliniae Citrobacter freundii (osittain), Citrobacter genomospecies Citrobacter youngae Clostridium sp Clostridium argentinense Clostridium botulinum toksiinityyppi G, Clostridium hastiforme (osittain), Clostridium subterminale (osittain) Clostridium barati -> Clostridium baratii ei ei 3kk/12kk muu 1 tai Clostridium baratii ei ei 3kk/12kk muu 1 tai 2 Clostridium barati, Clostridium paraperfringens, Clostridium perenne Clostridium bifermentans Clostridium botulinum ei ei 3kk/12kk muu 1 tai Clostridium botulinum toksiinityyppi G -> Clostridium argentinense Clostridium butyricum ei ei 3kk/12kk muu 1 tai 2 Clostridium pseudotetanicum Clostridium cadaveris Clostridium carnis Clostridium clostridiiforme -> Clostridium clostridioforme Clostridium clostridioforme Clostridium clostridiiforme Clostridium difficile Clostridium difficilis ei ei 3kk muu 3, 13, 20 tai 21 Ominaisuudet: TOKSIINI/+, TOKSIINI/ Clostridium difficilis -> Clostridium difficile Ominaisuudet: TOKSIINI/+, TOKSIINI/- ei ei 3kk muu 3, 13, 20 tai Clostridium glycolicum Clostridium hastiforme (osa kannoista) Clostridium hastiforme Clostridium histolyticum Clostridium innocuum Clostridium limosum Clostridium sp. CDC ryhmä P Clostridium novyi Clostridium paraperfringens -> Clostridium baratii ei ei 3kk/12kk muu 1 tai Clostridium paraputrificum Clostridium perenne -> Clostridium baratii ei ei 3kk/12kk muu 1 tai Clostridium perfringens Clostridium welchii, Welchia perfringens Clostridium pseudotetanicum -> Clostridium butyricum ei ei 3kk/12kk muu 1 tai 2

7 7 (46) Clostridium ramosum Actinomyces ramosus, Eubacterium filamentosum, Eubacterium ramosum, Ramibacterium ramosum Clostridium septicum Clostridium sordellii Clostridium sp. CDC ryhmä P-1 -> Clostridium limosum Clostridium sporogenes Clostridium subterminale (osa kannoista) Clostridium subterminale Clostridium symbiosum Bacteroides symbiosus, Fusobacterium biacutus, Fusobacterium symbiosum Clostridium tertium Clostridium tetani Clostridium welchii -> Clostridium perfringens Collinsella aerofaciens Eubacterium aerofaciens Colobactrum freundii -> Citrobacter freundii Comamonas acidovorans -> Delftia acidovorans Comamonas testosteroni Pseudomonas testosteroni Corynebacterium sp Corynebacterium afermentans ssp. afermentans Corynebacterium amycolacum Corynebacterium aquaticum -> Leifsonia aquatica Corynebacterium diphtheriae kyllä kyllä 3kk/12kk yv 3 Huom: Kannat Terveyden ja hyvinvoinnin laitokseen Ominaisuudet: TOKSIINI/+, TOKSIINI/- Kantakokoelma: Kaikki Corynebacterium equi -> Rhodococcus equi Corynebacterium haemolyticum -> Arcanobacterium haemolyticum Corynebacterium hofmanii -> Corynebacterium pseudodiphtheriticum Corynebacterium jeikeium CDC ryhmä JK, Corynebacterium ryhmä JK Corynebacterium minutissimum Corynebacterium pseudodiphtheriticum Corynebacterium hofmanii Corynebacterium pseudotuberculosis ei ei 3kk muu 3 Huom: Kannat Terveyden ja hyvinvoinnin laitokseen Ominaisuudet: TOKSIINI/+, TOKSIINI/ Corynebacterium pyogenes -> Arcanobacterium pyogenes Corynebacterium ryhmä JK -> Corynebacterium jeikeium Corynebacterium striatum Corynebacterium ulcerans ei ei 3kk/12kk muu 3 Huom: Kannat Terveyden ja hyvinvoinnin laitokseen Ominaisuudet: TOKSIINI/+, TOKSIINI/ Corynebacterium urealyticum Corynebacterium vaginale -> Gardnerella vaginalis Corynebacterium xerosis Coxiella burnetii ei ei 3kk/12kk muu 3 tai Curtobacterium sp Delftia acidovorans Comamonas acidovorans Dermabacter hominis Desulfomonas pigra -> Desulfovibrio piger Desulfovibrio desulfuricans

8 8 (46) Desulfovibrio piger Desulfomonas pigra Dialister pneumosintes Bacteroides pneumosintes Diplococcus pneumoniae -> Streptococcus pneumoniae Ominaisuudet: PEN/R, PEN/I Kantakokoelma: Verestä ja likvorista kaikki ei kyllä 3kk muu 1, 2, 7 tai EF ryhmä 26 -> Bordetella-like sp Edwardsiella tarda Eggerthella lenta Ehrlichia sp. ei ei 3kk muu 6 tai Eikenella corrodens CDC ryhmä HB Empedobacter brevis Flavobacterium breve Enteric ryhmä 10 -> Escherichia fergusonii Enteric ryhmä 17 -> Enterobacter asburiae Enteric ryhmä 19 -> Enterobacter cancerogenus Enteric ryhmä 46 -> Moellerella wisconsensis Enterobacter sp Enterobacter aerogenes Aerobacter aerogenes Enterobacter agglomerans -> Pantoea agglomerans Enterobacter amnigenus Enterobacter asburiae Enteric ryhmä Enterobacter cancerogenus Enteric ryhmä 19, Enterobacter taylorae Enterobacter cloacae Enterobacter gergoviae Enterobacter liquefaciens -> Serratia liquefaciens Enterobacter sakazakii Enterobacter taylorae -> Enterobacter cancerogenus Enterococcus sp. ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus avium ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus casseliflavus ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus dispar ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus durans ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19 Streptococcus durans (ryhmä D enterokokki), TEIKO/R Enterococcus faecalis Streptococcus faecalis (ryhmä D enterokokki) Huom: Yhdistelyaikaväli 3kk veri- ja likvorlöydöksissä, TEIKO/R ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19

9 9 (46) Enterococcus faecium ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19 Streptococcus faecium (ryhmä D enterokokki) Huom: Yhdistelyaikaväli 3kk veri- ja likvorlöydöksissä, TEIKO/R Enterococcus flavescens ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus gallinarum ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus hirae ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus malodoratus ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus mundtii ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus pseudoavium ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus raffinosus ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus saccharolyticus ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus seriolicida ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai 19, TEIKO/R Enterococcus solitarius, TEIKO/R ei kyllä 3kk/12kk/50vmuu 1, 2 tai Erwinia sp Erysipelothrix insidiosa -> Erysipelothrix rhusiopathiae Erysipelothrix rhusiopathiae Erysipelothrix insidiosa Escherichia sp Escherichia adecarboxylata -> Leclercia adecarboxylata Escherichia coli ei ei 3kk/50v muu 1, 2 tai 19 Ominaisuudet: 3KEF/I, 3KEF/R Escherichia coli EHEC kyllä kyllä 3kk/12kk yv 11 Huom: Serotyyppi ilmoitettava Ominaisuudet: O157, non-o157 Kantakokoelma: Kaikki Escherichia fergusonii Enteric ryhmä Escherichia hermannii Escherichia vulneris Eubacterium sp Eubacterium aerofaciens -> Collinsella aerofaciens

10 10 (46) Eubacterium alactolyticum -> Pseudoramibacter alactolyticus Eubacterium filamentosum -> Clostridium ramosum Eubacterium limosum Eubacterium ramosum -> Clostridium ramosum Eubacterium saburreum Facklamia sp Finegoldia magna Peptostreptococcus magnus Flavimonas oryzihabitans -> Pseudomonas oryzihabitans Flavobacterium sp Flavobacterium breve -> Empedobacter brevis Flavobacterium gleum -> Chryseobacterium gleum Flavobacterium indologenes -> Chryseobacterium indologenes Flavobacterium meningosepticum -> Chryseobacterium meningosepticum Flavobacterium multivorum -> Sphingobacterium multivorum Flavobacterium odoratum -> Myroides odoratus Fluoribacter bozemanae -> Legionella bozemanii Fluoribacter dumoffi -> Legionella dumoffii Fluoribacter gormanii -> Legionella gormanii Francisella tularensis kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 ei ei 3kk/12kk muu 3 tai 6 Pasteurella tularensis Fusobacterium sp Fusobacterium biacutus -> Clostridium symbiosum Fusobacterium mortiferum Fusobacterium necrophorum Fusobacterium nucleatum Fusobacterium symbiosum -> Clostridium symbiosum Fusobacterium varium Gardnerella vaginalis Corynebacterium vaginale, Haemophilus vaginalis Gemella sp Gemella haemolysans Gemella morbillorum Streptococcus morbillorum Gordona sp. -> Gordonia sp Gordonia sp. Gordona sp Haemophilus sp Haemophilus actinomycetemcomitans -> Actinobacillus actinomycetemcomitans Haemophilus aphrophilus Haemophilus ducreyi kyllä ei 3kk/12kk ilm 3 tai Haemophilus haemolyticus Haemophilus influenzae ei kyllä 3kk ilm 1, 2 tai 5 Huom: Korvaa vanhat mikrobitunnukset ja Serotyyppitieto ilmoitetaan ominaisuutena. Ominaisuudet: tyyppi B, ei B-tyyppiä Kantakokoelma: Verestä ja likvorista eristetyt Haemophilus parainfluenzae Haemophilus paraphrophilus Haemophilus segnis

11 11 (46) Haemophilus vaginalis -> Gardnerella vaginalis Hafnia alvei Helicobacter cinaedi Campylobacter cinaedi Helicobacter pylori Campylobacter pyloridis Kingella kingae Moraxella kingae, Moraxella kingii Klebsiella sp. ei ei 3kk/50v muu 1 tai Klebsiella ornithinolytica -> Raoultella ornithinolytica ei ei 3kk/50v muu 1 tai Klebsiella oxytoca ei ei 3kk/50v muu 1 tai Klebsiella ozaenae -> Klebsiella pneumoniae ssp. ozaenae ei ei 3kk/50v muu 1 tai Klebsiella planticola -> Raoultella planticola ei ei 3kk/50v muu 1 tai Klebsiella pneumoniae ei ei 3kk/50v muu 1, 2 tai 19 Ominaisuudet: 3KEF/R, 3KEF/I Klebsiella pneumoniae ssp. ozaenae ei ei 3kk/50v muu 1 tai 2 Klebsiella ozaenae Kluyvera sp Kluyvera ascorbata Kocuria sp Kocuria kristinae Kocuria rosea Kocuria varians Kytococcus sedentarius Lactobacillus sp Lactobacillus acidophilus Lactobacillus casei Lactobacillus catenaforme Lactobacillus jensenii Lactobacillus rhamnosus Lactobacillus salivarius Lactococcus lactis Leclercia adecarboxylata Escherichia adecarboxylata Legionella sp Legionella adelaidensis Legionella anisa Legionella beliardensis Kantakokoelma: Kaikki Legionella birminghamensis Legionella bozemanii Fluoribacter bozemanae kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai Legionella brunensis Legionella busanensis Kantakokoelma: Kaikki Legionella cherrii

12 Legionella cincinnatiensis Legionella dumoffii Fluoribacter dumoffi Legionella fallonii Kantakokoelma: Kaikki Legionella feeleii Legionella genomospecies Kantakokoelma: Kaikki Legionella gormanii Fluoribacter gormanii Legionella gresilensis Kantakokoelma: Kaikki Legionella hackeliae Legionella israelensis Legionella jordanis Legionella lasingensis Kantakokoelma: Kaikki Legionella longbeachae Legionella maceachernii Tatlockia maceachernii Legionella micdadei Tatlockia micdadei Legionella oakridgensis Legionella parisiensis Legionella pneumophila Legionella pneumophila ssp. fraseri Kantakokoelma: Kaikki Legionella pneumophila ssp. pascullei Kantakokoelma: Kaikki Legionella pneumophila ssp. ssp. pneumophila Ominaisuudet: sg 1-15 Kantakokoelma: Kaikki Legionella rowbothamii Kantakokoelma: Kaikki Legionella sainthelensi Legionella spiritensis 12 (46) kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17 kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 3, 6, 13 tai 17

13 13 (46) Legionella taurinensis Kantakokoelma: Kaikki Legionella tucsonensis Legionella wadsworthii Leifsonia aquatica Corynebacterium aquaticum Leptospira interrogans ei ei 3kk/12kk muu 3 tai Leptotrichia buccalis Leptotrichia sanguinegens Leuconostoc sp Levinea amalonatica -> Citrobacter amalonaticus Listeria sp. ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria grayi ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria innocua ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria ivanovii ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria ivanovii ssp. londoniensis ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria monocytogenes Kantakokoelma: Kaikki kyllä kyllä 3kk/12kk ilm 1, 2, 8, 9 tai Listeria murrayi ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria seeligeri ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Listeria welshimeri ei ei 3kk/12kk ilm 1 tai Methylobacterium sp Microbacterium sp Micrococcus sp Micrococcus luteus Micrococcus subgroup 3 -> Staphylococcus saprophyticus ssp. saprophyticus Micromonas micros Peptostreptococcus micros Mitsuokella sp Mobiluncus sp Mobiluncus curtisii ssp. curtisii Moellerella wisconsensis Enteric ryhmä Mogibacterium sp Moraxella sp Moraxella catarrhalis Branhamella catarrhalis, Neisseria catarrhalis Moraxella kingae -> Kingella kingae Moraxella kingii -> Kingella kingae Moraxella lacunata Moraxella liquefaciens Moraxella liquefaciens -> Moraxella lacunata Moraxella nonliquefaciens Moraxella osloensis Moraxella urethralis -> Oligella urethralis Morganella sp Morganella morganii Proteus morganii Morganella morganii ssp. morganii Mycobacterium sp. ei ei 3kk/50v ilm 3 tai 13

14 14 (46) Mycobacterium abscessus ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium abscessus ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium africanum kyllä kyllä 12kk/3v yv 3 tai 13 Kantakokoelma: Kaikki Mycobacterium agri ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium aichiense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium anthracenicum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium asiaticum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium aurum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium austroafricanum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium avium ei ei 3kk/50v ilm 3 tai 13 Mycobacterium avium ssp. avium Mycobacterium avium complex ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium avium ssp. avium ei ei 3kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium avium ssp. avium -> Mycobacterium avium ei ei 3kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium avium ssp. silvaticum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium bohemicum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium bovis Kantakokoelma: Kaikki kyllä kyllä 12kk/3v/50v yv 3 tai Mycobacterium bovis BCG ei kyllä 12kk/50v ilm 3 tai 13 BCG, Bacillus Calmette Guerin Huom: Lääkärit ilmoittavat ainoastaan rokotusten haittavaikutukset käyttäen "Ilmoitus rokotuksen haittavaikutuksesta-lomaketta (KTL/ROKO/101) Kantakokoelma: Kaikki Mycobacterium bovis ssp. caprae kyllä kyllä 12kk/3v yv Mycobacterium branderi ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium buckleii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium canettii kyllä kyllä 12kk/3v yv 3 tai 13 Kantakokoelma: Kaikki Mycobacterium celatum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium chelonae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium chelonae complex Huom: Ei alalaji vaan diagnostisten käytäntöjen luoma ryhmittely ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium chitae ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium chlorophenolicum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium chubuense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium columbarii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium conspicuum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium cookii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium diernhoferi ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium duvalii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium elephantis ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium fallax ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium farcinogenes ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium flavescens ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium florentinum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium fortuitum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium fortuitum complex Huom: Ei alalaji vaan diagnostisten käytäntöjen luoma ryhmittely ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium fortuitum ssp. acetamidolyti ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium fortuitum ssp. fortuitum ei ei 3kk/50v ilm

15 Mycobacterium fortuitum/chelonae complex Huom: Ei alalaji vaan diagnostisten käytäntöjen luoma ryhmittely 15 (46) ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium frederiksbergense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium gadium ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium gallinarum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium gilvum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium goodi ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium gordonae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium habana ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium haemophilum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium heckeshornense ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium heidelbergense ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium hiberniae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium immunogenum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium interjectum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium intracellulare ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium isoniacini ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium kansasii ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium komossense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium kubicae ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium lactis ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium lacus ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium lentiflavum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium leprae ei ei 12kk/50v ilm Mycobacterium lepraemurium ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium lufu ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium madagascariense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium mageritense ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium malmoense ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium marinum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium microti Kantakokoelma: Kaikki kyllä kyllä 12kk/3v/50v yv 3 tai Mycobacterium monacense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium moriokaense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium mucogenicum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium murale ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium n. sp. Fuerth 1999 ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium neoaurum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium nonchromogenicum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium novocastrense ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium obuense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium palustre ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium paraffinicum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium parafortuitum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium paratuberculosis ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium peregrinum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium phlei ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium pinnipedii kyllä ei 3kk/12kk/3v/50vilm Mycobacterium porcinum ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium poriferae ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium pulveris ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium ratisbonense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium rhodesiae ei ei 3kk/50v ilm

16 16 (46) Mycobacterium scrofulaceum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium senegalense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium septicum ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium shimoidei ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium shottsii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium simiae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium smegmatis ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium sphagni ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium sydneyiensis ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium szulgai ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium terrae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium thermoresistibile ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium tilburgii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium tokaiense ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium triplex ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium triviale ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium tuberculosis kyllä kyllä 12kk/3v yv 3 tai 13 Ominaisuudet: ISONIA/R, RIFAMP/R Kantakokoelma: Kaikki Mycobacterium tuberculosis complex kyllä ei 12kk/3v yv 3 tai Mycobacterium tusciae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium vabaalennii ei ei 3kk/50v ilm Mycobacterium vaccae ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium wolinskyi ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycobacterium xenopi ei ei 12kk/50v ilm 3 tai Mycoplasma sp Mycoplasma hominis Mycoplasma pneumoniae ei ei 3kk/12kk muu 3, 6 tai Myroides odoratus Flavobacterium odoratum Neisseria sp Neisseria catarrhalis -> Moraxella catarrhalis Neisseria cinerea Neisseria pharyngis Neisseria elongata ssp. elongata Neisseria flavescens Neisseria gonorrhoeae kyllä ei 3kk ilm 3 tai Neisseria meningitidis kyllä kyllä 3kk yv 1, 2, 5 tai 7 Huom: Seroryhmä ilmoitettava Ominaisuudet: A, B, C, W135, Y, NG Kantakokoelma: Verestä ja likvorista eristetyt Neisseria mucosa Neisseria parelongata -> Neisseria weaveri Neisseria pharyngis -> Neisseria cinerea Neisseria sicca Neisseria subflava Neisseria weaveri Neisseria parelongata Nocardia sp Nocardia asteroides Nocardia brasiliensis Nocardia carnea Nocardia farcinica Nocardia nova Nocardia otitidiscaviarum

17 17 (46) Nocardia veterana Ochrobactrum anthropi CDC ryhmä 5d Oligella urethralis Moraxella urethralis Pantoea agglomerans Enterobacter agglomerans Pasteurella sp Pasteurella haemolytica Pasteurella multocida Pasteurella multocida ssp. multocida Pasteurella pestis -> Yersinia pestis kyllä ei 3kk/12kk yv 1 tai Pasteurella pneumotropica Pasteurella pseudotuberculosis -> Yersinia pseudotuberculosis ei ei 3kk/12kk muu 3 tai 6 Ominaisuudet: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, Pasteurella tularensis -> Francisella tularensis ei ei 3kk/12kk muu 3 tai Pediococcus sp Peptococcus sp. (osa kannoista) Peptococcus asaccharolyticus -> Peptoniphilus asaccharolyticus Peptococcus saccharolyticus -> Staphylococcus saccharolyticus Peptoniphilus asaccharolyticus Peptococcus asaccharolyticus, Peptostreptococcus asaccharolyticus Peptoniphilus indolicus Peptostreptococcus indolicus Peptostreptococcus sp. Peptococcus sp. (osittain) Peptostreptococcus anaerobius Peptostreptococcus asaccharolyticus -> Peptoniphilus asaccharolyticus Peptostreptococcus indolicus -> Peptoniphilus indolicus Peptostreptococcus magnus -> Finegoldia magna Peptostreptococcus micros -> Micromonas micros Peptostreptococcus prevotii -> Anaerococcus prevotii Peptostreptococcus productus -> Ruminococcus productus Peptostreptococcus tetradius -> Anaerococcus tetradius Plesiomonas shigelloides Aeromonas shigelloides Porphyromonas sp Porphyromonas asaccharolytica Bacteroides asaccharolyticus, Bacteroides melaninogenicus ssp. asaccharolyticus Porphyromonas endodontalis Bacteroides endodontalis Porphyromonas gingivalis Bacteroides gingivalis Prevotella sp Prevotella bivia Bacteroides bivius Prevotella buccae Bacteroides buccae, Bacteroides capillus, Bacteroides pentosaceus, Bacteroides ruminicola ssp. brevis, Bacteroides ruminicola ssp. ruminicola (osittain) Prevotella corporis Bacteroides corporis Prevotella denticola Bacteroides denticola

18 18 (46) Prevotella disiens Bacteroides disiens Prevotella loescheii Bacteroides loescheii Prevotella melaninogenica Bacteroides melanogenicus, Bacteroides melanogenicus ssp. melanogenicus Prevotella oralis Bacteroides oralis Prevotella oris Bacteroides oris, Bacteroides ruminicola ssp. brevis (osittain), Bacteroides ruminicola ssp. ruminicola (osittain) Propionibacterium sp Propionibacterium acnes Propionibacterium granulosum Proteus sp Proteus inconstans -> Providencia stuartii Proteus mirabilis Proteus morganii -> Morganella morganii Proteus rettgeri -> Providencia rettgeri Proteus vulgaris Providencia sp Providencia rettgeri Proteus rettgeri Providencia stuartii Proteus inconstans Pseudomonas sp Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas alcaligenes Pseudomonas cepacia -> Burkholderia cepacia Pseudomonas fluorescens Pseudomonas hydrophila -> Aeromonas hydrophila Pseudomonas luteola Chryseomonas luteola Pseudomonas mallei -> Burkholderia mallei Pseudomonas maltophilia -> Stenotrophomonas maltophilia Pseudomonas mendocina CDC ryhmä Vb Pseudomonas multivorans -> Burkholderia cepacia Pseudomonas odorans -> Alcaligenes faecalis Pseudomonas oryzihabitans Flavimonas oryzihabitans Pseudomonas paucimobilis -> Sphingomonas paucimobilis Pseudomonas pickettii -> Ralstonia pickettii Pseudomonas pseudomallei -> Burkholderia pseudomallei Pseudomonas putida Pseudomonas putrefaciens -> Shewanella putrefaciens Pseudomonas stutzeri CDC ryhmä Vb Pseudomonas testosteroni -> Comamonas testosteroni Pseudomonas vesicularis -> Brevundimonas vesicularis Pseudoramibacter alactolyticus Eubacterium alactolyticum Rahnella aquatilis Ralstonia pickettii Pseudomonas pickettii Ramibacterium ramosum -> Clostridium ramosum

19 19 (46) Raoultella ornithinolytica ei ei 3kk/50v muu 1 tai 2 Klebsiella ornithinolytica Raoultella planticola ei ei 3kk/50v muu 1 tai 2 Klebsiella planticola Rhizobium radiobacter Agrobacterium tumefaciens Rhodococcus sp Rhodococcus equi Corynebacterium equi Rickettsia sp. ei ei 3kk muu 6 tai Rickettsia conorii Rochalimaea henselae -> Bartonella henselae Rochalimaea quintana -> Bartonella quintana Rothia dentocariosa Rothia mucilaginosa Stomatococcus mucilaginosus Ruminococcus productus Peptostreptococcus productus Salmonella sp Salmonella ssp. I -> Salmonella enterica ssp. enterica (I) Salmonella ssp. II -> Salmonella enterica ssp. salamae (II) Salmonella ssp. IIIa -> Salmonella enterica ssp. arizonae (IIIa) Salmonella ssp. IIIb -> Salmonella enterica ssp. diarizonae (IIIb) Salmonella ssp. IV -> Salmonella enterica ssp. houtenae (IV) Salmonella ssp. V -> Salmonella bongori (V) Salmonella ssp. VI -> Salmonella enterica ssp. indica (VI) Salmonella Aberdeen Salmonella Abony Salmonella Adana Salmonella Adelaide Salmonella Agama Salmonella Agona Salmonella Agoueve

20 20 (46) Salmonella Alachua Salmonella Alamo Salmonella Albany Salmonella Altendorf ei kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Altona Salmonella Amager Salmonella Amsterdam Salmonella Anatum Salmonella Anecho Salmonella Angoda Salmonella Arechavaleta Salmonella Augustenborg Salmonella Baildon Salmonella Banana Salmonella Bardo Salmonella Bareilly Salmonella Berkeley Salmonella Berta Salmonella Bispebjerg Salmonella Blegdam Salmonella Blockley Salmonella Bonariensis

21 21 (46) Salmonella Bonn Salmonella Bovismorbificans Salmonella Bracknell Salmonella Bradford Salmonella Braenderup Salmonella Brandenburg Salmonella Bredeney Salmonella Brunei Salmonella Bsilla Salmonella Cannstatt Salmonella Carno Salmonella Cerro Salmonella Chailey Salmonella Chester Salmonella Chicago Salmonella Chingola Salmonella Choleraesuis Salmonella Choleraesuis var kurzendorf Salmonella Coeln Salmonella Coleypark Salmonella Colindale Salmonella Concord

22 22 (46) Salmonella Corvallis Salmonella Cubana Salmonella Cullingworth ei kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Cyprus Salmonella Dakar Salmonella Denver Salmonella Derby Salmonella Djakarta ei kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Djugu Salmonella Dublin Salmonella Duesseldorf Salmonella Duisburg Salmonella Durban Salmonella Durham kyllä kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Eastbourne Salmonella Edinburg Salmonella Elisabethville Salmonella Elomrane Salmonella Emek Salmonella Enteritidis Salmonella Essen Salmonella Falkensee

23 23 (46) Salmonella Fayed Salmonella Ferruch Salmonella Galiema Salmonella Gambia Salmonella Gaminara Salmonella Gatuni Salmonella Give Salmonella Glostrup Salmonella Goelzau Salmonella Goldcoast Salmonella Gombe Salmonella Grumpensis Salmonella Guildford Salmonella Haardt Salmonella Hadar Salmonella Haifa Salmonella Hartford Salmonella Hato Salmonella Havana Salmonella Heidelberg Salmonella Hindmarsh Salmonella Hofit

24 24 (46) Salmonella Houston ei kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Hull Salmonella Hvittingfoss Salmonella Idikan Salmonella Indiana Salmonella Infantis Salmonella Irumu Salmonella Isangi Salmonella Israel Salmonella Istanbul Salmonella Itami Salmonella Ituri Salmonella Jangwani Salmonella Java Salmonella Javiana Salmonella Jericho ei ei 3kk/12kk yv Salmonella Johannesburg Salmonella Kambole Salmonella Kapemba Salmonella Kedougou Salmonella Kentucky Salmonella Kenya ei kyllä 3kk/12kk yv

25 25 (46) Salmonella Kiambu Salmonella Kibusi Salmonella Kingston Salmonella Kisangani Salmonella Kisii Salmonella Konstanz Salmonella Kottbus Salmonella Krefeld Salmonella Kumasi Salmonella Lagos Salmonella Leipzig Salmonella Lexington Salmonella Lille Salmonella Litchfield Salmonella Liverpool Salmonella Livingstone Salmonella Llandoff Salmonella Loanda Salmonella Lockleaze Salmonella Lomalinda Salmonella London Salmonella Manchester

26 26 (46) Salmonella Manhattan Salmonella Mapo Salmonella Matadi Salmonella Matopeni Salmonella Mbandaka Salmonella Meleagridis Salmonella Menden Salmonella Mgulani Salmonella Miami Salmonella Mikawasima Salmonella Minnesota Salmonella Mkamba Salmonella Molade Salmonella Montevideo Salmonella Morehead Salmonella Muenchen Salmonella Muenster Salmonella Nanga Salmonella Napoli Salmonella Nchanga Salmonella Ndolo Salmonella Neukoelln

27 27 (46) Salmonella Newlands Salmonella Newport Salmonella Nima Salmonella Ohio Salmonella Oldenburg Salmonella Oranienburg Salmonella Orion Salmonella Oslo Salmonella Othmarschen Salmonella Ouakam Salmonella Oudwijk Salmonella Panama Salmonella Paratyphi A kyllä kyllä 3kk/50v yv Salmonella Paratyphi B kyllä kyllä 3kk/50v yv Salmonella Paratyphi C kyllä kyllä 3kk/50v yv Salmonella Pomona Salmonella Poona Salmonella Potsdam Salmonella Putten Salmonella Reading Salmonella Redba Salmonella Richmond

28 28 (46) Salmonella Rissen Salmonella Rossleben Salmonella Rubislaw Salmonella Ruiru Salmonella Saarbruecken Salmonella Saintpaul Salmonella Salford Salmonella Sandiego Salmonella Schleissheim Salmonella Schwarzengrund Salmonella Seegefeld Salmonella Senegal Salmonella Senftenberg Salmonella Shubra Salmonella Singapore Salmonella Stanley Salmonella Stanleyville Salmonella Stendal Salmonella Stockholm Salmonella Szentes Salmonella Takoradi Salmonella Tarshyne

29 29 (46) Salmonella Telaviv Salmonella Telelkebir ei kyllä 3kk/12kk yv Salmonella Tennessee Salmonella Thompson Salmonella Tilburg Salmonella Tilene Salmonella Tokoin Salmonella Transvaal Salmonella Tshiongwe Salmonella Typhi kyllä kyllä 3kk/50v yv Salmonella Typhimurium Salmonella Typhimurium var copenhagen Salmonella Uganda Salmonella Umbilo Salmonella Urbana Salmonella Vejle Salmonella Victoria Salmonella Vinohrady Salmonella Virchow Salmonella Virginia Salmonella Wandsworth Salmonella Waycross

30 30 (46) Salmonella Weltevreden Salmonella Westhampton Salmonella Windermere Salmonella Worthington Salmonella Zanzibar Salmonella bongori (V) Salmonella ssp. V Salmonella enterica Salmonella enterica ssp. arizonae (IIIa) Salmonella ssp. IIIa Salmonella enterica ssp. diarizonae (IIIb) Salmonella ssp. IIIb Salmonella enterica ssp. enterica (I) Salmonella ssp. I Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä A (O:2) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä B (O:4) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä C (O:7; O:8) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä D Huom: Ryhmä D (O:9; O:9,46; O:9,46,27) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä E Huom: Ryhmä E (O:3,1O; O:1,3,19) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä F (O:11) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä G (O:13) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä H (O:6,14) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä I (O:16) Salmonella enterica ssp. enterica (I), ryhmä M (O:28)